# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mfj42182.fasta.nr -Q ../query/mKIAA4095.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA4095, 825 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7920400 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4124+/-0.000186; mu= 11.9368+/- 0.010 mean_var=77.5330+/-15.109, 0's: 35 Z-trim: 40 B-trim: 389 in 2/64 Lambda= 0.145657 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|223462818|gb|AAI47571.1| CDNA sequence AK220484 (1913) 5474 1160.6 0 gi|109121762|ref|XP_001088999.1| PREDICTED: simila (1036) 4612 979.3 0 gi|189441676|gb|AAI67465.1| LOC100170499 protein [ (1970) 4016 854.2 0 gi|148691052|gb|EDL22999.1| mCG14672 [Mus musculus (1727) 3974 845.4 0 gi|149031716|gb|EDL86666.1| rCG41248 [Rattus norve (1669) 3863 822.0 0 gi|149411308|ref|XP_001507474.1| PREDICTED: simila (1058) 3586 763.7 0 gi|118089026|ref|XP_419956.2| PREDICTED: similar t (1944) 3141 670.4 2e-189 gi|224048748|ref|XP_002196511.1| PREDICTED: simila (1933) 3134 668.9 5.5e-189 gi|114576135|ref|XP_001159582.1| PREDICTED: GREB1 ( 947) 3130 667.8 5.7e-189 gi|119903956|ref|XP_584947.3| PREDICTED: similar t (1943) 3132 668.5 7.4e-189 gi|126303324|ref|XP_001372682.1| PREDICTED: simila (1957) 3132 668.5 7.5e-189 gi|32451585|gb|AAH54502.1| GREB1 protein [Homo sap ( 947) 3128 667.4 7.6e-189 gi|168278655|dbj|BAG11207.1| GREB1 protein [synthe ( 947) 3127 667.2 8.8e-189 gi|109506294|ref|XP_574101.2| PREDICTED: similar t (1301) 3128 667.5 9.7e-189 gi|114576131|ref|XP_001159621.1| PREDICTED: GREB1 (1949) 3130 668.1 1e-188 gi|73980434|ref|XP_852477.1| PREDICTED: similar to (1949) 3129 667.8 1.2e-188 gi|119621330|gb|EAX00925.1| GREB1 protein, isoform (1949) 3128 667.6 1.3e-188 gi|126303322|ref|XP_001372666.1| PREDICTED: simila (1946) 3127 667.4 1.5e-188 gi|74739248|sp|Q4ZG55.1|GREB1_HUMAN RecName: Full= (1949) 3127 667.4 1.5e-188 gi|148666062|gb|EDK98478.1| gene regulated by estr (1580) 3119 665.7 4.2e-188 gi|123784633|sp|Q3UHK3.1|GREB1_MOUSE RecName: Full (1954) 3119 665.7 5e-188 gi|7264653|gb|AAF44295.1|AF180470_1 Kiaa0575 [Mus (1954) 3119 665.7 5e-188 gi|189442105|gb|AAI67232.1| Gene regulated by estr (1954) 3119 665.7 5e-188 gi|149050964|gb|EDM03137.1| rCG61467 [Rattus norve (1071) 3114 664.5 6.4e-188 gi|109102027|ref|XP_001089256.1| PREDICTED: simila (1949) 3116 665.1 7.7e-188 gi|109479175|ref|XP_001074126.1| PREDICTED: simila (1955) 3114 664.7 1e-187 gi|194220960|ref|XP_001503560.2| PREDICTED: simila (1951) 3110 663.9 1.8e-187 gi|189515655|ref|XP_001344452.2| PREDICTED: simila (1322) 2985 637.5 1.1e-179 gi|189530986|ref|XP_001920606.1| PREDICTED: hypoth (1802) 2926 625.2 7.5e-176 gi|61402751|gb|AAH91813.1| Id:ibd5087 protein [Dan ( 662) 2803 599.0 2.1e-168 gi|109506919|ref|XP_001071890.1| PREDICTED: simila ( 936) 2774 593.0 1.9e-166 gi|210107158|gb|EEA55109.1| hypothetical protein B (2042) 2724 582.8 5e-163 gi|47220320|emb|CAF98419.1| unnamed protein produc (1886) 2662 569.7 3.9e-159 gi|73961828|ref|XP_848408.1| PREDICTED: similar to ( 387) 2557 547.2 4.9e-153 gi|114672522|ref|XP_001152115.1| PREDICTED: hypoth ( 711) 2422 519.0 2.8e-144 gi|10435776|dbj|BAB14666.1| unnamed protein produc ( 875) 2417 518.0 6.7e-144 gi|194373489|dbj|BAG56840.1| unnamed protein produ ( 974) 2417 518.0 7.3e-144 gi|220673135|emb|CAX14824.1| novel protein similar ( 461) 2402 514.6 3.6e-143 gi|119621334|gb|EAX00929.1| GREB1 protein, isoform (1803) 2265 486.3 4.9e-134 gi|57089751|ref|XP_537303.1| PREDICTED: similar to ( 288) 1879 404.6 3e-110 gi|60416070|gb|AAH90703.1| Id:ibd5087 protein [Dan ( 410) 1880 404.9 3.5e-110 gi|210107155|gb|EEA55106.1| hypothetical protein B ( 393) 1652 357.0 8.8e-96 gi|118086866|ref|XP_419152.2| PREDICTED: hypotheti (1440) 1329 289.5 6.7e-75 gi|73961904|ref|XP_848934.1| PREDICTED: similar to ( 606) 1172 256.3 2.9e-65 gi|26329259|dbj|BAC28368.1| unnamed protein produc ( 217) 1074 235.3 2e-59 gi|210107156|gb|EEA55107.1| hypothetical protein B (1781) 952 210.3 5.6e-51 gi|115725275|ref|XP_001200378.1| PREDICTED: simila ( 492) 611 138.3 7.5e-30 gi|156214182|gb|EDO35177.1| predicted protein [Nem ( 431) 609 137.8 9e-30 gi|115624994|ref|XP_001204105.1| PREDICTED: hypoth ( 253) 580 131.6 4.1e-28 gi|198423776|ref|XP_002122232.1| PREDICTED: simila (2225) 533 122.4 2.1e-24 >>gi|223462818|gb|AAI47571.1| CDNA sequence AK220484 [Mu (1913 aa) initn: 5474 init1: 5474 opt: 5474 Z-score: 6206.7 bits: 1160.