FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0167.ptfa, 1029 aa vs ./tmplib.26680 library 1767988 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9512+/-0.00859; mu= -4.9613+/- 0.571 mean_var=371.8753+/-86.310, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0665 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1099 ( 981 res) mfj15083 ( 981) 1371 146 2.1e-35 mKIAA0041 ( 807 res) mbg03660 ( 807) 408 54 1.2e-07 mKIAA1249 ( 1079 res) mbg09359 (1079) 403 53 2e-07 mKIAA0400 ( 970 res) mfj04247 ( 970) 370 50 1.7e-06 mKIAA0148 ( 722 res) mbj00784 ( 722) 303 44 0.00012 mKIAA0782 ( 1147 res) mbh00053 (1147) 300 44 0.0002 mKIAA4097 ( 1033 res) mbg03907 (1033) 277 41 0.00086 >>mKIAA1099 ( 981 res) mfj15083 (981 aa) initn: 2546 init1: 1263 opt: 1371 Z-score: 728.0 bits: 146.2 E(): 2.1e-35 Smith-Waterman score: 2790; 55.985% identity (59.157% ungapped) in 802 aa overlap (248-1011:180-976) 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 GPGPLPGPQGLSSSSGSRELLGAELRASPKAVVNSQEWTLSRSIPELRLGVLGDVRSGKS : :::::::::::.:::..:..:.. :::: mKIAA1 NIYSIYELLERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNSQEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKS 150 160 170 180 190 200 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 SLIHRFLTGSYQVLEKIESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFS .:.::.:::.: :. :. ..:::..::::..:.:::.:.: :.:.:. :.:::::::: mKIAA1 ALVHRYLTGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLLLIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFS 210 220 230 240 250 260 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 LEDESSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARARALCTDMK :::: :::.: . ...... :. .. . :.:::::: ::...:::. :.::: : .:.: mKIAA1 LEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSE--IPLVLVGTQDAISSTNPRVIDDVRARKLSNDLK 270 280 290 300 310 320 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 RCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQL-LAACKSLPSSPSHSAA-STPVAG- ::.::::::::::::.::::.::::.:. ::.::: .. :::::.:::::.. :. :.. mKIAA1 RCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAV 330 340 350 360 370 380 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 ---QASNGGHT-SDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANR :.:::: . ::::::.::.:.....::: .. .:. :: ... .:::..::..: mKIAA1 HISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDVPPTANTPTP--VRKQSKRRSNLFTSR 390 400 410 420 430 440 520 530 540 550 560 mKIAA0 RGSDA--EKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYH .::: ::..:.::... ::::::::::..::::::.::::::::::::: .:: : :: mKIAA1 KGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYH 450 460 470 480 490 500 570 580 590 600 610 620 mKIAA0 PSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGP--SASINGLVKDMSTV------ ::..::....::::.::::::::::::::::: :: .: : :::.::::.. mKIAA1 PSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSACAPISSPRTNGLAKDMSSLHISPNS 510 520 530 540 550 560 630 640 650 660 mKIAA0 ---------QMGEG----PEASTP--MPSPSPSPSSLQLPTDQT--SKHLLKPDRNLARA ::. : : : : . : : :: . .: : .. .. : .:. . mKIAA1 GNVTSASGSQMASGISLVSFNSRPDGMHQRSYSVSSADQWSDATVIANSAISSDTGLGDS 570 580 590 600 610 620 670 680 690 700 710 mKIAA0 LSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMV--KKQRRKKLSTPSKTEGSAVQAE--EENFEFLIVS . .. . :.. :: . .::::: . ::.:::: .. :..: . :: :::.::.::: mKIAA1 VCSSPSISSSTSP-KLDPPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENLEFIIVS 630 640 650 660 670 680 720 730 740 750 760 770 mKIAA0 STGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKG :::::::::...::::::::::::::::::: ::::: : : :::::.:.:.::: .: mKIAA1 LTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRG 690 700 710 720 730 740 780 790 800 810 820 830 mKIAA0 NSTCVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAI :: :::: . ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :: :...: mKIAA1 NSHCVDCDTQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPMELIKVMSSI 750 760 770 780 790 800 840 850 860 870 880 890 mKIAA0 GNDTANRVWESDTRGRAKPTRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLGTTEEPLGRQLWAAV ::. :: ::: ..::.::. ::.:::.: :::::::: :::::: :: ::.:: :. mKIAA1 GNELANSVWEEGSQGRTKPSLDSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTEFSLGQQLLRAT 810 820 830 840 850 860 900 910 920 930 940 950 mKIAA0 EAQDVAAVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDA .:. .:.:::::. . .. . . . :. :::: . ..::..:::.:::.:: :::: mKIAA1 AEEDLRTVILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDA 870 880 890 900 910 920 960 970 980 990 1000 1010 mKIAA0 QGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSTATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASL .: ::: :::::.:: : :.:::.::: : .::. . . . : : mKIAA1 HGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLSRKSNSRNNSSGRAPSVI 930 940 950 960 970 980 1020 mKIAA0 GRVDTTIALV >>mKIAA0041 ( 807 res) mbg03660 (807 aa) initn: 394 init1: 325 opt: 408 Z-score: 229.6 bits: 53.7 E(): 1.2e-07 Smith-Waterman score: 435; 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