FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA0608.ptfa, 738 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1768279 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3384+/-0.00662; mu= 7.3677+/- 0.441
 mean_var=235.9864+/-57.036, 0's: 0 Z-trim: 13  B-trim: 0 in 0/36
 Lambda= 0.0835

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
mKIAA1322  ( 645 res)   mbh00387                   ( 645) 2135  270 4.6e-73
mKIAA0019  ( 841 res)   mpm12253                   ( 841)  342   54 5.5e-08
mKIAA4104  ( 1065 res)   mbg15134                  (1065)  338   54 8.9e-08
mKIAA1108  ( 1266 res)   mbg02140                  (1266)  312   51 8.7e-07
mKIAA0603  ( 956 res)   mfj60230                   ( 956)  304   50 1.4e-06
mFLJ00006  ( 766 res)   mbj00080                   ( 766)  269   46 2.3e-05
mKIAA1055  ( 979 res)   mpf00228                   ( 979)  262   45 4.8e-05
mFLJ00288  ( 329 res)   mic33003                   ( 329)  227   40 0.00046


>>mKIAA1322  ( 645 res)   mbh00387                        (645 aa)
 initn: 2144 init1: 1289 opt: 2135  Z-score: 1404.1  bits: 270.2 E(): 4.6e-73
Smith-Waterman score: 2135;  68.043% identity (68.791% ungapped) in 460 aa overlap (281-737:187-644)

              260       270       280       290       300       310
mKIAA0 LLPSAGPSAPLPAAEQGPGGTTARARRSGGFADFFARNLFPKRTKELKSVVHSAPGWKLF
                                     :. ::.:::. .. .. .   .   :::::
mKIAA1 LSSINETSDLHQQDCVAETEEGRKLKLLHPFSHFFTRNLLARK-QNARLDRQRDLGWKLF
        160       170       180       190        200       210     

              320       330       340        350       360         
mKIAA0 GKVPPRENLQKTSKIIQQEYEARTGRTCKA-APQSSRRKSFALEPLSTTALILEDRPPNL
       :::: ::. :: ::  :.::: ..::  .  .:... ::.. .:::::::::::::: ::
mKIAA1 GKVPLRETAQKDSKKTQKEYEDKAGRPSRPPSPKQNVRKNLDFEPLSTTALILEDRPANL
         220       230       240       250       260       270     

     370       380       390       400       410       420         
mKIAA0 PAKSVEEALRHRQEYDEMVAEAKKREIKEAHKRKRIMKERFKQEESIASAMVIWINEILP
       ::: .::: .:::.:.::: .:::::.:::..:.. ..:: : ::::..:.. : :::::
mKIAA1 PAKPAEEAQKHRQQYEEMVLQAKKRELKEAQRRRKQLEERCKVEESIGNAVLTWNNEILP
         280       290       300       310       320       330     

     430       440       450       460       470       480         
mKIAA0 NWEVMRSTRRVRELWWQGLPPSVRGKVWSLAVGNELNITPELYEIFLSRAKERWKSFSES
       :::.:  ...::.:::::.::::::::::::.::::::: ::..: :.::::::.:.: .
mKIAA1 NWETMWCSKKVRDLWWQGIPPSVRGKVWSLAIGNELNITHELFDICLARAKERWRSLSTG
         340       350       360       370       380       390     

     490         500       510       520       530       540       
mKIAA0 SSE--NDTEGLSVADREASLELIKLDISRTFPSLYIFQKGGPYHDVLHSILGAYTCYRPD
       .::  :.  :.:.:::::::::::::::::::.: :::.::::::.::::::::::::::
mKIAA1 GSEVENEDAGFSAADREASLELIKLDISRTFPNLCIFQQGGPYHDMLHSILGAYTCYRPD
         400       410       420       430       440       450     

       550       560       570       580       590       600       
mKIAA0 VGYVQGMSFIAAVLILNLEEADAFIAFANLLNKPCQLAFFRVDHSMMLKYFATFEVFFEE
       ::::::::::::::::::. :::::::.::::::::.:::::::..:: :::.:::::::
mKIAA1 VGYVQGMSFIAAVLILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHGLMLTYFAAFEVFFEE
         460       470       480       490       500       510     

