FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
../query/mKIAA4125.ptfa, 870 aa
vs ./tmplib.26680 library
1768147 residues in 2168 sequences
Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9426+/-0.00729; mu= 10.7608+/- 0.482
mean_var=349.5079+/-81.225, 0's: 0 Z-trim: 18 B-trim: 0 in 0/36
Lambda= 0.0686
FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16
The best scores are: opt bits E(2168)
mKIAA0699 ( 869 res) mbg04602 ( 869) 1340 147 7.6e-36
mKIAA0216 ( 2048 res) mib13036 (2048) 259 41 0.0018
mFLJ00150 ( 1174 res) mfj11357 (1174) 244 39 0.004
mKIAA1561 ( 1106 res) mej02373 (1106) 237 38 0.0062
mKIAA4151 ( 1916 res) mpf01376 (1916) 239 39 0.0071
>>mKIAA0699 ( 869 res) mbg04602 (869 aa)
initn: 3108 init1: 1138 opt: 1340 Z-score: 735.9 bits: 147.3 E(): 7.6e-36
Smith-Waterman score: 3167; 64.044% identity (67.217% ungapped) in 826 aa overlap (58-868:41-842)
30 40 50 60 70 80
mKIAA4 ICFSFSLLLCVYLRHPAMAAEEALKTVDQYKTEIERLTKELTETTHEKIQAAEYGLVVLE
..:..::..::.:::.::::::::::.:::
mKIAA0 SRPRRAATMSAPSEEEEYARLVMEAQPEWLRAEVKRLSHELAETTREKIQAAEYGLAVLE
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
mKIAA4 EKLTLKQQYDELEAEYDGLKQELEQLREAFGQSFSIHRKVAEDGETREETLLQESASKEA
:: :: :..:::..:.....:.:::.:::::. . :.::: :::.:::.:.:::::::
mKIAA0 EKHQLKLQFEELEVDYEAIRSEMEQLKEAFGQAHTNHKKVAADGESREESLIQESASKEQ
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
mKIAA4 YYLNKILEMQNELKQSRAVVTNVQAENERLSAVVQELKENNEMVELQRIRMKDEIREYKF
::. :.::.:.:::: : :.::.:.:::::..:.::::: :. ::.:: :..:.:.::::
mKIAA0 YYVRKVLELQTELKQLRNVLTNTQSENERLTSVAQELKEINQNVEIQRGRLRDDIKEYKF
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
mKIAA4 REARLLQDYTELEEENITLQKLVSTLKQNQVEYEGLKHEIKRFEEETVLLNSQLEDAIRL
:::::::::.:::::::.::: ::.:.:::::.:::::::::.:::: :::::::::::
mKIAA0 REARLLQDYSELEEENISLQKQVSVLRQNQVEFEGLKHEIKRLEEETEYLNSQLEDAIRL
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
mKIAA4 KEIAEHQLEEALETLKNEREQKNNLRKELSQYINLSDS----HISISVDGLKFAEDG--S
:::.:.::::::::::.:::::::::::::.:....:: :...:.:::::..: .
mKIAA0 KEISERQLEEALETLKTEREQKNNLRKELSHYMSINDSFYTSHLQVSLDGLKFSDDTVTA
260 270 280 290 300 310
330 340 350 360 370
mKIAA4 EPNNDDK--MNGHIHGPLGKLNGDYRTPTTRKGESLHP-----VSDLFSELNISEIQKLK
::::: . .:: :. : : . : .: : :: ..: : ::::.:::.::::::::
mKIAA0 EPNNDAEALVNGFEHSGLVKSSLDNKTSTPRK-DGLAPPSPSLVSDLLSELHISEIQKLK
320 330 340 350 360
380 390 400 410 420 430
mKIAA4 QQLIQVEREKAILLANLQESQTQLEHTKGALTEQHERVHRLTEHVNAMRGLQNSKEIKAE
:::.:.::::. :::.::..: :::...:.:.::::.:.::::...:.: :: .:: ..
