Comparison of KIAA cDNA sequences between mouse and human (KIAA0892)

<< Original sequence data >>

mouse  mKIAA0892 (mfj60316)     length:   3822 bp
human   KIAA0892  (hk08289)     length:   4164 bp


<< Aligned sequence information (excl. stop, if exists.) >>

----------------------------------------------------------
            length    #match  #mismatch   %diff
----------------------------------------------------------
DNA

  CDS1 :      354       323       31       8.76
  Total:      354       323       31       8.76

  3'UTR:     2352      1148     1204      51.19

amino acid

  CDS1 :      118       118        0       0.00
  Total:      118       118        0       0.00
----------------------------------------------------------


<< Alignment region (incl. stop, if exists.) >>

----------------------------------------------------------
                    cDNA      cDNA original    amino acid
----------------------------------------------------------
  CDS1 : mouse     2 -   358      2 -   358      1 -   119
         human  1511 -  1867      2 -  1867    504 -   622
  3'UTR: mouse   359 -  3822
         human  1868 -  4164
----------------------------------------------------------


<< Alignment >>

*--[ CDS1 ]--*
             1 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 50
             1 R  L  T  A  C  S  L  V  L  L  G  H  I  F  Y  V  L  17
mfj60316     2 CGCCTCACAGCCTGCTCCCTTGTGCTGCTGGGTCACATCTTCTATGTGTT 51
               || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |
hk08289   1511 CGGCTCACAGCCTGCTCCCTCGTGCTTCTGGGCCACATCTTCTATGTGCT 1560
           504 R  L  T  A  C  S  L  V  L  L  G  H  I  F  Y  V  L  520

            51 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 100
            18  G  N  H  R  E  S  N  N  M  V  V  P  A  M  Q  L  A 34
mfj60316    52 GGGAAATCACAGGGAGAGTAACAACATGGTGGTACCTGCCATGCAGCTGG 101
               |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
hk08289   1561 GGGAAACCACAGGGAGAGTAACAACATGGTGGTGCCTGCCATGCAGCTCG 1610
           521  G  N  H  R  E  S  N  N  M  V  V  P  A  M  Q  L  A 537

           101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 150
            35   S  K  I  P  D  M  S  V  Q  L  W  S  S  A  L  L   50
mfj60316   102 CCAGCAAGATCCCAGACATGTCTGTGCAGCTGTGGTCATCTGCCCTCCTG 151
               ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || |||
hk08289   1611 CCAGCAAGATCCCGGACATGTCGGTACAGCTGTGGTCGTCAGCACTGCTG 1660
           538   S  K  I  P  D  M  S  V  Q  L  W  S  S  A  L  L   553

           151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 200
            51 R  D  L  N  K  A  C  G  N  A  M  D  A  H  E  A  A  67
mfj60316   152 AGAGACCTAAACAAGGCATGTGGGAACGCCATGGATGCCCATGAAGCCGC 201
               |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||
hk08289   1661 AGAGACCTGAATAAAGCCTGTGGGAACGCCATGGATGCCCATGAAGCCGC 1710
           554 R  D  L  N  K  A  C  G  N  A  M  D  A  H  E  A  A  570

           201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 250
            68  Q  M  H  Q  N  F  S  Q  Q  L  L  Q  D  H  I  E  A 84
mfj60316   202 ACAGATGCACCAGAACTTCTCACAGCAGCTGCTGCAGGACCACATCGAGG 251
                |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||
hk08289   1711 CCAGATGCACCAGAACTTCTCGCAGCAGCTGCTCCAGGACCACATTGAGG 1760
           571  Q  M  H  Q  N  F  S  Q  Q  L  L  Q  D  H  I  E  A 587

           251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 300
            85   C  S  L  P  E  H  N  L  I  T  W  T  D  G  P  P   100
mfj60316   252 CCTGTAGCCTCCCAGAGCACAACCTCATTACGTGGACAGATGGCCCACCC 301
               |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||
hk08289   1761 CCTGCAGCCTCCCCGAACACAACCTCATCACGTGGACAGACGGTCCACCC 1810
           588   C  S  L  P  E  H  N  L  I  T  W  T  D  G  P  P   603

