FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4240.ptfa, 416 aa vs ./tmplib.26680 library 1768601 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2161+/- 0.005; mu= 12.3701+/- 0.334 mean_var=137.1866+/-30.748, 0's: 0 Z-trim: 16 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1095 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4241 ( 453 res) mfj17221 ( 453) 2252 367 1.2e-102 mFLJ00017 ( 408 res) msh09230 ( 408) 1893 310 1.4e-85 mKIAA0763 ( 530 res) mbp04234 ( 530) 538 96 4.4e-21 mKIAA1110 ( 911 res) mbg05269 ( 911) 531 96 1.3e-20 mKIAA0248 ( 1803 res) mbg12530 (1803) 481 88 4.6e-18 mKIAA2011 ( 771 res) mfj31262 ( 771) 386 73 9.2e-14 mKIAA0522 ( 646 res) mbp09103 ( 646) 296 58 1.6e-09 mKIAA0969 ( 1106 res) mic02056 (1106) 201 44 7.1e-05 >>mKIAA4241 ( 453 res) mfj17221 (453 aa) initn: 2283 init1: 2252 opt: 2252 Z-score: 1934.9 bits: 367.1 E(): 1.2e-102 Smith-Waterman score: 2252; 84.319% identity (84.319% ungapped) in 389 aa overlap (26-414:65-453) 10 20 30 40 50 mKIAA4 RGLREVSGGRGPEPVASTMEDDDSYVPSDLTAEERQELENIRRRKQELLADIQRL :: ::. :::.:: .:::::.::. ::.:: mKIAA4 QPSRSRRLRARRLAGSGLKMDEGGGGEGGSVPEDLSLEEREELLDIRRRKKELIDDIERL 40 50 60 70 80 90 60 70 80 90 100 110 mKIAA4 KEEIAEVANEIESLGSTEERKNMQRNKQVAMGRKKFNMDPKKGIQFLIENGLLKNTCEDI : ::::: .::..: :.:: :. :::::.::::::::::::::::::::: ::... ::. mKIAA4 KYEIAEVMTEIDNLTSVEESKTTQRNKQIAMGRKKFNMDPKKGIQFLIENDLLQSSPEDV 100 110 120 130 140 150 120 130 140 150 160 170 mKIAA4 AQFLYKGEGLNKTAIGDYLGERDEFSIQVLYAFVELHEFTDLNLVQALRQFLWSFRLPGE :::::::::::::.:::::::::.:.:.:: ::::::::.:::::::::::::::::::: mKIAA4 AQFLYKGEGLNKTVIGDYLGERDDFNIKVLQAFVELHEFADLNLVQALRQFLWSFRLPGE 160 170 180 190 200 210 180 190 200 210 220 230 mKIAA4 AQKIDRMMEAFAQRYCQCNTGVFQSTDTCYVLSFAIIMLNTSLHNPNVKDKPTVERFIAM ::::::::::::.::: :: ::::::::::::::::::::::::: ::.::::.::::.: mKIAA4 AQKIDRMMEAFASRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFAIIMLNTSLHNHNVRDKPTAERFITM 220 230 240 250 260 270 240 250 260 270 280 290 mKIAA4 NRGINDGGDLPEELLRNLYESIKNEPFKIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGGRVKT :::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: mKIAA4 NRGINEGGDLPEELLRNLYESIKNEPFKIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGGRVKT 280 290 300 310 320 330 300 310 320 330 340 350 mKIAA4 WKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVEDSKKPNCFELYIPDNKDQVIK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::: :..: :::: mKIAA4 WKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVEDPRKPNCFELYNPSHKGQVIK 340 350 360 370 380 390 360 370 380 390 400 410 mKIAA4 ACKTEADGRVVEGNHTVYRISAPTPEEKEDWIKCIKAAISRDPFYEMLAARKKKVSSTKR :::::::::::::::.:::::::.:::::.:.: :::.:::::::.:::.::..... : mKIAA4 ACKTEADGRVVEGNHVVYRISAPSPEEKEEWMKSIKASISRDPFYDMLATRKRRIANKK 400 410 420 430 440 450 mKIAA4 H >>mFLJ00017 ( 408 res) msh09230 (408 aa) initn: 1908 init1: 1302 opt: 1893 Z-score: 1628.9 bits: 310.3 E(): 1.4e-85 Smith-Waterman score: 1893; 70.312% identity (70.496% ungapped) in 384 aa overlap (27-410:23-405) 10 20 30 40 50 60 mKIAA4 RGLREVSGGRGPEPVASTMEDDDSYVPSDLTAEERQELENIRRRKQELLADIQRLKEEIA :..:.. : .::..:. ....:: :::.::.::: mFLJ00 AGKASSWATFPLGFRMDVCHTDPAELSSGEAKELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 mKIAA4 EVANEIESLGSTEERKNMQRNKQVAMGRKKFNMDPKKGIQFLIENGLLKNTCEDIAQFLY .: .:. . :::: . :..:.. .:::::::::.::::.:::. :: . .::::::: mFLJ00 DVFAQIDCFESTEESRMAQKEKEMCIGRKKFNMDPNKGIQYLIEHKLLTSDVQDIAQFLY 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 mKIAA4 KGEGLNKTAIGDYLGERDEFSIQVLYAFVELHEFTDLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKID ::.:::::::: ::::.: ...::: :::. :::..:::::::::::::::::::::::: mFLJ00 KGDGLNKTAIGTYLGEKDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKID 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 mKIAA4 RMMEAFAQRYCQCNTGVFQSTDTCYVLSFAIIMLNTSLHNPNVKDKPTVERFIAMNRGIN ::::::: ::: :: :::.::::::::::..:::::.::::::.:.: :::..:::::: mFLJ00 RMMEAFAARYCLCNPGVFRSTDTCYVLSFSVIMLNTGLHNPNVRDRPPFERFVTMNRGIN 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 mKIAA4 DGGDLPEELLRNLYESIKNEPFKIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGGRVKTWKRRW .:.::::: ::::..:::.:::.::::::.:::::::::::::::::::: ::::::::: mFLJ00 SGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGGDLTHTFFNPDREGWLLKLGG-RVKTWKRRW 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 mKIAA4 FILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVEDSKKPNCFELYIPDNKDQVIKACKTE ::::::::::::.::::::::::::::::...::: ::: :.::: :. . : ::::::. mFLJ00 FILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVEDPKKPFCLELYNPSCRGQKIKACKTD 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 mKIAA4 ADGRVVEGNHTVYRISAPTPEEKEDWIKCIKAAISRDPFYEMLAARKKKVSSTKRH .::.::::.: ::::: . ::...::. :.:.:.: :::..:.:::::. mFLJ00 GDGKVVEGKHESYRISAANAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLLSARKKKIVGK 360 370 380 390 400 >>mKIAA0763 ( 530 res) mbp04234 (530 aa) initn: 376 init1: 193 opt: 538 Z-score: 470.8 bits: 96.5 E(): 4.4e-21 Smith-Waterman score: 538; 41.748% identity (43.000% ungapped) in 206 aa overlap (68-267:79-284) 40 50 60 70 80 90 mKIAA4 LENIRRRKQELLADIQRLKEEIAEVANEIESLGSTEERKNMQRNKQVAMGRKKFNMDPKK : : ... :... .: . :: :.: mKIAA0 TINCSSESSSRDSLREQTLSKQTYHKETRNSWDSPAFSNDVIRKRHYRIGLNLFNKKPEK 50 60 70 80 90 100 100 110 120 130 140 150 mKIAA4 GIQFLIENGLLKNTCEDIAQFLYKGEGLNKTAIGDYLGERD-EFSIQVLYAFVELHEFTD :::.::: :.. .: .:.:: . .::.. ::..::.:. .:. .:: :. .:. mKIAA0 GIQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSA 110 120 130 140 150 160 160 170 180 190 200 210 mKIAA4 LNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCQCNTGV---FQSTDTCYVLSFAIIM ..: .:::.: .:. :::::..:..:::.:::: :: :: :.. :: ..:.::::. mKIAA0 MELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCVCNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIIL 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 mKIAA4 LNTSLHNPNVKD--KPTVERFIAMNRGINDGGDLPEELLRNLYESIKNEPFKIPEDDGND :::....:::: : .: :. ::..:: :.:.: : ..:: :... .: :: mKIAA0 LNTDMYSPNVKPERKMKLEDFVKNLRGVDDGEDIPRETLIGIYERIRKRELKTNEDHVSQ 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 mKIAA4 LTHTFFNPDREGWLLKLGGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIR mKIAA0 VQKVEKLIVGKKPIGSLHHGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFQVPDPNKPQKLGLHQREIFLF 290 300 310 320 330 340 >>mKIAA1110 ( 911 res) mbg05269 (911 aa) initn: 510 init1: 188 opt: 531 Z-score: 462.4 bits: 95.7 E(): 1.3e-20 Smith-Waterman score: 533; 35.926% identity (38.645% ungapped) in 270 aa overlap (5-267:307-564) 10 20 30 mKIAA4 RGLREVSGGRGPEPVASTMEDDDSY-VPSDLTAE :. :: . : ..:. . : :. .: mKIAA1 PAVAQAVVEEAVATEAEEEEEGAKQAGKGAEAEGGDNSEQLSSSSASTKSAKSSSEASAA 280 290 300 310 320 330 40 50 60 70 80 90 mKIAA4 ERQELENIRRRKQELLADIQRLKEEIAEVANEIESLGSTEERKNMQRNKQVAMGRKKFNM .: : .. .. : . : .. . .:.. :: . : .: . ::. mKIAA1 ASKEAL------QAVILSLPRYHCE-NPASCRSPTLSTDTLRKRLYR-----IGLNLFNI 340 350 360 370 380 100 110 120 130 140 150 mKIAA4 DPKKGIQFLIENGLLKNTCEDIAQFLYKGEGLNKTAIGDYLGE-RDEFSIQVLYAFVELH .: ::::::: :.. .: .:.:: . .::.. ::..::. . .:. .:: :. mKIAA1 NPDKGIQFLISRGFIPDTPIGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNSKKQFNRDVLDCVVDEM 390 400 410 420 430 440 160 170 180 190 200 mKIAA4 EFTDLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCQCNTGV---FQSTDTCYVLSF .:....: .:::.: .:. :::::..:..:::.::::.:: : :.. :: ..:.: mKIAA1 DFSNMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCMCNPEVVQQFHNPDTIFILAF 450 460 470 480 490 500 210 220 230 240 250 260 mKIAA4 AIIMLNTSLHNPNVKD--KPTVERFIAMNRGINDGGDLPEELLRNLYESIKNEPFKIPED :::.:::....::.: : .: :: ::..::.:.:.::. ..:: :... .: :: mKIAA1 AIILLNTDMYSPNIKPDRKMMLEDFIRNLRGVDDGADIPRELVVGIYERIQQKELKSNED 510 520 530 540 550 560 270 280 290 300 310 320 mKIAA4 DGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLEN mKIAA1 HVTYVTKVEKSIVGMKTVLSMPHRRLVCCSRLFEVTDVNKLQKQAAHQREVFLFNDLLVI 570 580 590 600 610 620 >>mKIAA0248 ( 1803 res) mbg12530 (1803 aa) initn: 354 init1: 304 opt: 481 Z-score: 416.7 bits: 88.2 E(): 4.6e-18 Smith-Waterman score: 481; 40.201% identity (42.105% ungapped) in 199 aa overlap (74-267:641-835) 50 60 70 80 90 100 mKIAA4 RKQELLADIQRLKEEIAEVANEIESLGSTEERKNMQRNKQVAMGRKKFNMDPKKGIQFLI : :: ..: . : ..::. :::::::: mKIAA0 EEAGDSGADKKFTRKPPRFSCLLPDPRELIEIKN--KKKLLITGTEQFNQKPKKGIQFLQ 620 630 640 650 660 110 120 130 140 150 160 mKIAA4 ENGLLKNTCED--IAQFLYKGEGLNKTAIGDYLGERDEFSIQVLYAFVELHEFTDLNLVQ :.::: .. .::.: .. :.: ::.....: ....: .:: : : : . mKIAA0 EKGLLTIPMDNTEVAQWLRENPRLDKKMIGEFVSDRK--NMDLLESFVSTFSFQGLRLDE 670 680 690 700 710 720 170 180 190 200 210 220 mKIAA4 ALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCQCNTGVFQSTDTCYVLSFAIIMLNTSLHNP ::: .: .::::::: : :..:.:.... .:: . : ..:.:..:..:.:::::. :: mKIAA0 ALRLYLEAFRLPGEAPVIHRLLEVFTEHWRSCNGSPFANSDACFALAYAVIMLNTDQHNH 730 740 750 760 770 780 230 240 250 260 270 mKIAA4 NVK--DKP-TVERFIAMNRGINDGGDLPEELLRNLYESIKNEPFKIPEDDGNDLTHTFFN ::. . : :.:.: .:.: : :. ...:...:..:::: . .::.. mKIAA0 NVRKQNAPMTLEEFRKNLKGVNGGKDFEQDILEDMYHAIKNEEIVMPEEQTGLVRENYVW 790 800 810 820 830 840 280 290 300 310 320 330 mKIAA4 PDREGWLLKLGGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVEDSKK mKIAA0 SVLLHRGASPEGVFLRVPPGSYDLDLFTMTWGPTIAALSYVFDKSLEETIIQKAISGFRK 850 860 870 880 890 900 >>mKIAA2011 ( 771 res) mfj31262 (771 aa) initn: 419 init1: 386 opt: 386 Z-score: 339.4 bits: 72.7 E(): 