FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1766.ptfa, 618 aa vs ./tmplib.26680 library 1768399 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5576+/-0.00408; mu= 16.8713+/- 0.273 mean_var=82.2759+/-19.186, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1414 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA3020 ( 1884 res) mbg15810 (1884) 1932 405 3.9e-113 mKIAA1091 ( 1217 res) mbg00289 (1217) 327 77 1.1e-14 mKIAA0870 ( 1280 res) mth00251 (1280) 316 75 5.2e-14 mKIAA1277 ( 1074 res) mph01932 (1074) 266 65 5.5e-11 mKIAA0358 ( 1581 res) mbg05815 (1581) 244 60 1.6e-09 mKIAA1608 ( 845 res) mkg10115 ( 845) 226 56 1.3e-08 >>mKIAA3020 ( 1884 res) mbg15810 (1884 aa) initn: 2377 init1: 1907 opt: 1932 Z-score: 2123.5 bits: 404.6 E(): 3.9e-113 Smith-Waterman score: 2363; 60.312% identity (61.922% ungapped) in 577 aa overlap (34-596:12-587) 10 20 30 40 50 60 mKIAA1 YRYSRRRENAELARAGWAAAAARAATGTRFPGAAAAVMARLADYFIVVGYDHEKPGPGEG : : : ::::::::..:.. . : ::: mKIAA3 ARRHRTLEPWSPPAPLA-MARLADYFVLVAFGPHPRGSGEG 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 mKIAA1 LGKIIQRFPQQDWDDTPFPQGIELFCQPGGWHLSRERKQPTFFVVVLTDIDSDRHYCSCL :.:.::::..::.:.::::::::::::.::.: ::. :::::.:::::.:.::::.:: mKIAA3 QGQILQRFPEKDWEDNPFPQGIELFCQPSGWQLCPERNPPTFFVAVLTDINSERHYCACL 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 mKIAA1 TFYEAEINLQ--------GTKKEEIEG---EEVSGLI--QPAEVFAPKSLVLVSRLDYPE ::.: . : :.:: .: ..:. ::...::::.::::::::. : mKIAA3 TFWEPVESTQEVVCTDNATEKEEEADGGGQARLSSTAPAQPGQLFAPKTLVLVSRLDHAE 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 IFRACLGLIYTVYVDSMSVSLESLIANLCACLVPAAGGSQKLFSLGAGDRQLIQTPLHDS .:: :::::...:....::::..:.:: .: :: :::::. .::::::::.::::: :: mKIAA3 VFRNSLGLIYAIHVEGLNVSLENVIGNLLTCTVPLAGGSQRTISLGAGDRQVIQTPLVDS 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 mKIAA1 LPVTGTSVALLFQQLGIQNVLNLFCAVLTENKVLLHSASFQRLSDACRALESLMFPLKYS :::. ::::::.:::: :::.::::.:::.:::. : :.:::.::::.: .:.:::.:: mKIAA3 LPVSRCSVALLFRQLGITNVLSLFCAALTEHKVLFLSRSYQRLADACRGLLALLFPLRYS 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 mKIAA1 YPYIPILPAQLLEVLSSPTPFIIGVHSIFKTDVHELLDVIIADLDGGTIKIPECIHLSSL . :.::::::::::::.::::::::.. :.....::::::.:::::::. .:::.:. : mKIAA3 FTYVPILPAQLLEVLSTPTPFIIGVNAAFQAETQELLDVIVADLDGGTVTVPECVHIPPL 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 mKIAA1 PEPLLHQTQSALSLILHPDLEVADHAFPPPRTALSHSKMLDKEVRAVFLRLFAQLFQGYR :::: ::...::..: :.::.:: ::::: :. : :: :::.:::::::::::.:::: mKIAA3 PEPLQSQTHNVLSMVLDPELELADLAFPPPTTSASSLKMQDKELRAVFLRLFAQLLQGYR 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 mKIAA1 SCLQLIRIHAEPVIHFHKTAFLGQRGLVENDFLTKVLNGMAFAGFVSERGPPYRACDLFD ::...::: ::::.:::.::::::::::.::: :::.:::::::::::: :::: :::: mKIAA3 WCLHIVRIHPEPVIRFHKAAFLGQRGLVEDDFLMKVLEGMAFAGFVSERGVPYRATDLFD 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 mKIAA1 ELVAFEVERIKVEEKNPLKMIKHIRELAEQLFKNENPNPHMAFQKVPRPTEGSHLRVHIL :::: :: :....:..: ....:..::::::.::::: : .:..:: :: :.:::: mKIAA3 ELVAHEVARMRADESHPHRVLRHVQELAEQLYKNENPYPAVAMHKVQRPGEASHLRRTHR 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 mKIAA1 PFPKINEARVQELIQENLAKNQNAPPATRIEKKCVVPAGPPVGMYVHVCMHPCVHVCVPL :::...:. .: .... :: :.::::.. :.. .::.:::. .. : : .. : mKIAA3 PFPRLDEGTIQWIVDQAAAKMQGAPPAVKAERRSTVPSGPPMTAILERCSGPHINSARRL 530 540 550 560 570 580 600 610 mKIAA1 -CVRVCVLVCVCVCVCVCVHTHAHTHCSF :: :. mKIAA3 EVVRNCISYVFEGKMLEAKKLLPAVLRALKGRAARRCLAHELHLHVQQNRAVLDHQQFDF 590 600 610 620 630 640 >>mKIAA1091 ( 1217 res) mbg00289 (1217 aa) initn: 297 init1: 273 opt: 327 Z-score: 356.2 bits: 77.0 E(): 1.1e-14 Smith-Waterman score: 386; 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