# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mib04094.fasta.nr -Q ../query/mKIAA2028.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA2028, 1392 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7916969 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6098+/-0.000194; mu= 13.4673+/- 0.011 mean_var=95.1183+/-18.508, 0's: 38 Z-trim: 47 B-trim: 599 in 2/63 Lambda= 0.131505 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|109477888|ref|XP_233830.4| PREDICTED: similar t (1488) 8111 1550.3 0 gi|116138756|gb|AAI25584.1| Pleckstrin homology do (1491) 5329 1022.5 0 gi|26325204|dbj|BAC26356.1| unnamed protein produc (1491) 5326 1021.9 0 gi|158706384|sp|Q8C115.2|PKHH2_MOUSE RecName: Full (1491) 5323 1021.4 0 gi|149727614|ref|XP_001499637.1| PREDICTED: simila (1493) 5233 1004.3 0 gi|158706383|sp|Q8IVE3.2|PKHH2_HUMAN RecName: Full (1493) 5229 1003.5 0 gi|119620698|gb|EAX00293.1| hCG2039966, isoform CR 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similar to CG12467-PA ( 684) 3413 658.7 3.9e-186 gi|160418966|sp|Q80TI1.2|PKHH1_MOUSE RecName: Full (1356) 3369 650.6 2.1e-183 gi|148670687|gb|EDL02634.1| mCG5814, isoform CRA_a (1360) 3359 648.7 7.8e-183 gi|224051295|ref|XP_002199434.1| PREDICTED: simila (1466) 3353 647.6 1.8e-182 gi|149051543|gb|EDM03716.1| pleckstrin homology do (1367) 3345 646.1 4.9e-182 gi|194038451|ref|XP_001925997.1| PREDICTED: plecks (1400) 3244 626.9 2.9e-176 gi|194381470|dbj|BAG58689.1| unnamed protein produ ( 932) 3189 616.3 3e-173 gi|119601346|gb|EAW80940.1| pleckstrin homology do (1422) 3190 616.7 3.6e-173 gi|160418959|sp|Q9ULM0.2|PKHH1_HUMAN RecName: Full (1364) 3187 616.1 5.2e-173 gi|73964222|ref|XP_537487.2| PREDICTED: similar to (1476) 3171 613.1 4.5e-172 gi|126282997|ref|XP_001378386.1| PREDICTED: simila (1368) 3153 609.6 4.5e-171 gi|220673194|emb|CAX12962.1| novel protein similar (1090) 3127 604.6 1.2e-169 gi|194225118|ref|XP_001916221.1| PREDICTED: plecks (1494) 3117 602.8 5.5e-169 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