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 5474; 100.000% identity (100.000% similar) in 825 aa overlap (1-825:1089-1913) 10 20 30 mKIAA4 AALDLSAKEAERVPASENDSEELLIDLERP :::::::::::::::::::::::::::::: gi|223 DSSYLTRTALEQEVGLACCYVSKEVIRGPAAALDLSAKEAERVPASENDSEELLIDLERP 1060 1070 1080 1090 1100 1110 40 50 60 70 80 90 mKIAA4 QSNSSAVTGTSGSIMENGVSSSSTAGKPQQQLLTPTSSIRLDEGVSASTAVVGEILKQEC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|223 QSNSSAVTGTSGSIMENGVSSSSTAGKPQQQLLTPTSSIRLDEGVSASTAVVGEILKQEC 1120 1130 1140 1150 1160 1170 100 110 120 130 140 150 mKIAA4 DSLDPPMASSTTSKPSSSSSSSAQALAWSRQPRGLHTALPPVIILSKAAYSLLGSQKGGR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|223 DSLDPPMASSTTSKPSSSSSSSAQALAWSRQPRGLHTALPPVIILSKAAYSLLGSQKGGR 1180 1190 1200 1210 1220 1230 160 170 180 190 200 210 mKIAA4 LPSSSSLLPHADVAWVSSLRPGLHKDMSSEEQSLYYRQWTSARQHHADYSNQPDPISGAR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|223 LPSSSSLLPHADVAWVSSLRPGLHKDMSSEEQSLYYRQWTSARQHHADYSNQPDPISGAR 1240 1250 1260 1270 1280 1290 220 230 240 250 260 270 mKIAA4 TLHPRRLLLTGPPQVGKTGSYLQFLRILFRMLIRLLEVDVYNEEEINTDHSDDSELSQSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|223 TLHPRRLLLTGPPQVGKTGSYLQFLRILFRMLIRLLEVDVYNEEEINTDHSDDSELSQSE 1300 1310 1320 1330 1340 1350 280 290 300 310 320 330 mKIAA4 GEPWPDIETFSKMPFDVSVHDPKYRLMSLVYSEKLAGIKQEVIKEYKVEEPRQRETMSMM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|223 GEPWPDIETFSKMPFDVSVHDPKYRLMSLVYSEKLAGIKQEVIKEYKVEEPRQRETMSMM 1360 1370 1380 1390 1400 1410 340 350 360 370 380 390 mKIAA4 LTQYAAYNTFHHCEQCQQYMAFTPASQMSDSTLHAFTFSSSMLGEEVQLYFIIPKSKESH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|223 LTQYAAYNTFHHCEQCQQYMAFTPASQMSDSTLHAFTFSSSMLGEEVQLYFIIPKSKESH 1420 1430 1440 1450 1460 1470 400 410 420 430 440 450 mKIAA4 FVFSKQGRHLESMRLPLVSDKNLNAVKSPIFTPSSGRHEHGLLNLFHAMEGISHLHLLVV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|223 FVFSKQGRHLESMRLPLVSDKNLNAVKSPIFTPSSGRHEHGLLNLFHAMEGISHLHLLVV 1480 1490 1500 1510 1520 1530 460 470 480 490 500 510 mKIAA4 KEYEMPLYRKYWPNHIMLVLPGMFNNAGVGAARFLIKELSYHNLELERNRLEELGVKRQC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|223 KEYEMPLYRKYWPNHIMLVLPGMFNNAGVGAARFLIKELSYHNLELERNRLEELGVKRQC 1540 1550 1560 1570 1580 1590 520 530 540 550 560 570 mKIAA4 VWPFIVVMDDSCVLWNIHSVQEQTSQPTEAGISSKNVSLKSVLQHIEATPKIIHYAILGI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|223 VWPFIVVMDDSCVLWNIHSVQEQTSQPTEAGISSKNVSLKSVLQHIEATPKIIHYAILGI 1600 1610 1620 1630 1640 1650 580 590 600 610 620 630 mKIAA4 QKWNSKLTSQSLKAPFSRCHVHDFILLNIDLTQNVQYDFNRYFCEDVDFNLRTNSSGLLI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|223 QKWNSKLTSQSLKAPFSRCHVHDFILLNIDLTQNVQYDFNRYFCEDVDFNLRTNSSGLLI 1660 1670 1680 1690 1700 1710 640 650 660 670 680 690 mKIAA4 CRFNNFSLMKKHVQVGGQRDFIIKPKLMVSENVVPILPLQYVCAPDSEHTLLAAPAQFLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|223 CRFNNFSLMKKHVQVGGQRDFIIKPKLMVSENVVPILPLQYVCAPDSEHTLLAAPAQFLL 1720 1730 1740 1750 1760 1770 700 710 720 730 740 750 mKIAA4 EKFLQHASYKLFPKAIHNFKSPVLAIDCYLNIGQEVAICYVSSRPHSSNVNCEGVFFSGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|223 EKFLQHASYKLFPKAIHNFKSPVLAIDCYLNIGQEVAICYVSSRPHSSNVNCEGVFFSGL 1780 1790 1800 1810 1820 1830 760 770 780 790 800 810 mKIAA4 LLYLCDSFVGADLLKKFKFLKGATLCVICQDRSSLRQTIVRLELEDEWQFRLRDEFQTAN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|223 LLYLCDSFVGADLLKKFKFLKGATLCVICQDRSSLRQTIVRLELEDEWQFRLRDEFQTAN 1840 1850 1860 1870 1880 1890 820 mKIAA4 SSDDKPLYFLTGRHV ::::::::::::::: gi|223 SSDDKPLYFLTGRHV 1900 1910 >>gi|109121762|ref|XP_001088999.1| PREDICTED: similar to (1036 aa) initn: 4852 init1: 3585 opt: 4612 Z-score: 5231.5 bits: 979.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 4900; 88.517% identity (94.856% similar) in 836 aa overlap (2-825:202-1036) 10 20 30 mKIAA4 AALDLSAKEAERVPASENDSEELLIDLERPQ :::::.:: ::. .:::::.:::::::::: gi|109 SSYLTRTALEQEVGLACCYVSKEVIRGPTVALDLSGKEQERAAVSENDSDELLIDLERPQ 180 190 200 210 220 230 40 50 60 70 80 mKIAA4 SNSSAVTGTSGSIMENGVSSSSTAGKPQQQLLTPT-----SSIRLDEGVSASTAVVG--E :::::::::::::::::::::::: : :.: :::. .:. ::::::::.: .: : gi|109 SNSSAVTGTSGSIMENGVSSSSTADKSQKQSLTPSFQSPATSLGLDEGVSASSAGAGAGE 240 250 260 270 280 290 90 100 110 120 130 140 mKIAA4 ILKQECDSLDPPMASSTTSKPSSSSSSSAQALAWSRQP----RGLHTALPPVIILSKAAY :::::::: : ::::::::: ::::. ..: :. :: :: :.:::::.::::::: gi|109 TLKQECDSLGPQMASSTTSKPPSSSSGP-RTLPWQGQPIRGCRGPHAALPPVVILSKAAY 300 310 320 330 340 350 150 160 170 180 190 200 mKIAA4 SLLGSQKGGRLPSSSSLLPHADVAWVSSLRPGLHKDMSSEEQSLYYRQWTSARQHHADYS :::::::.:.::::::::::::::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::: gi|109 SLLGSQKSGKLPSSSSLLPHADVAWVSSLRPLLNKDMSSEEQSLYYRQWTSARQHHADYS 360 370 380 390 400 410 210 220 230 240 250 260 mKIAA4 NQPDPISGARTLHPRRLLLTGPPQVGKTGSYLQFLRILFRMLIRLLEVDVYNEEEINTDH ::::: ::.:..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: gi|109 NQPDPASGTRNFHPRRLLLTGPPQVGKTGSYLQFLRILFRMLIRLLEVDVYDEEEINTVW 420 430 440 450 460 470 270 280 290 300 310 mKIAA4 SDDSELSQ-SEGEPWPDIETFSKMPFDVSVHDPKYRLMSLVYSEKLAGIKQEVIKEYKVE . .: : : ::::::::.::::::::::::::: ::::::.:::::.::::::: ::: gi|109 NRESPWHQISLGEPWPDIESFSKMPFDVSVHDPKYTLMSLVYTEKLAGVKQEVIKESKVE 480 490 500 510 520 530 320 330 340 350 360 370 mKIAA4 EPRQRETMSMMLTQYAAYNTFHHCEQCQQYMAFTPASQMSDSTLHAFTFSSSMLGEEVQL :::.:::.:.:::.:::::::::::::.::: :: ::::::::::::::::::::::::: gi|109 EPRKRETVSIMLTKYAAYNTFHHCEQCRQYMDFTSASQMSDSTLHAFTFSSSMLGEEVQL 540 550 560 570 580 590 380 390 400 410 420 430 mKIAA4 YFIIPKSKESHFVFSKQGRHLESMRLPLVSDKNLNAVKSPIFTPSSGRHEHGLLNLFHAM ::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 YFIIPKSKESHFVFSKQGKHLESMRLPLVSDKNLNAVKSPIFTPSSGRHEHGLLNLFHAM 600 610 620 630 640 650 440 450 460 470 480 490 mKIAA4 