mKIAA0 QQLVQMEREKVGLLATLQDTQKQLEQARGTLSEQHEKVNRLTENLSALRRLQAGKERQTS
370 380 390 400 410 420
440 450 460 470 480 490
mKIAA4 LDCEKGRNSAEEAHDYEVDINGLEILECKYRVAVTEVIDLKAEIKALKEKYNKSVENYTE
:: :: :.: :.. ::::::: ::: :::.:::.:. .:. ..:::. .. ...:
mKIAA0 LDNEKDRDSHEDGDYYEVDINGPEILACKYHVAVAEAGELREQLKALRSTHEAREAQHAE
430 440 450 460 470 480
500 510 520 530 540 550
mKIAA4 EKTKYESKIQMYDEQVTNLEKTSKESGEKMAHMEKELQKMTGIANENHNTLNTAQDELVT
:: .::.. : :... :::.:... : .::.::::.:.. .:.:....::.:::::::
mKIAA0 EKGRYEAEGQALTEKISLLEKASHQDRELLAHLEKELKKVSDVAGETQGSLNVAQDELVT
490 500 510 520 530 540
560 570 580 590 600 610
mKIAA4 FSEELAQLYHHVCLCNNETPNRVMLDYYRQSRVTRSGSLKGPDDPRGLLSPRLSRRGVSS
::::::.::::::.:::::::::::::::... :. : .:.: :: :
mKIAA0 FSEELANLYHHVCMCNNETPNRVMLDYYREGQ----GK-AGRTSPEG--------RGRRS
550 560 570 580 590
620 630 640 650 660 670
mKIAA4 PVESRTSSEPVSKENTETSKEPSPTKTPTISPVITAPPSSPVLDTSDIRKEPMNIYNLNA
:: : . ::... . : . :: . : ::. :: :.:::::::: :
mKIAA0 PVLL-----PKGLLATEVGRADGGTGDNSPSPSSSLP--SPL---SDPRREPMNIYNLIA
600 610 620 630 640
680 690 700 710 720 730
mKIAA4 IIRDQIKHLQKAVDRSLQLSRQRAAARELAPMIDKDKEALMEEILKLKSLLSTKREQIAT
:::::::::: ::::. .::::: :..::.: .:::::::::::::::::::::::::.:
mKIAA0 IIRDQIKHLQAAVDRTTELSRQRIASQELGPAVDKDKEALMEEILKLKSLLSTKREQITT
650 660 670 680 690 700
740 750 760 770 780 790
mKIAA4 LRAVLKANKQTAEVALANLKNKYENEKAMVTETMTKLRNELKALKEDAATFSSLRAMFAT
::.:::::::::::::::::.::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
mKIAA0 LRTVLKANKQTAEVALANLKSKYENEKAMVTETMMKLRNELKALKEDAATFSSLRAMFAT
710 720 730 740 750 760
800 810 820 830 840 850
mKIAA4 RCDEYVTQLDEMQRQLAAAEDEKKTLNTLLRMAIQQKLALTQRLEDLEFDHEQSRRSKGK
:::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::: ::.::::.::...:
mKIAA0 RCDEYITQLDEMQRQLAAAEDEKKTLNSLLRMAIQQKLALTQRLELLELDHEQTRRGRSK
770 780 790 800 810 820
860 870
mKIAA4 LG-KSKIGSPKSGH-CPQ
. :.: .::. .: :
mKIAA0 AASKAKPASPSVSHTCACASERAEGAGLANQVFCSEKHSIYCD
830 840 850 860
>>mKIAA0216 ( 2048 res) mib13036 (2048 aa)
initn: 138 init1: 85 opt: 259 Z-score: 154.5 bits: 40.9 E(): 0.0018
Smith-Waterman score: 264; 21.007% identity (24.569% ungapped) in 814 aa overlap (63-862:1259-1968)
40 50 60 70 80 90
mKIAA4 SLLLCVYLRHPAMAAEEALKTVDQYKTEIERLTKELTETTHEKIQAAEYGLVVLE-EKLT
.:..: .. :.:: . : .: :.
mKIAA0 CVQKNIKKNKGVKDWPWWKLFTTVRPLIQVQLSEEQIRNKDEEIQQLRSKLEKVEKERNE
1230 1240 1250 1260 1270 1280
100 110 120 130 140 150
mKIAA4 LKQQYDELEAEYDGLKQELEQLREAFGQSFSIHRKVAEDGETREETLLQESASKEAYYLN
:. . :.::.. . : .:: . :.. :.: : :.:: :. : :. ::
mKIAA0 LRLSSDRLETRISELTSELTDERNT-GESASQ----LLDAETAER-LRTEKEMKELQTQY
1290 1300 1310 1320 1330 1340
160 170 180 190 200 210
mKIAA4 KILEMQNELKQSRAVVTNVQAENERLSAVVQELKENNEMVELQRIRMKDEIREYKFREAR
:. : :. . ... .:. : . . :. ... : :.... .:: : . :
mKIAA0 DALKKQMEVMEMEVM----EARLIRAAEINGEVDDDDAGGE-WRLKYERAVREVDFTKKR
1350 1360 1370 1380 1390
220 230 240 250 260
mKIAA4 LLQDYTE-LEEENITLQKLVSTLKQNQVEYEGLKHEIKRFEEETVLLNSQLEDA---IRL
: :. . .: :. . ..: : . :.. . .. ....... :...:.:. ..
