FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0603.ptfa, 956 aa vs ./tmplib.26680 library 1768061 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6104+/-0.00661; mu= 4.9795+/- 0.440 mean_var=217.8062+/-50.945, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0869 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1108 ( 1266 res) mbg02140 (1266) 2053 271 6.9e-73 mKIAA4104 ( 1065 res) mbg15134 (1065) 748 107 1.1e-23 mKIAA0019 ( 841 res) mpm12253 ( 841) 409 65 5.9e-11 mFLJ00006 ( 766 res) mbj00080 ( 766) 377 61 9e-10 mKIAA1055 ( 979 res) mpf00228 ( 979) 358 58 5.5e-09 mKIAA0882 ( 1229 res) mfj03243 (1229) 350 57 1.3e-08 mKIAA0676 ( 1268 res) mfj02220 (1268) 338 56 3.7e-08 mFLJ00288 ( 329 res) mic33003 ( 329) 324 54 5.1e-08 mKIAA0608 ( 738 res) mfj39041 ( 738) 304 51 5e-07 mKIAA1322 ( 645 res) mbh00387 ( 645) 294 50 1.1e-06 mFLJ00332 ( 439 res) msk03045 ( 439) 230 42 0.00022 >>mKIAA1108 ( 1266 res) mbg02140 (1266 aa) initn: 2984 init1: 1676 opt: 2053 Z-score: 1400.9 bits: 271.0 E(): 6.9e-73 Smith-Waterman score: 3007; 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