FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4129.ptfa, 1125 aa vs ./tmplib.26680 library 1767892 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2290+/-0.0069; mu= -3.0599+/- 0.456 mean_var=269.7059+/-67.364, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 90 in 1/35 Lambda= 0.0781 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0705 ( 1252 res) mbg00550 (1252) 1233 153 2.5e-37 mKIAA1634 ( 1170 res) mbg16650 (1170) 888 114 1.2e-25 mKIAA0147 ( 1694 res) mbg04389 (1694) 263 44 0.00024 mKIAA4048 ( 1363 res) mbg06182 (1363) 215 38 0.0089 >>mKIAA0705 ( 1252 res) mbg00550 (1252 aa) initn: 2574 init1: 636 opt: 1233 Z-score: 762.6 bits: 153.1 E(): 2.5e-37 Smith-Waterman score: 3149; 47.893% identity (56.663% ungapped) in 1163 aa overlap (39-1110:1-1074) 10 20 30 40 50 60 mKIAA4 AQKEGLILAIGWAFAGTTRSPREGEVPGVDYSFLTVKEFLDLEQSGTLLEVGTYEGNYYG : :.::.::..::.::.::: :::: :::: mKIAA0 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. :..::..::..:.:::::::::. . : :: . :. .:.:::: : :. mKIAA0 RYVIDLMHHAARNGQVNLTVRRKVLCGGEPCPENGRSPGSVSTHHSS--P-------RSD 690 700 710 720 730 830 840 850 860 870 880 mKIAA4 QGSQNSLNTVSSGSGSTSGIGSGGGGGSGVVSAVLQPYDVEIRRGENEGFGFVIVSSVSR .. .. : .. .:... : .: :: :: :.: :::::::::.::..: mKIAA0 YATYSNSNHAAPSSNASPP--------EGFASHSLQTSDVVIHRKENEGFGFVIISSLNR 740 750 760 770 780 890 900 910 920 930 940 mKIAA4 PEAGTTFGNACVAMPHKIGRIIEGSPADRCGKLKVGDRILAVNGCSITNKSHSDIVNLIK ::.:.: ...::::::::.:::::::.::::::::::::: :: : :.:::.::: mKIAA0 PESGAT-----ITVPHKIGRIIDGSPADRCAKLKVGDRILAVNGQSIINMPHADIVKLIK 790 800 810 820 830 840 950 960 970 980 mKIAA4 EAGNTVTLRIIPGDESSNATLLTNAEKIATITTTH------------------------A .:: .::::::: .: .. : ..:: . .. : : mKIAA0 DAGLSVTLRIIPQEELNSPTSAPSSEKQSPMAQQHSPLAQQSPLAQPSPATPNSPVAQPA 850 860 870 880 890 900 990 1000 1010 mKIAA4 PSQ----QGTQET-RTTTKPKQDSQ---------------FEFKGPQAA----------- : : :: ... :. .: .:: . .... : .. mKIAA0 PPQPLQLQGHENSYRSEVKARQDVKPDIRQPPFTDYRQPPLDYRQPPGGDYSQPPPLDYR 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:..:: ::..::: ::::::. .. . :. mKIAA1 AAEKDGRLRAADELMCIDGIPVKGKSHKQVLDLMTTAARNGHVLLTVRRKIFYGEKQPED 430 440 450 460 470 480 810 820 830 840 850 860 mKIAA4 EVPSPASSHHSSNQPASLTEEKRTPQGSQNSLNTVSSGSGSTSGIGSGGGGGSGVVSAVL : ::.. .: .: :. .. : : : : mKIAA1 E------SHQAFSQNGS-------PRLNRAELPTRS---------------------APQ 490 500 510 870 880 890 900 910 920 mKIAA4 QPYDVEIRRGENEGFGFVIVSSVSRPEAGTTFGNACVAMPHKIGRIIEGSPADRCGKLKV . ::: ..: :::::::::..: :.: :. .::::::.:.:::::::: ::: mKIAA1 EAYDVTLQRKENEGFGFVILTSKSKPPPGV--------IPHKIGRVIDGSPADRCGGLKV 520 530 540 550 560 930 940 950 960 970 mKIAA4 GDRILAVNGCSITNKSHSDIVNLIKEAGNTVTLRIIPGDESSNATLLTNAEK-------- ::.: :::: ::.. ::..::.:::.:: :::: .. .: . ::. . mKIAA1 GDHISAVNGQSIVDLSHDNIVQLIKDAGVTVTLTVVAEEEHHGPPSGTNSARQSPALQHR 570 580 590 600 610 620 980 990 1000 1010 mKIAA4 -IATITTTHAPSQQGTQE---TRTTTKPKQDSQFEFK-------------GPQAAQEQDF .. ..: :... . : : . . . : . : : . : mKIAA1 PMGQAQANHIPGDRIALEGEIGRDVCSSYRHSWSDHKHLAQPDTAVISVVGSRHNQSLGC 630 640 650 660 670 680 1020 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