mKIAA0 LQQELEDKMEVEQQSRRQLERRLGDLQADSDESQRALQQLKKKCQRLTAELQDTKLHLEG
1400 1410 1420 1430 1440 1450
270 280 290 300 310 320
mKIAA4 KEIAEHQLEEALETLKNEREQKNNLRKELSQYINLSDSHISISVDGLKFAEDGSEPNNDD
... .:.::. . . .: : . : .: .:. ... : : .:: : .. .
mKIAA0 QQVRNHELEKKQRRFDSELSQAH----EETQREKLQREKLQREKDML-LAEAFSLKQQME
1460 1470 1480 1490 1500 1510
330 340 350 360 370 380
mKIAA4 KMNGHIHGPLGKLNGDYRTPTTRKGESLHPVSDLFSELNISEIQKLKQQLIQVEREKAIL
. . : : :.: ::. .:.: ...: . :
mKIAA0 EKDLDIAG------------FTQKVVSLE-----------AELQDISSQESKDE------
1520 1530 1540
390 400 410 420 430 440
mKIAA4 LANLQESQTQLEHTKGALTEQHERVHRLTEHVNAMRGLQNSKEIKAELDCEKGRNSAEEA
:.: . . ::. .. . .:.:. : :...... :...: .. :.. :. :..
mKIAA0 -ASLAKVKKQLRDLEAKVKDQEEE---LDEQAGSIQMLEQAK-LRLEMEMERMRQT----
1550 1560 1570 1580 1590
450 460 470 480 490 500
mKIAA4 HDYEVDINGLEILE----CKYRVAVTEVIDLKAEIKALKEKYNKSVENYTEEKTKYESKI
:. :.. :. : :. .. :: :.:.:. . .. .:: . :::.
mKIAA0 HSKEMESRDEEVEEARQSCQKKLKQMEV--------QLEEEYEDK-QKALREKRELESKL
1600 1610 1620 1630 1640
510 520 530 540 550 560
mKIAA4 QMYDEQVTNLEKTSKESGEKMAHMEKELQKMTGIANENHNTLNTAQDELVTFSEELAQLY
. ..:: .... :. ...:.:.. .. . . :. ... . ..:.:::
mKIAA0 STLSDQV------NQRDFESEKRLRKDLKRTKALLADAQIMLDHLKNNAPS-KREIAQLK
1650 1660 1670 1680 1690
570 580 590 600 610
mKIAA4 HHVCLCNNETPNRVMLDYYRQSRVTRSGSLKGPDD---PRGLLSPRLSR-RGVSSPVESR
.. : ..: . . . .: :: . : .::: . .. ...:
mKIAA0 NQ--LEESEFTCAAAVKARKAMEVEMEDLHLQIDDIAKAKTALEEQLSRLQREKNEIQNR
1700 1710 1720 1730 1740 1750
620 630 640 650 660 670
mKIAA4 TSSEPVSKENTETSKEPSPTKTPTISPVITAPPSSPVLDTSDIRKEPMNIYNLNAIIRDQ
: ... .: :. . . . . . . .. :. .:. .. .:.:. ..:
mKIAA0 L--EEDQEDMNELMKKHKAAVAQASRDMAQMNDLQAQIEESNKEKQELQ-EKLQAL-QSQ
1760 1770 1780 1790 1800 1810
680 690 700 710 720 730
mKIAA4 IKHL-QKAVDRSLQLSRQRAAARELAPMIDKDKEALMEEILKLKSLLSTKREQIATLRAV
.. : :. ::.:: .:::.: ::: .. .: .. .:..: : .: . :
mKIAA0 VEFLEQSMVDKSL-VSRQEAKIRELETRLEFEKT----QVKRLENLASRLKETMEKL---
1820 1830 1840 1850 1860
740 750 760 770 780 790
mKIAA4 LKANKQTAEVALANLKNKYENEKAMVTETMTKLRNELKALKEDAATFSSLRAMFATRCDE
... . : :. ..: .:.. :. .:. ::. . .. .: :.:
mKIAA0 ---TEERDQRAAAENREKEQNKR---------LQRQLRDTKEEMSELARKEAE-ASR---