EGISHLHLLVVKEYEMPLYRKYWPNHIMLVLPGMFNNAGVGAARFLIKELSYHNLELERN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::: gi|109 EGISHLHLLVVKEYEMPLYRKYWPNHIMLVLPGMFNNAGTGAARFLIKELSYHNLELERN 660 670 680 690 700 710 500 510 520 530 540 550 mKIAA4 RLEELGVKRQCVWPFIVVMDDSCVLWNIHSVQEQTSQPTEAGISSKNVSLKSVLQHIEAT ::::::.::::::::::.::::::::::::::: .:::.:...::::::::.:::::::: gi|109 RLEELGIKRQCVWPFIVMMDDSCVLWNIHSVQEPSSQPVEVAVSSKNVSLKTVLQHIEAT 720 730 740 750 760 770 560 570 580 590 600 610 mKIAA4 PKIIHYAILGIQKWNSKLTSQSLKAPFSRCHVHDFILLNIDLTQNVQYDFNRYFCEDVDF :::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 PKIVHYAILGIQKWSSKLTSQSLKAPFSRCHVHDFILLNIDLTQNVQYDFNRYFCEDVDF 780 790 800 810 820 830 620 630 640 650 660 670 mKIAA4 NLRTNSSGLLICRFNNFSLMKKHVQVGGQRDFIIKPKLMVSENVVPILPLQYVCAPDSEH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::...:::::::.::::::: gi|109 NLRTNSSGLLICRFNNFSLMKKHVQVGGQRDFIIKPKIMVSESLAPILPLQYICAPDSEH 840 850 860 870 880 890 680 690 700 710 720 730 mKIAA4 TLLAAPAQFLLEKFLQHASYKLFPKAIHNFKSPVLAIDCYLNIGQEVAICYVSSRPHSSN ::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::: ::::::.:::::::: gi|109 TLLAAPAQFLLEKFLQHASYKLFPKAIHNFRSPVLAIDCYLNIGPEVAICYISSRPHSSN 900 910 920 930 940 950 740 750 760 770 780 790 mKIAA4 VNCEGVFFSGLLLYLCDSFVGADLLKKFKFLKGATLCVICQDRSSLRQTIVRLELEDEWQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 VNCEGVFFSGLLLYLCDSFVGADLLKKFKFLKGATLCVICQDRSSLRQTIVRLELEDEWQ 960 970 980 990 1000 1010 800 810 820 mKIAA4 FRLRDEFQTANSSDDKPLYFLTGRHV :::::::::::::.:::::::::::: gi|109 FRLRDEFQTANSSEDKPLYFLTGRHV 1020 1030 >>gi|189441676|gb|AAI67465.1| LOC100170499 protein [Xeno (1970 aa) initn: 2814 init1: 1641 opt: 4016 Z-score: 4550.7 bits: 854.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 4016; 71.995% identity (87.981% similar) in 832 aa overlap (3-825:1145-1970) 10 20 30 mKIAA4 AALDLSAKEAERVPASENDSEELLIDLERPQS :::: :::.. .: :::.:: :::.:::: gi|189 SFLSRTALEQEVGLACCYVSREVVREPMTVLDLSEKEADKDNTSGNDSDELYIDLDRPQS 1120 1130 1140 1150 1160 1170 40 50 60 70 80 mKIAA4 NSSAVTGTSGSIMENGVSSSSTAGKPQQQLLT----PTSSIRLDEGVSASTAVVGEILKQ :.:::::::::: ::::::::.: :.: :. ... .::: . ....... : gi|189 NGSAVTGTSGSIAENGVSSSSAADDSQRQPLAFNFQNVANSTVDEG-TYPNSTASDLGKP 1180 1190 1200 1210 1220 1230 90 100 110 120 130 140 mKIAA4 ECDSLDPPMASSTTSKPSSSSSSSAQALAWSRQP--RGLHTALPPVIILSKAAYSLLGSQ ::::: ::::::. : :.:.. :. : ..:: ::: ..:::::.:.:: .: gi|189 ECDSLGSQMASSTTKL----SPPSSQTFKWNDQSGREALHLALPRIVILSKATYNLLDTQ 1240 1250 1260 1270 1280 150 160 170 180 190 200 mKIAA4 KGGRLPSSSSLLPHADVAWVSSLRPGLHKDMSSEEQSLYYRQWTSARQHHADYSNQPDPI :.:. :.. ::::::::.:. .:::.. ::..:.:::::::::.:. :::::.:. .: gi|189 KNGQAPTTISLLPHADVSWLRTLRPSISTDMTTEDQSLYYRQWTTAKPHHADYTNSSEP- 1290 1300 1310 1320 1330 1340 210 220 230 240 250 260 mKIAA4 SGARTLHPRRLLLTGPPQVGKTGSYLQFLRILFRMLIRLLEVDVYNEEEINT-DHSDDSE .: :. : :::::::::::::::.::::::::.::::::::::::.:.:::. ..:. .: gi|189 NGMRSAHTRRLLLTGPPQVGKTGAYLQFLRILYRMLIRLLEVDVYDEQEINAVEESEIDE 1350 1360 1370 1380 1390 1400 270 280 290 300 310 320 mKIAA4 LSQSEGEPWPDIETFSKMPFDVSVHDPKYRLMSLVYSEKLAGIKQEVIKEYKVEEPRQRE .: . :::::.::: :::.::::::: .: .:.:. . : . :.: ::::.:: gi|189 ISPPDFSQWPDIEVFSKTQFDVTVHDPKYRHISPLYTERNSHGKPDSQAEMKPEEPRKRE 1410 1420 1430 1440 1450 1460 330 340 350 360 370 380 mKIAA4 TMSMMLTQYAAYNTFHHCEQCQQYMAFTPASQMSDSTLHAFTFSSSMLGEEVQLYFIIPK :.:::::.:::::::::::::.::: . .::: .:::::::::::::::::::.::::: gi|189 TVSMMLTKYAAYNTFHHCEQCHQYMDVSSTSQMPESTLHAFTFSSSMLGEEVQLHFIIPK 1470 1480 1490 1500 1510 1520 390 400 410 420 430 440 mKIAA4 SKESHFVFSKQGRHLESMRLPLVSDK-NLNAVKSPIFTPSSGRHEHGLLNLFHAMEGISH ::: ::::::::.::::::::::.:: : : ::::::::::::::::::::.::::::.: gi|189 SKEHHFVFSKQGKHLESMRLPLVTDKQNPNMVKSPIFTPSSGRHEHGLLNLYHAMEGIGH 1530 1540 1550 1560 1570 1580 450 460 470 480 490 500 mKIAA4 LHLLVVKEYEMPLYRKYWPNHIMLVLPGMFNNAGVGAARFLIKELSYHNLELERNRLEEL ::..:::::::::::::: :::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::: gi|189 LHIMVVKEYEMPLYRKYWSNHIMLVLPGMFNNAGAGASRFLIKELSYHNLELERNRLEEL 1590 1600 1610 1620 1630 1640 510 520 530 540 550 560 mKIAA4 GVKRQCVWPFIVVMDDSCVLWNIHS-VQEQTSQPTEAGISSKNVSLKSVLQHIEATPKII :::::::::.:..:::::::::.:: : :: : :. .:::::.::::.:.:::: gi|189 GVKRQCVWPLIAIMDDSCVLWNLHSKVPEQMSPSLETESLVRNVSLKNVLQHMEGTPKIT 1650 1660 1670 1680 1690 1700 570 580 590 600 610 620 mKIAA4 HYAILGIQKWNSKLTSQSLKAPFSRCHVHDFILLNIDLTQNVQYDFNRYFCEDVDFNLRT .::.::::::::::.:. : ::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::. gi|189 NYAMLGIQKWNSKLSSSLPKRPFSRCHVHDFILLNVDLTQNVQYDLNRYFCEDVDFNLRV 1710 1720 1730 1740 1750 1760 630 640 650 660 670 680 mKIAA4 NSSGLLICRFNNFSLMKKHVQVGGQRDFIIKPKLMVSENVVPILPLQYVCAPDSEHTLLA ::.::::::::::::::::.::::..:::::::.:..:...:: :.:::::::::.:::: gi|189 NSGGLLICRFNNFSLMKKHIQVGGHKDFIIKPKIMITESLAPISPMQYVCAPDSEQTLLA 1770 1780 1790 1800 1810 1820 690 700 710 720 730 740 mKIAA4 APAQFLLEKFLQHASYKLFPKAIHNFKSPVLAIDCYLNIGQEVAICYVSSRPHSSNVNCE :::::::::::::.:..:::::..: ..:.::.:::::.: ::..::::::::: ::.:: gi|189 APAQFLLEKFLQHSSHRLFPKALNNCRNPLLAVDCYLNLGPEVTLCYVSSRPHSVNVSCE 1830 1840 1850 1860 1870 1880 750 760 770 780 790 800 mKIAA4 GVFFSGLLLYLCDSFVGADLLKKFKFLKGATLCVICQDRSSLRQTIVRLELEDEWQFRLR :. ::::::::::::: : .:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|189 GMAFSGLLLYLCDSFVCAGMLKKYKFLKGATLCVICQDRSSLRQTIVRLELEDEWQFRLR 1890 1900 1910 1920 1930 1940 810 820 mKIAA4 DEFQTANSSDDKPLYFLTGRHV :::::::::::::::::::::. gi|189 DEFQTANSSDDKPLYFLTGRHI 1950 1960 1970 >>gi|148691052|gb|EDL22999.1| mCG14672 [Mus musculus] (1727 aa) initn: 3958 init1: 3958 opt: 3974 Z-score: 4503.8 bits: 845.