FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0308.ptfa, 1890 aa vs ./tmplib.26680 library 1767127 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.8920+/-0.00636; mu= -10.4905+/- 0.416 mean_var=350.2673+/-86.378, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 141 in 1/35 Lambda= 0.0685 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4075 ( 1945 res) mbg09037 (1945) 1222 136 7.2e-32 mKIAA1564 ( 868 res) mbh04633 ( 868) 901 104 1.4e-22 mKIAA1259 ( 1196 res) mpm05149 (1196) 519 67 4.2e-11 mKIAA1122 ( 1071 res) mbh00587 (1071) 406 55 8.9e-08 mKIAA0809 ( 1368 res) mbp01279 (1368) 299 45 0.00016 >>mKIAA4075 ( 1945 res) mbg09037 (1945 aa) initn: 1179 init1: 629 opt: 1222 Z-score: 664.5 bits: 136.3 E(): 7.2e-32 Smith-Waterman score: 1244; 38.510% identity (43.393% ungapped) in 631 aa overlap (6-583:883-1495) 10 20 30 mKIAA0 GGCGELNAIDWRCVIIDEAHRLKNKNCKLLEGLKL :..::: :.:.::::::::.. :... :. mKIAA4 KKASRMKKEASVKFHVLLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNG 860 870 880 890 900 910 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 MNLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPLRFPSESTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILK ..:.::.:::::::::..:::: ::.:: : :: . :..::.:. :.:..::. .: mKIAA4 YSLQHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKLHDMLG 920 930 940 950 960 970 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 PMMLRRLKEDVEKKLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVN : :::::: :: :.. : : :..:::. .:::::. :: .:: :. .: ..: .:.: mKIAA4 PHMLRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQV-SLLN 980 990 1000 1010 1020 1030 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 TMMELRKCCNHPYLIKGAEEKILGEFRDTYNPSASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMK ..:.:.::::::::. : . :. :: .:...:::.:..:.: ..: mKIAA4 VVMDLKKCCNHPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSA-------LIRASGKLLLLQKMLKNLK 1040 1050 1060 1070 1080 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 AGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIHKRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFL :::.:::::::.. ::.:::.: :. : :::::: . ::.:: :::::. : ...: :: mKIAA4 EGGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFL 1090 1100 1110 1120 1130 1140 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 LCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYERE : ::::::::::..::: ::.::::::.::.:: .: ::::::: : .::.::: : :.. mKIAA4 LSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEER 1150 1160 1170 1180 1190 1200 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 MFDRASLKLGLDKAVLQSMSGRDSNVSGIQQLSKKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFC . . :. :. : . :.. : .. ..::.:..:.:. :. . .: .:. mKIAA4 ITQVAKKKMMLTHLVVRPGLGSKTG-----SMSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDN 1210 1220 1230 1240 1250 400 410 420 430 mKIAA0 EEDID-----------QILLRRTKTITIESEGRG-----STFAKASFVAS----GNRTDI .: : . :: :.. : ..: .: :.: :..:. :.. .. mKIAA4 KEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEV 1260 1270 1280 1290 1300 1310 440 450 460 470 mKIAA0 SLD--------DPNFWQKWAKKAELDIDTISGRNSLVIDTPRIRKQT---------RPFS . ::..:.: .. . . .:: . :::::. : .. mKIAA4 EREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARN--LGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDWQ 1320 1330 1340 1350 1360 1370 480 490 500 510 520 mKIAA0 ATK-DELAELSEAESEGEE-----KPKLRRPCDRSGGYGRTE------CFRVEKNLLVYG . :. .. : : ::.: . ::: .:.: . . :: :. : : mKIAA4 DDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRP-SRKGLRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVLG 1380 1390 1400 1410 1420 1430 530 540 550 560 570 580 mKIAA0 WG-RWREILSHGRFKRQLNEHDV---EVICRALLAYCLIHYRGDEKIKGFIWDLITPTED .. : :. . .. .. . .:. . . : : . .... .. :. : : : mKIAA4 FNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKA--YVSLFMRHLCEPGAD 1440 1450 1460 1470 1480 1490 590 600 610 620 630 640 mKIAA0 GQTRELQNHLGLSAPVPRGRKGKKVKTQTSSFDIQKAEWLRKYNPEQLLQDEGYKKHVKH : mKIAA4 GAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEHVNGRWSMPELAEVEENKKMSQP 1500 1510 1520 1530 1540 1550 >>mKIAA1564 ( 868 res) mbh04633 (868 aa) initn: 1063 init1: 369 opt: 901 Z-score: 497.6 bits: 104.3 E(): 1.4e-22 Smith-Waterman score: 1350; 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