FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4127.ptfa, 1510 aa vs ./tmplib.26680 library 1767507 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7589+/-0.00516; mu= 9.8192+/- 0.344 mean_var=134.3047+/-32.479, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1107 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0701 ( 1470 res) mbg01637 (1470) 3067 502 3.3e-142 >>mKIAA0701 ( 1470 res) mbg01637 (1470 aa) initn: 3249 init1: 1397 opt: 3067 Z-score: 2645.5 bits: 502.2 E(): 3.3e-142 Smith-Waterman score: 3312; 40.106% identity (43.705% ungapped) in 1506 aa overlap (76-1503:8-1467) 50 60 70 80 90 100 mKIAA4 GSRCPRRGEVRGRLFSTTEEATAARLPAFHAGPGCSMAGIIKKQILKHLSRFTKNLSPDK ..:. .:::::::::::::::::::::::: mKIAA0 GATRERRSSPAGTMAGIIKKQILKHLSRFTKNLSPDK 10 20 30 110 120 130 140 150 160 mKIAA4 INLSTLKGEGQLTHLELDEEVLQNVLELPTWLAITRVYCNRASIQIQWTKLKTHPICLCL ::::::::::.: 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