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 4268; 82.909% identity (83.030% similar) in 825 aa overlap (1-825:1043-1727) 10 20 30 mKIAA4 AALDLSAKEAERVPASENDSEELLIDLERP :::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 DSSYLTRTALEQEVGLACCYVSKEVIRGPAAALDLSAKEAERVPASENDSEELLIDLERP 1020 1030 1040 1050 1060 1070 40 50 60 70 80 90 mKIAA4 QSNSSAVTGTSGSIMENGVSSSSTAGKPQQQLLTPTSSIRLDEGVSASTAVVGEILKQEC ::::::::::: gi|148 QSNSSAVTGTS------------------------------------------------- 1080 100 110 120 130 140 150 mKIAA4 DSLDPPMASSTTSKPSSSSSSSAQALAWSRQPRGLHTALPPVIILSKAAYSLLGSQKGGR ::::::::::::: gi|148 -----------------------------------------------AAYSLLGSQKGGR 1090 160 170 180 190 200 210 mKIAA4 LPSSSSLLPHADVAWVSSLRPGLHKDMSSEEQSLYYRQWTSARQHHADYSNQPDPISGAR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 LPSSSSLLPHADVAWVSSLRPGLHKDMSSEEQSLYYRQWTSARQHHADYSNQPDPISGAR 1100 1110 1120 1130 1140 1150 220 230 240 250 260 270 mKIAA4 TLHPRRLLLTGPPQVGKTGSYLQFLRILFRMLIRLLEVDVYNEEEINTDHSDDSELSQSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 TLHPRRLLLTGPPQVGKTGSYLQFLRILFRMLIRLLEVDVYNEEEINTDHSDDSELSQSE 1160 1170 1180 1190 1200 1210 280 290 300 310 320 330 mKIAA4 GEPWPDIETFSKMPFDVSVHDPKYRLMSLVYSEKLAGIKQEVIKEYKVEEPRQRETMSMM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 GEPWPDIETFSKMPFDVSVHDPKYRLMSLVYSEKLAGIKQEVIKEYKVEEPRQRETMSMM 1220 1230 1240 1250 1260 1270 340 350 360 370 380 390 mKIAA4 LTQYAAYNTFHHCEQCQQYMAFTPASQMSDSTLHAFTFSSSMLGEEVQLYFIIPKSKESH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 LTQYAAYNTFHHCEQCQQYMAFTPASQMSDSTLHAFTFSSSMLGEEVQLYFIIPKSKESH 1280 1290 1300 1310 1320 1330 400 410 420 430 440 450 mKIAA4 FVFSKQGRHLESMRLPLVSDKNLNAVKSPIFTPSSGRHEHGLLNLFHAMEGISHLHLLVV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 FVFSKQGRHLESMRLPLVSDKNLNAVKSPIFTPSSGRHEHGLLNLFHAMEGISHLHLLVV 1340 1350 1360 1370 1380 1390 460 470 480 490 500 510 mKIAA4 KEYEMPLYRKYWPNHIMLVLPGMFNNAGVGAARFLIKELSYHNLELERNRLEELGVKRQC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 KEYEMPLYRKYWPNHIMLVLPGMFNNAGVGAARFLIKELSYHNLELERNRLEELGVKRQC 1400 1410 1420 1430 1440 1450 520 530 540 550 560 570 mKIAA4 VWPFIVVMDDSCVLWNIHSVQEQTSQPTEAGISSKNVSLKSVLQHIEATPKIIHYAILGI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 VWPFIVVMDDSCVLWNIHSVQEQTSQPTEAGISSKNVSLKSVLQHIEATPKIIHYAILGI 1460 1470 1480 1490 1500 1510 580 590 600 610 620 630 mKIAA4 QKWNSKLTSQSLKAPFSRCHVHDFILLNIDLTQNVQYDFNRYFCEDVDFNLRTNSSGLLI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 QKWNSKLTSQSLKAPFSRCHVHDFILLNIDLTQNVQYDFNRYFCEDVDFNLRTNSSGLLI 1520 1530 1540 1550 1560 1570 640 650 660 670 680 690 mKIAA4 CRFNNFSLMKKHVQVGGQRDFIIKPKLMVSENVVPILPLQYVCAPDSEHTLLAAPAQFLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 CRFNNFSLMKKHVQVGGQRDFIIKPKLMVSENVVPILPLQYVCAPDSEHTLLAAPAQFLL 1580 1590 1600 1610 1620 1630 700 710 720 730 740 750 mKIAA4 EKFLQHASYKLFPKAIHNFKSPVLAIDCYLNIGQEVAICYVSSRPHSSNVNCEGVFFSGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 EKFLQHASYKLFPKAIHNFKSPVLAIDCYLNIGQEV------------------------ 1640 1650 1660 1670 760 770 780 790 800 810 mKIAA4 LLYLCDSFVGADLLKKFKFLKGATLCVICQDRSSLRQTIVRLELEDEWQFRLRDEFQTAN .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 --------------------QGATLCVICQDRSSLRQTIVRLELEDEWQFRLRDEFQTAN 1680 1690 1700 1710 820 mKIAA4 SSDDKPLYFLTGRHV ::::::::::::::: gi|148 SSDDKPLYFLTGRHV 1720 >>gi|149031716|gb|EDL86666.1| rCG41248 [Rattus norvegicu (1669 aa) initn: 3966 init1: 3753 opt: 3863 Z-score: 4378.0 bits: 822.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 3865; 82.162% identity (85.270% similar) in 740 aa overlap (1-740:1022-1664) 10 20 30 mKIAA4 AALDLSAKEAERVPASENDSEELLIDLERP ::::::.::.::::.:.::::::::::::: gi|149 DSSYLTRTALEQEVGLACCYVSKEVVRGPAAALDLSGKETERVPTSDNDSEELLIDLERP 1000 1010 1020 1030 1040 1050 40 50 60 70 80 90 mKIAA4 QSNSSAVTGTSGSIMENGVSSSSTAGKPQQQLLTPTSSIRLDEGVSASTAVVGEILKQEC ::::::::::: gi|149 QSNSSAVTGTS------------------------------------------------- 1060 100 110 120 130 140 150 mKIAA4 DSLDPPMASSTTSKPSSSSSSSAQALAWSRQPRGLHTALPPVIILSKAAYSLLGSQKGGR :::::::::::.. gi|149 -----------------------------------------------AAYSLLGSQKGSK 1070 160 170 180 190 200 210 mKIAA4 LPSSSSLLPHADVAWVSSLRPGLHKDMSSEEQSLYYRQWTSARQHHADYSNQPDPISGAR ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: gi|149 LPSSS-LLPHADVAWVSSLRPGLHKDMSSEEQSLYYRQWTSARQHHADYSNQPDPISGVR 1080 1090 1100 1110 1120 1130 220 230 240 250 260 270 mKIAA4 TLHPRRLLLTGPPQVGKTGSYLQFLRILFRMLIRLLEVDVYNEEEINTDHSDDSELSQSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:.::::::: gi|149 TLHPRRLLLTGPPQVGKTGSYLQFLRILFRMLIRLLEVDVYDEEEINTDHTDSSELSQSE 1140 1150 1160 1170 1180 1190 280 290 300 310 320 330 mKIAA4 GEPWPDIETFSKMPFDVSVHDPKYRLMSLVYSEKLAGIKQEVIKEYKVEEPRQRETMSMM ::::::::::::: :::::::::: ::: ::::::::.:::::::::.:.::.::::::: gi|149 GEPWPDIETFSKMTFDVSVHDPKYSLMSPVYSEKLAGVKQEVIKEYKAEQPRKRETMSMM 1200 1210 1220 1230 1240 1250 340 350 360 370 380 390 mKIAA4 LTQYAAYNTFHHCEQCQQYMAFTPASQMSDSTLHAFTFSSSMLGEEVQLYFIIPKSKESH ::.:::::::::::::.::: ::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 LTKYAAYNTFHHCEQCHQYMDFTPNSQMSDSTLHAFTFSSSMLGEEVQLYFIIPKSKESH 1260 1270 1280 1290 1300 1310 400 410 420 430 440 450 mKIAA4 FVFSKQGRHLESMRLPLVSDKNLNAVKSPIFTPSSGRHEHGLLNLFHAMEGISHLHLLVV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 FVFSKQGRHLESMRLPLVSDKNLNAVKSPIFTPSSGRHEHGLLNLFHAMEGISHLHLLVV 1320 1330 1340 1350 1360 1370 460 470 480 490 500 510 mKIAA4 KEYEMPLYRKYWPNHIMLVLPGMFNNAGVGAARFLIKELSYHNLELERNRLEELGVKRQC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 KEYEMPLYRKYWPNHIMLVLPGMFNNAGVGAARFLIKELSYHNLELERNRLEELGVKRQC 1380 1390 1400 1410 1420 1430 520 530 540 550 560 570 mKIAA4 VWPFIVVMDDSCVLWNIHSVQEQTSQPTEAGISSKNVSLKSVLQHIEATPKIIHYAILGI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 VWPFIVVMDDSCVLWNIHSVQEQTSQPTEAGISSKNVSLKSVLQHIEATPKIIHYAILGI 1440 1450 1460 1470 1480 1490 580 590 600 610 620 630 mKIAA4 QKWNSKLTSQSLKAPFSRCHVHDFILLNIDLTQNVQYDFNRYFCEDVDFNLRTNSSGLLI ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 QKWNSKLTSQNLKAPFSRCHVHDFILLNIDLTQNVQYDFNRYFCEDVDFNLRTNSSGLLI 1500 1510 1520 1530 1540 1550 640 650 660 670 680 690 mKIAA4 CRFNNFSLMKKHVQVGGQRDFIIKPKLMVSENVVPILPLQYVCAPDSEHTLLAAPAQFLL ::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::: gi|149 CRFNNFSLMKKHVQVGGQRDFIIKPKLMVSENLAPILPLQYVCAPDSEHTLLAAPAQFLL 1560 1570 1580 1590 1600 1610 700 710 720 730 740 750 mKIAA4 EKFLQHASYKLFPKAIHNFKSPVLAIDCYLNIGQEVAICYVSSRPHSSNVNCEGVFFSGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::: : :.. .. : gi|149 EKFLQHASYKLFPKAIHNFKSPVLAIDCYLNIGQEVLPCVSSAKTEAPYVKQLFA 1620 1630 1640 1650 1660 760 770 780 790 800 810 mKIAA4 LLYLCDSFVGADLLKKFKFLKGATLCVICQDRSSLRQTIVRLELEDEWQFRLRDEFQTAN >>gi|149411308|ref|XP_001507474.1| PREDICTED: similar to (1058 aa) initn: 3779 init1: 2788 opt: 3586 Z-score: 4066.2 bits: 763.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 3586; 85.366% identity (93.984% similar) in 615 aa overlap (212-825:444-1058) 190 200 210 220 230 240 mKIAA4 QSLYYRQWTSARQHHADYSNQPDPISGARTLHPRRLLLTGPPQVGKTGSYLQFLRILFRM :::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 LSENDAEELLVDLERPQSNSSAVTGTSGGGLHPRRLLLTGPPQVGKTGSYLQFLRILFRM 420 430 440 450 460 470 250 260 270 280 290 300 mKIAA4 LIRLLEVDVYNEEEINTDHSDDSELSQSEGEPWPDIETFSKMPFDVSVHDPKYRLMSLVY ::::::::::.::::::. :.. :.:::: . :::.:.:.:::::::::::::::::::. gi|149 LIRLLEVDVYDEEEINTNPSESCEISQSERDHWPDVENFGKMPFDVSVHDPKYRLMSLVF 480 490 500 510 520 530 310 320 330 340 350 360 mKIAA4 SEKLAGIKQEVIKEYKVEEPRQRETMSMMLTQYAAYNTFHHCEQCQQYMAFTPASQMSDS . .:::.:::. :: .:..:..:::.:::::..::::::::::::.::: .:..: ::: gi|149 TAELAGVKQEASKEVRVDDPKKRETVSMMLTKFAAYNTFHHCEQCHQYMDVNPGAQASDS 540 550 560 570 580 590 370 380 390 400 410 420 mKIAA4 TL-HAFTFSSSMLGEEVQLYFIIPKSKESHFVFSKQGRHLESMRLPLVSDKNLNAVKSPI :: . ::: .. ::::::::::::::.::::::::::::::::.::::: gi|149 TLPRHFTFLPTFXXXXXXXXXXXPKSKESHFVFSKQGKHLESMRLPLVSDKNLNSVKSPI 600 610 620 630 640 650 430 440 450 460 470 480 mKIAA4 FTPSSGRHEHGLLNLFHAMEGISHLHLLVVKEYEMPLYRKYWPNHIMLVLPGMFNNAGVG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::: gi|149 FTPSSGRHEHGLLNLFHAMEGISHLHLLVVKEYEMPLYRKYWPNHIMLVLPGTFNNAGVG 660 670 680 690 700 710 490 500 510 520 530 540 mKIAA4 AARFLIKELSYHNLELERNRLEELGVKRQCVWPFIVVMDDSCVLWNIHSVQEQTSQPTEA ::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::: ::..:: .. gi|149 AARFLIKELSYHNLELERNRLGELGVKRQCVWPFIVVMDDSCVLWNIHSDQEHSSQSADP 720 730 740 750 760 770 550 560 570 580 590 600 mKIAA4 GISSKNVSLKSVLQHIEATPKIIHYAILGIQKWNSKLTSQSLKAPFSRCHVHDFILLNID ::.::::::::::::.::::::.::::::::::.::. ..::::::::::::::::::: gi|149 GIASKNVSLKSVLQHMEATPKIVHYAILGIQKWHSKMKPRNLKAPFSRCHVHDFILLNID 780 790 800 810 820 830 610 620 630 640 650 660 mKIAA4 LTQNVQYDFNRYFCEDVDFNLRTNSSGLLICRFNNFSLMKKHVQVGGQRDFIIKPKLMVS ::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.::: gi|149 LTQNVQYDLNRYFCEDVDFNLRTNSSGLLICRFNNFSLMKKHVQVGGQRDFAIKPKIMVS 840 850 860 870 880 890 670 680 690 700 710 720 mKIAA4 ENVVPILPLQYVCAPDSEHTLLAAPAQFLLEKFLQHASYKLFPKAIHNFKSPVLAIDCYL :...:.::.::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::..:::::::::: gi|149 ESLAPVLPVQYVCAPDSEHTLLAAPAQFLLEKFLQHATYKLFPKAIHNLRSPVLAIDCYL 900 910 920 930 940 950 730 740 750 760 770 780 mKIAA4 NIGQEVAICYVSSRPHSSNVNCEGVFFSGLLLYLCDSFVGADLLKKFKFLKGATLCVICQ ::: ::::::::::::: ::: ::: :::::::::::::::.:::::::::::::::::: gi|149 NIGPEVAICYVSSRPHSINVNSEGVVFSGLLLYLCDSFVGAELLKKFKFLKGATLCVICQ 960 970 980 990 1000 1010 790 800 810 820 mKIAA4 DRSSLRQTIVRLELEDEWQFRLRDEFQTANSSDDKPLYFLTGRHV ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 DRSSLRQTIVRLELEDEWQFRLRDEFQTANSSDDKPLYFLTGRHV 1020 1030 1040 1050 >>gi|118089026|ref|XP_419956.2| PREDICTED: similar to GR (1944 aa) initn: 2692 init1: 1752 opt: 3141 Z-score: 3557.1 bits: 670.4 E(): 2e-189 Smith-Waterman score: 3143; 55.594% identity (77.855% similar) in 