FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1207.ptfa, 2078 aa vs ./tmplib.26680 library 1766939 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0956+/-0.0051; mu= 19.4228+/- 0.342 mean_var=113.2495+/-25.015, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.1205 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00175 ( 2118 res) mtg01832 (2118) 6869 1207 0 mKIAA4194 ( 320 res) mbg12940 ( 320) 155 39 0.0034 mKIAA0538 ( 826 res) msh37311 ( 826) 151 38 0.0098 >>mFLJ00175 ( 2118 res) mtg01832 (2118 aa) initn: 5989 init1: 1285 opt: 6869 Z-score: 6449.8 bits: 1207.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 7955; 55.556% identity (58.986% ungapped) in 2115 aa overlap (2-2031:14-2090) 10 20 30 40 mKIAA1 LLGCDLLSPRAMLRVIVESATNIPKTKFGK-PDPIVSVIFKDEKKKTK ::: ::: .. :.:.:..: . ::..:.::. ::.:: mFLJ00 LSPKLLLPLRPTRLGCG-----AMLCCLLARASNLPNVKKDRRSDPVASLIFRGVKKRTK 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 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