9.2e-14 Smith-Waterman score: 386; 40.260% identity (40.260% ungapped) in 154 aa overlap (115-268:308-461) 90 100 110 120 130 140 mKIAA4 AMGRKKFNMDPKKGIQFLIENGLLKNTCEDIAQFLYKGEGLNKTAIGDYLGERDEFSIQV .:. ::. .:. :. .. .::. ..:: : mKIAA2 SELDSTERLALGSTDTLSNGQKADLEAAQRLAKRLYRLDGFRKADVARHLGKNNDFSKLV 280 290 300 310 320 330 150 160 170 180 190 200 mKIAA4 LYAFVELHEFTDLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCQCNTGVFQSTDTC .... :: ..: :::: :: . : ::.:. .:.. :.::: ::: ...: : mKIAA2 AGEYLKFFVFTGMTLDQALRVFLKELALMGETQERERVLAHFSQRYFQCNPEALSSEDGA 340 350 360 370 380 390 210 220 230 240 250 260 mKIAA4 YVLSFAIIMLNTSLHNPNVKDKPTVERFIAMNRGINDGGDLPEELLRNLYESIKNEPFKI ..:. :...:::.::. :. . : ::. .:.:::::.:.:::. :: ::::: .. mKIAA2 HTLTCALMLLNTDLHGHNIGKRMTCGDFIGNLEGLNDGGDFPRELLKALYSSIKNEKLQW 400 410 420 430 440 450 270 280 290 300 310 320 mKIAA4 PEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIP :. mKIAA2 AIDEEELRRSLSELADPNPKVIKRVSGGSGSSSSPFLDLTPEPGAAVYKHGALVRKVHAD 460 470 480 490 500 510 >>mKIAA0522 ( 646 res) mbp09103 (646 aa) initn: 297 init1: 129 opt: 296 Z-score: 263.3 bits: 58.3 E(): 1.6e-09 Smith-Waterman score: 296; 42.157% identity (44.330% ungapped) in 102 aa overlap (171-267:3-104) 150 160 170 180 190 mKIAA4 SIQVLYAFVELHEFTDLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCQCNTGV--- :. :::::..:..:::.:::: :: .. mKIAA0 LIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCVCNPALVRQ 10 20 30 200 210 220 230 240 250 mKIAA4 FQSTDTCYVLSFAIIMLNTSLHNPNVKD--KPTVERFIAMNRGINDGGDLPEELLRNLYE :.. :: ..:.::::.:::....:.:: : .. :: ::...: :.:..:: ..:. mKIAA0 FRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPSVKAERKMKLDDFIKNLRGVDNGEDIPRDLLVGIYQ 40 50 60 70 80 90 260 270 280 290 300 310 mKIAA4 SIKNEPFKIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTT :... .. .: mKIAA0 RIQGRELRTNDDHVSQVQAVERMIVGKKPVLSLPHRRLVCCCQLYEVPDPNRPQRLGLHQ 100 110 120 130 140 150 >>mKIAA0969 ( 1106 res) mic02056 (1106 aa) initn: 211 init1: 161 opt: 201 Z-score: 179.8 bits: 43.7 E(): 7.1e-05 Smith-Waterman score: 201; 30.400% identity (33.628% ungapped) in 125 aa overlap (278-393:92-213) 250 260 270 280 290 300 mKIAA4 ELLRNLYESIKNEPFKIPEDDGNDLTHTFFNPD----REGWLLKLGGGRVKTWKRRWFIL ::. . ::: : ... :: :..:::.: mKIAA0 EVPPERPNIRATRTSRKAIAFGKRAHSMKRNPNAPVTKAGWLYKQASSGVKQWNKRWFVL 70 80 90 100 110 120 310 320 330 340 350 mKIAA4 TDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVEDS---KKPNCFELYIP--DNKDQVIKACK .: ::.:.. .. : ::: .. . :. : .. . :.. . :. : mKIAA0 VDRCLFYYKDEKQESILGSIPLLSFRVAAVQPSDNISRKHTFKVTVHWVDEAGASSTHCL 130 140 150 160 170 180 360 370 380 390 400 410 mKIAA4 TEADGRVVEGNHTVYRISAPTPEEKEDWIKCIKAAISRDPFYEMLAARKKKVSSTKRH . .. : .: : .:: .:::.: ::. . : mKIAA0 SPQAEHA--GVRT-YFFSAESPEEQEAWIQAMGEAARVQIPPAQKSVPQPVRHSLEKPDS 190 200 210 220 230 mKIAA0 ENIPPSKHHQQPPHNNLTKLEPEAKTRGEGDGRGCEKAERRPERPEVKKETLVKANGLPS 240 250 260 270 280 290 416 residues in 1 query sequences 1768601 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 11:06:11 2006 done: Mon Mar 27 11:06:12 2006 Scan time: 0.630 Display time: 0.110 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]