1870 1880 1890 1900
800 810 820 830 840 850
mKIAA4 YVTQLDEMQRQLAAAEDEKKTLNTLLRMAIQQKLALTQRLEDLEFDHEQSRRSKGKLGKS
. :.. .: . : ...:.. :..:... : .:: :.. .... .. : :
mKIAA0 ---KKHELEMDLESLEAANQSLQADLKLAFKRIGDLQAAIED-EMESDENEDLINSEGDS
1910 1920 1930 1940 1950 1960
860 870
mKIAA4 KIGSPKSGHCPQ
. :
mKIAA0 DVDSELEDRVDGVKSWLSKNKGPSKAPSDDGSLKSSSPTSHWKPLAPDPSDDEHDPVDSI
1970 1980 1990 2000 2010 2020
>>mFLJ00150 ( 1174 res) mfj11357 (1174 aa)
initn: 141 init1: 77 opt: 244 Z-score: 148.5 bits: 39.0 E(): 0.004
Smith-Waterman score: 293; 22.975% identity (25.199% ungapped) in 827 aa overlap (45-844:248-1028)
20 30 40 50 60 70
mKIAA4 HQALFFSIFIFIPICFSFSLLLCVYLRHPAMAAEEALKTVDQYKTEIERLTKELTETTHE
. :..:: .. ::: : : : . :
mFLJ00 LEVEELHRTIERHQQRKDFIDGHVENLMTELEIEKSLKHHEDIVDEIECLEKTLLKRRSE
220 230 240 250 260 270
80 90 100 110 120 130
mKIAA4 KIQAAEYGLVVLEEKLTLKQQYDELEAE-YDGLKQELEQLREAFGQSFSIHRKVAEDGET
.. :. :. :..:. .. . .: . :..: : . . ...: .
mFLJ00 -LREADRLLAEAENELACTKEKTKSAVEKFTDAKRNLLQTESDAEALEKRAQETALNLVK
280 290 300 310 320 330
140 150 160 170 180 190
mKIAA4 REETLLQESASKEAYYLNKILEMQNELKQSRAVVTNVQAENERLSAVVQELKENNEMVEL
:. : .:. : .:: .... ::. ::. .:. . :. ..: : :. :
mFLJ00 AEQQLRLLQADAEDLEQHKI-KQEEILKEINKVVAAKDADFQCLNEKKEKLTE--ELQSL
340 350 360 370 380 390
200 210 220 230 240 250
mKIAA4 QR-IRMKDEIREYKFREARLLQDYTELEEENITLQKLVSTLKQNQVEYEGLKHEIKRFEE
:: :. .. ...... : .. : :. . :. : : . ..: : : :. . .:
mFLJ00 QRDIKAAQHSEDHHLQVLR--ESETLLQAKRAELETLKSQVTSQQQELAVLDSELGHRRE
400 410 420 430 440 450
260 270 280 290 300 310
mKIAA4 ETVLLNSQLEDA-IRLKEIAEHQLEEALETLKNEREQKNNLRKELSQYINLSDSHISISV
: .::...: .: :.: :. : .. :: :. : .::: . . ::: .
mFLJ00 ELLLLQDSLAQAKADLQEALTLGETEVAEKCSHIREVKS-LLEELSFQKGELNVHISEKK
460 470 480 490 500 510
320 330 340 350 360 370
mKIAA4 DGLKFAEDGSEPNNDDKMNGHIHGPLGKLNGDYRTPTTRKGESLHPVSDLFSELNISEIQ
: . .. : : . ... : .: .:. :. :.:.. .:. ::.:
mFLJ00 TQLALIQQEME-----KEEKNLQVVLQQL--------SRHKTELKNVADIL-QLETSELQ
520 530 540 550
380 390 400 410 420
mKIAA4 KLKQQLIQ--VEREKAILLANLQESQTQLEHTKGALTEQHERVHRLTEHVNAMRGLQNSK
:: : : :: ::: . .. : . .::. . : .:.....: . .. : ....