       610       620       630       640       650       660       
mKIAA0 NLSKLFLHFKSYNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRVWDVFCRDGEEFLFRTGLGIL
       :: ::: :::. ::: :::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.::::
mKIAA1 NLPKLFAHFKKNNLTADIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFCRDGEEFLFRTALGIL
         520       530       540       550       560       570     

       670       680       690       700       710       720       
mKIAA0 RLYEDILLQMDFIHIAQFLTKLPEDITSEKLFSCIAAIQMQNSTKKWTQVFASVAKDIKE
       .:.:::: .::::: :::::.::::. ....:. :...:::. .:::.::.... :: .:
mKIAA1 KLFEDILTRMDFIHSAQFLTRLPEDLPADEVFAAISTVQMQSRNKKWAQVLSALQKDSRE
         580       590       600       610       620       630     

       730        
mKIAA0 GDKNTSPALKS
        .:. ::.:. 
mKIAA1 MEKG-SPSLRH
          640     

>>mKIAA0019  ( 841 res)   mpm12253                        (841 aa)
 initn: 357 init1: 169 opt: 342  Z-score: 235.7  bits: 54.4 E(): 5.5e-08
Smith-Waterman score: 397;  27.848% identity (30.450% ungapped) in 316 aa overlap (423-734:99-391)

            400       410       420       430       440       450  
mKIAA0 KREIKEAHKRKRIMKERFKQEESIASAMVIWINEILPNWEVMRSTRRVRELWWQGLPPSV
                                     :. ..: .:: ...:.. ..  ..:.: ..
mKIAA0 RFGFLHEEELPYHNAAADRQKQLEIERTSKWL-KMLKKWERYKNTEKFHRRIYKGIPLQL
       70        80        90       100        110       120       

            460       470       480       490       500       510  
mKIAA0 RGKVWSLAVGNELNITPELYEIFLSRAKERWKSFSESSSENDTEGLSVADREASLELIKL
       ::.::.:           : ::   . ::. ...  :. .. ..: :   :.     : :
mKIAA0 RGEVWAL-----------LLEI--PKMKEETRDLY-SKLKHRARGCSPDIRQ-----IDL
       130                    140        150       160             

            520        530       540       550       560       570 
mKIAA0 DISRTFPSLYIFQ-KGGPYHDVLHSILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAVLILNLEEADAF
       :..::: .  .:. . :  .. :  .:.::. :  .::: :::: :.:.:.. ..: :::
mKIAA0 DVNRTFRDHIMFRDRYGVKQQSLFHVLAAYSIYNTEVGYCQGMSQITALLLMYMNEEDAF
      170       180       190       200       210       220        

             580         590       600       610       620         
mKIAA0 IAFANLLNKPCQL--AFFRVDHSMMLKYFATFEVFFEENLSKLFLHFKSYNLTPDIYLID
        :...:.. : .   .::      .:..    : .... ::::  :. : ..  ..: . 
mKIAA0 WALVKLFSGPKHAMHGFFVQGFPKLLRFQEHHEKILNKFLSKLKQHLDSQEIYTSFYTMK
      230       240       250       260       270       280        

     630       640       650       660       670       680         
mKIAA0 WIFTLYSKSLPLDLACRVWDVFCRDGEEFLFRTGLGILRLYEDILLQMDFIHIAQFLTK-
       :.:  .    :. :  :.::..  .::. :   .  ::.:..  :..... ....:: . 
mKIAA0 WFFQCFLDRTPFRLNLRIWDIYIFEGERVLTAMSYTILKLHKKHLMKLSMEELVEFLQET
      290       300       310       320       330       340        

      690       700       710       720       730                  
mKIAA0 LPEDITSEKLFSCIAAIQMQNSTKKWTQVFASVAKDIKEGDKNTSPALKS          
       : .:.  :  :   .  :.: :  .  ..  .. .  :: .   .:              
mKIAA0 LAKDFFFEDDF---VIEQLQVSMAELKRAKLDLPEPGKEDEYPKKPLGQLPPESACVNHL
      350          360       370       380       390       400     

mKIAA0 SNGQRSVGRPSPKTSSRREDGSPRKNHEHSPVHHSRNGTPERAGQSRRKSVDEGSKNLKH
         410       420       430       440       450       460     

>>mKIAA4104  ( 1065 res)   mbg15134                       (1065 aa)
 initn: 379 init1: 285 opt: 338  Z-score: 231.9  bits: 54.1 E(): 8.9e-08
Smith-Waterman score: 380;  26.646% identity (29.930% ungapped) in 319 aa overlap (413-721:527-820)

