FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1202.ptfa, 1395 aa vs ./tmplib.26680 library 1767622 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2199+/-0.00758; mu= 0.1258+/- 0.503 mean_var=299.5899+/-73.170, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0741 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1481 ( 1726 res) mpf00742 (1726) 762 96 6e-20 >>mKIAA1481 ( 1726 res) mpf00742 (1726 aa) initn: 916 init1: 350 opt: 762 Z-score: 450.5 bits: 96.1 E(): 6e-20 Smith-Waterman score: 769; 26.140% identity (31.631% ungapped) in 1469 aa overlap (65-1395:339-1690) 40 50 60 70 80 mKIAA1 TTMHFPSEAFSLSWHSGCNTSDVSVQWCPLSRHCSTEKSSSIGSMESLE-----QPG--- :: ::...: : . ..:. .:. mKIAA1 ENEDSSLKRHITPPHGHSPYPSERKNIHGGSRACSNHHSLSSPQAQALHVGDDRRPSRLS 310 320 330 340 350 360 90 100 110 120 130 140 mKIAA1 QPTYEGHLLPIDQNMYPSQ---RDSAYSSFSASSNASDCALS-LK--PEEPPSTDCVMPG :: .:: . :.: : :.. 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