mFLJ00 GLKLQHDQKVVELEKAQV--DVLEEKLELENLQQATQQQRRELERQRQLLE--RDRRETE
560 570 580 590 600 610
430 440 450 460 470 480
mKIAA4 EIKAELDCEKGRNSAEEAHDYEVDINGL-EILECK----YRV-AVTEVIDLKAEIKALKE
...:: . .. .: . :..: : : : :: :.:: . : : . :
mFLJ00 RVRAE--SQALQSCVECLSKEKEDLQGQCESWEKKSSHAQRVLAATEESN-KMEQSNLG-
620 630 640 650 660
490 500 510 520 530
mKIAA4 KYNKSVENYTEEKTKY-ESKIQMYDEQVTNLEKTSKESGEKMAHMEKEL---QKMTGIAN
: . ::.. .: . ..:. ...: :..... . . : . ...:: : .:.
mFLJ00 KLELSVRKLRQELEQLSQDKLALHSE-VAEVQQQLQGKQEAINSLQEELDSTQDHLDLAK
670 680 690 700 710 720
540 550 560 570 580 590
mKIAA4 EN--HNT--LNTAQDELVTFSEELAQLYHHVCLCNNETPNRVMLDYYRQSRVTRSGSLKG
.. :.: : .: . ..:.... . .. :..:: .. . :... : ..:.
mFLJ00 QDLIHTTKCQNELLNEQTQLQEDISKWMARLESCQKETETKEQQVQQLQDEI-RESKLRL
730 740 750 760 770 780
600 610 620 630 640 650
mKIAA4 PDDPRGLLSPRLSRRGVSSPVESRTSSEPVSKENTETSKEPSPTKTPTISPVITAPPSSP
: . .. .:... . .... . ... . :: . :. . . . .
mFLJ00 --DQQEMMFQKLQKEREREEQKFEAGKVTLEQQQRQLEKELTDQKSRLKQLLTDVSAAEG
790 800 810 820 830 840
660 670 680 690 700 710
mKIAA4 VLDTSDIRKEPMNIYNLNAIIRDQIKHLQKAVDRSLQLSRQRAAARELAPMIDKDKEALM
: : ...: : .:. .. .: : :. .: :: : . :: . .:. . .
mFLJ00 RLGT--LQEEERRIEGLERML-SQAK--QQLSEREQQLM---AKSGELLAL-QKEADDMR
850 860 870 880 890
720 730 740 750 760
mKIAA4 EEILKLKSLLSTKRE----QIATLRAVLKANKQTAEVALANLKNKYEN---EKAMVTETM
.. :.. . :.:. :.: :. .:: ... : : :..: :: .: :.: .
mFLJ00 ADFSLLRNQFLTERKKAEKQVAGLKEALKIQRSQLEKNL--LEQKQENSCMQKEMATIEL
900 910 920 930 940 950
770 780 790 800 810 820
mKIAA4 TKLRNELKALKEDAATFSSLRAMFATRCDEYVTQLDEMQRQLAAAEDEKKTLNTLLRMAI
. :. .: .. .:... . . ..: : .::. .. : .::.. .. :
mFLJ00 VAQDNHERA-RRLMKELSQMQQEYLELKKQVANQKDLERRQMEVS-DAMRTLKSEVKDEI
960 970 980 990 1000 1010
830 840 850 860 870
mKIAA4 QQKL-ALTQRLEDLEFDHEQSRRSKGKLGKSKIGSPKSGHCPQ
. .: :.: : .: :
mFLJ00 RTSLRNLNQFLPELPADLASILERNENLRELESLKENFPFTTKERIFEEKSNFPQVHIMD
1020 1030 1040 1050 1060 1070
>>mKIAA1561 ( 1106 res) mej02373 (1106 aa)
initn: 124 init1: 65 opt: 237 Z-score: 145.0 bits: 38.3 E(): 0.0062
Smith-Waterman score: 302; 21.504% identity (24.531% ungapped) in 851 aa overlap (48-840:196-999)
20 30 40 50 60 70
mKIAA4 LFFSIFIFIPICFSFSLLLCVYLRHPAMAAEEALKTVDQ--YKTE--IERL-TKELTETT
:.::: :.. :..: .... :. :.
mKIAA1 ELAHKVAECKALALECERVKEDSDEQIKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKE
170 180 190 200 210 220
80 90 100 110 120 130
mKIAA4 HEKIQAAEYGLVVLEEKLTLKQQYDELEAEYDGLKQELEQLREAFGQSFSIHRKVAED-G
: .:: . ..:: :..: .:...:.: . :. .:: . :: . . .: :
mKIAA1 HLTNEAATGSHRIIEE---LREQLKDLKGKYEGASAEVGKLRSQIKQSEMLVGEFKRDEG
230 240 250 260 270 280
140 150 160 170 180
mKIAA4 ETREET--LLQESASKEAYYLN---KILEMQNELKQSRA-VVTNVQAEN-ERL-SAVVQE
. ::. : .: .. :. ...:....::. : .. .: .:. : . :.. ..
