FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00088.ptfa, 904 aa vs ./tmplib.26680 library 1768113 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.5659+/-0.0039; mu= 23.3563+/- 0.262 mean_var=69.6262+/-15.965, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.1537 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0088 ( 775 res) mbh03415 ( 775) 2938 661 1.3e-190 mKIAA1161 ( 718 res) mbh03358 ( 718) 242 63 1.1e-10 >>mKIAA0088 ( 775 res) mbh03415 (775 aa) initn: 2889 init1: 2831 opt: 2938 Z-score: 3514.6 bits: 661.3 E(): 1.3e-190 Smith-Waterman score: 2938; 55.764% identity (55.989% ungapped) in 746 aa overlap (159-903:31-774) 130 140 150 160 170 180 mFLJ00 FKIDLLSKNEAVISINSLGQLYFEHLQVPHKQRATKGNGQNTPAATSQENQEDL-GLWEE . .:: :.: . : :... ..: : ::: mKIAA0 PLVPAPSGLEQTALLPSRQESKDPAEGNGAQPEATPGDG-DKPEETQEKAEKDEPGAWEE 10 20 30 40 50 190 200 210 220 230 240 mFLJ00 KFGKFVDVKANGPSSVGLDFSLHGFEHLYGIPQHAESHQLKNTRDGDAYRLYNLDVYGYQ : : : ::.:::::::: :.::.::::.::.: .:: :. :. ::::::::. :. mKIAA0 TFKTHSDSKPYGPTSVGLDFSLPGMEHVYGIPEHADSLRLKVTEGGEPYRLYNLDVFQYE 60 70 80 90 100 110 250 260 270 280 290 300 mFLJ00 VHDKMGIYGSVPYLLAHKQGRTVGIFWLNASETLVEINTEPAVEYTMTQMGPAAAKQKVR ... :..::::: ::::. : .:::::::.:: :.:... : . . .: . mKIAA0 LNNPMALYGSVPVLLAHSFHRDLGIFWLNAAETWVDISSNTAGKTLFGKMLDYLQGSGET 120 130 140 150 160 170 310 320 330 340 350 360 mFLJ00 CRTDVHWMSESGIIDVFLLTGPTPADVFKQYSYITGTQAMPPLFSLGYHQCRWNYEDEQD .::..::::::::::::. ::. :::.::. .:::::.:::::::::: ::::.:: : mKIAA0 PQTDIRWMSESGIIDVFLMLGPSVFDVFRQYASLTGTQALPPLFSLGYHQSRWNYRDEAD 180 190 200 210 220 230 370 380 390 400 410 420 mFLJ00 VKAVDAGFDEHDIPYDVIWLDIEHTEDKKYFTWDKKRFANPKRMQELLRSKKRKLVVISD : :: :::.:..: :::::::::.. :.::::: :: .: : : : ::.::::.: : mKIAA0 VLEVDQGFDDHNMPCDVIWLDIEHADGKRYFTWDPTRFPQPLNMLEHLASKRRKLVAIVD 240 250 260 270 280 290 430 440 450 460 470 480 mFLJ00 PHIKVDPDYTVYAQAKEQGFFVKNPEGGDFEGVCWPGLSSYLDFTNPKVREWYSSLFAFP :::::: : :. . ...:..::. .:.:.:: :::: .:: :::::..: :.:..:.: mKIAA0 PHIKVDSGYRVHEELRNHGLYVKTRDGSDYEGWCWPGSASYPDFTNPRMRAWWSNMFSFD 300 310 320 330 340 350 490 500 510 520 530 540 mFLJ00 VYQGSTDILFLWNDMNEPSVFRGPELTMHKSAVHYGDWEHRELHNIYGFYQQMATAEGLI :.::. :..:::::::::: :::.:: :.::::: ::::..:::::.: .::::.::: mKIAA0 NYEGSAPNLYVWNDMNEPSVFNGPEVTMLKDAVHYGGWEHRDIHNIYGLYVHMATADGLI 360 370 380 390 400 410 550 560 570 580 590 600 mFLJ00 QRSKGKERPFVLSRSFFAGSQKYGAVWTGDNKAEWSYLKISIPMLLTLSVSGISFCGADV ::: : ::::::::.::.:::..:::::::: :::..::::::: :.:.. :.::::::: mKIAA0 QRSGGIERPFVLSRAFFSGSQRFGAVWTGDNTAEWDHLKISIPMCLSLALVGLSFCGADV 420 430 440 450 460 470 610 620 630 640 650 660 mFLJ00 GGFIGNPEAELLVRWYQAGAYQPFFRGHATMNTKRREPWLFGEEYTQLIREAIRQRYALL :::. ::: :::::::: ::::::::.:: ..: ::::::.. .: . ::.:. :::.:: mKIAA0 GGFFKNPEPELLVRWYQMGAYQPFFRAHAHLDTGRREPWLLASQYQDAIRDALFQRYSLL 480 490 500 510 520 530 670 680 690 700 710 720 mFLJ00 PYLYSLFYHAHVSSQPVMRPLWVEYPDDLETFAVEDEYMLGSALLVHPVTDPQTATIDVF :. :.:::.:: . ::::::::.::.:. ::..::..:::.:::.:::.: . ..:. mKIAA0 PFWYTLFYQAHKEGFPVMRPLWVQYPEDMSTFSIEDQFMLGDALLIHPVSDAGAHGVQVY 540 550 560 570 580 590 730 740 750 760 770 780 mFLJ00 LPGSDEVWYDSKTFAYWKGGCTVKIPVTLDTIPVFQRGGSVVPVKTTVGTSTGWMADSPY :::..::::: ... .: :. .::::..::::::::..:: : :. : :.: mKIAA0 LPGQEEVWYDIQSYQKHHGPQTLYLPVTLSSIPVFQRGGTIVPRWMRVRRSSDCMKDDPI 600 610 620 630 640 650 790 800 810 820 830 840 mFLJ00 GLRVALSPQGSAVGELYLDDGHSFQYLHQDQFLYRKFLFCSSVLTNRCANEKGHYPSKCI : :::::::.: :::.:::::.:.: . .:: :.: : .:.:.. :. ::: . mKIAA0 TLFVALSPQGTAQGELFLDDGHTFNYQTRHEFLLRRFSFSGSTLVSSSADPKGHLETPIW 660 670 680 690 700 710 850 860 870 880 890 900 mFLJ00 VEQILVLGLKKKPSSVTTHLSDGRAQPAAFTYCAETSTLRLEKLSLRVGEDWEVRVG .:.....: ::..:. . . . . .: . :::.: :.: .. :. :: ... mKIAA0 IERVVIMG-AGKPAAVVLQTKGSPESRLSFQHDPETSVLILRKPGVSVASDWSIHLR 720 730 740 750 760 770 >>mKIAA1161 ( 718 res) mbh03358 (718 aa) initn: 282 init1: 142 opt: 242 Z-score: 283.9 bits: 63.4 E(): 1.1e-10 Smith-Waterman score: 348; 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