            390       400       410       420       430         440
mKIAA0 EYDEMVAEAKKREIKEAHKRKRIMKERFKQEESIASAMVIWINEILPNWEVMRSTR--RV
                                     .:   . .  : .:.: .:..  :.:  ..
mKIAA4 SQSSMIPSPPEDDEEEDNDEPLLSGFGDVSKECAEKILETW-GELLSKWHLNLSVRPKQL
        500       510       520       530        540       550     

              450       460       470       480       490       500
mKIAA0 RELWWQGLPPSVRGKVWSLAVGNELNITPELYEIFLSRAKERWKSFSESSSENDTEGLSV
         :  .:.: ..::.::.: .: . :          ..  :... .  . : .:.     
mKIAA4 SSLVRSGVPEALRGEVWQLLAGCHNN----------DHLVEKYRILITKESPQDSA----
         560       570       580                 590       600     

              510       520        530       540       550         
mKIAA0 ADREASLELIKLDISRTFPSLYIFQK-GGPYHDVLHSILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAA
                :  ::.::::.   :.  ::  .: :..:  ::. :  ..:: ::.::.::
mKIAA4 ---------ITRDINRTFPAHDYFKDTGGDGQDSLYKICKAYSVYDEEIGYCQGQSFLAA
                      610       620       630       640       650  

     560       570       580       590       600       610         
mKIAA0 VLILNLEEADAFIAFANLLNKPCQLAFFRVDHSMMLKYFATFEVFFEENLSKLFLHFKSY
       ::.:.. : .:: ......       .:. .   .   :  .: ...: .  :. :: . 
mKIAA4 VLLLHMPEEQAFSVLVKIMFDYGLRELFKQNFEDLHCKFYQLERLMQEYIPDLYNHFLDI
            660       670       680       690       700       710  

     620       630       640       650       660       670         
mKIAA0 NLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRVWDVFCRDGEEFLFRTGLGILRLYEDILLQMDF
       .:   .:  .:..::.. ..:: .. .. :..  .:   .: ..::.:.  .: ::  ::
mKIAA4 SLEAHMYASQWFLTLFTAKFPLYMVFHIIDLLLCEGISVIFNVALGLLKTSKDDLLLTDF
            720       730       740       750       760       770  

     680        690             700       710       720       730  
mKIAA0 IHIAQFL-TKLPEDITSEK------LFSCIAAIQMQNSTKKWTQVFASVAKDIKEGDKNT
           .:. ..::.   ::.       ..: . :. :.. ::. . . ..           
mKIAA4 EGALKFFRVQLPKRYRSEENAKRLMELACNTKIS-QKKLKKFEKEYHTMREQQAQQEDPI
            780       790       800        810       820       830 

                                                                   
mKIAA0 SPALKS                                                      
                                                                   
mKIAA4 ERFERENRRLQEANMRLEQENDDLAHELVTSKIALRKDLDNAEEKADALNKELLMTKQKL
             840       850       860       870       880       890 

>>mKIAA1108  ( 1266 res)   mbg02140                       (1266 aa)
 initn: 293 init1: 250 opt: 312  Z-score: 214.2  bits: 51.0 E(): 8.7e-07
Smith-Waterman score: 340;  22.540% identity (25.150% ungapped) in 559 aa overlap (208-726:613-1153)

       180       190       200       210       220       230       
mKIAA0 VDGAGGLDDWAAPLEDPLRSCCLAAGDTDDPDPAAATPAGRAVESAEPSLGLPDARFGSR
                                     :.:: ..: : . ..     ..       :
mKIAA1 AEESALLSPQQAFRRRANTLSHFPVECPAPPEPAQSSP-GVSQRKLMRYHSVSTETPHER
            590       600       610       620        630       640 

       240        250       260       270       280       290      
mKIAA0 NTFEVSRRQSAG-DLLPSAGPSAPLPAAEQGPGGTTARARRSGGFADFFARNLFPKRTK-
       :. ..   .: :    ::: :   :  . ..:.      . :.:     . :  :: .. 
mKIAA1 NVDHLPGGESQGCPGQPSAPPPPRLNPSASSPNFFKYLKHNSSGEQ---SGNAVPKSVSY
             650       660       670       680          690        