mKIAA1 RLVEENKRLQKECGTCEVELERRGRRVVELEGQLKELGAKLALSVPTEKFESMKSSLSND
290 300 310 320 330 340
190 200 210 220 230
mKIAA4 LKEN-NEMVELQR--------IRM--KD--EIREYKFREARLLQDYTELEEENITLQKLV
..:. ....:. : ::. .: .: ..: . : ..::... : : :
mKIAA1 INEKVKRLAEVGRDYESAQGEIRQLKRDLESVRAQHIRPEEHEQLRSRLEQKSGELGKKV
350 360 370 380 390 400
240 250 260 270
mKIAA4 STLK-QNQVEYEGLKHEIKRFEEETVLLNSQLED----------AIRLKEIAEHQLEEAL
: : .::. :........ .. :::.:... .:..: ... . .
mKIAA1 SELTLKNQT----LQKDVEKLHADNKLLNQQVHSLTVEMKTRYVPLRVSEEMKKSHDVNV
410 420 430 440 450
280 290 300 310 320 330
mKIAA4 ETLK---NEREQKNNLRKELSQYINLSDSHISISVDGLKFAEDGSEPNNDDKMNGHIHGP
: :. .: :. . .:. .. . ..... .:. :. . . : .. . :. ...
mKIAA1 EDLNKKLSEATQRYTEKKQEAERLLAENDKLTKNVSRLEAVFVAPEKHEKELMG--LKSN
460 470 480 490 500 510
340 350 360 370 380 390
mKIAA4 LGKLNGDYRTPTTRKGESLHPVSDLFSELNISEIQKLKQQLIQV---EREKAILLANLQE
...:. . . . ::. . . :.:: : : . :..: . . :. :: : .....
mKIAA1 IAELKKQLSELNKKCGEGQEKIRALMSE-NSSLKKTLSSQYVPAKTHEEVKASLNSTVEK
520 530 540 550 560 570
400 410 420 430 440
mKIAA4 SQTQLEHTKGALTEQHERVHRLTEHVNAMR-GLQNSK-EIKAE---LDCEKGRNSAEEAH
.. : ..: . . ..: .: .. ...: .:.: . ..::. :. .. : :.
mKIAA1 TNRALLEAKKRFDDTSQEVSKLRDENEVLRRNLENVQNQMKADYVSLEEHSRRMSTVSQS
580 590 600 610 620 630
450 460 470 480 490 500
mKIAA4 DYEVDINGLEILECKYRVAVTEVIDLKAEIKALKEKYNKSVENYTEEKTKYESKIQMYDE
:.. . :: .: . :...:.::::: :.. . .... . : .... ..
mKIAA1 LKEAQEANAAILA-DHRQGQEEIVSLHAEIKAQKKELD-TIQECIKLKYAPLARLEECER
640 650 660 670 680 690
510 520 530 540 550 560
mKIAA4 QVTNLEKTSKESGEKMAHMEKELQKMTGIANENHNTLNTAQDELVTFSEELAQLYHHVCL
. :: ::. ...: .. .. . ...... : . .:.....:: : . .
mKIAA1 KFKATEKGLKEQLSEQTHKCRQRDEEVKKGKQENERLRA---DLAALQKEL-QDRNALAE
700 710 720 730 740
570 580 590 600 610 620
mKIAA4 CNNETPNRVMLDYYRQSRVTRSGSLKGPDDPRGLLSPRLSRRGVSSPVESRTSSEPVSKE
:. . . :. .. : : : :.: ... .:: .. .