           301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 350
           101 P  V  Q  F  Q  A  Q  N  G  P  N  T  S  L  A  S  L  117
mfj60316   302 CCTGTGCAGTTCCAAGCTCAGAATGGACCCAACACCAGCCTGGCCAGCCT 351
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk08289   1811 CCCGTGCAGTTCCAAGCTCAGAATGGACCCAACACCAGCCTGGCCAGCCT 1860
           604 P  V  Q  F  Q  A  Q  N  G  P  N  T  S  L  A  S  L  620

           351 ----+-- 357
           118  L  *   119
mfj60316   352 TCTGTGA 358
                ||||||
hk08289   1861 CCTGTGA 1867
           621  L  *   622


*--[ 3'UTR ]--*
             1 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 50
mfj60316   359 GGCCTGTGTCCGCAACTTGGACCCAACACTGGAGCTCTCTGGGAACAAAA 408
                              | | ||     |  |  |||||    ||  |    
hk08289   1868 .............GGCCTTGATGGGGCCATCCAGCTCCGCAGGGCCTGCG 1904

            51 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 100
mfj60316   409 CCACCAGGGTGCCCACCAGTCCCTCACCATTGTCCAGAGCTAAGTCCTAA 458
               |  |   ||   |||||    |  |||       ||   ||    || | 
hk08289   1905 CGTCTCCGGCTTCCACCCAGACGGCAC......TCAAGCCTGCCCCCGAG 1948

           101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 150
mfj60316   459 GAGTGCTGAAGCCATCATCTGCCTCTGAGGGTGACAGCCAATTGCACCTG 508
               | |||||     | | ||   |    |||  |   || |    | |  ||
hk08289   1949 GCGTGCTTCCTTCCTGATTGTCTCTAGAGCTTCCAAGTCCTGGGAATGTG 1998

           151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 200
mfj60316   509 TTCCAGGACTCAGTGCCATCTATTGAAGGGACTGATGGCCTAATCTGTGT 558
                      | ||  |||| ||    || |||  || | |||    |    |
hk08289   1999 CGGGGCCAGTCCCTGCCCTCCCAGGAGGGG..TGGTAGCCGTTCCCACCT 2046

           201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 250
mfj60316   559 CTGGGTGTCACCTGAGAAGAACAGGGTGACAATGTGTGTAGGGGCATCAT 608
               |   |    |||      | | ||| | |||    |   |  |||    |
hk08289   2047 CGCAGCAGGACCCCCAGTGCAGAGGCTCACAGGTGGCACACAGGCGCTGT 2096

           251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 300
mfj60316   609 CTGAGTGCTCAACCGAACCTAAGTGCAGCTGCACAAAGTGG.CCTCCAAC 657
               ||               |   || ||       || ||||| ||||    
hk08289   2097 CT...............CTCCAGAGCCATCCTTCAGAGTGGACCTCAGTG 2131

           301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 350
mfj60316   658 CCAGGGCAAGCTGAGGGGAGAGTAATGGCTCTCACTTTCCTCGGTCTGCT 707
               ||||  |   || |            |  |||   |  | |||| | |  
hk08289   2132 CCAGTCCTGCCTCA............GCATCTGGGTCACGTCGGCCAGGA 2169

           351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 400
mfj60316   708 GTTCTTCCAGTGTCCCTGCACTCAGGGACTTCTGAGGACCTGGAAGTCAG 757
               ||      || || |  ||   |||                      |||
hk08289   2170 GT......AGGGTGCAGGCCTCCAG......................CAG 2191

           401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 450
mfj60316   758 ACTCTTAATCTGAGTGGTCCTCCAAGGTGACCCAGTGCAGGGGAGGAGTT 807
                  || |  ||| |||      | |||  |  ||||||    | ||    
hk08289   2192 GTCCTAATCCTGTGTG......CCAGGGCAGGCAGTGCCCCAGGGG.... 2231

