FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0608.ptfa, 738 aa vs ./tmplib.26680 library 1768279 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3384+/-0.00662; mu= 7.3677+/- 0.441 mean_var=235.9864+/-57.036, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0835 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1322 ( 645 res) mbh00387 ( 645) 2135 270 4.6e-73 mKIAA0019 ( 841 res) mpm12253 ( 841) 342 54 5.5e-08 mKIAA4104 ( 1065 res) mbg15134 (1065) 338 54 8.9e-08 mKIAA1108 ( 1266 res) mbg02140 (1266) 312 51 8.7e-07 mKIAA0603 ( 956 res) mfj60230 ( 956) 304 50 1.4e-06 mFLJ00006 ( 766 res) mbj00080 ( 766) 269 46 2.3e-05 mKIAA1055 ( 979 res) mpf00228 ( 979) 262 45 4.8e-05 mFLJ00288 ( 329 res) mic33003 ( 329) 227 40 0.00046 >>mKIAA1322 ( 645 res) mbh00387 (645 aa) initn: 2144 init1: 1289 opt: 2135 Z-score: 1404.1 bits: 270.2 E(): 4.6e-73 Smith-Waterman score: 2135; 68.043% identity (68.791% ungapped) in 460 aa overlap (281-737:187-644) 260 270 280 290 300 310 mKIAA0 LLPSAGPSAPLPAAEQGPGGTTARARRSGGFADFFARNLFPKRTKELKSVVHSAPGWKLF :. ::.:::. .. .. . . ::::: mKIAA1 LSSINETSDLHQQDCVAETEEGRKLKLLHPFSHFFTRNLLARK-QNARLDRQRDLGWKLF 160 170 180 190 200 210 320 330 340 350 360 mKIAA0 GKVPPRENLQKTSKIIQQEYEARTGRTCKA-APQSSRRKSFALEPLSTTALILEDRPPNL :::: ::. :: :: :.::: ..:: . .:... ::.. .:::::::::::::: :: mKIAA1 GKVPLRETAQKDSKKTQKEYEDKAGRPSRPPSPKQNVRKNLDFEPLSTTALILEDRPANL 220 230 240 250 260 270 370 380 390 400 410 420 mKIAA0 PAKSVEEALRHRQEYDEMVAEAKKREIKEAHKRKRIMKERFKQEESIASAMVIWINEILP ::: .::: .:::.:.::: .:::::.:::..:.. ..:: : ::::..:.. : ::::: mKIAA1 PAKPAEEAQKHRQQYEEMVLQAKKRELKEAQRRRKQLEERCKVEESIGNAVLTWNNEILP 280 290 300 310 320 330 430 440 450 460 470 480 mKIAA0 NWEVMRSTRRVRELWWQGLPPSVRGKVWSLAVGNELNITPELYEIFLSRAKERWKSFSES :::.: ...::.:::::.::::::::::::.::::::: ::..: :.::::::.:.: . mKIAA1 NWETMWCSKKVRDLWWQGIPPSVRGKVWSLAIGNELNITHELFDICLARAKERWRSLSTG 340 350 360 370 380 390 490 500 510 520 530 540 mKIAA0 SSE--NDTEGLSVADREASLELIKLDISRTFPSLYIFQKGGPYHDVLHSILGAYTCYRPD .:: :. :.:.:::::::::::::::::::.: :::.::::::.:::::::::::::: mKIAA1 GSEVENEDAGFSAADREASLELIKLDISRTFPNLCIFQQGGPYHDMLHSILGAYTCYRPD 400 410 420 430 440 450 550 560 570 580 590 600 mKIAA0 VGYVQGMSFIAAVLILNLEEADAFIAFANLLNKPCQLAFFRVDHSMMLKYFATFEVFFEE ::::::::::::::::::. :::::::.::::::::.:::::::..:: :::.::::::: mKIAA1 VGYVQGMSFIAAVLILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHGLMLTYFAAFEVFFEE 460 470 480 490 500 510 610 620 630 640 650 660 mKIAA0 NLSKLFLHFKSYNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRVWDVFCRDGEEFLFRTGLGIL :: ::: :::. ::: :::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::: mKIAA1 NLPKLFAHFKKNNLTADIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFCRDGEEFLFRTALGIL 520 530 540 550 560 570 670 680 690 700 710 720 mKIAA0 RLYEDILLQMDFIHIAQFLTKLPEDITSEKLFSCIAAIQMQNSTKKWTQVFASVAKDIKE .:.:::: .::::: :::::.::::. ....:. :...:::. .:::.::.... :: .: mKIAA1 KLFEDILTRMDFIHSAQFLTRLPEDLPADEVFAAISTVQMQSRNKKWAQVLSALQKDSRE 580 590 600 610 620 630 730 mKIAA0 GDKNTSPALKS .:. ::.:. mKIAA1 MEKG-SPSLRH 640 >>mKIAA0019 ( 841 res) mpm12253 (841 aa) initn: 357 init1: 169 opt: 342 Z-score: 235.7 bits: 54.4 E(): 5.5e-08 Smith-Waterman score: 397; 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