mKIAA1 EAREAERALSGKADELSKQLKDLSQKYSDVK--------SEREKLVEEKAKQASEILAAQ
750 760 770 780 790 800
630 640 650 660 670 680
mKIAA4 NTETSKEPSPTKTPTISPVITAPPSSPVLDTSDIRKEPMN--IYNLNAIIRDQIKHL---
: .:.: : :. . :. .: : .:. .:.. . :
mKIAA1 NL-LQKQPVP------------------LEQVEALKKSLNGTIEQLKEELRSKQRCLERE
810 820 830 840
690 700 710 720 730
mKIAA4 QKAVDRSLQL-SRQRAAARELAPMIDKDKEALMEEILKLKSLLSTKREQIAT-LRAV--L
:..:.. :: :. .. :: . : :::: .:. .:. : :.:. . : :
mKIAA1 QQTVSQLQQLLENQKNSSVTLAEHL-KLKEALEKEVGIMKASLREKEEESQKKTKEVSKL
850 860 870 880 890 900
740 750 760 770 780 790
mKIAA4 KANKQTAEVALANLKNKYENEKAMVTETMTKLRNELKALKEDAATFSSLRAMFATRCDEY
... ::.. :: ::... . . : . :..... :.. : :: . :.:
mKIAA1 QTEVQTTKQALKNLETREVVDMSKYKATKNDLETQISNLNDKLA---SLNRKYDQACEEK
910 920 930 940 950
800 810 820 830 840 850
mKIAA4 VTQLDEMQRQLAAAEDEKKTLNTLLRMAIQQKLALTQRLEDLEFDHEQSRRSKGKLGKSK
:. :: . . :.: . . .. . : ::...
mKIAA1 VSAKDEKELLHLSIEQEIRDQKERCDKSLTTIMELQQRIQESAKQIEAKDNKITELLNDV
960 970 980 990 1000 1010
860 870
mKIAA4 IGSPKSGHCPQ
mKIAA1 ERLKQALNGLSQLTYSSGSPTKRQSQLVDTLQQRVRDLQQQLADADRQHQEVIAIYRTHL
1020 1030 1040 1050 1060 1070
>>mKIAA4151 ( 1916 res) mpf01376 (1916 aa)
initn: 195 init1: 77 opt: 239 Z-score: 144.0 bits: 38.9 E(): 0.0071
Smith-Waterman score: 320; 22.919% identity (25.703% ungapped) in 877 aa overlap (41-859:159-998)
20 30 40 50 60
mKIAA4 LPIIHQALFFSIFIFIPICFSFSLLLCVYLRHPAMAAEEALKT-VDQYKTEIERLTKELT
:. :. ...:. ... . .::::: :.
mKIAA4 CELKKKPTELEEETNAKQQLQRKLQAALISRKEALKENKSLQEQLSSARDAVERLTKSLA
130 140 150 160 170 180
70 80 90 100 110 120
mKIAA4 ETTHE-KIQAAEYGLVVLEEKLT-LKQQYDELEAEYD-------GLKQELEQLREAFGQS
.. . ..: : :. ::: :... :.: ::.: .:. :.:. :.:
mKIAA4 DVESQVSVQNQEKDAVL--GKLTILQEERDKLIAEMDRFLLENQSLSGSCESLKLALGGL
190 200 210 220 230 240
130 140 150 160 170 180
mKIAA4 FSIHRKVAEDGETREETLLQESASKEAYYLNKILEMQNELKQSRAVVTNVQAENERLSAV
..:. :. :. . . . ::. . .: :.:.: . ::. : ::.. :
mKIAA4 TEDKEKLMEELESVRSSKMAESTE----WQEKHKELQKEYEVLLQSYENVSNEAERIQHV
250 260 270 280 290 300
190 200 210 220 230
mKIAA4 VQELK-ENNEMVELQRIRMKDEIREYKFREARLLQDYTELEEENITLQKLVSTLKQNQVE
:. .. :..:. : .:. :: :: .: . :.:: . ..:.... .:. .:
mKIAA4 VESVRQEKQELYAKLRSTESDK-RE---REKQLQDAEQEMEEMKEKMRKFAKSKQQKILE
310 320 330 340 350
240 250 260 270 280
mKIAA4 YEG----LKHEIKRF----EEETVLL--NSQLEDAIRLKEIAEHQLEEALETLKNEREQK
: :. : . : .:: ::.:.. .. . .. : . .:.: :..
mKIAA4 LEEENDRLRAEAQPVGGTGESMEALLSSNSSLKEELEKITLEHKTLSKEFEALMAEKDAL
360 370 380 390 400 410
290 300 310 320 330 340
mKIAA4 NNLRKELSQYINLSDSHISISVDGLKFAEDGSEPNNDDKMNGHIHGPLGK------LNGD
.. ..:. . .... .. .:. .: ..::. : .. .. .:: :. .