867 aa overlap (4-825:1083-1944) 10 20 mKIAA4 AALDLSAKEAERVPASENDSEELLID------- :. .. :.. ...:..::. . gi|118 SLVRTTLEQELGLAAYFVSSEIHTEKAVVNDVIESDPEKLSSTDNEDEEIATEGSTSEKR 1060 1070 1080 1090 1100 1110 30 40 50 60 mKIAA4 ----LERPQSNSSAVTGTSGSIMENGVSSSS-------TAG---KPQQQLLTPTS----- :: .:..:: .. :.. .... : ::: : .:.:. .. gi|118 SPMKRERSHSHDSASSSLSSKASSKSLTFCSEPSPPLVTAGDRAKSPHQVLSNSTEETTN 1120 1130 1140 1150 1160 1170 70 80 90 100 110 mKIAA4 -----SIRLDEG----VSASTAVVGEIL--KQECDSLDPPMASSTTSKPSSSSSSSAQA- . ..:.: .: .: : ::. : . ..::..: :::::::: . gi|118 NHERQKQKVDKGAQTTISKHLPPGNEQLDTKQNIKSAQISITSSSSSPFSSSSSSSAPTH 1180 1190 1200 1210 1220 1230 120 130 140 150 160 170 mKIAA4 ----LAWSRQPRGLHTALPPVIILSKAAYSLLGSQKGGRLPSSSSLLPHADVAWVSSLRP : :. . ::...: : .:... : .. ::.::::::. .: :.::.:: gi|118 NSFILQTSQCSMTKSSKQPPIVFLPKLVYDIITSTDSSGLPKSSSLLPYHSVMWASSFRP 1240 1250 1260 1270 1280 1290 180 190 200 210 220 230 mKIAA4 GLHKDMSSEEQSLYYRQWTSARQHHADYSNQPDPISGARTLHPRRLLLTGPPQVGKTGSY . : :. :::::::::: . : ::.:. . . :.:::::::.::::.::::.: gi|118 LMSKMMTCTEQSLYYRQWTVPKPIHMDYNNRNE--GRMDTFHPRRLLLSGPPQIGKTGAY 1300 1310 1320 1330 1340 1350 240 250 260 270 280 290 mKIAA4 LQFLRILFRMLIRLLEVDVYNEEEINTDHSDDSELSQSE-GEPWPDIETFSKMPFDVSVH :::: :: :::::: :::::.::::: . ...:. . :. :::.:::.:.::: ..: gi|118 LQFLSILSRMLIRLTEVDVYDEEEININIKEESDQCYHQPGDTWPDLETFKKIPFDYTIH 1360 1370 1380 1390 1400 1410 300 310 320 330 340 mKIAA4 DPKYRLMSLVYSEKLAGIKQE--VIKEYKVEEPRQRETMSMMLTQYAAYNTFHHCEQCQQ ::::. ::. : :: ...: :.. . . .:.: : :..::::::.::::::.: gi|118 DPKYEDASLICS-KLQTVNSEDRPISRRQEDMYTHRQTTRMRLSKYAAYNTYHHCEQCHQ 1420 1430 1440 1450 1460 350 360 370 380 390 400 mKIAA4 YMAFTPASQMSDSTLHAFTFSSSMLGEEVQLYFIIPKSKESHFVFSKQGRHLESMRLPLV ::.:.: :. .::::::.:: ::::::.::.:::::::: :::::. ::.::::::::: gi|118 YMGFNPRYQLYESTLHAFAFSYSMLGEEIQLHFIIPKSKEHHFVFSQPGRQLESMRLPLV 1470 1480 1490 1500 1510 1520 410 420 430 440 450 460 mKIAA4 SDKNLNAVKSPIFTPSSGRHEHGLLNLFHAMEGISHLHLLVVKEYEMPLYRKYWPNHIML .::. . .::: :::..:::::::.::.:::.: ::::.:::::::: .:.::::::::: gi|118 TDKSEDFIKSPTFTPTTGRHEHGLFNLYHAMDGASHLHVLVVKEYEMAIYKKYWPNHIML 1530 1540 1550 1560 1570 1580 470 480 490 500 510 520 mKIAA4 VLPGMFNNAGVGAARFLIKELSYHNLELERNRLEELGVKRQCVWPFIVVMDDSCVLWNIH :::..::.::::::.::::::::::::::::: ::::.: : .:::::. :::::.:: gi|118 VLPSIFNSAGVGAAHFLIKELSYHNLELERNRQEELGIKPQDIWPFIVISDDSCVMWNAV 1590 1600 1610 1620 1630 1640 530 540 550 560 570 580 mKIAA4 SVQEQTSQPTEAGISSKNVSLKSVLQHIEATPKIIHYAILGIQKWNSKLTSQSLKAPFSR :. . .. .. . .::::: .::.:::::.. :::..:..::.:: .. .: ::: gi|118 EVDCSGDRKSDYTWTERNVSLKHILQRIEATPNVTHYALIGMRKWSSKTNTAEIKEPFSC 1650 1660 1670 1680 1690 1700 590 600 610 620 630 640 mKIAA4 CHVHDFILLNIDLTQNVQYDFNRYFCEDVDFNLRTNSSGLLICRFNNFSLMKKHVQVGGQ :::::::.::.::::::::. ::. :.:::::::..:.::::::::.::.:::.. :::: gi|118 CHVHDFIMLNVDLTQNVQYNQNRFTCDDVDFNLRVHSAGLLICRFNHFSVMKKQIAVGGQ 1710 1720 1730 1740 1750 1760 650 660 670 680 690 700 mKIAA4 RDFIIKPKLMVSENVVPILPLQYVCAPDSEHTLLAAPAQFLLEKFLQHASYKLFPKAIHN :.: :: : ::. : : : ::.:::::.::.::::::.::::.::. :...:: ...: gi|118 RSFHIKSK--VSDIPVSISPAQYICAPDSKHTFLAAPAQLLLEKYLQYHSHRFFPLSLKN 1770 1780 1790 1800 1810 1820 710 720 730 740 750 760 mKIAA4 FKSPVLAIDCYLNIGQEVAICYVSSRPHSSNVNCEGVFFSGLLLYLCDSFVGADLLKKFK .. :::..:::::.: ..:.::::::::: :.. :. ::::::::::::: :..::::. gi|118 YRHPVLSVDCYLNLGPQIAVCYVSSRPHSLNISSSGLTFSGLLLYLCDSFVVASFLKKFH 1830 1840 1850 1860 1870 1880 770 780 790 800 810 820 mKIAA4 FLKGATLCVICQDRSSLRQTIVRLELEDEWQFRLRDEFQTANSSDDKPLYFLTGRHV ::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::...:.::.::::::. gi|118 FLKGATLCVICQDRNSLRQTVVRLELEDEWQFRLRDEFQTANAKEDRPLFFLTGRHI 1890 1900 1910 1920 1930 1940 >>gi|224048748|ref|XP_002196511.1| PREDICTED: similar to (1933 aa) initn: 2637 init1: 1742 opt: 3134 Z-score: 3549.2 bits: 668.9 E(): 5.5e-189 Smith-Waterman score: 3152; 56.169% identity (78.143% similar) in 851 aa overlap (4-825:1088-1933) 10 20 30 mKIAA4 AALDLSAKEAERVPASENDSEELLIDLERPQSN :. .. :.. ...:..::. . .. gi|224 SLVRTSLEQELGLAAYFVSSEIHTEKAVVNDVLESDPEKLSSTDNEDEEIATEGSASEKR 1060 1070 1080 1090 1100 1110 40 50 60 70 mKIAA4 S------SAVTGTSGSIMENGVSSSSTAGKPQQQLLTPTSSI---------RLDEG---- : : ...: . . .:. : ..: : : . : ..:.: gi|224 SPMKRERSRSHDSASSSLSSKASTFCTESSPPQALSNSTEETTNNYERQKQKVDKGAQTT 1120 1130 1140 1150 1160 1170 80 90 100 110 120 mKIAA4 VSASTAVVGEIL--KQECDSLDPPMASSTTSKPSSSSSSSAQA-----LAWSRQPRGLHT .: : : : ::. : . ..::.. :::::::: . : :. . gi|224 ISKHLPPVTEQLDMKQNIKSTQVSITSSSSPPFSSSSSSSAPTHNSFILQTSQCSMTKAS 1180 1190 1200 1210 1220 1230 130 140 150 160 170 180 mKIAA4 ALPPVIILSKAAYSLLGSQKGGRLPSSSSLLPHADVAWVSSLRPGLHKDMSSEEQSLYYR ::...: : .:... : .. ::.::::::. .: :.::.:: . : :. ::::::: gi|224 KQPPIVFLPKLVYDIITSTDSSGLPKSSSLLPYHSVMWASSFRPLMSKMMTCTEQSLYYR 1240 1250 1260 1270 1280 1290 190 200 210 220 230 240 mKIAA4 QWTSARQHHADYSNQPDPISGARTLHPRRLLLTGPPQVGKTGSYLQFLRILFRMLIRLLE ::: . : ::.:. . . :.:::::::.::::.::::.::::: :: :::::: : gi|224 QWTVPKPIHMDYNNRNE--GRMDTFHPRRLLLSGPPQIGKTGAYLQFLSILSRMLIRLTE 1300 1310 1320 1330 1340 1350 250 260 270 280 290 300 mKIAA4 VDVYNEEEINTDHSDDSE-LSQSEGEPWPDIETFSKMPFDVSVHDPKYRLMSLVYSEKLA ::::.::::: ...:. .. :. :::.:.:.::::: ..:::::. ::. : :: gi|224 VDVYDEEEINLTIKEESDQYYHQPGDMWPDLESFKKMPFDYTIHDPKYEDASLICS-KLQ 1360 1370 1380 1390 1400 1410 310 320 330 340 350 360 mKIAA4 GIKQEVIKEYKVEEPRQ--RETMSMMLTQYAAYNTFHHCEQCQQYMAFTPASQMSDSTLH ...: . . .: :.: : :..::::::.::::::.:::.:.: :. .:::: gi|224 TMNSEDRSMSRRQEDMYTCRQTTRMRLSKYAAYNTYHHCEQCHQYMGFNPRYQIYESTLH 1420 1430 1440 1450 1460 1470 370 380 390 400 410 420 mKIAA4 AFTFSSSMLGEEVQLYFIIPKSKESHFVFSKQGRHLESMRLPLVSDKNLNAVKSPIFTPS ::.:: ::::::.::.:::::::: :::::. ::.:::::::::.::. . .::: :::. gi|224 AFAFSYSMLGEEIQLHFIIPKSKEHHFVFSQPGRQLESMRLPLVTDKSEDYIKSPTFTPT 1480 1490 1500 1510 1520 1530 430 440 450 460 470 480 mKIAA4 SGRHEHGLLNLFHAMEGISHLHLLVVKEYEMPLYRKYWPNHIMLVLPGMFNNAGVGAARF .:::::::.::.:::.: ::::.:::::::: .:.::::::::::::..::.::::::.: gi|224 TGRHEHGLFNLYHAMDGASHLHVLVVKEYEMAIYKKYWPNHIMLVLPSIFNSAGVGAAHF 1540 1550 1560 1570 1580 1590 490 500 510 520 530 540 mKIAA4 LIKELSYHNLELERNRLEELGVKRQCVWPFIVVMDDSCVLWNIHSVQEQTSQPTEAGISS :::::::::::::::: ::::.: : .:::::. :::::.:: :. . .. .. . gi|224 LIKELSYHNLELERNRQEELGIKPQDIWPFIVISDDSCVMWNAVEVDCSGDRKSDYTWTE 1600 1610 1620 1630 1640 1650 550 560 570 580 590 600 mKIAA4 KNVSLKSVLQHIEATPKIIHYAILGIQKWNSKLTSQSLKAPFSRCHVHDFILLNIDLTQN .:::::..::::::::.. :::..:..::.:: .: .: ::: ::::::..::.::::: gi|224 RNVSLKQILQHIEATPNVTHYALIGMRKWSSKTNSAEIKDPFSCCHVHDFLMLNVDLTQN 1660 1670 1680 1690 1700 1710 610 620 630 640 650 660 mKIAA4 VQYDFNRYFCEDVDFNLRTNSSGLLICRFNNFSLMKKHVQVGGQRDFIIKPKLMVSENVV :::. ::. :.:::::::..:.::::::::.:..:::.. :::::.: :: : ::.. : gi|224 VQYNQNRFTCDDVDFNLRVHSAGLLICRFNHFNVMKKQIAVGGQRSFHIKSK--VSDTPV 1720 1730 1740 1750 1760 1770 670 680 690 700 710 720 mKIAA4 PILPLQYVCAPDSEHTLLAAPAQFLLEKFLQHASYKLFPKAIHNFKSPVLAIDCYLNIGQ : : ::.:::::.::.::::::.::::.::. :...:: ...:.. :::..:::::.: gi|224 SISPAQYICAPDSKHTFLAAPAQLLLEKYLQYHSHRFFPLSLKNYSHPVLSVDCYLNLGP 1780 1790 1800 1810 1820 1830 730 740 750 760 770 780 mKIAA4 EVAICYVSSRPHSSNVNCEGVFFSGLLLYLCDSFVGADLLKKFKFLKGATLCVICQDRSS ..:.::::::::: :.. :. ::::::::::::: :..::::.::::::::::::::.: gi|224 QIAVCYVSSRPHSLNISSSGLTFSGLLLYLCDSFVVASFLKKFHFLKGATLCVICQDRNS 1840 1850 1860 1870 1880 1890 790 800 810 820 mKIAA4 LRQTIVRLELEDEWQFRLRDEFQTANSSDDKPLYFLTGRHV ::::.:::::::::::::::::::::...:.::.::::::. gi|224 LRQTVVRLELEDEWQFRLRDEFQTANAKEDRPLFFLTGRHI 1900 1910 1920 1930 >>gi|114576135|ref|XP_001159582.1| PREDICTED: GREB1 prot (947 aa) initn: 2597 init1: 1726 opt: 3130 Z-score: 3549.0 bits: 667.8 E(): 5.7e-189 Smith-Waterman score: 3133; 55.658% identity (77.483% similar) in 866 aa overlap (9-825:88-947) 10 20 mKIAA4 AALDLSAKEAERVPASENDSEELLID-----------L .::.. ...:..::: . gi|114 ALEQELGLAAYFVSNEVPLEKGARNEALESDAEKLSSTDNEDEELGTEGSTSEKRSPMKR 60 70 80 90 100 110 30 40 50 60 70 mKIAA4 ERPQSNSSAVTG----TSGSIMENGVSSSSTAGKPQ-QQLLTPTSSIRLDEGVS------ :: .:..:: .. .::: . .: ::.. .. :: .. .: .:: . gi|114 ERSRSHDSASSSLSSKASGSAL-GGESSAQPTALPQGEHARSPQPCGPAEEGRAPGEKQR 120 130 140 150 160 170 80 90 100 110 mKIAA4 --AS----TAVV----GEILKQECD------SLDPPMASS----TTSKPSSSSSSSAQAL :: .:. : . .:. :.. ..:: ..:. ::::: . : gi|114 PRASQGPPSAISRHSPGLTPQPDCSLRTGQRSVQVSVTSSCSQLSSSSGSSSSSVAPAAG 180 190 200 210 220 230 120 130 140 150 160 170 mKIAA4 AWSRQPR--GLHTAL--PPVIILSKAAYSLLGSQKGGRLPSSSSLLPHADVAWVSSLRPG .: : .: : ::...: : .:... : .. ::...:::: .: :.::.:: gi|114 TWVLQASQCSLTKACRQPPIVFLPKLVYDMVVSTDSSGLPKAASLLPSPSVMWASSFRPL 240 250 260 270 280 290 180 190 200 210 220 230 mKIAA4 LHKDMSSEEQSLYYRQWTSARQHHADYSNQPDPISGARTLHPRRLLLTGPPQVGKTGSYL : : :.: :::::::::: : : ::.:. . . . ..:::::::.::::.::::.:: gi|114 LSKTMTSTEQSLYYRQWTVPRPSHMDYGNRAE--GRVDSFHPRRLLLSGPPQIGKTGAYL 300 310 320 330 340 350 240 250 260 270 280 290 mKIAA4 QFLRILFRMLIRLLEVDVYNEEEINTDHSDDSELSQSE-GEPWPDIETFSKMPFDVSVHD ::: .: :::.:: :::::.::::: . ..:. . ..::::.: :.:.::: .:: gi|114 QFLSVLSRMLVRLTEVDVYDEEEININLREESDWHYLQLSDPWPDLELFKKLPFDYIIHD 360 370 380 390 400 410 300 310 320 330 340 mKIAA4 PKYRLMSLVYSEKLAGIKQEVIKEYKVEEPR--QRETMSMMLTQYAAYNTFHHCEQCQQY :::. ::. :. :::.: . : .:.: : :..::::::.::::::.:: gi|114 PKYEDASLICSH-YQGIKSEGRGMSRKPEDLYVRRQTARMRLSKYAAYNTYHHCEQCHQY 420 430 440 450 460 470 350 360 370 380 390 400 mKIAA4 MAFTPASQMSDSTLHAFTFSSSMLGEEVQLYFIIPKSKESHFVFSKQGRHLESMRLPLVS :.: : :. .::::::.:: ::::::.::.:::::::: :::::. : .:::::::::. gi|114 MGFHPRYQLYESTLHAFAFSYSMLGEEIQLHFIIPKSKEHHFVFSQPGGQLESMRLPLVT 480 490 500 510 520 530 410 420 430 440 450 460 mKIAA4 DKNLNAVKSPIFTPSSGRHEHGLLNLFHAMEGISHLHLLVVKEYEMPLYRKYWPNHIMLV ::. . .::: :::..:::::::.::.:::.: ::::.:::::::: .:.:::::::::: gi|114 DKSHEYIKSPTFTPTTGRHEHGLFNLYHAMDGASHLHVLVVKEYEMAIYKKYWPNHIMLV 540 550 560 570 580 590 470 480 490 500 510 520 mKIAA4 LPGMFNNAGVGAARFLIKELSYHNLELERNRLEELGVKRQCVWPFIVVMDDSCVLWNIHS ::..::.::::::.::::::::::::::::: ::::.: : .:::::. :::::.::. . gi|114 LPSIFNSAGVGAAHFLIKELSYHNLELERNRQEELGIKPQDIWPFIVISDDSCVMWNVVD 600 610 620 630 640 650 530 540 550 560 570 580 mKIAA4 VQEQTSQPTEAGISSKNVSLKSVLQHIEATPKIIHYAILGIQKWNSKLTSQSLKAPFSRC :. . : . : .::::: ..:::::.:.:.:::.::..::.:: .. .. ::::: gi|114 VNSAGERSREFSWSERNVSLKHIMQHIEAAPNIMHYALLGLRKWSSKTRASEVREPFSRC 