# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mia28019.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0635.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0635, 1125 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7899317 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4042+/-0.000205; mu= 8.1142+/- 0.011 mean_var=144.1161+/-27.629, 0's: 36 Z-trim: 155 B-trim: 54 in 1/64 Lambda= 0.106836 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|62288026|sp|Q6P5D4.1|CP135_MOUSE RecName: Full= (1140) 7048 1099.2 0 gi|148705959|gb|EDL37906.1| centrosomal protein 13 (1152) 7048 1099.3 0 gi|109499601|ref|XP_223341.4| PREDICTED: similar t (1140) 6576 1026.5 0 gi|74209432|dbj|BAE23283.1| unnamed protein produc (1031) 6227 972.7 0 gi|63092069|emb|CAI93867.1| centrosomal protein 13 (1145) 6086 951.0 0 gi|187953263|gb|AAI36536.1| Centrosomal protein 13 (1140) 5950 930.0 0 gi|62288025|sp|Q66GS9.1|CP135_HUMAN RecName: Full= (1140) 5946 929.4 0 gi|149702945|ref|XP_001491802.1| PREDICTED: centro (1139) 5943 928.9 0 gi|114594686|ref|XP_517281.2| PREDICTED: centrosom (1140) 5941 928.6 0 gi|194667888|ref|XP_001789241.1| PREDICTED: centro (1139) 5795 906.1 0 gi|109074801|ref|XP_001084949.1| PREDICTED: simila (1131) 5298 829.5 0 gi|73975305|ref|XP_539276.2| PREDICTED: similar to ( 919) 4714 739.4 2.1e-210 gi|149487048|ref|XP_001518640.1| PREDICTED: simila (1143) 4636 727.5 1e-206 gi|118090502|ref|XP_420699.2| PREDICTED: similar t (1163) 4525 710.4 1.5e-201 gi|126331725|ref|XP_001370634.1| PREDICTED: simila (1188) 4467 701.5 7.4e-199 gi|119625883|gb|EAX05478.1| hCG2027094 [Homo sapie ( 846) 4398 690.7 9.3e-196 gi|110665674|gb|ABG81483.1| centrosome protein 4 [ ( 845) 4223 663.7 1.2e-187 gi|158706461|sp|Q5RG45.2|CP135_DANRE RecName: Full (1164) 3669 578.4 7.7e-162 gi|148705960|gb|EDL37907.1| centrosomal protein 13 (1189) 3005 476.1 5e-131 gi|166796870|gb|AAI59174.1| LOC100145206 protein [ ( 916) 2078 333.1 4.3e-88 gi|29127003|gb|AAH48022.1| LOC398577 protein [Xeno ( 936) 2005 321.9 1.1e-84 gi|62020284|gb|AAH12003.1| CEP135 protein [Homo sa ( 365) 1895 304.5 7.1e-80 gi|194671321|ref|XP_616564.4| PREDICTED: similar t ( 697) 1661 268.7 8e-69 gi|73969397|ref|XP_531789.2| PREDICTED: similar to ( 697) 1660 268.6 8.9e-69 gi|126337167|ref|XP_001363486.1| PREDICTED: simila ( 699) 1652 267.3 2.1e-68 gi|195539891|gb|AAI68202.1| Tsga10 protein [Rattus ( 697) 1637 265.0 1e-67 gi|149046338|gb|EDL99231.1| testis specific 10, is ( 810) 1633 264.5 1.8e-67 gi|74724919|sp|Q9BZW7.1|TSG10_HUMAN RecName: Full= ( 698) 1631 264.1 2e-67 gi|149046339|gb|EDL99232.1| testis specific 10, is ( 788) 1631 264.1 2.1e-67 gi|148682582|gb|EDL14529.1| testis specific 10, is ( 690) 1629 263.8 2.4e-67 gi|81885028|sp|Q6NY15.1|TSG10_MOUSE RecName: Full= ( 697) 1629 263.8 2.4e-67 gi|22382177|gb|AAH28366.1| Testis specific, 10 [Ho ( 698) 1629 263.8 2.4e-67 gi|189053887|dbj|BAG36156.1| unnamed protein produ ( 698) 1626 263.3 3.4e-67 gi|198434276|ref|XP_002126770.1| PREDICTED: simila ( 862) 1627 263.6 3.5e-67 gi|13508448|gb|AAK27309.1| nucleoporin NYD-SP7 [Ho ( 699) 1622 262.7 5.2e-67 gi|47219334|emb|CAG10963.1| unnamed protein produc ( 858) 1622 262.8 5.9e-67 gi|47047249|gb|AAN01136.3| TSGA10 [Mus musculus] ( 689) 1608 260.5 2.3e-66 gi|210085239|gb|EEA33718.1| hypothetical protein B (1179) 1540 250.3 4.7e-63 gi|165971181|gb|AAI58466.1| LOC100145056 protein [ ( 379) 1514 245.8 3.5e-62 gi|115689588|ref|XP_781904.2| PREDICTED: similar t (1062) 1501 244.2 2.8e-61 gi|118084268|ref|XP_416892.2| PREDICTED: similar t (1152) 1485 241.8 1.7e-60 gi|149046337|gb|EDL99230.1| testis specific 10, is ( 610) 1476 240.1 2.8e-60 gi|81097756|gb|AAI09434.1| LOC553303 protein [Dani ( 427) 1446 235.4 5.4e-59 gi|60416187|gb|AAH90739.1| LOC553303 protein [Dani ( 415) 1434 233.5 1.9e-58 gi|75076511|sp|Q4R6W3.1|TSG10_MACFA RecName: Full= ( 601) 1270 208.4 1e-50 gi|119625882|gb|EAX05477.1| hCG2039594 [Homo sapie ( 249) 1222 200.6 9.2e-49 gi|148682581|gb|EDL14528.1| testis specific 10, is ( 805) 1201 197.9 1.9e-47 gi|18307574|dbj|BAB84031.1| unnamed protein produc ( 464) 1093 181.0 1.4e-42 gi|119622293|gb|EAX01888.1| testis specific, 10, i ( 462) 1077 178.5 7.5e-42 gi|73975303|ref|XP_854140.1| PREDICTED: similar to ( 217) 1036 171.8 3.6e-40 >>gi|62288026|sp|Q6P5D4.1|CP135_MOUSE RecName: Full=Cent (1140 aa) initn: 7048 init1: 7048 opt: 7048 Z-score: 5876.7 bits: 1099.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 7048; 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