mKIAA4 SEETRNLKLQV---EAQV-LKQASLEATEKSDEPK--DVIEEVTQAVVGKSQERDALSDS
420 430 440 450 460 470
350 360 370 380 390
mKIAA4 YRTPTTRK---GESLHP-VSDLFSELNISEIQKLKQQLIQVEREKAILLANLQESQ--TQ
. .. :.. .: ::. :: . .:.. ::: :.. . : : . :... .:
mKIAA4 AKLEDSEAILMGDGAKPGVSETFSSHD--DIKNYLQQLDQLKGRIAELEMEKQKDRELSQ
480 490 500 510 520 530
400 410 420 430 440
mKIAA4 -LEHTKGALTEQ---HERVHRLTEHVNAMRGLQNSKEIKAELDCE--KGRNSAEEAHD--
::. :.:: : .. .: :. . : : ..:. :: :. : ...::: .:
mKIAA4 ALENEKNALLTQISAKDSELKLLEEEVTKRTTLN-QQIQEEL-CRVTKLKETAEEEKDDL
540 550 560 570 580
450 460 470 480 490 500
mKIAA4 YEVDINGLEILECKYRVAVTEVIDLKAEIKALKEKYNKSVENYTEEKTKYESKIQMYDEQ
: .: : :. . .: : :.:: :...:. .. . :... .:
mKIAA4 EERLMNQLAELNGSIGNYYQDVTD--AQIK------NEQLESEMRNLQRCVSELEEEKQQ
590 600 610 620 630 640
510 520 530 540 550 560
mKIAA4 VTNLEKTSKESGEKMAHMEKELQKMTGIANENHNTLNTAQDELVTFSEELAQLYHHVCLC
... :::. :: . .::: . : ::..: . :. : ..:. :: . :.
mKIAA4 LVK-EKTKVESEIRKEYMEKIQGAQKGPANKSHA--KELQELLREKQQEVKQLQKD-CIR
650 660 670 680 690
570 580 590 600 610 620
mKIAA4 NNETPNRVMLDYYRQSRVTRSGSLKGPDDPRGLLSPRLS-RRGVSSPVES------RTSS
: . .. . . ... : : : .: :. . :. ... . : :.:
mKIAA4 YLERIS-ALEKTVKALEFVHTESQKDLDVTKGNLAQAVEHRKKAQAELSSFKILLDDTQS
700 710 720 730 740 750
630 640 650 660 670
mKIAA4 EP--VSKENTETSKEPSPTKTPTISPVITAPPSS-PVLDTSD--IRKEPMNIYN-LNAII
: : .: . .:: . .: : . . :. .. ::: :. . :.:.
mKIAA4 EAARVLADNLKLKKELQSNKESIKSQIKQKDEDLLRRLEQAEEKHRKEKKNMQEKLDALH
760 770 780 790 800 810
680 690 700 710 720 730
mKIAA4 RDQIKHLQKAVDRSLQLSRQRAAARELAPMIDKDKEALMEEILKLKSLLSTKREQIATLR
:.. . . .. ...:.:. .:: .:. : ...:: . . . : .
mKIAA4 REKAHVEETLAEIQVSLTRKDQEMKELQGSLDSTLAQLAAFTKSMSSLQDDRDRVIDEAK
820 830 840 850 860 870
740 750 760 770 780 790
mKIAA4 AVLKANKQTAEVALANLKNKYENEKAMVTETMTKLRNELKALKEDAATFSSLRAMFATRC
. .. .. ... : :: :. . . .. ... :: .. . . .. ..
mKIAA4 KWERRFGDAIQTKEEEVRLKEENCIAL-KDQLRQMAIHMEELKITVSRLEHDKEIWESKA
880 890 900 910 920 930
800 810 820 830 840 850
mKIAA4 DEYVTQLDEMQRQLAAAEDEKKTLNTLLRMAIQ----QKLALTQRLEDLEFDHEQSRRSK
. :.:.. :. ..:.: :.. :. : : .: ::. .:. ..:. .
mKIAA4 Q---TELQHHQKAYDKLQEENKELTSQLEDARQLYHDSKNELTKLESELKSLKDQTTDLN
940 950 960 970 980 990
860 870
mKIAA4 GKLGKSKIGSPKSGHCPQ
..: : :
mKIAA4 NSLEKCKEHENNLEGIIKQQEADIQNCKFSCEQLETDLAASRELTSRLHDEINAKEQKII
1000 1010 1020 1030 1040 1050
870 residues in 1 query sequences
1768147 residues in 2168 library sequences
Scomplib [34t11]
start: Mon Mar 27 11:02:38 2006 done: Mon Mar 27 11:02:40 2006
Scan time: 0.970 Display time: 0.400
Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]