FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4158.ptfa, 761 aa vs ./tmplib.26680 library 1768256 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4057+/-0.00463; mu= 20.2752+/- 0.311 mean_var=97.0003+/-21.949, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1302 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0927 ( 713 res) mbg08305 ( 713) 2224 428 1.2e-120 mKIAA1884 ( 1806 res) mib34059 (1806) 859 173 3.3e-43 mKIAA1894 ( 2796 res) mbf00006 (2796) 768 156 6e-38 mKIAA1890 ( 875 res) mbg14487 ( 875) 290 65 3.3e-11 mKIAA4159 ( 511 res) mid27006 ( 511) 173 43 0.0001 >>mKIAA0927 ( 713 res) mbg08305 (713 aa) initn: 2570 init1: 1261 opt: 2224 Z-score: 2258.2 bits: 428.5 E(): 1.2e-120 Smith-Waterman score: 2404; 47.043% identity (52.006% ungapped) in 744 aa overlap (8-751:32-704) 10 20 30 mKIAA4 PHVSSCLPGPCSWNFSGPEGSLDSPTAPSSPSDVGLD :. :. .:: ::: .:: : .: . :. mKIAA0 NELTGSASEESQETTTSTIVTTTIITTEQAPALCGVSFSDPEGYIDSSDFPPQPYSSFLE 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 mKIAA4 CFYYISVYPGYGVEIKVENISLQEGETITVEGLGGPDPLPLANQSFLLRGQVIRSPTHQA : : ..:: :::::..:....:.::: ....:. :: ::::..:..::::::::. mKIAA0 CTYNVTVYTGYGVELQVKSVNLSEGELLSIRGVDGPTLTVLANQTLLVEGQVIRSPTNTI 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 mKIAA4 ALRFQSLPLPAGPGTFHFRYQAYLLSCHFPRRPAYGDVTVTSLHPGGSAHFHCATGYQLK .. :... : :::...:::..::: ::::: :.::: .:: :: ::::: ::.:. mKIAA0 SVYFRTFQ-DDGLGTFQLHYQAFMLSCPFPRRPDAGEVTVMDLHSGGVAHFHCHLGYELQ 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 mKIAA4 GARFLTCLNATQPFWDSQEPVCIAACGGVIRNATTGRIVSPGFPGNYSNNLTCHWLLEAP ::. :::.::..: :.:::::: : :::...::: ::..::.:::. ... : : .::: mKIAA0 GAKTLTCINASKPHWSSQEPVCSAPCGGAVHNATIGRVLSPSFPGTANGSQLCVWTIEAP 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 mKIAA4 ESQRLHLHFEKVSLAEDDDRLIIRNGNNVEAPPVYDSYEVEYLPIEGLLSSGRHFFVEFS :.:.::::.:.. : : : :.:. .: . . .::: ..: .:.::::: : . .::. mKIAA0 EGQKLHLHLERLLLHEKD-RMIVYSGRTNTSALLYDSLRTESVPFEGLLSEGSSIRIEFT 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 mKIAA4 TDSSGAAAGMALRYEAFQQGHCYEPFVKYGNFSSSAPSYPVGTTVEFSCDPGYTLEQGSI .:.. ::... .:.:::..::::::... :::..: :.: .:: :::.::::..:::: mKIAA0 SDQGQAASAFNIRFEAFEKGHCYEPYIQNGNFTTSDPTYNIGTIVEFTCDPGHSLEQGPA 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 mKIAA4 IIECVDLHDPQWNETEPACRAVCSGEITDSAGVVLSPNWPEPYGRGQDCIWGVHVEEDKR .::::...:: ::.::: :::.:.::.. :::::::::::::..:.::.: .:: :.:: mKIAA0 VIECVNVRDPYWNDTEPLCRAMCGGELSAVAGVVLSPNWPEPYAEGEDCVWKIHVGEEKR 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 mKIAA4 IMLDIRVLRIGSGDVLTFYDGDDLTARVLGQYSGPRGHFKLFTSMADVTIQFQSDPGTSA :.:::. : ....:.::.::::... .::::: : . ::..: :.::::.:::. mKIAA0 IFLDIQFLNLSNSDILTIYDGDEVVPHVLGQYFGHSSPQKLYSSTPDLTIQFHSDPAGLI 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 mKIAA4 LGYQQGFVIHFFEVPRNDTCPELPEIPNGWKNPSQPELVHGTVVTYQCYPGYQVVGSSIL .: :::.....:: :::.: .:::: ::::. :. :::.:. .:::: :::..:::. : mKIAA0 FGKGQGFIMNYIEVSRNDSCSDLPEIQNGWKTTSHTELVRGARITYQCDPGYDIVGSDTL 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 mKIAA4 MCQWDLSWSEDLPSCQRVTSCHDPGDVEHSRRLISSPKFPVGATVQYVCDQGFVLTGSAI :::::::: : : :... :.: .:: mKIAA0 TCQWDLSWSSDPPFCEKT---------EES----------------LACD---------- 540 550 560 580 590 600 610 620 630 mKIAA4 LTCHDRQAGSPKWSDRAPKCLLEQFKPCHGLSAPENGARSPEKRLHPAGATIHFSCAPGY .: :: :::: . :::. : .. : : :. mKIAA0 ---------NP------------------GL--PENGYQILYKRLYLPGESLTFMCYEGF 570 580 590 640 650 660 670 680 690 mKIAA4 VLKGQASIKCVPGHPSHWSDPPPICRAASLDGFYNGRSLDVAKAPAASSALDAAHLAAAI : :...:.:. :.::::: : :::.. . :.: . .:. :.: :: :.:.....: :: mKIAA0 ELMGEVTIRCILGQPSHWSGPLPICKVNQ-DSFEH--ALE-AEA-AAESSLEGGNMALAI 600 610 620 630 640 650 700 710 720 730 740 750 mKIAA4 FLPLVAMVLLVGGVYLYFSRFQGKSPLQLPRTHPRPYNRITVESAFDNPTYETGSLSFAG :.:.. . ::.::.:.: .: . : :.:: . .::..::::. :::: :::: mKIAA0 FIPVLLISLLLGGAYIYVTRCRQYSSLRLPLMYSHPYSQITVETEFDNPIYETGETREYE 660 670 680 690 700 710 760 mKIAA4 DERI mKIAA0 VSI >>mKIAA1884 ( 1806 res) mib34059 (1806 aa) initn: 600 init1: 288 opt: 859 Z-score: 868.1 bits: 172.6 E(): 3.3e-43 Smith-Waterman score: 1002; 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