FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA2028.ptfa, 1392 aa vs ./tmplib.26680 library 1767625 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6223+/-0.00686; mu= 7.5277+/- 0.457 mean_var=231.6063+/-55.010, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0843 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1200 ( 1447 res) mbg09531 (1447) 3369 424 1.2e-118 mKIAA0799 ( 1450 res) mbg04147 (1450) 274 47 2.3e-05 >>mKIAA1200 ( 1447 res) mbg09531 (1447 aa) initn: 2546 init1: 1460 opt: 3369 Z-score: 2222.3 bits: 423.7 E(): 1.2e-118 Smith-Waterman score: 3810; 47.639% identity (54.815% ungapped) in 1398 aa overlap (1-1365:181-1428) 10 20 30 mKIAA2 DLESVMQEKDDIIQNLALRLEEQKQVRIQE .: ...: ::..:..: .::.:::.: .: mKIAA1 ETQVGVMEEKIKLSNLKSVDSTGTLHQKYQELLKAVQGKDELISQLQAQLEKQKQTRAEE 160 170 180 190 200 210 40 50 60 70 80 90 mKIAA2 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::.::.:.:.:::.. .:.. .: :... :::: ..:::.:. . ::. . mKIAA1 SPKENTVVWIAVNEDGVSILDHRTMQVNITYPYSSVTTFGGCRDDFMLVIRSIPDQSSGK 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1320 1330 1340 1350 1360 1370 mKIAA2 PT-EKLLFAMAKHKILEITLLIASYINSFHQQKTTFHHLSAPALLSPRTQAPQARVMGSQ .:: : : :: : ::..:::.: : . :. . :: .:: mKIAA1 TRIDKLTFRMPAPKITETTLMMASYMN--HCSATVNLSAKLPAARQPRDLDGQFFASVSC 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1380 1390 mKIAA2 PPLSNSRPTKGPTLL mKIAA1 TKGSALL >>mKIAA0799 ( 1450 res) mbg04147 (1450 aa) initn: 420 init1: 134 opt: 274 Z-score: 188.6 bits: 47.4 E(): 2.3e-05 Smith-Waterman score: 477; 21.455% identity (26.048% ungapped) in 1072 aa overlap (413-1350:420-1436) 390 400 410 420 430 440 mKIAA2 NAISMIRPLRPQETDLDVVDGDGAEAVNRMDTGCDDGLFSYDSQDPPPCADDQENSEAPK :.. .: ..: : ::. : mKIAA0 EADDDAFKDSPNPSEHGHSDQRTSGIRTSDDSSEEDPYMNYTVVPTSPSADSTVLLAASM 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 mKIAA2 KAPCNKPPTPPLHRFPSWESRIYAVAKSGIRVSEAFNMEHANKNSADILSYSAASLYTSL . . :: : :: ..: : .... . . : :..:. : mKIAA0 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