           451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 500
mfj60316   808 TGGGAAGAGGTGTACATACGCAGTTGATGAGGCTGAGACTTCGTGTGCCC 857
                                                                 
hk08289   2232 .................................................. 2232

           501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 550
mfj60316   858 TTAAGAAGCTCCTTGCTCATATTCAGCAGCACGTCTTGGCCCAGCCTAAG 907
                                         || |||| ||       | ||   
hk08289   2232 ..........................CACCACGCCT.......GACTCTC 2248

           551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 600
mfj60316   908 CATCAGGCAGAAGTCCCATTGGACCTGAATGAGAGGGTTCCTTCCTGGCA 957
               |||||  |||   |       || | | |  |||| ||| | ||    ||
hk08289   2249 CATCACCCAGGCCTTGATGCCGAGCGGGAGTAGAGTGTTTCCTCTGCTCA 2298

           601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 650
mfj60316   958 GCTATTTAGCTTTCCCATGGAGGACAGTTATGGGACCAGCTCAGCTCCTC 1007
                     |  |     |  ||| | |||||   || |    |  |      
hk08289   2299 AGGCAATTTCCAGAGCCCGGATGCCAGTTTCTGGCCTGAATTTG...... 2342

           651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 700
mfj60316  1008 TTGGCTTGATAGCTGCCCTAAGGGTGACAATAATGGGGGGGTACGGGGCA 1057
                                   ||||    | ||||||         |||  
hk08289   2343 ...................GAGGGAAGAAGTAATGGCCCTAGTGTGGG.. 2371

           701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 750
mfj60316  1058 CAGTGGTTCCTGCCAGCTCATGGTATCTAGGCAGGTGCTCACCAAGCAAT 1107
                                                       || |||||  
hk08289   2372 ........................................ACGAAGCACA 2381

           751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 800
mfj60316  1108 GTGAAGACCACTTCTCAGAGCTTTGGAAGCCATGACTGAAGGGACGAAGC 1157
               |     | ||||| ||  ||||||                         |
hk08289   2382 GATCCCAGCACTTTTCCCAGCTTT.......................CTC 2408

           801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 850
mfj60316  1158 TCCAAGACCTTCATGGACATCCTTTCTGAGCCATGTGGCAGAGACTGCCC 1207
               ||||  | |                     || ||  ||||     ||| 
hk08289   2409 TCCAGCATCA..................GTCCCTGCAGCAGCTGGGGCCT 2440

           851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 900
mfj60316  1208 ATGGCCAGGTGCTCCCAACCCTTCTGTCTTCCTCTAGCCCTTGGGTCCCA 1257
                ||| ||||  | | ||                         ||| ||||
hk08289   2441 CTGGTCAGGAACCCTCA.........................GGGACCCA 2465

           901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 950
mfj60316  1258 GGGACCTACCCTCAATACCTGCATCACAGCCCTGCTTATTTATTTAAGCT 1307
               || ||  | | || | || |           ||||   || |        
hk08289   2466 GGAACTCAGCTTCCAAACAT...........CTGCACCTTGA........ 2496

           951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1000
mfj60316  1308 TTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTCTAGGGCATTTTGTACATACAGCAATTCA 1357
                                                                 
hk08289   2497 .................................................. 2497

          1001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1050
mfj60316  1358 AACAAGGACCTCTCGACTTGCCATCTGTCCTGATGTTAGAGTGCTTTTAG 1407
                          |  |||| ||||    ||| |  ||  | ||||      
hk08289   2497 ...........CCGGACTCGCCA....TCCCGCCGTGGGGGTGC...... 2525

          1051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1100
mfj60316  1408 TGTCCATATCTCAGGCATGTGAAAACTAAGCACAGGGTCACGACAAACTC 1457
                                                  ||| |    |||| |
hk08289   2526 ..................................AGGTGATTGTAAACAC 2541

