FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1587.ptfa, 934 aa vs ./tmplib.26680 library 1768083 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6492+/-0.00762; mu= -5.6957+/- 0.503 mean_var=342.2218+/-82.339, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0693 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00211 ( 305 res) mbg20018 ( 305) 653 79 8.2e-16 mKIAA1114 ( 1736 res) mbg06405 (1736) 631 78 1.2e-14 mFLJ00163 ( 798 res) mph01789 ( 798) 622 77 1.3e-14 >>mFLJ00211 ( 305 res) mbg20018 (305 aa) initn: 716 init1: 421 opt: 653 Z-score: 376.2 bits: 79.3 E(): 8.2e-16 Smith-Waterman score: 653; 45.614% identity (47.059% ungapped) in 228 aa overlap (459-681:67-292) 430 440 450 460 470 480 mKIAA1 DPSVRPKREDRFLDFQVLRDSKNSNSITIMGLGTSRVALTLKP--QDPMEQNVAELLQFL : .: : :. : : .: .::::.::: mFLJ00 PSTQADPERDWGGAGEEGPSTSRAAGGSSQGSRASLSAPTVGPRTQKQLELKVAELVQFL 40 50 60 70 80 90 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 LLKDQTKYPIKESDMREFIDKDYRHQFPEILRRAAVHLECIFRFELKELDTEEHIYILLN :.::: : :::..:. . . ::: .:..:. :: .:. .: ..: ::. . : :::.: mFLJ00 LIKDQKKIPIKRTDILKHVVGDYRDVYPNLLKLAAERLQYVFGYKLVELEPKSHSYILIN 100 110 120 130 140 150 550 560 570 580 590 600 mKIAA1 KLGPVPFEGLEDVPNG-PKMGLLMMILGHILLNGNQAREADIWEMLWRFGVQRERRLSVF : :: .. .: : ::::..:: :...:: :...:..: :.:: .. .: mFLJ00 MLEPVEADAEMRGDQGTPISGLLMIVLGLIFMKGNTITETEVWDFLRRLGVYPTKKHLIF 160 170 180 190 200 210 610 620 630 640 650 660 mKIAA1 GNVKRLLSVEFVWQRYLDYR--PLTDCVPVEYEFYWGPRSRAETTKMKILKFMAKIYNKD :. :.:.. .:: ::::.:: : :: ::.::. ::::. ::.:::.:::.::..:.: mFLJ00 GDPKKLITEDFVRQRYLEYRRIPHTD--PVDYELQWGPRTNLETSKMKVLKFVAKVHNQD 220 230 240 250 260 270 670 680 690 700 710 720 mKIAA1 PMDWPALYNEALEEDADRVVVNNFRVARPFRRPLFAEVAPELDASGSKYSPHSWPESRLE : :::. : ::: .. .:. mFLJ00 PKDWPTQYCEALADEESRARPATASAPATSS 280 290 300 >>mKIAA1114 ( 1736 res) mbg06405 (1736 aa) initn: 633 init1: 426 opt: 631 Z-score: 355.3 bits: 77.9 E(): 1.2e-14 Smith-Waterman score: 631; 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