           300       310         320       330         340         
mKIAA0 --ELKSVVHSAPGWKLFGK--VPPRENLQKTSKIIQQEYEARTGRT--CKAAPQSSRRKS
          :.. .::. .   : :  .:  ::     :  ....:.....     ..: ..::.:
mKIAA1 RNALRKKLHSSSSVPNFLKFLAPVDENNTCDFKNTNRDFESKANHLGDTDGTPVKTRRHS
      700       710       720       730       740       750        

     350       360                  370       380       390        
mKIAA0 FALEPLSTTALILE--DRPP---------NLPAKSVEEALRHRQEYDEMVAEAKK--REI
       .  . .  .:   .  : :          .:: .:  : . .   .  .  : .:  ::.
mKIAA1 WRQQIFLRVATPQKACDSPSRYEDYSELGELPPRSPLEPVCEDGPFGPVQEEKRKTSREL
      760       770       780       790       800       810        

        400          410        420         430       440       450
mKIAA0 KEAHKR---KRIMKERFKQE-ESIASAMVIWINE--ILPNWEVMRSTRRVRELWWQGLPP
       .:  :.   ..:.  :...: ... ..    .:.   :   :.    ..:  .: . :  
mKIAA1 RELWKKAILQQILLLRMEKENQKLQASENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLST
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mKIAA0 SVRGKV-WSL-----AVGNEL--NITPELYEIFLSRAKERWKSFSESSSENDTEGLSVAD
         :.:. ...     :::. .  .   :... ::..  .  . :  ... .:.    .  
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mKIAA0 REASLE-LIKLDISRTFPSLYIFQ-KGGPYHDVLHSILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAV
       . .: .  : .:..::::.   :. . :  .  :..:: ::.    .::: ::.::.:..
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mKIAA0 LILNLEEADAFIAFANLLNKPCQLAFFRVDHSMMLKYFATFEVFFEENLSKLFLHFKSYN
       :.:.. : .::  .  :.        .: :  ..   .  .  ....    :. :.. ..
mKIAA1 LLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEEHE
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       . :..:   :..:......:: .. ::.:..  .: : .:...:..:  .. ..:: . .
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       . :..:. . ::.          .. .::.   :  .:::  ..::...           
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mKIAA0 S                                                           
                                                                   
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 initn: 271 init1: 191 opt: 304  Z-score: 210.3  bits: 49.9 E(): 1.4e-06
Smith-Waterman score: 340;  23.310% identity (26.316% ungapped) in 429 aa overlap (307-713:428-829)

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                                     :  ..: .:    :  :. . .::. ..  
mKIAA0 DGEGRKRTSSTCSNESLNAGGTPVTPRRVSWRQRIFLRVASPVN--KSPSAMQQQKDG-L
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        :: .  : :    ..  :::      .  .  .:..  .   ::. .   : :.   . 
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mKIAA0 AEAKKREIKEAHKRKRIMKERFKQE-ESIASA----MVIWINEILPNWEVMR-STRRVRE
        : ......:: .: ...... : . : ...     .. : ...:     .: . . .. 
mKIAA0 MEKENQKLEEA-RRDELQSRKVKLDYEEVGTCQKEILIAWDKKLLNCRTKIRCDMEDIHT
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          .:.: : ::..:. ::.  .: .  :. ..   .  ::  :...             
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       :...: :    .:..::::.   :. . :  .  : ..: ::.    .::: ::.::.:.
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mKIAA0 VLILNLEEADAFIAFANLLNKPCQLAF---FRVDH-SMMLKYFATFEVFFEENLSKLFLH
       ::.:.. : .::  .  :.    .:.:   .: :  :......   ... . .  .:. :
mKIAA0 VLLLHMSEEQAFEMLKFLMY---DLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYH-RELYNH
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mKIAA0 FKSYNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRVWDVFCRDGEEFLFRTGLGILRLYEDILL
       ..  ...:..:   :..::.....:: .. ::.:..  .: : .:...:..:   : ...
mKIAA0 LEENEISPSLYAAPWFLTLFASQFPLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQEALIM
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mKIAA0 QMD-FIHIAQFLTKLPEDITSEKLFSCIAAIQMQNSTKKWTQVFASVAKDIKEGDKNTSP
       . . : .:..:: .   :... .. . :. .  .. .:.                     
mKIAA0 ECENFENIVEFLKSTLPDMNTTEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELLESSYA
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mKIAA0 ALKS                                                        
                                                                   
