# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mia20043.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1202.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1202, 1395 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7910489 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1189+/-0.000203; mu= 11.7118+/- 0.011 mean_var=129.0704+/-24.025, 0's: 27 Z-trim: 70 B-trim: 0 in 0/66 Lambda= 0.112891 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|123122092|emb|CAM20542.1| shroom family member (1359) 9305 1528.1 0 gi|148701934|gb|EDL33881.1| mCG49121 [Mus musculus (1358) 7978 1311.9 0 gi|74007420|ref|XP_855411.1| PREDICTED: similar to (1714) 6926 1140.7 0 gi|62666648|ref|XP_228786.3| PREDICTED: similar to (1487) 6628 1092.1 0 gi|149744516|ref|XP_001496242.1| PREDICTED: shroom (1483) 5368 886.9 0 gi|109130785|ref|XP_001083331.1| PREDICTED: simila (1400) 3637 605.0 1.2e-169 gi|118600967|ref|NP_065768.2| shroom family member 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