FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1027.ptfa, 2564 aa vs ./tmplib.26680 library 1766453 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7198+/-0.00526; mu= 11.0558+/- 0.350 mean_var=150.8580+/-35.179, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1044 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 44, opt: 32, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0320 ( 1471 res) mbg01292 (1471) 6543 999 0 mKIAA4173 ( 381 res) mid20040 ( 381) 380 70 1.5e-12 mKIAA0655 ( 1083 res) mfj00059 (1083) 381 71 2.7e-12 mKIAA4113 ( 618 res) mpf00134 ( 618) 361 68 1.5e-11 mFLJ00256 ( 1000 res) mej02301 (1000) 229 48 2e-05 mKIAA1548 ( 789 res) mpm02067 ( 789) 211 45 0.00011 mKIAA0338 ( 907 res) mbg08118 ( 907) 200 44 0.00039 >>mKIAA0320 ( 1471 res) mbg01292 (1471 aa) initn: 3708 init1: 3285 opt: 6543 Z-score: 5328.2 bits: 999.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 6889; 73.759% identity (74.622% ungapped) in 1471 aa overlap 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