          1101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1150
mfj60316  1458 CATAGTCTATGTTGAGTTTCCACCTACATGACCCCACCACAGTGTCCAAC 1507
                   ||  |||| ||                                   
hk08289   2542 GGGTGTGCATGTGGA................................... 2556

          1151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1200
mfj60316  1508 AGCTAAAGATTGAGGGGAAATCCCAGATGGGCTAGCACAAAGAGGTATTA 1557
                ||  | |  || | ||  |                              
hk08289   2557 TGCACACGGGTGTGCGGTGA.............................. 2576

          1201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1250
mfj60316  1558 TAACCCAGGAGTTACTAAGAGCCAGCCCTGAGCCAGGCTAACTGTAGCCC 1607
                       ||  |    |||   |||   ||||   |    |||| || |
hk08289   2577 .......AGATCTGTGGAGATGGAGCTGGGAGCTGAGGCTCCTGTTGCAC 2619

          1251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1300
mfj60316  1608 TATATGAGCCCTTAAGCCACAGGTGACACTCTGAGTGAAGGAAGGCATGT 1657
                |   |   ||||   |||           ||||| |   | | ||  | 
hk08289   2620 CA...GCCACCTTCCCCCATCTTGTGGCTGCTGAGGGGCAGGAAGCGGG. 2665

          1301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1350
mfj60316  1658 CATCTATTGAGAGGGTTGGTTTGTTTTCATAAACATGGGTGGCTTTGCCT 1707
                       ||| ||| | || |  |    | || ||      ||  ||  
hk08289   2666 .......GGAGTGGGCTCGTCTCCTAAATTTAAGATCACCTCCTCAGCTA 2708

          1351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1400
mfj60316  1708 GGTTTTAGCAGCCTTTTAATCGGGAACTGTAAGCTGAGATCTGTGAGAAG 1757
               |   ||||    | |   |  ||   |      | |||||||       |
hk08289   2709 G..CTTAGAGTGCGTGGCACGGGCCCCCCGCCCCCGAGATCT.......G 2749

          1401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1450
mfj60316  1758 TCTGTTTGCTGGTCTCTCCCTTTAGGACCACTATTCCCCCAGTCTTTTCA 1807
                      |    | ||| |||    || |  |   |  ||   ||   | 
hk08289   2750 GAGCCCAGGGACTTTCTTCCTGGCAGATCTGTGGCCTTCCCTGCTCAGCC 2799

          1451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1500
mfj60316  1808 TTTCCCTCCCTCCAGCCTTGCCAGCAGCCCCTCTACTATAGACTGAAGCC 1857
               | |   |||| |||  |   ||| |  | |  || |  |   |||   | 
hk08289   2800 TCTTGGTCCCCCCACTCCCTCCACCGCCTCACCTTCCCT..GCTGGGTCT 2847

          1501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1550
mfj60316  1858 CTGAGGCAGAGGCATAGCCCCTTCATCAACTCAGCCTGGTAGGAAGCTGG 1907
               ||| |||| ||    |  |||     | |  ||| |     |||  |   
hk08289   2848 CTGGGGCACAGTGTGAAACCCGCACCCTAGCCAGGCCCCAGGGAGCC... 2894

          1551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1600
mfj60316  1908 TCCACAGCCCCTTTTTCTGTTTGATTTTAGCTGGATATTGATTGC.TTGT 1956
                                         |  |||||     ||  ||   ||
hk08289   2895 ..........................TCCGCTGGGCCCAGACAGCAGCGT 2918

          1601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1650
mfj60316  1957 TTGTTGTTTTTTGCTTCTTTTGAAGACACTGGTGCCACGCCTCAGCCTCC 2006
               ||| | || |   ||| | ||| | |  | || |   | ||   |    |
hk08289   2919 TTGGTTTTATCCACTTTTCTTGGATAATCAGGAGGTGCCCCAGTGGTCAC 2968

