FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1560.ptfa, 848 aa vs ./tmplib.26680 library 1768169 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.7368+/-0.00413; mu= 23.0934+/- 0.277 mean_var=79.1728+/-18.156, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1441 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00202 ( 831 res) mph00650 ( 831) 1047 228 3.6e-60 mKIAA4214 ( 691 res) mph00667 ( 691) 492 112 1.8e-25 >>mFLJ00202 ( 831 res) mph00650 (831 aa) initn: 1054 init1: 366 opt: 1047 Z-score: 1172.5 bits: 228.0 E(): 3.6e-60 Smith-Waterman score: 1286; 33.461% identity (35.255% ungapped) in 786 aa overlap (76-846:69-829) 50 60 70 80 90 100 mKIAA1 GRCKHTSEDWVDCGFKPTFFRSATLKWKESLMSRKRPFVGRCCYSCTPQSWERFFNPSIP .... :::.:::: .:::.::: .:. :: mFLJ00 PQTQQRSNHNGQETSLWSSSFGMKMEAITPFLGKYRPFMGRCCQTCTPKSWESLFHRSIM 40 50 60 70 80 90 110 120 130 140 150 160 mKIAA1 SLGLRNVIYINETHTRHRGWLARRLSYILFVQERDVHKGMFATSVTENVLSSSRVQEAIA .::. ::: ..: .:: ::::.::: :.:. :. . .. :. .... .. ::. .. mFLJ00 DLGFCNVILVKEENTRFRGWLVRRLCYFLWSLEQHIPTSFDAS---QKIMENTGVQNLLS 100 110 120 130 140 150 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 EVAAELNPDGSAQQQSKAIQKVKRKARKILQEMVATVSPGMIRLTGWVLLKLFNSFFWNI . : .... :. . ::.....:: .. .: : ..:: .:.:: ..: .: :. mFLJ00 GRV----PGAAGEGQAPEL--VKKEVQRILGHIQTTPRPFLLRLFSWALLWFLNRLFLNV 160 170 180 190 200 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 QIHKGQLEMVKAATETNLPLLFLPVHRSHIDYLLLTFILFCHNIKAPYIASGNNLNIPVF :.::::..::. :.. . ::.:: .:.: .: .:: :.:: ... . .: . ::. mFLJ00 QLHKGQMKMVQKAVQEGSPLVFLSTHKSLLDGFLLPFVLFSQGLGVVRVALDSRTCSPVL 210 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 340 mKIAA1 STLIHKLGGFFIRRRLDETPDGRKDILYRALLHGHVVELLRQQQFLEIFLEGTRSRSG-K .:..::::.:. ... . :. . :: ::.... : ::: . : : :::: . : . mFLJ00 RALLRKLGGLFLPPEVNLSLDNSEGILARAVVRATVEELLTSGQPLLIFLEEPPGSPGPR 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 mKIAA1 TSCARAGLLSVVVDTLSSNTIPDILVIPVGISYDRIIEGHYNGEQLGKPKKNESLWSVAR : . :.::....... : : ..::.:.:: . .. : .. : .::. : mFLJ00 LSALGQAWLGVVIQAVQAGIISDATLVPVAIAYDLVPDAPCNMNHDLAPL---GLWTGAL 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 mKIAA1 GVIRMLRKNYGY-----VRVDFAQPFSLKEYLEGQSQKPVSAPLSLEQALLPAILP--SR .:.: : . .: ::: .::::::.:: . ... .. .::. : : .: : mFLJ00 AVFRRLCNCWGCNRRVCVRVHLAQPFSLQEYTIN-ARSCWDSRQTLEHLLQPIVLGECSV 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 PNDVADEHQDLSSNESRNPADEAFRRRLIANLAEHILFTASKSCAIMSTHIVACLLLYRH :. : :. . . : . . :. :..:.: .. : :.::: :.: ::: .: mFLJ00 VPDTEKE-QEWTPPTGLLLALKEEDQLLVRRLSRHVLSASVASSAVMSTAIMATLLLLKH 450 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 RQGIHLSTLVEDFFVMKEEVLARDFDLGFSGNSEDVVMHAIQLLGNCVTITHTSRKDEFF ..:. :: :. .: . ::.: : ::.::::. . ...:...:: :.. .. . : . mFLJ00 QKGVVLSQLLGEFSWLTEETLLRGFDVGFSGQLRCLAQHTLSLLRAHVVLLRVHQGD-LV 510 520 530 540 550 560 580 590 600 610 620 630 mKIAA1 ITPSTTVPSVFELNFYSNGVLHVFIMEAIIACSIYAVLNKRCSGGSAGGLGN--LISQEQ ..: :.. .: : .: .:. ::. ::.. ..: : . : . :.::.. mFLJ00 VVPRPG-PGLTHLARLSMELLPTFLSEAVGACAVRGLLAGRVPPEGPWELQGIELLSQNE 570 580 590 600 610 620 640 650 660 670 680 690 mKIAA1 LVRKAASLCYLLSNEGTISLPCQTFYQVCHETVGKFIQYGILTVAEQDDQEDVSPGLAEQ : :. : .:: .. . :::. : :.:.. ..:: :.: :::. . ..: mFLJ00 LYRQILLLLHLLPQDLLLPQPCQSSYCYCQEVLDRLIQCGLL-VAEETPGSRPACDTGRQ 630 640 650 660 670 680 700 710 720 730 740 750 mKIAA1 QWDKKLPELNWR--SDEEDEDSD-FGEEQRDCYLKVSQSKEHQQFITFLQRLLGPLLEAY . . :: :. .: : .:: : : :. ..::... .:. :: :::.:.:.:. mFLJ00 HLSAKLL---WKPSGDFTDSESDDFEEPGGRCF-RLSQQSRCPDFFLFLCRLLSPILKAF 690 700 710 720 730 760 770 780 790 800 810 mKIAA1 SSAAIFVHNFSGPVPESE--YLQKLHRYLITRTERNVAVYAESATYCLVKNAVKMFKDIG ..:: :.: : .:.:: : .:: ..: . .... ... : : :. .:: :::.: mFLJ00 AQAATFLH--LGQLPDSEVAYSEKLFQFLQACAQEE-GIF-ECADPNLAISAVWTFKDLG 740 750 760 770 780 790 820 830 840 mKIAA1 VFKETKQKRVSVLELSSTFLPQCNRQKLLEYILSFVVL :..: . :.:: :: . :..:: ..: .:. mFLJ00 VLQEMPSPTGPQLHLSPTFATRDNQDKLEQFIRQFICS 800 810 820 830 >>mKIAA4214 ( 691 res) mph00667 (691 aa) initn: 419 init1: 197 opt: 492 Z-score: 549.5 bits: 112.4 E(): 1.8e-25 Smith-Waterman score: 495; 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