660 670 680 690 700 710 590 600 610 620 630 640 mKIAA4 HVHDFILLNIDLTQNVQYDFNRYFCEDVDFNLRTNSSGLLICRFNNFSLMKKHVQVGGQR :::.::.::.::::::::. ::..:.:::::::..:.:::.:::: ::.:::.. :::.: gi|114 HVHNFIILNVDLTQNVQYNQNRFWCDDVDFNLRVHSAGLLLCRFNRFSVMKKQIVVGGHR 720 730 740 750 760 770 650 660 670 680 690 700 mKIAA4 DFIIKPKLMVSENVVPILPLQYVCAPDSEHTLLAAPAQFLLEKFLQHASYKLFPKAIHNF .: : : ::.: . ..: ::.:::::.::.::::::.:::::::: :. .:: ...: gi|114 SFHITSK--VSDNSAAVVPAQYICAPDSKHTFLAAPAQLLLEKFLQHHSHLFFPLSLKNH 780 790 800 810 820 830 710 720 730 740 750 760 mKIAA4 KSPVLAIDCYLNIGQEVAICYVSSRPHSSNVNCEGVFFSGLLLYLCDSFVGADLLKKFKF :::..:::::.:.....::::::::: :..: ..:::::::::::::::..::::.: gi|114 DHPVLSVDCYLNLGSQISVCYVSSRPHSLNISCSDLLFSGLLLYLCDSFVGASFLKKFHF 840 850 860 870 880 890 770 780 790 800 810 820 mKIAA4 LKGATLCVICQDRSSLRQTIVRLELEDEWQFRLRDEFQTANSSDDKPLYFLTGRHV :::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::. .:.::.::::::. gi|114 LKGATLCVICQDRSSLRQTVVRLELEDEWQFRLRDEFQTANAREDRPLFFLTGRHI 900 910 920 930 940 >>gi|119903956|ref|XP_584947.3| PREDICTED: similar to GR (1943 aa) initn: 2663 init1: 1743 opt: 3132 Z-score: 3546.9 bits: 668.5 E(): 7.4e-189 Smith-Waterman score: 3158; 55.893% identity (78.296% similar) in 857 aa overlap (9-825:1093-1943) 10 20 mKIAA4 AALDLSAKEAERVPASENDSEELL-----------IDL .::.. ...:..:::. . gi|119 ALEQELGLAAYFVSSEAPLEKGARTEALESDAEKLSSTDNEDEELVTEGSTSEKRSPVKR 1070 1080 1090 1100 1110 1120 30 40 50 60 70 80 mKIAA4 ERPQSNSSAVTGTSGSIMENGVSSSSTAGKPQ-QQLLTPTSSIRLDE----GVSASTAVV :: :..:: .. :.. .. . :.:: : .. .: : .: : .. gi|119 ERSCSHDSASSSLSSKASSSAPCGESSAGPSQVERARSPPSCGPSEEARAPGERQRLRAA 1130 1140 1150 1160 1170 1180 90 100 110 120 mKIAA4 G---EILKQECDSL----DPPMASST---TSKPSSSSSSSAQ--------ALAWSRQPRG : ..... .: :: . :. .: ::.:::.::. ::. . . . gi|119 GGPPSVISRHSPGLTPQPDPSLKSGQHVQVSAPSASSSGSASSPALPAAGALVLQASQCS 1190 1200 1210 1220 1230 1240 130 140 150 160 170 180 mKIAA4 LHTAL--PPVIILSKAAYSLLGSQKGGRLPSSSSLLPHADVAWVSSLRPGLHKDMSSEEQ . : :::..: : .:... : :. ::...:::: .: :.::.:: : : :.: :: gi|119 MTKACRQPPVVFLPKLVYDMVTSTDGSGLPKAASLLPSHSVMWASSFRPLLSKTMTSTEQ 1250 1260 1270 1280 1290 1300 190 200 210 220 230 240 mKIAA4 SLYYRQWTSARQHHADYSNQPDP-ISGARTLHPRRLLLTGPPQVGKTGSYLQFLRILFRM :::::::: : : ::.:. . ..: .:::::::.::::.::::.::::: :: :: gi|119 SLYYRQWTVPRPGHMDYGNRAEGRVDG---FHPRRLLLSGPPQIGKTGAYLQFLSILSRM 1310 1320 1330 1340 1350 250 260 270 280 290 300 mKIAA4 LIRLLEVDVYNEEEINTDHSDDSELSQSE-GEPWPDIETFSKMPFDVSVHDPKYRLMSLV :::: :::::.::::: . .::. . ..::::.: :.:.::: .:::::. ::. gi|119 LIRLTEVDVYDEEEININLREDSDWHYLQLSDPWPDLELFKKLPFDYIIHDPKYEDASLI 1360 1370 1380 1390 1400 1410 310 320 330 340 350 mKIAA4 YSEKLAGIKQEVIKEYKVEEPR--QRETMSMMLTQYAAYNTFHHCEQCQQYMAFTPASQM :.. ..:.: .. : .:.: : :...:::::.::::::.:::.: : :. gi|119 CSHH-QSVKSEDRGTHRKPEDLYVRRQTARMRLSKFAAYNTYHHCEQCHQYMGFHPRYQL 1420 1430 1440 1450 1460 1470 360 370 380 390 400 410 mKIAA4 SDSTLHAFTFSSSMLGEEVQLYFIIPKSKESHFVFSKQGRHLESMRLPLVSDKNLNAVKS .::::::.:: ::::::.::.:::::::: :::::. : .:::::::::.::. . .:: gi|119 YESTLHAFAFSYSMLGEEIQLHFIIPKSKEHHFVFSQPGGQLESMRLPLVTDKSHEYIKS 1480 1490 1500 1510 1520 1530 420 430 440 450 460 470 mKIAA4 PIFTPSSGRHEHGLLNLFHAMEGISHLHLLVVKEYEMPLYRKYWPNHIMLVLPGMFNNAG : :::..:::::::.::.:::.: ::::.:::::::: .:.::::::::::::..::.:: gi|119 PTFTPTTGRHEHGLFNLYHAMDGASHLHVLVVKEYEMAIYKKYWPNHIMLVLPSIFNSAG 1540 1550 1560 1570 1580 1590 480 490 500 510 520 530 mKIAA4 VGAARFLIKELSYHNLELERNRLEELGVKRQCVWPFIVVMDDSCVLWNIHSVQEQTSQPT ::::.::::::::::::::::: ::::.: : .:::::. :::::.::. .:. . gi|119 VGAAHFLIKELSYHNLELERNRQEELGIKPQDIWPFIVISDDSCVMWNVVDVDSGGERSR 1600 1610 1620 1630 1640 1650 540 550 560 570 580 590 mKIAA4 EAGISSKNVSLKSVLQHIEATPKIIHYAILGIQKWNSKLTSQSLKAPFSRCHVHDFILLN : . : .::::: ..:::::.:.: :::..:..::.:: :. .. :::::::::::.:: gi|119 EFSWSERNVSLKHIMQHIEASPNITHYALIGMRKWSSKTGSHEVREPFSRCHVHDFIVLN 1660 1670 1680 1690 1700 1710 600 610 620 630 640 650 mKIAA4 IDLTQNVQYDFNRYFCEDVDFNLRTNSSGLLICRFNNFSLMKKHVQVGGQRDFIIKPKLM .::::::::. ::..:.:::::::..:.:::.:::: ::.:::...:::.:.: : : gi|119 VDLTQNVQYNQNRFMCDDVDFNLRVHSAGLLLCRFNRFSVMKKQISVGGHRSFHITSK-- 1720 1730 1740 1750 1760 1770 660 670 680 690 700 710 mKIAA4 VSENVVPILPLQYVCAPDSEHTLLAAPAQFLLEKFLQHASYKLFPKAIHNFKSPVLAIDC ::.. . ..: ::.:::::.::.::::::.:::::::: :...:: ...:. :::..:: gi|119 VSDSPMAVVPAQYICAPDSKHTFLAAPAQLLLEKFLQHHSHRFFPLSLKNLGHPVLSVDC 1780 1790 1800 1810 1820 1830 720 730 740 750 760 770 mKIAA4 YLNIGQEVAICYVSSRPHSSNVNCEGVFFSGLLLYLCDSFVGADLLKKFKFLKGATLCVI :::.:.....::::::::: :..: :::::::::::::::..::::.:::::::::: gi|119 YLNLGSQISVCYVSSRPHSLNISCSDFVFSGLLLYLCDSFVGASFLKKFHFLKGATLCVI 1840 1850 1860 1870 1880 1890 780 790 800 810 820 mKIAA4 CQDRSSLRQTIVRLELEDEWQFRLRDEFQTANSSDDKPLYFLTGRHV ::::.:::::.:::::::::::::::::::::...:.::.::::::. gi|119 CQDRNSLRQTVVRLELEDEWQFRLRDEFQTANAKEDRPLFFLTGRHI 1900 1910 1920 1930 1940 825 residues in 1 query sequences 2727779818 residues in 7921681 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Tue Mar 17 12:14:53 2009 done: Tue Mar 17 12:23:20 2009 Total Scan time: 1112.410 Total Display time: 0.500 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]