FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
../query/mKIAA4129.ptfa, 1125 aa
vs ./tmplib.26680 library
1767892 residues in 2168 sequences
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Lambda= 0.0781
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: :.::.::..::.::.::: :::: ::::
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:::::..:. . .:: . . : .. ::.:: ..:..:.: :: ::::. : .:
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.. .. . ...:: . : . . :. ::. . ... . . : . :.: :
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::.::::::::.::::::::::::::::::: : :. :: :::...: :
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150 160 170 180 190
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: :::::.::.::.::::::::.::.:::::::::: ::...:. ::
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200 210 220 230 240
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:. : ::. :: ::.:::. :.::: :. : :.::. :::::..::
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250 260 270 280
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::::::::.::.. ::::: ::::::::::: .:..::::::::.:::.:::.::: ::.
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290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470
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: :::::::::::.:: .:.: .::... : ..:::...:.. . :.:.. : .. :
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350 360 370 380 390 400
480 490 500 510 520 530
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: : ::: .... : .:.::.::: ::: ::.:. :::: .::::::::::
mKIAA0 RPPHSLHSMPADGQLDGTYPPPVHDDNVSMASSGATQAELMTLTIVKGAQGFGFTIADSP
410 420 430 440 450 460
540 550 560 570 580 590
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: ::::::.: : :: :::::::.:..::: :.:..:::.: .:: :::..:...:
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470 480 490 500 510 520
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::. : :.:: . ..: ..:.: : :.:. : : : :: . :: . ::
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530 540 550 560 570
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.:.. .::::.... .::..::.: . : : ... ...:.. .:.: :
mKIAA0 STEAFDPRKPDPYELYEKSRAIYESRQQVP-PRTSF-------RMDSSG----PDYKELD
580 590 600 610 620
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. : : :.:::::::::.:::.:: :: .. .:.:: ::::. ::::. ::: :: ::.:
mKIAA0 VHLRRMESGFGFRILGGDEPGQPILIGAVIAMGSADRDGRLHPGDELVYVDGIPVAGKTH
630 640 650 660 670 680
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. :..::..::..:.:::::::::. . : :: . :. .:.:::: : :.
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.. .. : .. .:... : .: :: :: :.: :::::::::.::..:
mKIAA0 YATYSNSNHAAPSSNASPP--------EGFASHSLQTSDVVIHRKENEGFGFVIISSLNR
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mKIAA4 PEAGTTFGNACVAMPHKIGRIIEGSPADRCGKLKVGDRILAVNGCSITNKSHSDIVNLIK
::.:.: ...::::::::.:::::::.::::::::::::: :: : :.:::.:::
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950 960 970 980
mKIAA4 EAGNTVTLRIIPGDESSNATLLTNAEKIATITTTH------------------------A
.:: .::::::: .: .. : ..:: . .. : :
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: : :: ... :. .: .:: . .... : ..
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: ::: .::..:.::::::::.::::::.::::::::::::::
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mKIAA4 RCGKMRIGDEILEINGETTKNMKHSRAIELIKNGGRRVRLFLRRGDGSVPEYGGSNYENI
: :.::.::.:.:::::.:..: :.:::::::.:::::::.:.:: :.:::::
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1030 1040 1050 1060 1070 1080
1120
mKIAA4 PSFPGMTP
mKIAA0 MCMKSDKHGSPYFYLLGHPKDTTNPTPGVLPLPTWDIQREHDVRKPKELSAGGQKKQRLG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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210 220 230 240 250 260
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::: :::::::: ::.:::::.:.:::.::
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10 20 30
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:: :::::::: : .: : :. : .:
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330 340 350 360 370 380
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:::.::.::: .....:.::. :::::..:::.::::::.:... ::::: :::. ::
mKIAA1 -FTRDPSQLKGVLVRASLKKSTMGFGFTIIGGDRPDEFLQVKNVLKDGPAAQDGKIAPGD
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:::..: .::::::::.::..:: .:.. :.: :::::::: : .:: ...:...
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130 140 150 160 170
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180 190 200 210 220 230
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:: ..::::.:. ..::: ::::.::::: : :.::.:.:: :.::..::.: :. ..
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240 250 260 270 280 290
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::: ::: :::..: . : :..: ::. ::: : :. :. . :....:
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300 310 320 330 340
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350 360 370 380
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mKIAA4 SGLSKGERDREINSTNFGECQNYQEQDIFLWRKETGFGFRILGGNEPGEPIYIGHIVPLG
: .. :.:: ..:.:::::.:::. : . :::: :.:::
mKIAA1 ---------------------NTKDLDVFLRKQESGFGFRVLGGDGPDQSIYIGAIIPLG
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::. :::::..:::.:.:: :: ::::. :..:: ::..::: ::::::. .. . :.
mKIAA1 AAEKDGRLRAADELMCIDGIPVKGKSHKQVLDLMTTAARNGHVLLTVRRKIFYGEKQPED
430 440 450 460 470 480
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mKIAA4 EVPSPASSHHSSNQPASLTEEKRTPQGSQNSLNTVSSGSGSTSGIGSGGGGGSGVVSAVL
: ::.. .: .: :. .. : : : :
mKIAA1 E------SHQAFSQNGS-------PRLNRAELPTRS---------------------APQ
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870 880 890 900 910 920
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. ::: ..: :::::::::..: :.: :. .::::::.:.:::::::: :::
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::.: :::: ::.. ::..::.:::.:: :::: .. .: . ::. .
