FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4225.ptfa, 868 aa vs ./tmplib.26680 library 1768149 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8367+/-0.00534; mu= 13.2139+/- 0.356 mean_var=136.6329+/-32.134, 0's: 0 Z-trim: 12 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.1097 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1739 ( 755 res) mtj00724 ( 755) 1569 260 6.2e-70 mKIAA1745 ( 871 res) mid29072 ( 871) 1503 250 9.5e-67 mKIAA4055 ( 794 res) mfj06069 ( 794) 1274 214 7.3e-56 mKIAA1479 ( 1009 res) mbg01940 (1009) 846 146 2.1e-35 mKIAA0331 ( 574 res) mph02015 ( 574) 802 139 1.8e-33 mKIAA1619 ( 240 res) mpg02927 ( 240) 508 92 1.1e-19 mKIAA1869 ( 774 res) mph01643 ( 774) 502 91 4.4e-19 >>mKIAA1739 ( 755 res) mtj00724 (755 aa) initn: 1090 init1: 489 opt: 1569 Z-score: 1347.9 bits: 260.3 E(): 6.2e-70 Smith-Waterman score: 1569; 46.154% identity (47.866% ungapped) in 559 aa overlap (100-647:17-566) 70 80 90 100 110 120 mKIAA4 YVGAREAVFAVNALNISEKQHEVYWKVSEDKKSKCAEKGKSKQTECLNYIRVLQPLSSTS .: . .::.. ::::.:.:: ::: .:. mKIAA1 RLWSCKERSLGRLQLRRKLNVPRKGRA-QTECFNFIRFLQPYNSSH 10 20 30 40 130 140 150 160 170 180 mKIAA4 LYVCGTNAFQPTCDHLNLTSFKF-LGKSEDGKGRCPFDPAHSYTSVMVGGELYSGTSYNF :::::: :::: : ..:. .: . .. :::::.::.:::...:...: :::::.: :: mKIAA1 LYVCGTYAFQPKCTYINMLTFTLDRAEFEDGKGKCPYDPAKGHTGLLVDGELYSATLNNF 50 60 70 80 90 100 190 200 210 220 230 240 mKIAA4 LGSEPIISRN-SSHSPLRTEYAIPWLNEPSFVFADVIQKSPDGPEGEDDKVYFFFTEVSV ::.::.: : ..: ..::: ::::: :: . . .: . :.:::.::::.: .: mKIAA1 LGTEPVILRYMGTHHSIKTEYLAFWLNEPHFVGSAFVPESVGSFTGDDDKIYFFFSERAV 110 120 130 140 150 160 250 260 270 280 290 300 mKIAA4 EYEFVFKLMIPRVARVCKGDQGGLRTLQKKWTSFLKARLICSKPDSGLVFNILQDVFVLR ::. . .. :::::::::.:: ::::::::.::::::.:: :: . :: :. : .:: mKIAA1 EYDCYSEQVVARVARVCKGDMGGARTLQKKWTTFLKARLVCSAPDWKVYFNQLKAVHTLR 170 180 190 200 210 220 310 320 330 340 350 360 mKIAA4 APGLKEPVFYAVFTPQLNNVGLSAVCAYTLATVEAVFSRGKYMQSATVEQSHTKWVRYNG . . .. .:..:: . ... ::::: : : .. :: .: : . . ::.. ::.::. mKIAA1 GASWHNTTFFGVFQARWGDMDLSAVCEYQLEQIQQVF-EGPYKEYS--EQAQ-KWARYTD 230 240 250 260 270 280 370 380 390 400 410 420 mKIAA4 PVPTPRPGACIDSEARAANYTSSLNLPDKTLQFVKDHPLMDDSVTPIDNRPKLIKKDVNY :::.::::.::.. : .:::::.:::.::.:.: ::::.:.: : .:: :.::..:. mKIAA1 PVPSPRPGSCINNWHRDNGYTSSLELPDNTLNFIKKHPLMEDQVKPRLGRPLLVKKNTNF 290 300 310 320 330 340 430 440 450 460 470 480 mKIAA4 TQIVVDRTQALDGTFYDVMFISTDRGALHKAVILTKEVHVIEETQLFRDSEPVLTLLLSS :..:.::. .:::. : :.::.: : : ::: : .:..:: :.: :.::: .:.::. mKIAA1 THVVADRVPGLDGATYTVLFIGTGDGWLLKAVSLGPWIHMVEELQVF-DQEPVESLVLSQ 350 360 370 380 390 400 490 500 510 520 530 540 mKIAA4 KKGRKFVYAGSNSGVVQAPLAFCEKHGSCEDCVLARDPYCAWSPAIKACVTLHQEEASSR .: : ..::: : .:: :: : :. : ::::::::::::. . ::. . ...: mKIAA1 SK--KVLFAGSRSQLVQLSLADCTKYRFCVDCVLARDPYCAWNVNTSRCVATTSGRSGSF 410 420 430 440 450 550 560 570 580 590 600 mKIAA4 GWIQDMSG-DTSS-CLD---KSKESFNQHFFKHGGTAE-LKCFQKSNLARVVWKFQNGEL .: ... :::. : . :. .:. ... .:: : : .::::.. : : . .: mKIAA1 -LVQHVANLDTSKMCNQYGIKKVRSIPKNITVVSGTDLVLPCHLSSNLAHAHWTFGSQDL 460 470 480 490 500 510 610 620 630 640 650 mKIAA4 KAASP-KYGF-VGRKHLLIFNLSDGDSGVYQCLSEER-VRNKTVSQLLAKHVLEVKMVPR : .: .. . .: . :... .. :: :.: :::. .: . : :.: mKIAA1 PAEQPGSFLYDTGLQALVVMAAQSRHSGPYRCYSEEQGTRLAAESYLVAVVAGSSVTLEA 520 530 540 550 560 570 660 670 680 690 700 710 mKIAA4 TPPSPTSEDAQTEGSKITSKMPVASTQGSSPPTPALWATSPRAATLPPKSSSGTSCEPKM mKIAA1 RAPLENLGLVWLAVVALGAVCLVLLLLVLSLRRRLREELEKGAKASERTLVYPLELPKEP 580 590 600 610 620 630 >>mKIAA1745 ( 871 res) mid29072 (871 aa) initn: 1451 init1: 731 opt: 1503 Z-score: 1290.7 bits: 249.9 E(): 9.5e-67 Smith-Waterman score: 1653; 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