FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0327.ptfa, 933 aa vs ./tmplib.26680 library 1768084 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2911+/-0.00431; mu= 20.7033+/- 0.289 mean_var=99.2383+/-23.073, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1287 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1621 ( 810 res) mbg08078 ( 810) 2050 392 1.7e-109 mKIAA0345 ( 962 res) mbg19517 ( 962) 1900 364 4.5e-101 mKIAA1400 ( 1098 res) mbh01141 (1098) 1366 265 3.5e-71 mKIAA1313 ( 969 res) mbh01521 ( 969) 1121 220 1.6e-57 mKIAA1562 ( 1135 res) mfj24085 (1135) 968 191 6.4e-49 mKIAA0811 ( 1654 res) mbg07446 (1654) 525 109 4.6e-24 mKIAA1775 ( 918 res) mbg01642 ( 918) 305 68 6.7e-12 >>mKIAA1621 ( 810 res) mbg08078 (810 aa) initn: 1410 init1: 920 opt: 2050 Z-score: 2058.2 bits: 391.9 E(): 1.7e-109 Smith-Waterman score: 2050; 44.343% identity (44.692% ungapped) in 769 aa overlap (34-799:44-809) 10 20 30 40 50 60 mKIAA0 ASKNQHRHGRLVLLCTLMGTLCKISVGQIRYSVPEETDKGTVVGNISKDLGLEPRELAER ::. :::..:. :.:..::::.. :...: mKIAA1 TAWMCNLRQRQVLAFFVLLHVSGAGAELGPYSIEEETERGSFVANLGKDLGVDLAEISNR 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 mKIAA0 GVRIVSRGRSQLFSLNPRGGSLVTAGRIDREELCAQSTPCLVNINILVEEKGKLFGVEIE .::.:. .. ..:: ..:.:. ..::::::.. ::......:.:. ..: .:.. mKIAA1 RARIISQENKEHLQLNLQSGDLLINEKLDREELCGSIEPCVLHFQVLMENPLEVFQAELR 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 mKIAA0 ITDINDNNPKFHVGDLEVKINEIAAPGARYPLPEAVDPDVGINSLQSYQLSPNRHFSLHL . :::: .: : .. ..: : .: : .:: .:.: ::.::..:.:.:: : :: . mKIAA1 VMDINDYSPVFSEREMILRILENSALGDTFPLNNALDSDVAINNIQTYRLSSNSHFLVVT 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 mKIAA0 QTGDDGTINPELVLERTLDREEEPTHHLVLTASDGGEPRRSSTALIQITVLDTNDNAPVF .. .:: ::::::. ::::::: .:.::: ::: : ::.:: . : :.: ::::: : mKIAA1 RNRSDGRKYPELVLEKELDREEEPELRLTLTALDGGAPPRSGTAQVLIEVVDINDNAPKF 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 mKIAA0 DQPVYRVKVLENVAPGTLLLTVRASDPDEGVNGKVTYKFRKINEKQSLLFHLHENTGEMT .::.:::.. :: :.:.::: :.: : : ::: : . . .: : .... :::. mKIAA1 QQPTYRVQIPENSPTGSLVLTVSANDLDSGDYGKVLYALSQPSEDISKTLEVNPVTGEIR 260 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 mKIAA0 VAKNLDYEECSLYEMEIQAEDVGALLGRSKVIIMVEDVNDNRPEVTITSLFNPVLENSLP . :..:.: ::..:.: : :.: :. ... : ::::: ::: ...: .:: ::: : mKIAA1 LRKEVDFETIPSYEVDIKATDGGGLSGKCTLLLKVVDVNDNAPEVMLSALTSPVPENS-P 320 330 340 350 360 370 370 380 390 400 410 420 mKIAA0 GTVIAFLNVHDQDSGKNGQVVCYTHDNLPFKLEKSIDNYYRLVTWKYLDREKVSTYNITV :.: ..:.: ::..::... ...::: :..: :.: ::: . ::::. ::::. mKIAA1 DEVVAVFSVKDPDSANNGKMIASIEEDLPFLLKSSGKNFYTLVTKRALDREEREKYNITI 380 390 400 410 420 430 430 440 450 460 470 480 mKIAA0 IASDLGAPPLSTETYIALTVADTNDNPPRFSHTSYTAYLPENNLRGASIFSLTAHDPDSQ .::::.: :.:. :.. :.::::: : :..:::: .. ::: . : ...: : :. mKIAA1 TVSDLGTPRLTTQHTITVQVSDTNDNAPAFNQTSYTLFVRENNSPAMHIGTISATDSDAG 440 450 460 470 480 490 490 500 510 520 530 540 mKIAA0 ENAQVTYSVSEDTIQGVPLSSYISINSDTGILYALQSFDFEKIQDLQLLVIATDSGSPPL :....::. . . :.: ::::.:.: :.::...:.: .: ... : : :.::: : mKIAA1 SNSHISYSLLPSHDPQLALDSLISINADNGQLFALRALDYEALQAFEFHVGAIDQGSPAL 500 510 520 530 540 550 550 560 570 580 590 600 mKIAA0 SSNVSLSLFVLDQNDNAPEILYPSFPTDGSTGVELAPRSAEPGYLVTKVVAVDKDSGQNA ::.. . . :::.::::: .::: . .... .:: ::.::::::::::::::.:::::: mKIAA1 SSQALVRVVVLDDNDNAPFVLYP-MQNSSAPCTELLPRAAEPGYLVTKVVAVDRDSGQNA 560 570 580 590 600 610 610 620 630 640 650 660 mKIAA0 WLSYRLLKASEPGLFSVGLHTGEVRTARALLDRDALKQNLVMAVQDHGQPPLSATVTLTV :::..::::.::::::: :.:::::.: : .::. :. ::. :.:.:.:: ::.::: : mKIAA1 WLSFQLLKATEPGLFSVWAHNGEVRTTRLLSERDVPKHRLVLLVKDNGDPPRSASVTLHV 620 630 640 650 660 670 670 680 690 700 710 720 mKIAA0 AVANSIPEVLADLSSIMTPEVPEDSDLTLHLVVAVAVVSCVFLVFVIVLLALRLQRWQKS :.... . : . . ... :::.::.:.: :: .::. :......:: : .: mKIAA1 LVVDGFSQPYLPLPEVARNPAHDEDALTLYLVIALASVSSLFLLSVLLFVGVRLCRRARS 680 690 700 710 720 730 730 740 750 760 770 780 mKIAA0 RQLQGSRSGLAPAPPSHFVGIDGVQAFLQTYSHEVSLTSGSQ-TSHIIFPQPNYADML-- .:.: : :.:.: . :: .. :.:...: : . :. ::.. : .: . . : mKIAA1 ASLSG-YSVPEGHIPGHLVDVRGVGTLSQSYQYDVCLMGDSSGTSEFNFLKPVFPSSLDQ 740 750 760 770 780 790 790 800 810 820 830 840 mKIAA0 INQESCEKNDSLLTSIDFHENKDEDACAPQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDETGTWP . . :.:.:: .:. ::. mKIAA1 CSGKEIEENSSLHNSFGFHH 800 810 >>mKIAA0345 ( 962 res) mbg19517 (962 aa) initn: 1642 init1: 765 opt: 1900 Z-score: 1906.9 bits: 364.2 E(): 4.5e-101 Smith-Waterman score: 2035; 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