FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1054.ptfa, 752 aa vs ./tmplib.26680 library 1768265 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3570+/-0.00475; mu= 18.2715+/- 0.318 mean_var=107.9900+/-24.841, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 4 in 1/35 Lambda= 0.1234 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0736 ( 747 res) mbh04144 ( 747) 2827 515 1.2e-146 mKIAA0735 ( 588 res) mbg06312 ( 588) 2631 480 3.4e-136 >>mKIAA0736 ( 747 res) mbh04144 (747 aa) initn: 3149 init1: 2145 opt: 2827 Z-score: 2725.1 bits: 514.9 E(): 1.2e-146 Smith-Waterman score: 3182; 63.108% identity (64.325% ungapped) in 740 aa overlap (26-751:7-746) 10 20 30 40 50 60 mKIAA1 CCCSRAAEHSPWTLPCHTLPISRDKMEDSYKDRTSLMKGAKDIAKEVKKQTVKKVNQAVD ::....::.....:::::::::::...::: ...: mKIAA0 SAPSPIMEEGFRDRAAFIRGAKDIAKEVKKHAAKKVVKGLD 10 20 30 40 70 80 90 100 110 mKIAA1 RAQDEYTQRSYSRFQDEEDDDDYYPPGETYSGEVNDDE----GSSEATEGHDEEDEIYEG :.::::..::::::..:.:::: : :. . ..:: .::.:::::::.:::::: mKIAA0 RVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDPCPCGRLLPRRRGQDEEEGGASSDATEGHDEDDEIYEG 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 mKIAA1 EYQGIP-STNQGKDSIVSVGQP----KGD----EYKDRRELESERRADEEELAQQYELII :::::: . . :: .. : : .: : . :..:: :.:::::::: :. mKIAA0 EYQGIPRAESGGKGERMADGAPLAGVRGGLSDGEGPPGGRGEAQRRKDREELAQQYETIL 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 QECGHGRFQWALFFVLGMALMADGVEVFVVGFVLPSAETDLCIPNSGSGWLGSIVYLGMM .:::::::::.:.::::.:::::::::::::::::::: :.:. .:..: :: ::::::: mKIAA0 RECGHGRFQWTLYFVLGLALMADGVEVFVVGFVLPSAEKDMCLSDSNKGMLGLIVYLGMM 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 VGAFFWGGLADKVGRKQSLLICMSVNGFFAFLSSFVQGYGFFLVCRLLSGFGIGGAIPTV ::::.::::::..::.: ::: .:::. :::.:::::::: :: :::::: ::::.:: : mKIAA0 VGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLSVNSVFAFFSSFVQGYGTFLFCRLLSGVGIGGSIPIV 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 mKIAA1 FSYFAEVLAREKRGEHLSWLCMFWMIGGIYASAMAWAIIPHYGWSFSMGSAYQFHSWRVF ::::.: ::.::::::::::::::::::.::.::::::::::::::.::::::::::::: mKIAA0 FSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFWMIGGVYAAAMAWAIIPHYGWSFQMGSAYQFHSWRVF 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 mKIAA1 VIVCALPCVSSVVALTFMPESPRFLLEVGKHDEAWMILKLIHDTNMRARGQPEKVFTVNK :.:::.: : .. ::: .::::::.:: ::::::::.:: .:::::::.:.::.::.:.. mKIAA0 VLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRFFLENGKHDEAWMVLKQVHDTNMRAKGHPERVFSVTH 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 mKIAA1 IKTPKQIDELIEIESDTGTWYRRCFVRIRTELYGIWLTFMRCFNYPVRENTIKLTIVWFT ::: .: ::::::.:::::::.: :: . .: .:. ::. :. :. . :::: mKIAA0 IKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRWGVRALSLGGQVWGNFLSCFSPEYRRITLMMMGVWFT 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 mKIAA1 LSFGYYGLSVWFPDVIKHLQSDEYALLTRNVQKDKYANFSINFTMENQIHTGMEYENGRF .::.::::.:::::.:.:::. .:: :. .. . ..:::.::::: : .: : .: mKIAA0 MSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDYAARTKVFPGERVEHVTFNFTLENQIHRGGQYFNDKF 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 mKIAA1 LGVKFKSVTFKDSVFKSCTFDDVTSVNTYFKNCTFIDTLFDNTDFEPYKFIDSEFQNCSF .:...:::.:.::.:. : :.:::: ::.:.:::::.:.: :::. :::..:.. : .: mKIAA0 IGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVTSSNTFFRNCTFINTVFYNTDLFEYKFVNSRLVNSTF 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 mKIAA1 LHNKTGCQITFDDD-YSAYWIYFVNFLGTLAVLPGNIVSALLMDRIGRLTMLGGSMVLSG :::: :: . .:: .:::.:::::::::::::::::::.:::: ::.:: ::: mKIAA0 LHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFVSFLGTLAVLPGNIVSALLMDKIGRLRMLAGSSVLSC 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 mKIAA1 ISCFFLWFGTSESMMIGMLCLYNGLTISAWNSLDVVTVELYPTDRRATGFGFLNALCKAA .::::: ::.::: ::..:::..:..:..::.:::.::::::.:.:.:.::::::::: : mKIAA0 VSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGGVSIASWNALDVLTVELYPSDKRTTAFGFLNALCKLA 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 mKIAA1 AVLGNLIFGSLVSITKAIPILLASTVLVCGGLVGLRLPDTRTQVLM :::: :: :.:.:::: :::.::..:. :. ..:.::.:: :::. mKIAA0 AVLGISIFTSFVGITKAAPILFASAALALGSSLALKLPETRGQVLQ 710 720 730 740 >>mKIAA0735 ( 588 res) mbg06312 (588 aa) initn: 2943 init1: 1952 opt: 2631 Z-score: 2537.5 bits: 479.9 E(): 3.4e-136 Smith-Waterman score: 2631; 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