          1651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1700
mfj60316  2007 AAGCACCTGGCTCTTAGATTTTGGCTGTGGGGTTTTGATTGGAAGGGGCA 2056
               |      ||||  |  || || ||  | | |||   |             
hk08289   2969 A...GTGTGGCATTCCGAGTTGGGGCGGGTGGTCGGG............. 3002

          1701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1750
mfj60316  2057 GTGTTTAGAGCTTTTGTTTCTTAAGATAGTATCTCTTGTTCATGGATGAC 2106
                                   | ||||||| | |          | | |  
hk08289   3003 ....................TCAAGATAGCAGC.........AGCAGGTG 3023

          1751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1800
mfj60316  2107 CTTGAGCTCTTGATTCTCCTGCCTCCACCACCCTAGTCCTGGGATGATGG 2156
                  | ||||  ||  |  |  |||||| |  |   | ||  |||   |  
hk08289   3024 TCAGGGCTCAAGACACCACCCCCTCCAGCTTCTGGGGCCCAGGAGCCTCT 3073

          1801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1850
mfj60316  2157 GCATGTGCCATAGTGCTGGCTTTACCTGGTGCTGCTAGCCTAGCATTCTG 2206
                | ||   ||  | |  ||        ||| ||||           || |
hk08289   3074 CCCTGCTACAGGGGGTGGG........GGTCCTGC...........TCAG 3104

          1851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1900
mfj60316  2207 CCAGCTGAGCCATAGCTTTA..TCCTGTGATCCTATCTTGATGCAATATT 2254
               |  | |  |   | | ||||  || ||| | |||  ||   || ||    
hk08289   3105 CAGGGTAGGTGGTGGTTTTAGGTCTTGTCACCCTCACTCAGTGGAA.... 3150

          1901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1950
mfj60316  2255 TGGTTTGGACCTTCTGTGAAGGGTGTTATACCCTGCAGTTTCAGCATACA 2304
                                         |    |  | || ||  || |   
hk08289   3151 .........................CTGCCTCTGGGAGCTTTGGCGTCTG 3175

          1951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2000
mfj60316  2305 AGCCCCTAGACACGCTTGCTCCTGTACCCAGGTGCAACGCAGAAACCAGC 2354
                | |   ||  ||||| | |    | | |||||             ||||
hk08289   3176 TGACTAAAGGGACGCTGGAT....TGCTCAGGT.............CAGC 3208

          2001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2050
mfj60316  2355 TGGACATGGTGGCTCACACCTGTCACACCTGGAAGGCTAAGAACACTCCC 2404
               ||  |  ||                                    |||||
hk08289   3209 TGCTCGGGG....................................CTCCC 3222

          2051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2100
mfj60316  2405 AAGTTACATGCCAGTAAGGGTTACACAGTGAAATATGAATAACCCAGTAA 2454
               | | |   ||    | ||    |  ||| |   | | ||||||||  |  
hk08289   3223 AGGCTGGGTGTGCCTTAGCCACAGGCAGGG..CTGTCAATAACCCCCTTC 3270

          2101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2150
mfj60316  2455 AGGAGAGCCTGGTCCAGCCCTTGTGCTCCTGGGTAGGGAAGGCTCTTTGC 2504
                  |  | |     |    | |  || || | |   ||      ||   |
hk08289   3271 CTCACTGGCCACCACCTGACATCAGCACCAGTGACAGG......CTGGTC 3314

          2151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2200
mfj60316  2505 TTTTCCATGGGTTAGTTGACTCTTGACTGCAGGTGAAATCCATATAAAAT 2554
                       ||| | ||      ||| |   ||  ||   ||         
hk08289   3315 AGAGGGCGGGGCTGGTGAGGGTTTGTCCTAAGAGGACCACC......... 3355

          2201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2250
mfj60316  2555 TAGACAGGTTTAAAAAAAAAACAAAACAAAAAAGCCGGGCGTGGTGGCGC 2604
                                                                 
hk08289   3356 .................................................. 3356

          2251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2300
mfj60316  2605 ACGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGTGAATTTCTGAGT 2654
                           ||| | || ||    ||| || ||              
hk08289   3356 ...........GCCATCTCTGGGTCTCCAGGGGGAG.............. 3380