mKIAA0 CEDNESLEKLERANNQLKRQNMDLLEKLQVAHAKIQALESNLETLLTRETKMKALIRTLE
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 initn: 198 init1: 198 opt: 269  Z-score: 188.6  bits: 45.6 E(): 2.3e-05
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mFLJ00 CSQMTGSPLVEDPPQRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWDKIAVSLPRSEKLRSLVLA-GIPH
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mKIAA0 NITPELYEIFLSRAKERWKSFSESSSENDTEGLSVADREASLELIKLDISRTFPSLYIFQ
       .. :.:. . :: : .. :. :: : ..  .. :  :.  . . :. :. ::.::   : 
mFLJ00 GMRPQLW-MRLSGALQKKKN-SELSYREIIKN-SSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSNACFA
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mKIAA0 K----GGPYHDVLHSILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAVLILNLEEADAFIAFANLLNKP
       .    : :    :. .: : .   :..:: :: ...:: :.: ::: :::  .  ...  
mFLJ00 NVNSIGVPR---LRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMCAIIEDL
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mKIAA0 CQLAFFRVDHSMMLKYFATFEVFFEENLSKLFLHFKSYNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPL
          ..: .    .     ... .. . : .:   .. ...  ..  . :..: ... . .
mFLJ00 LPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVVHI
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        :  :.::.:  .:   ::.: ::.::: :. :.: .    : . :. .: .. . .:. 
mFLJ00 RLLLRIWDLFFYEGSLVLFQTTLGMLRLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPAQMDDAELLL
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mKIAA0 CIAAIQMQNSTKKWTQVFASVAKDIKEGDKNTSPALKS                      
                                                                   
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>>mKIAA1055  ( 979 res)   mpf00228                        (979 aa)
 initn: 274 init1: 211 opt: 262  Z-score: 182.9  bits: 44.9 E(): 4.8e-05
Smith-Waterman score: 292;  23.729% identity (27.119% ungapped) in 472 aa overlap (253-700:483-919)

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mKIAA1 NERLGMLMETIQAKDEVIIKLSACEGSVSSPTLGPSSPLAIPASKD----QLELDRLKDS
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mKIAA0 FADFFARNLF-PKRTKELKSVVHSAPGWK--LFGKVPPREN--LQKTSKIIQQEYEARTG
       .  . ..: :  :.  ::... ..:   .  :..:    :    :  :: .    : .: 
mKIAA1 LQGYKSQNKFLNKEILELSALRRNAERRERDLMAKYSSLEAKLCQVESKYLILLQEMKTP
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        .: .  :.  :  .:   :   :: .:..    : .. :.  :   .:.:    . : .
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mKIAA0 AKKREIKEAHKRKRIMKERFKQEESIASAMVIWINEILP--NWEVMRSTRRVRELWWQGL
         ..:   :. :   .:  .  ... .:. : : : .    : : :  . ....:   :.
mKIAA1 DDEEEKLVAKVRALDLKTLYLTDNQEVSTGVKWENYFASTMNRE-MACSPELKNLIRAGI
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mKIAA0 PPSVRGKVWSLAVGNEL-----NITPELYEIFLSRAKERWKSFSESSSENDTEGLSVADR
       :   :.:::.  :  .      .. :. .. .:..: :. .  :..              
mKIAA1 PHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDSMEPDYFQTLLQKALEKQNPASKQ--------------
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mKIAA0 EASLELIKLDISRTFPSLYIFQKGGPYH-DVLHSILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAVLI
             :.::. ::.:.   ...      . :.:.: :..   ::.:: ::.. ..:: .
mKIAA1 ------IELDLLRTLPNNKHYSSPTSEGIQKLRSVLLAFSWRNPDIGYCQGLNRLVAVAL
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mKIAA0 LNLEEADAFIAFANLLN--KPCQLAFFRVDHSMMLKYFATFEVFFEENLSKLFLHFKSYN
       : :.. :::  ......   : .     .  :.. .   .:. .. :.: .:  ::..:.
mKIAA1 LYLDQEDAFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQR--VFRDLLSEKLPRLHTHFEQYK
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mKIAA0 LTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRVWDVFCRDGEEFLFRTGLGILRLYEDILLQM-DF
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