FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4125.ptfa, 870 aa vs ./tmplib.26680 library 1768147 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9426+/-0.00729; mu= 10.7608+/- 0.482 mean_var=349.5079+/-81.225, 0's: 0 Z-trim: 18 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0686 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0699 ( 869 res) mbg04602 ( 869) 1340 147 7.6e-36 mKIAA0216 ( 2048 res) mib13036 (2048) 259 41 0.0018 mFLJ00150 ( 1174 res) mfj11357 (1174) 244 39 0.004 mKIAA1561 ( 1106 res) mej02373 (1106) 237 38 0.0062 mKIAA4151 ( 1916 res) mpf01376 (1916) 239 39 0.0071 >>mKIAA0699 ( 869 res) mbg04602 (869 aa) initn: 3108 init1: 1138 opt: 1340 Z-score: 735.9 bits: 147.3 E(): 7.6e-36 Smith-Waterman score: 3167; 64.044% identity (67.217% ungapped) in 826 aa overlap (58-868:41-842) 30 40 50 60 70 80 mKIAA4 ICFSFSLLLCVYLRHPAMAAEEALKTVDQYKTEIERLTKELTETTHEKIQAAEYGLVVLE ..:..::..::.:::.::::::::::.::: mKIAA0 SRPRRAATMSAPSEEEEYARLVMEAQPEWLRAEVKRLSHELAETTREKIQAAEYGLAVLE 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 140 mKIAA4 EKLTLKQQYDELEAEYDGLKQELEQLREAFGQSFSIHRKVAEDGETREETLLQESASKEA :: :: :..:::..:.....:.:::.:::::. . :.::: :::.:::.:.::::::: mKIAA0 EKHQLKLQFEELEVDYEAIRSEMEQLKEAFGQAHTNHKKVAADGESREESLIQESASKEQ 80 90 100 110 120 130 150 160 170 180 190 200 mKIAA4 YYLNKILEMQNELKQSRAVVTNVQAENERLSAVVQELKENNEMVELQRIRMKDEIREYKF ::. :.::.:.:::: : :.::.:.:::::..:.::::: :. ::.:: :..:.:.:::: mKIAA0 YYVRKVLELQTELKQLRNVLTNTQSENERLTSVAQELKEINQNVEIQRGRLRDDIKEYKF 140 150 160 170 180 190 210 220 230 240 250 260 mKIAA4 REARLLQDYTELEEENITLQKLVSTLKQNQVEYEGLKHEIKRFEEETVLLNSQLEDAIRL :::::::::.:::::::.::: ::.:.:::::.:::::::::.:::: ::::::::::: mKIAA0 REARLLQDYSELEEENISLQKQVSVLRQNQVEFEGLKHEIKRLEEETEYLNSQLEDAIRL 200 210 220 230 240 250 270 280 290 300 310 320 mKIAA4 KEIAEHQLEEALETLKNEREQKNNLRKELSQYINLSDS----HISISVDGLKFAEDG--S :::.:.::::::::::.:::::::::::::.:....:: :...:.:::::..: . mKIAA0 KEISERQLEEALETLKTEREQKNNLRKELSHYMSINDSFYTSHLQVSLDGLKFSDDTVTA 260 270 280 290 300 310 330 340 350 360 370 mKIAA4 EPNNDDK--MNGHIHGPLGKLNGDYRTPTTRKGESLHP-----VSDLFSELNISEIQKLK ::::: . .:: :. : : . : .: : :: ..: : ::::.:::.:::::::: mKIAA0 EPNNDAEALVNGFEHSGLVKSSLDNKTSTPRK-DGLAPPSPSLVSDLLSELHISEIQKLK 320 330 340 350 360 380 390 400 410 420 430 mKIAA4 QQLIQVEREKAILLANLQESQTQLEHTKGALTEQHERVHRLTEHVNAMRGLQNSKEIKAE :::.:.::::. :::.::..: :::...:.:.::::.:.::::...:.: :: .:: .. mKIAA0 QQLVQMEREKVGLLATLQDTQKQLEQARGTLSEQHEKVNRLTENLSALRRLQAGKERQTS 370 380 390 400 410 420 440 450 460 470 480 490 mKIAA4 LDCEKGRNSAEEAHDYEVDINGLEILECKYRVAVTEVIDLKAEIKALKEKYNKSVENYTE :: :: :.: :.. ::::::: ::: :::.:::.:. .:. ..:::. .. ...: mKIAA0 LDNEKDRDSHEDGDYYEVDINGPEILACKYHVAVAEAGELREQLKALRSTHEAREAQHAE 430 440 450 460 470 480 500 510 520 530 540 550 mKIAA4 EKTKYESKIQMYDEQVTNLEKTSKESGEKMAHMEKELQKMTGIANENHNTLNTAQDELVT :: .::.. : :... :::.:... : .::.::::.:.. .:.:....::.::::::: mKIAA0 EKGRYEAEGQALTEKISLLEKASHQDRELLAHLEKELKKVSDVAGETQGSLNVAQDELVT 490 500 510 520 530 540 560 570 580 590 600 610 mKIAA4 FSEELAQLYHHVCLCNNETPNRVMLDYYRQSRVTRSGSLKGPDDPRGLLSPRLSRRGVSS ::::::.::::::.:::::::::::::::... :. : .:.: :: : mKIAA0 FSEELANLYHHVCMCNNETPNRVMLDYYREGQ----GK-AGRTSPEG--------RGRRS 550 560 570 580 590 620 630 640 650 660 670 mKIAA4 PVESRTSSEPVSKENTETSKEPSPTKTPTISPVITAPPSSPVLDTSDIRKEPMNIYNLNA :: : . ::... . : . :: . : ::. :: :.:::::::: : mKIAA0 PVLL-----PKGLLATEVGRADGGTGDNSPSPSSSLP--SPL---SDPRREPMNIYNLIA 600 610 620 630 640 680 690 700 710 720 730 mKIAA4 IIRDQIKHLQKAVDRSLQLSRQRAAARELAPMIDKDKEALMEEILKLKSLLSTKREQIAT :::::::::: ::::. .::::: :..::.: .:::::::::::::::::::::::::.: mKIAA0 IIRDQIKHLQAAVDRTTELSRQRIASQELGPAVDKDKEALMEEILKLKSLLSTKREQITT 650 660 670 680 690 700 740 750 760 770 780 790 mKIAA4 LRAVLKANKQTAEVALANLKNKYENEKAMVTETMTKLRNELKALKEDAATFSSLRAMFAT ::.:::::::::::::::::.::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::: mKIAA0 LRTVLKANKQTAEVALANLKSKYENEKAMVTETMMKLRNELKALKEDAATFSSLRAMFAT 710 720 730 740 750 760 800 810 820 830 840 850 mKIAA4 RCDEYVTQLDEMQRQLAAAEDEKKTLNTLLRMAIQQKLALTQRLEDLEFDHEQSRRSKGK :::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::: ::.::::.::...: mKIAA0 RCDEYITQLDEMQRQLAAAEDEKKTLNSLLRMAIQQKLALTQRLELLELDHEQTRRGRSK 770 780 790 800 810 820 860 870 mKIAA4 LG-KSKIGSPKSGH-CPQ . :.: .::. .: : mKIAA0 AASKAKPASPSVSHTCACASERAEGAGLANQVFCSEKHSIYCD 830 840 850 860 >>mKIAA0216 ( 2048 res) mib13036 (2048 aa) initn: 138 init1: 85 opt: 259 Z-score: 154.5 bits: 40.9 E(): 0.0018 Smith-Waterman score: 264; 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