FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4100.ptfa, 1145 aa vs ./tmplib.26680 library 1767872 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2692+/-0.00408; mu= 20.1556+/- 0.274 mean_var=79.6425+/-17.966, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1437 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0587 ( 1067 res) mbg06335 (1067) 3204 675 1.7e-194 >>mKIAA0587 ( 1067 res) mbg06335 (1067 aa) initn: 3129 init1: 1644 opt: 3204 Z-score: 3584.3 bits: 675.0 E(): 1.7e-194 Smith-Waterman score: 4123; 56.657% identity (58.027% ungapped) in 1059 aa overlap (13-1071:33-1066) 10 20 30 40 mKIAA4 LSGWSSLSVAIMSLTSAYQLKLAEKLTILNDRGQGVLIRMYN :. . : ::::::::::::: :.: :.:: mKIAA0 GQAGGPEGGGEPGSSAPGGGGGGGGRTMSRSVLQPSQQKLAEKLTILNDRGVGMLTRLYN 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 mKIAA4 IKKTCSDSKSKPPFLLEKSMESCLKYINKKFPNIDVRNSTQHLGPVHREKAEIIRFLTNY :::.:.: :.:: .:..:..:: .:.: .::: ...::..:.:. ...::.::.. :. : mKIAA0 IKKACGDPKAKPSYLIDKNLESAVKFIVRKFPAVETRNNNQQLAQLQKEKSEILKNLALY 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 mKIAA4 YQSFVDVMEFRDHVYELLNTIDACQCHFDINLNFDFTRSYLDLIVTYTSVILLLSRIEDR : .:::::::.::: .::::::.:: :::..:::.:..:::: ::::....::::::.: mKIAA0 YFTFVDVMEFKDHVCDLLNTIDVCQVFFDITVNFDLTKNYLDLTVTYTTLMILLSRIEER 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 mKIAA4 RILIGMYNCAHEMLHGHSDPSFARLGQMVLEYDHPLKKLTEEFGPHTKAVSGALLSLHFL . .::.:: :::: :: :: . :::::...:..::::. ::: ::.:..: ::.::... mKIAA0 KAIIGLYNYAHEMTHGASDREYPRLGQMIVDYENPLKKMMEEFVPHSKSLSDALISLQMV 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 mKIAA4 FVRRNQGAEQWRSAQLLSLISSPPAMINPANSDTMACEYLSVEVMERWIIIGFLLCHGCL . ::: .:.:::.::::::::.: .:.: .::.:::: : mKIAA0 YPRRNLSADQWRNAQLLSLISAPSTMLN----------------------FGFILCHGML 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 mKIAA4 NSNSQCQKLWKLCLEGSLYITLIREDVLQVHKVTEDLFSSLKGYSKRVADIKESKEHAIT :... .:::: :..: ..:.:..:...::..:::: ...::.::. ::.: :: :.. mKIAA0 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