# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mfk00395.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0372.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0372, 808 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7919258 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1417+/-0.000182; mu= 12.7941+/- 0.010 mean_var=70.9461+/-13.891, 0's: 39 Z-trim: 55 B-trim: 44 in 2/64 Lambda= 0.152268 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|148705169|gb|EDL37116.1| mCG116369 [Mus musculu (1595) 5233 1159.6 0 gi|162318356|gb|AAI56422.1| Tetratricopeptide repe (1563) 5199 1152.1 0 gi|109465788|ref|XP_001059136.1| PREDICTED: simila (1563) 4887 1083.5 0 gi|194220064|ref|XP_001918367.1| PREDICTED: simila (1564) 4568 1013.5 0 gi|73952285|ref|XP_536294.2| PREDICTED: similar to (1562) 4557 1011.1 0 gi|126321482|ref|XP_001364956.1| PREDICTED: simila (1567) 4206 933.9 0 gi|109464191|ref|XP_226606.4| PREDICTED: similar t (1471) 3892 864.9 0 gi|82235853|sp|Q6DFB8.1|TTC37_XENLA RecName: Full= (1564) 3280 730.5 1.2e-207 gi|183985694|gb|AAI66212.1| Ttc37 protein [Xenopus (1562) 3198 712.5 3.3e-202 gi|194668362|ref|XP_613739.4| PREDICTED: similar t (1545) 2550 570.2 2.3e-159 gi|210091704|gb|EEA39949.1| hypothetical protein B (1475) 1669 376.6 4e-101 gi|210116525|gb|EEA64269.1| hypothetical protein B ( 946) 1393 315.8 5.1e-83 gi|115916059|ref|XP_782499.2| PREDICTED: similar t (1398) 1366 310.0 4.2e-81 gi|115961768|ref|XP_001191373.1| PREDICTED: simila (1475) 1362 309.2 8.1e-81 gi|34782861|gb|AAH15163.1| TTC37 protein [Homo sap ( 206) 1166 265.5 1.6e-68 gi|212509450|gb|EEB12833.1| conserved hypothetical (1309) 941 216.6 5.1e-53 gi|91086379|ref|XP_974702.1| PREDICTED: similar to (1377) 912 210.3 4.4e-51 gi|108877360|gb|EAT41585.1| conserved hypothetical ( 661) 891 205.4 6e-50 gi|156216711|gb|EDO37642.1| predicted protein [Nem (1085) 869 200.8 2.5e-48 gi|167868424|gb|EDS31807.1| tetratricopeptide repe (1231) 856 198.0 2e-47 gi|157020921|gb|EAA03563.4| AGAP003279-PA [Anophel (1231) 823 190.7 3.1e-45 gi|47215918|emb|CAG00393.1| unnamed protein produc (1526) 794 184.4 3e-43 gi|198427094|ref|XP_002124972.1| PREDICTED: simila (1558) 793 184.2 3.6e-43 gi|189519477|ref|XP_690763.3| PREDICTED: similar t (1526) 754 175.6 1.3e-40 gi|190620397|gb|EDV35921.1| GF12228 [Drosophila an (1231) 744 173.3 5.2e-40 gi|193902298|gb|EDW01165.1| GH20601 [Drosophila gr (1227) 736 171.6 1.7e-39 gi|194175840|gb|EDW89451.1| GE19251 [Drosophila ya (1233) 732 170.7 3.2e-39 gi|194125002|gb|EDW47045.1| GM21091 [Drosophila se (1233) 729 170.1 5.1e-39 gi|198136414|gb|EDY69124.1| GA24845 [Drosophila ps (1232) 724 169.0 1.1e-38 gi|193909290|gb|EDW08157.1| GI19800 [Drosophila mo (1231) 722 168.5 1.5e-38 gi|194170872|gb|EDW85773.1| GK23246 [Drosophila wi (1235) 721 168.3 1.7e-38 gi|15010438|gb|AAK77267.1| GH04440p [Drosophila me ( 640) 716 167.0 2.2e-38 gi|190662231|gb|EDV59423.1| GG23410 [Drosophila er (1233) 712 166.3 6.8e-38 gi|23240362|gb|AAF58990.2| CG8777 [Drosophila mela (1233) 709 165.7 1.1e-37 gi|194142388|gb|EDW58794.1| GJ18460 [Drosophila vi (1222) 620 146.1 8.1e-32 gi|110758191|ref|XP_395911.3| PREDICTED: similar t (1096) 565 134.0 3.2e-28 gi|190586351|gb|EDV26404.1| hypothetical protein T (1584) 510 122.0 1.9e-24 gi|221115151|ref|XP_002162336.1| PREDICTED: simila ( 665) 469 112.7 4.9e-22 gi|221121460|ref|XP_002155391.1| PREDICTED: simila ( 462) 456 109.8 2.7e-21 gi|194114066|gb|EDW36109.1| GL17618 [Drosophila pe (1234) 458 110.5 4.2e-21 gi|194192716|gb|EDX06292.1| GD10628 [Drosophila si ( 937) 445 107.6 2.5e-20 gi|215463819|gb|EEB95507.1| hypothetical protein M ( 279) 365 89.6 1.9e-15 gi|220728183|gb|EED82082.1| predicted protein [Pos ( 703) 347 86.0 6e-14 gi|187983898|gb|EDU49386.1| conserved hypothetical (1142) 348 86.3 7.5e-14 gi|119411719|gb|EAW21662.1| antiviral protein (Ski (1419) 337 84.0 4.7e-13 gi|164647542|gb|EDR11786.1| predicted protein [Lac (1329) 328 82.0 1.8e-12 gi|46096135|gb|EAK81368.1| hypothetical protein UM (1546) 328 82.0 2e-12 gi|159127743|gb|EDP52858.1| antiviral protein (Ski (1429) 326 81.6 2.5e-12 gi|66852372|gb|EAL92697.1| translation repressor/a (1429) 326 81.6 2.5e-12 gi|40744409|gb|EAA63585.1| hypothetical protein AN (1410) 324 81.1 3.4e-12 >>gi|148705169|gb|EDL37116.1| mCG116369 [Mus musculus] (1595 aa) initn: 5233 init1: 5233 opt: 5233 Z-score: 6202.6 bits: 1159.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 5233; 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