FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4095.ptfa, 825 aa vs ./tmplib.26680 library 1768192 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3669+/-0.00516; mu= 8.2970+/- 0.344 mean_var=127.1675+/-29.635, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1137 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0575 ( 1034 res) mpm10253 (1034) 1621 278 4.1e-75 >>mKIAA0575 ( 1034 res) mpm10253 (1034 aa) initn: 1622 init1: 869 opt: 1621 Z-score: 1440.9 bits: 277.9 E(): 4.1e-75 Smith-Waterman score: 2212; 46.459% identity (57.675% ungapped) in 833 aa overlap (28-825:329-1034) 10 20 30 40 50 mKIAA4 AALDLSAKEAERVPASENDSEELLIDLERPQSNSSAVTG----TSGSIMENGVSSSS :: .:..:: .. .:::.. : : . mKIAA0 LSSTDEDEEAGTEGCFEAGSTSEQRGPVKRERSHSHDSASSSLSSRASGSVLY-GESLVQ 300 310 320 330 340 350 60 70 80 90 mKIAA4 TAGKPQQQLL-TPTSSIRLDEG----------VSASTAVV-----GEI------LKQECD .: :: .: .: .:: :: ...:. : . :. mKIAA0 PSGPPQGELTRSPPPCGPAEEGRAPGEIQRLRVSQGSTVISRHSPGLVPQPDSSLRTGRR 360 370 380 390 400 410 100 110 120 130 140 mKIAA4 SLDPPMASSTTSKPSSSSSSS-----AQALAWSRQPRGLHTAL--PPVIILSKAAYSLLG ::. : : :. . ::.:::. :..:. . . .. : ::...: : .:..: mKIAA0 SLQVPAAPSSQLSSSSGSSSTCAVPTANVLVLQASQCSMAKACRQPPIVFLPKLVYDMLL 420 430 440 450 460 470 150 160 170 180 190 200 mKIAA4 SQKGGRLPSSSSLLPHADVAWVSSLRPGLHKDMSSEEQSLYYRQWTSARQHHADYSNQPD : .. ::.:.:::: .: :.::.:: : : :.: :::::::::: : : ::.:. . mKIAA0 STDSSGLPKSASLLPSPSVMWTSSFRPLLSKMMTSTEQSLYYRQWTVPRPSHMDYGNRAE 480 490 500 510 520 530 210 220 230 240 250 260 mKIAA4 PISGARTLHPRRLLLTGPPQVGKTGSYLQFLRILFRMLIRLLEVDVYNEEEINTDHSDDS . . ..:::::::.::::.::::.::::: :: :::::: :::::.::::::. ..: mKIAA0 --GRVDSFHPRRLLLSGPPQIGKTGAYLQFLSILSRMLIRLTEVDVYDEEEINTSFREES 540 550 560 570 580 590 270 280 290 300 310 320 mKIAA4 ELSQSE-GEPWPDIETFSKMPFDVSVHDPKYRLMSLVYSEKLAGIKQEVIKEYKVEEPR- : . ..::::.: :.::::: .:::::. ::. :. . ... : :. mKIAA0 EWRYLQLADPWPDLELFQKMPFDYIIHDPKYEDASLICSHPQTIKSEDRGMSRKPEDLYV 600 610 620 630 640 650 330 340 350 360 370 380 mKIAA4 QRETMSMMLTQYAAYNTFHHCEQCQQYMAFTPASQMSDSTLHAFTFSSSMLGEEVQLYFI .:.: : :..::::::.::::::::::.: : : mKIAA0 RRQTARMRLSKYAAYNTYHHCEQCQQYMGFHPHYQ------------------------- 660 670 680 690 390 400 410 420 430 440 mKIAA4 IPKSKESHFVFSKQGRHLESMRLPLVSDKNLNAVKSPIFTPSSGRHEHGLLNLFHAMEGI ..: : mKIAA0 ---ERRSSF--------------------------------------------------- 450 460 470 480 490 500 mKIAA4 SHLHLLVVKEYEMPLYRKYWPNHIMLVLPGMFNNAGVGAARFLIKELSYHNLELERNRLE :::: :::::::::: : mKIAA0 -------------------------------------------IKELCYHNLELERNRQE 700 710 510 520 530 540 550 560 mKIAA4 ELGVKRQCVWPFIVVMDDSCVLWNIHSVQEQTSQPTEAGISSKNVSLKSVLQHIEATPKI ::::: : ::::::. :::::.::. .:. . : . : .::::: .. ::::.:.: mKIAA0 ELGVKPQDVWPFIVIADDSCVMWNVADVDCAGERSREFSWSERNVSLKYIMLHIEASPNI 720 730 740 750 760 770 570 580 590 600 610 620 mKIAA4 IHYAILGIQKWNSKLTSQSLKAPFSRCHVHDFILLNIDLTQNVQYDFNRYFCEDVDFNLR :::.::..:: :: .. .. :::::::::::.::.::::::::. ::. :.::::::: mKIAA0 THYALLGMRKWASKTRGREVQEPFSRCHVHDFIILNVDLTQNVQYNQNRFTCDDVDFNLR 780 790 800 810 820 830 630 640 650 660 670 680 mKIAA4 TNSSGLLICRFNNFSLMKKHVQVGGQRDFIIKPKLMVSENVVPILPLQYVCAPDSEHTLL ..:.:::.:::: ::.:::.. :::.:.: : : ::.. : :.: ::.:::::.::.: mKIAA0 VHSAGLLLCRFNRFSVMKKQIAVGGHRSFHITSK--VSDSSVAIVPSQYICAPDSKHTFL 840 850 860 870 880 890 690 700 710 720 730 740 mKIAA4 AAPAQFLLEKFLQHASYKLFPKAIHNFKSPVLAIDCYLNIGQEVAICYVSSRPHSSNVNC :::::.:::::::. :...:: ...: . :::..:::::.: ....::::::::: :..: mKIAA0 AAPAQLLLEKFLQYHSHRFFPLSLKNHSHPVLSVDCYLNLGPQISVCYVSSRPHSLNISC 900 910 920 930 940 950 750 760 770 780 790 800 mKIAA4 EGVFFSGLLLYLCDSFVGADLLKKFKFLKGATLCVICQDRSSLRQTIVRLELEDEWQFRL . :::::::::::::::..::::.::::::::::::::.:::::.::::::::::::: mKIAA0 SDMVFSGLLLYLCDSFVGASFLKKFHFLKGATLCVICQDRNSLRQTVVRLELEDEWQFRL 960 970 980 990 1000 1010 810 820 mKIAA4 RDEFQTANSSDDKPLYFLTGRHV ::::::::...:.::.:::.::. mKIAA0 RDEFQTANAKEDRPLFFLTARHI 1020 1030 825 residues in 1 query sequences 1768192 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 11:01:43 2006 done: Mon Mar 27 11:01:44 2006 Scan time: 0.940 Display time: 0.060 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]