# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mfj34112.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0167.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0167, 1029 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7903002 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4479+/-0.000204; mu= 9.5634+/- 0.011 mean_var=152.0478+/-28.938, 0's: 30 Z-trim: 88 B-trim: 8 in 1/70 Lambda= 0.104012 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|109480648|ref|XP_576238.2| PREDICTED: similar t ( 836) 5083 775.3 0 gi|15625582|gb|AAL04171.1|AF413077_1 centaurin gam ( 836) 4984 760.5 8e-217 gi|109097489|ref|XP_001116290.1| PREDICTED: centau ( 836) 4968 758.1 4.2e-216 gi|194212311|ref|XP_001917890.1| PREDICTED: centau ( 835) 4924 751.5 4.1e-214 gi|97046551|sp|Q3UHD9.1|AGAP2_MOUSE RecName: Full= (1186) 4664 712.6 2.9e-202 gi|81900368|sp|Q8CGU4.1|AGAP2_RAT RecName: Full=Ar (1186) 4627 707.1 1.4e-200 gi|97535883|sp|Q99490.2|AGAP2_HUMAN RecName: Full= (1192) 4439 678.9 4.2e-192 gi|170650694|ref|NP_001116244.1| centaurin, gamma (1192) 4430 677.5 1.1e-191 gi|114644123|ref|XP_509171.2| PREDICTED: centaurin (1192) 4417 675.6 4.2e-191 gi|119892427|ref|XP_581013.3| PREDICTED: similar t (1188) 4396 672.4 3.7e-190 gi|109097487|ref|XP_001116285.1| PREDICTED: centau (1192) 4383 670.5 1.4e-189 gi|9716661|gb|AAF97595.1| nuclear GTPase PIKE [Rat ( 753) 3997 612.3 2.9e-172 gi|193783765|dbj|BAG53747.1| unnamed protein produ ( 848) 3196 492.2 4.7e-136 gi|73968517|ref|XP_538251.2| PREDICTED: similar to ( 744) 3075 474.0 1.3e-130 gi|119617454|gb|EAW97048.1| centaurin, gamma 1, is ( 856) 2932 452.6 4e-124 gi|116487949|gb|AAI25888.1| Zgc:153779 [Danio reri ( 827) 2691 416.4 3e-113 gi|74184734|dbj|BAE27969.1| unnamed protein produc ( 681) 1396 222.0 8.3e-55 gi|80978937|ref|NP_001032213.1| centaurin, gamma 2 ( 804) 1396 222.1 9.3e-55 gi|224054075|ref|XP_002191217.1| PREDICTED: ArfGAP ( 863) 1395 221.9 1.1e-54 gi|149633412|ref|XP_001508850.1| PREDICTED: simila ( 681) 1393 221.5 1.1e-54 gi|109101576|ref|XP_001082744.1| PREDICTED: simila ( 804) 1388 220.9 2.1e-54 gi|80978934|ref|NP_055729.2| centaurin, gamma 2 is ( 804) 1388 220.9 2.1e-54 gi|15625584|gb|AAL04172.1|AF413078_1 centaurin gam ( 804) 1387 220.7 2.4e-54 gi|119591485|gb|EAW71079.1| centaurin, gamma 2, is ( 804) 1387 220.7 2.4e-54 gi|194665937|ref|XP_001788943.1| PREDICTED: simila ( 899) 1385 220.5 3.1e-54 gi|148708153|gb|EDL40100.1| centaurin, gamma 2 [Mu ( 804) 1371 218.3 1.3e-53 gi|51315986|sp|Q8BXK8.1|AGAP1_MOUSE RecName: Full= ( 857) 1371 218.3 1.3e-53 gi|74184704|dbj|BAE27957.1| unnamed protein produc ( 857) 1368 217.9 1.8e-53 gi|194211459|ref|XP_001915945.1| PREDICTED: simila ( 946) 1365 217.5 2.6e-53 gi|7023161|dbj|BAA91862.1| unnamed protein product ( 426) 1356 215.8 3.9e-53 gi|26330696|dbj|BAC29078.1| unnamed protein produc ( 414) 1354 215.4 4.7e-53 gi|194374627|dbj|BAG62428.1| unnamed protein produ ( 696) 1357 216.1 4.9e-53 gi|114584112|ref|XP_001148486.1| PREDICTED: centau ( 538) 1355 215.7 5.1e-53 gi|160332373|sp|Q9UPQ3.4|AGAP1_HUMAN RecName: Full ( 857) 1357 216.2 5.6e-53 gi|109101574|ref|XP_001082607.1| PREDICTED: simila ( 857) 1357 216.2 5.6e-53 gi|119591484|gb|EAW71078.1| centaurin, gamma 2, is ( 857) 1356 216.1 6.2e-53 gi|118093312|ref|XP_421880.2| PREDICTED: similar t (1213) 1357 216.4 7.1e-53 gi|73994179|ref|XP_848466.1| PREDICTED: similar to ( 936) 1355 216.0 7.3e-53 gi|189520208|ref|XP_001921526.1| PREDICTED: simila ( 857) 1346 214.6 1.8e-52 gi|149037650|gb|EDL92081.1| centaurin, gamma 2 (pr ( 669) 1329 211.9 8.7e-52 gi|126341186|ref|XP_001371571.1| PREDICTED: simila ( 872) 1330 212.2 9.4e-52 gi|29476829|gb|AAH48300.1| CENTG3 protein [Homo sa ( 403) 1321 210.5 1.4e-51 gi|194210144|ref|XP_001495190.2| PREDICTED: centau ( 871) 1320 210.7 2.7e-51 gi|119574410|gb|EAW54025.1| centaurin, gamma 3, is ( 683) 1313 209.5 4.7e-51 gi|149046527|gb|EDL99352.1| centaurin, gamma 3 (pr ( 538) 1310 209.0 5.4e-51 gi|97535922|sp|Q96P47.2|AGAP3_HUMAN RecName: Full= ( 875) 1313 209.6 5.5e-51 gi|15625586|gb|AAL04173.1|AF413079_1 centaurin gam ( 876) 1313 209.6 5.5e-51 gi|110227613|ref|NP_114152.3| centaurin, gamma 3 i ( 911) 1313 209.7 5.7e-51 gi|21755825|dbj|BAC04766.1| unnamed protein produc ( 467) 1308 208.6 6.1e-51 gi|149046528|gb|EDL99353.1| centaurin, gamma 3 (pr ( 682) 1310 209.1 6.4e-51 >>gi|109480648|ref|XP_576238.2| PREDICTED: similar to Ce (836 aa) initn: 5079 init1: 5079 opt: 5083 Z-score: 4129.3 bits: 775.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 5083; 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