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.. ..: :... . : : . . . : . : : . :
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:.::::::. :: .: :.:: : : .:..:
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:.:. : : :::. . ..: :.
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630 640 650 660 670 680
mKIAA4 LHTASPSHGIQVLPEYLPADAPAPDQTDSSGQKKP-DPFKIWAQSRSMYENRPMSPSPAS
.: . .: . . .: .: .: . : : . . ::: . :.
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690 700 710 720
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: :.: .....: . .: .:... : :. :.:. : :
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:. : : :.:... : : : .: ::.:. :.:. . :. .:. .. :.
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790 800 810 820 830 840
mKIAA4 KQGHVNLTVRRKVVFAVPKAENEVP-SPASSHHSSN-QPASLTEEKRTPQGSQNSLNTVS
:.. : :. . .: . .: : ... . . ..: :. . ::
mKIAA0 AA--VQMRVWRERMVEPENAVTITPLRPEDDYSPREWRGGGLRLPLLQPE-TPVSLRQRH
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850 860 870 880 890
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.. : .:.: . .::.: . :: : :. : :
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900 910 920 930 940 950
mKIAA4 ACVAMPHKIGRIIEGSPADRCGKLKVGDRILAVNGCSITNKSHSDIVNLIKEAGNTVTL-
:.:: ::. : : : :.::::.:..:: ..:. :. :.:. :. :..:
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940 950 960 970 980
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mKIAA4 --RIIPGDESSNATLLTNAEKIATITTTHAPSQQGTQETRTTTKPKQDSQFEFKGPQAAQ
: : . .. ::...: . . : . . .: :: ..
mKIAA0 LERETGGTYPPSPPPHSSPTPAATVAATVSTAVPGEPLLPRLSPSLLATALE--GPYPVE
990 1000 1010 1020 1030 1040
1020 1030 1040 1050 1060
mKIAA4 EQDFYTVELERGAKGFGFSLRGGREYN------MD--LYVLRLAEDGPAERCGKMRIGDE
: . : :.. .:.:. :: ... .: ... .. : : ::: .:.::.
mKIAA0 E-----ICLPRAGGPLGLSIVGGSDHSSHPFGVQDPGVFISKVLPRGLAARCG-LRVGDR
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1070 1080 1090 1100 1110 1120
mKIAA4 ILEINGETTKNMKHSRAIELIKNGGRRVRLFLRRGDGSVPEYGGSNYENIPSFPGMTP
:: .::. ... :..:. . .. :..:: : : : . ::
mKIAA0 ILAVNGQDVREATHQEAVSALLRPCLELCLLVRRD----PPPPGMRELCIQKAPGEKLGI
1110 1120 1130 1140 1150
mKIAA0 SIRGGAKGHAGNPCDPTDEGIFISKVSPTGAAGRDGRLRVGLRLLEVNQQSLLGLTHAEA
1160 1170 1180 1190 1200 1210
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mKIAA4 THNQVVDMLIECPKGSEVTLLVQRGGLPVPKKSPKSQPLERKDSQNSSQHSVSSHRSLHT
:.: ... :.. . .... : .. :
mKIAA4 IPDLALASDSAQLAAAGSDRGKHCRKMFFMKESSSTSSKEKSGKPEAQSSSFLFPKACHQ
120 130 140 150 160 170
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mKIAA4 ASPSHGIQVLPEYLPADAPAPDQTDSSGQKKPDPFKIWAQSRSMYENRPMSPSPASGLSK
. :.. .: : : .. : :.. .:... .. .:. .. . : : ..
mKIAA4 RTRSNSTSVNP-YSAGEIDFPMTKKSAAPTDRQPYSLCSNRKSLSQQLDY---PILGTAR
180 190 200 210 220 230
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:. ......:. .. . ..: : . . :.:: :.::.. : ::. :
mKIAA4 PTRS--LSTAQLGQLSGGLQASVISNIVLMKGQAKGLGFSIVGGKDSIYGPIGIYVKSIF
240 250 260 270 280
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mKIAA4 PLGAADTDGRLRSGDELICVDGTPVIGKSHQLVVQLMQQAAKQGHVNLTVRRKVVFAVPK
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