FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4164.ptfa, 1207 aa vs ./tmplib.26680 library 1767810 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9528+/-0.00644; mu= 3.5975+/- 0.426 mean_var=223.4819+/-54.955, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0858 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0970 ( 622 res) mpg00610 ( 622) 2182 284 6.7e-77 mKIAA1514 ( 1994 res) mbf03631 (1994) 221 41 0.0017 mKIAA1628 ( 1294 res) mbg00013 (1294) 210 40 0.0033 mFLJ00154 ( 1340 res) mfj45154 (1340) 201 39 0.0073 >>mKIAA0970 ( 622 res) mpg00610 (622 aa) initn: 1720 init1: 938 opt: 2182 Z-score: 1473.0 bits: 283.6 E(): 6.7e-77 Smith-Waterman score: 2182; 50.883% identity (51.378% ungapped) in 623 aa overlap (589-1207:2-622) 560 570 580 590 600 610 mKIAA4 KSCPSEVLVCTTSPDRPGPPTRPLIKGPVTSHGFSVKWDAPKDNGGSEILKYLLEITDGT ::::.. :: ::::::. : ::..:...: mKIAA0 HSHGFKITWDPPKDNGGAPINKYVVEMAEG- 10 20 30 620 630 640 650 660 670 mKIAA4 SEAGQWEVAYSGSATEYVFTHLKPGTLYKLRACCISTGGHSQCSESLPVRTLSLAPGQCR :....:.. :::.. :.. .: :: :.::. ::: ::.: :::: :.: .. :: : mKIAA0 SNGNKWDMIYSGTTREHLCDRLTPGCYYRLRVYCISDGGQSAVSESLLVQTPAVPPGPCL 40 50 60 70 80 90 680 690 700 710 720 730 mKIAA4 PPRVLGRPKHKGVHLEWDVPASESGCEVSEYSVEMTEPE-NVASEVYHGPELECTVGNLL :::. :::: : ..:.: : ..: .: :.:::: . . .::.: :.:::::.:: mKIAA0 PPRLQGRPKAKEIQLRWGPPQVDGGSPISCYAVEMTPADKDEPRDVYQGSEVECTVGSLL 100 110 120 130 140 150 740 750 760 770 780 790 mKIAA4 PGTVYRFRVRALNDGGYGPYSDVSEITTAAGPPGQCRAPRVSFTPDGCVLVGWESPASPG :: .: ::.:: : :.::.:. .:::: ::: ::: :.:. :. :.:: : : : mKIAA0 PGKTYSFRLRAANRIGFGPFSEKYDITTAPGPPDQCRPPQVTCRSATCAQVNWEIPLSNG 160 170 180 190 200 210 800 810 820 830 840 850 mKIAA4 ADISEYRLEWGEDEQSLELVYHGPDTCFEMRDLLPAAQYCCRLQAFNPAGAGPYSELVHC .:..::::::: : :... : :: :.. : ::. : ::.::.. .::::.::.: : mKIAA0 TDVTEYRLEWGGVEGSMQMCYCGPGLSCELKGLSPATTYYCRVQAMSVVGAGPFSEVVAC 220 230 240 250 260 270 860 870 880 890 900 910 mKIAA4 QTPASAPDPVSTLCVLEEEPPSAHPDSPSVCLVLNWEEPCNNGSEILAYNIDLGDSC-IT :: :.: :. : . .. :::.::...:.:: ..:::::::.:::::. .: mKIAA0 VTPPSVPAIVTCLQEISDDDIEYPHYSPSTCLAISWKEPYDHGSEILAYSIDLGDKQPLT 280 290 300 310 320 330 920 930 940 950 960 970 mKIAA4 VGNTTTHVMKNLLPETTYRIRIQAINEIGVGPFSQFIKAKTRPLPPSPPRLECAASGPQS ::. :.... .: :.:::::::::.: .:.::::. :: ::.::::.::::::.: . :. mKIAA0 VGKMTSYIIDSLQPDTTYRIRIQALNSLGAGPFSHTIKLKTKPLPPDPPRLECVAFNHQN 340 350 360 370 380 390 980 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA4 LKLKWGDSNSKTHAAGDMVYTLQLEDRNKRFISIYRGPSHTYKVQRLTEFTCYSFRIQAM ::::::... :: .. . : ::.:::: ::.:.:::: ::::::::.: : :.: ::: mKIAA0 LKLKWGEGTPKTLSTDAVQYHLQMEDRNGRFVSLYRGPCHTYKVQRLSESTSYKFCIQAC 400 410 420 430 440 450 1040 1050 1060 1070 1080 1090 mKIAA4 SEAGEGPYSETYTFSTTKSVPPTLKAPRVTQLEGNSCEIFWETVPPMRGDPVSYVLQVLV .:::::: :. :.:.: ::.: .::::.. ... . ::: :: . ::.:::: : :::.: mKIAA0 NEAGEGPLSQEYVFTTPKSLPAALKAPKIEKINDHICEITWEYLQPMKGDPVIYNLQVMV 460 470 480 490 500 510 1100 1110 1120 1130 1140 1150 mKIAA4 GRDSEYKQVYKGEEATFQISGLQSNTDYRFRVCACRRCVDTS--QELSGAFSPSAAFMLQ :.:::.::.::: ...:. :.:: : .::::::: :.: : . :.: : .: .. :. : mKIAA0 GKDSEFKQIYKGPDTSFRYSSLQLNCEYRFRVCAIRQCQDPTGHQDLVGPYSTTVFFISQ 520 530 540 550 560 570 1160 1170 1180 1190 1200 mKIAA4 QREVMLTGDLGGMEEAKMKGMMPTDEQFAALIVLGFATLSILFAFILQYFLMK . : ... ... :. . . .::: ::.:.. :: .:::.:::.:::..: mKIAA0 RTEPPASSNKDSVDSARTRRTL-SDEQCAAVILVVFAFFSILIAFIIQYFVIK 580 590 600 610 620 >>mKIAA1514 ( 1994 res) mbf03631 (1994 aa) initn: 191 init1: 109 opt: 221 Z-score: 155.0 bits: 41.5 E(): 0.0017 Smith-Waterman score: 514; 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