          2301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2350
mfj60316  2655 TCAAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATA 2704
                       ||||||| |          || |   |  | ||||||||   
hk08289   3381 ........AGCCTGGCC........CTGTCCTTTGCTACCCAGGGCT... 3411

          2351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2400
mfj60316  2705 CAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAACAAAAAAAAAAATAATTAGACAGGTTT 2754
                       ||| | | ||  || | || |  | |     | |    |   
hk08289   3412 .....GCCCCCAGGCCCATGAAGCCAATAGGAGAGCGTGTGGCACTGGCC 3456

          2401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2450
mfj60316  2755 TACTGATAGGTGGTTGACTTAAATTTGACAGACTTTAACTGTCTATCCCT 2804
                ||  |  |    |   ||              | |  ||  | | || |
hk08289   3457 CACAAACTGTCCCTGTCCT.............GTCTTCCTCCCGAGCCAT 3493

          2451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2500
mfj60316  2805 GG...CTGATCTTGTATTGTAGCTGCTGTTCCCCAAATCTCACCCAAGGT 2851
               ||   ||| |         | |  |  |  ||||| |||   ||      
hk08289   3494 GGCCTCTGCTAGCTCCACCTTGAAGGAGCCCCCCACATCCTCCC...... 3537

          2501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2550
mfj60316  2852 TATATAGTGTGAGCTACCACTGTAGGATTAGACTGGGTTTGTTTGTTTGT 2901
                            ||||  |     |||   ||    | ||| |      
hk08289   3538 .............CTACATCCCAGAGATGCCACCACTTGTGTCTCCACAA 3574

          2551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2600
mfj60316  2902 TTTGCTTTTTGTGGCTTGGTTTCTGGATCTCCACTGGCTTACATAGGAAA 2951
               | ||||  |     |  || ||| |      ||||| |  ||    | | 
hk08289   3575 TGTGCTCCTGCCCACCCGGGTTCCG......CACTGTCCGACCCCTGCAC 3618

          2601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2650
mfj60316  2952 TTCTTACATTTCAACCCCAAGTTTCTGAGACCGTAGGTAGCACTCCACCA 3001
                 |   ||| ||| | |   ||          | |    |  |  | |||
hk08289   3619 ACCACTCATGTCACCACGGCGT..........GCATCATGTTCATCCCCA 3658

          2651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2700
mfj60316  3002 TGCCATCTCTTCAGCCACTTGTTTGTAGTTTTGTACTTTGTTGGGGGTGG 3051
               |    |   || ||||  |  ||  | ||   | | |||||  |  |   
hk08289   3659 TCTATTTATTTAAGCCTTTCTTTGCTTGTAGGGCATTTTGTATGTAG... 3705

          2701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2750
mfj60316  3052 AACCAAGCTCTTGTGCACAGCAAACACACCTCTCAAACTGAACTATACTG 3101
                    |||  |||   |||| || | ||   || ||    | || | |||
hk08289   3706 .....AGCAGTTGAAAACAG.AACCTCAGAACTTAA...CATCTGTCCTG 3746

          2751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2800
mfj60316  3102 CAGGTGTTCCTAAATTCAAGACCCCAGTGCTCAAGACTCAAGGGAGGAGC 3151
                 | |         |||| |||| |  || |                   
hk08289   3747 ATGTTAAAGTGCTTTTCATGACCACCCTGTT................... 3777

          2801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2850
mfj60316  3152 ATCCACTGCCTTCGGTATGCCATTGTGTGCCTAAGCACTGACCTTTCCGA 3201
                       |  |   ||||  |   |  |  | ||  || |  ||| | |
hk08289   3778 ......ATCTATGTATATGTAAAGTTAAGGATGAGATCTTAAGTTTACAA 3821

