FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1825.ptfa, 1100 aa vs ./tmplib.26680 library 1767917 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4646+/-0.00415; mu= 20.1655+/- 0.278 mean_var=86.3383+/-20.197, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1380 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1347 ( 915 res) mtj01524 ( 915) 189 48 6.2e-06 mKIAA0703 ( 810 res) mbp06179 ( 810) 171 45 6.9e-05 mKIAA4233 ( 1195 res) mbg18924 (1195) 159 43 0.00046 mKIAA0778 ( 1022 res) mph00577 (1022) 157 42 0.00055 mKIAA4139 ( 1059 res) mfj21022 (1059) 153 41 0.00097 mKIAA1137 ( 923 res) meh02020 ( 923) 147 40 0.002 mKIAA0956 ( 1210 res) mpm12246 (1210) 148 40 0.0021 mKIAA4195 ( 1061 res) mbg00956 (1061) 144 39 0.0034 >>mKIAA1347 ( 915 res) mtj01524 (915 aa) initn: 339 init1: 172 opt: 189 Z-score: 198.9 bits: 48.3 E(): 6.2e-06 Smith-Waterman score: 234; 23.956% identity (31.965% ungapped) in 455 aa overlap (360-778:281-657) 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 GVKRVTANNLETFIFILFLLVFAIAAAAYVWVEGTKDPSRNRYKLFLECTLILTSVVPPE :. : :: ..: . . ....: mKIAA1 KTPLQKSMDLLGKQLSFYSFGIIGIIMLVGWLLG-KDI----LEMFTISVSLAVAAIPEG 260 270 280 290 300 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 LPIELSLAVNTSLIALAKLYMYCTEPFRIPFAGKVEVCCFDKTGTLTSDSLVVRGVAGLR ::: ..... ... ..: . . : .: : :::::::.. ..: . mKIAA1 LPIVVTVTLALGVMRMVKKRAIVKKLPIVETLGCCNVICSDKTGTLTKNEMTVTHIL-TS 310 320 330 340 350 360 450 460 470 480 mKIAA1 DG--KEVTPVSSI-----------------PIETHRALASC-HSLMQLDDGTLVGDPLEK :: ::: :. : .. . :.: . . ..::.: : : mKIAA1 DGLHAEVTGVGYNQFGEVIVDGDVVHGFYNPAVSRIVEAGCVCNDAVIRNNTLMGKPTEG 370 380 390 400 410 420 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 AMLT-AVDWTLTKDEKVFPRSIKTQGLKIHQRFHFASALKRMSVLASYE-KLGSTDLCYI :... :. : .. . :. . . :.: : :.: .. . ..:.. mKIAA1 ALIALAMKMGLDGLQQDYIRKAE---------YPFSSEQKWMAVKCVHRTQQDRPEICFM 430 440 450 460 470 550 560 570 580 590 mKIAA1 AAVKGAPE-------TLHS-----MFSQCPPD-YHHIHTEISREGARVLALGY-KELGHL ::: : : .: ..: : :.. ..... : :::::. :::.: mKIAA1 ---KGAYEQVIKYCTTYNSKGQTLALTQQQRDLYQQEKARMGSAGLRVLALASGPELGQL 480 490 500 510 520 530 600 610 620 630 640 650 mKIAA1 THQQAREIKREALECSLKFVGFIVVSCPLKADSKAVIREIQNASHRVVMITGDNPLTACH : :.:.. . : .. : .. . .. . :::::. :: mKIAA1 T-----------------FLGLVGIIDPPRTGVKEAVTTLIASGVSIKMITGDSQETAIA 540 550 560 570 660 670 680 690 700 710 mKIAA1 VAQELHFIDKAHTLILHPPSEKGQPCEWRSIDSSIVLPLTLGSPKALALEHALCLTGDGL .:..: . .:. .: . .:. mKIAA1 IASRLGLYSKT-----------SQSVSGEEVDT--------------------------- 580 590 720 730 740 750 760 770 mKIAA1 AHLQAVDPQQLLCLIPHVQVFARVAPKQKEFVITSLKELGYVTLMCGDGTNDVGALKHAD .. :.: ..:.: :: :..:..: .: ::.. : :. : :::.::. ::: :: mKIAA1 -----MEVQHLSQIVPKVAVFYRASPRHKMKIIKSLQKNGAVVAMTGDGVNDAVALKAAD 600 610 620 630 640 650 780 790 800 810 820 830 mKIAA1 VGVALLANAPERVVERRRRPRDSPVLSNSGPRVSRSTKQKSALLSPEEPPASHRDRLSQV .:::. mKIAA1 IGVAMGQTGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIKNFVRFQLSTSIAALTL 660 670 680 690 700 710 >>mKIAA0703 ( 810 res) mbp06179 (810 aa) initn: 294 init1: 159 opt: 171 Z-score: 180.2 bits: 44.7 E(): 6.9e-05 Smith-Waterman score: 208; 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