FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00045.ptfa, 612 aa vs ./tmplib.26680 library 1768405 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2714+/-0.00731; mu= 3.8687+/- 0.489 mean_var=280.8352+/-65.175, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0765 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00012 ( 454 res) mbg15561 ( 454) 327 50 6.7e-07 mKIAA4167 ( 342 res) mpj04828 ( 342) 245 40 0.0003 mKIAA0413 ( 1251 res) meh00513 (1251) 251 42 0.00039 mKIAA0696 ( 555 res) mbh00867 ( 555) 215 37 0.0039 mKIAA1824 ( 959 res) mbg09179 ( 959) 210 37 0.0078 >>mFLJ00012 ( 454 res) mbg15561 (454 aa) initn: 730 init1: 318 opt: 327 Z-score: 216.3 bits: 49.7 E(): 6.7e-07 Smith-Waterman score: 655; 30.467% identity (39.563% ungapped) in 535 aa overlap (20-538:27-454) 10 20 30 40 50 mFLJ00 GAGAAFGMSSGLRAADFPRWKRHIAEELRRRDRLQRQAFEEIILQYTKLLEKS :::::...::.::: :. : :.. :..::::. mFLJ00 LCAAARDSAAMAGPGAPCDPCAPAAVWKRHIVRQLRHRDRTQKALFLELVPAYNHLLEKA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 mFLJ00 DLHSVLTQKLQAEKHD-MPNRHEISPGHDGAWNDSQLQEMAQLRIKHQEELTELHKKRGE .: . ...::..: .: . .::: . .. . .:.. :.::.: :.: :. :: mFLJ00 ELLAKFSEKLKSEPKDAISTRHEDWREEVSGTGPDQVSSPASLRVKWQQEKKGLQLVCGE 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 mFLJ00 LAQLVIDLNNQMQQKDKEIQMNEAKISEYLQTISDLETNCLDLRTKLQDLEVANQTLKDE .: :. : : :.: :...:.. . :. mFLJ00 MAYQVV------------------KKSAALDT----------LQSQLEERQ-------DR 130 140 180 190 200 210 220 230 mFLJ00 YDALQITFTALEEKLRKTTEENQELVTRWMAEKAQEANRLNAENEKDSRRRQARLQKELA .::: . :.: ......: : . ::.: :. :: ...:: mFLJ00 LEALQACVVQLQEA---RAQQSRQLEERQAENAAQRAACAAAN--------QALVSQELK 150 160 170 180 190 240 250 260 270 mFLJ00 EAAKEPLPV-EQDDDIEVIVDETSDHTEETSPVR--AVSRAAT------------RRSVS .:::. . . : . .: : :...: .:. :.. : ::. : mFLJ00 KAAKRTVSISEIPNTLE---DGTKEETVALAPAALPEFSESETCEKWKRPFSFKKRRGHS 200 210 220 230 240 250 280 290 300 310 320 330 mFLJ00 SIPVPQDIMDTHPASGKDVRVPTTASYVFDAHDGEVNAVQFSPGSRLLATGGMDRRVKLW .:.. ... :. ....:. :. :.::: .::::: :.:.: :::::: :: ..:: mFLJ00 VGGAPEQRYQSIPVC-VSAQIPSQAQDVLDAHLSEVNAVCFGPNSSLLATGGADRLIHLW 260 270 280 290 300 310 340 350 360 370 380 390 mFLJ00 EAFGDKCEFKGSLSGSNAGITSIEFDSAGAYLLAASNDFASRIWTVDDYRLRHTLTGHSG .. : . : . .: :....:::..:: .:. .:::. . :...: : mFLJ00 NVVGGRLEANQTLEGAGGSITSVDFDPSGSQVLAATYNQAAQLWKVG------------- 320 330 340 350 400 410 420 430 440 450 mFLJ00 KVLSAKFLLDNARIVSGSHDRTLKLWDLRSKVCEEMQSLCVLMVFGFLSGIKTVFAGSSC : :: .: .:. . : : mFLJ00 ----------------------------------ETQS----------KGSRTINVLSYC 360 370 460 470 480 490 500 510 mFLJ00 NDIVCTEQCVMSGHFDKKIRFWDIRSESVVREMELLGKITALDLNPERTELLSCSRDDLL ::.:: .. ..::: :.:::::: :. .. . . :..:.: :. .. .:::::::. : mFLJ00 NDVVCGDHIIISGHNDQKIRFWDSRGPHCIQVIPVQGRVTSLHLSYDQLHLLSCSRDNTL 380 390 400 410 420 430 520 530 540 550 560 570 mFLJ00 KVIDLRTNAVKQTFSAPGFKCGSDWTRVVFSPDGSYVAAGSAEGSLYVWSVLTGKVEKVL :::::: . ..:.: : :::: mFLJ00 KVIDLRISNIRQVFRADGFKC 440 450 >>mKIAA4167 ( 342 res) mpj04828 (342 aa) initn: 193 init1: 152 opt: 245 Z-score: 168.6 bits: 40.4 E(): 0.0003 Smith-Waterman score: 356; 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