FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1474.ptfa, 1050 aa vs ./tmplib.26680 library 1767967 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7303+/-0.00642; mu= 0.8325+/- 0.426 mean_var=292.7374+/-69.779, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0750 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4206 ( 1093 res) mbg03925 (1093) 2338 267 9.7e-72 mKIAA4248 ( 1059 res) mfj00143 (1059) 1125 136 2.9e-32 >>mKIAA4206 ( 1093 res) mbg03925 (1093 aa) initn: 2729 init1: 924 opt: 2338 Z-score: 1380.3 bits: 267.1 E(): 9.7e-72 Smith-Waterman score: 3649; 58.049% identity (64.323% ungapped) in 1056 aa overlap (48-1050:88-1093) 20 30 40 50 60 70 mKIAA1 QRRNSARPALATRTHRPLSSPAMKWTASLTSETSDRMADFESSSIKNEEETKEVQVPLED :: ::..: :.::: ..:.: : : : mKIAA4 EETEIKEAQSYQNSPVSTATNQDAGYGSPFSEGSDQLAHFKSSSSREEKE--ESQCPDSV 60 70 80 90 100 110 80 90 100 110 mKIAA1 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