          2851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2900
mfj60316  3202 AAGGATTCAGAGTCCAGCTATGTGTCTCATCCCCCACACCTGGGCATCTC 3251
                   |  |  ||| |                                 ||
hk08289   3822 TTAAAAACTCAGTAC.................................TC 3838

          2901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2950
mfj60316  3252 TGCCTTCCAGAGTCTGCTTAAGCTAGATTTCAGGTAGAGTCCACTCCTTC 3301
                   ||  | | ||| ||  ||||  ||   ||                 
hk08289   3839 AATATTTAATATTCTACTCGAGCTTTATGGAAG................. 3871

          2951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3000
mfj60316  3302 CTTTGTCAACTTGAAGGCTCTATCGTCAGAACAAGCCTGGTCCTACCTCA 3351
                                                                 
hk08289   3872 .................................................. 3872

          3001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3050
mfj60316  3352 CCAACCCTGGATGGTGGGGTTTGGAGCAAGTGAGGTAGATGAGTCCTGGG 3401
               ||||  |  |    || |  |  | ||  ||| |  || |  |  |    
hk08289   3872 CCAAATCATGTGCATGTGTGTGTGTGCGTGTGTGCAAGCTTTGAAC..CT 3919

          3051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3100
mfj60316  3402 GCTTTGCTGGTTGTTACCTCCTATGACAGCAGGTGTCCCATCTGGAAAGT 3451
                |||     |  |   | ||  ||||||  | |  |   ||  | |   |
hk08289   3920 CCTTCCACAGCCGCATCTTCTCATGACACAAAGCTTTTGATAAGTACTTT 3969

          3101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3150
mfj60316  3452 TGAGTCTGTCGTCAGCCTGTGCTAAGCTGGCTGGGCACACAAAGCTTCTC 3501
                  ||  |||                  |    ||  | || ||| ||||
hk08289   3970 CCTGTGGGTC..................GCTCAGGGCCTCATAGCATCTC 4001

          3151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3200
mfj60316  3502 ATGAGAGTGGTCTACCATCCCAAATAGCAAAAACGCCCCACAGCCAGGCA 3551
               ||   | |                      | | |       ||||| ||
hk08289   4002 ATTCAATT......................ACAAGAATAGAGGCCAGACA 4029

          3201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3250
mfj60316  3552 AGGTGGCATGTATCTGTGATCCCAGCAATGAAGAGGTAAAGATCAGGAGT 3601
                ||||||   |  ||||  ||||||| |    |  |       |||||| 
hk08289   4030 CGGTGGCGCATGCCTGTAGTCCCAGCTAACTGGGAGGCTGAGGCAGGAGG 4079

          3251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3300
mfj60316  3602 TAAGGGTCATCCTCATGCTAGCCTGGGCTACAGGACCTTGTTTTTGAAAA 3651
                     | | ||                                      
hk08289   4080 ATCACTTGAGCC...................................... 4091

          3301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3350
mfj60316  3652 AATAAAACAGGAGCTGGAGAAATGGGTCAGCAGTTTATAGAGGCCCAAGT 3701
                      |||||| | |||      || ||||   |   ||  |   | |
hk08289   4092 .......CAGGAGATTGAGGCTGCAGTGAGCATGATCGCGACACTGCACT 4134

          3351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3400
mfj60316  3702 TCAGTTCCCAGCACCCTTGTCAGGCAGCTAACAGCCCATCTGTAACTCCA 3751
                |||                                              
hk08289   4135 CCAG.............................................. 4138

          3401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3450
mfj60316  3752 GCTCTGGGGGTCTGACAACCCTCTTCTGGCATCTACACATACCTGAACAC 3801
                  ||||| | | |  |  | |  |||                       
hk08289   4139 ..CCTGGGTGACGGTGAGACTTTGTCTC...................... 4164

          3451 ----+----*----+----*- 3471
mfj60316  3802 TTAGAGCATTTACAAATAATT 3822
                                    
hk08289   4164 ..................... 4164