FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4056.ptfa, 844 aa vs ./tmplib.26680 library 1768173 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0197+/-0.00668; mu= 2.6453+/- 0.445 mean_var=218.9501+/-51.937, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0867 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0338 ( 907 res) mbg08118 ( 907) 1876 248 4.2e-66 mKIAA0987 ( 851 res) mfk00358 ( 851) 1377 185 2.4e-47 mKIAA1548 ( 789 res) mpm02067 ( 789) 932 130 1.3e-30 mKIAA1013 ( 989 res) mpg00833 ( 989) 195 38 0.0084 >>mKIAA0338 ( 907 res) mbg08118 (907 aa) initn: 2069 init1: 1505 opt: 1876 Z-score: 1279.1 bits: 247.8 E(): 4.2e-66 Smith-Waterman score: 1947; 42.697% identity (55.152% ungapped) in 890 aa overlap (136-844:29-898) 110 120 130 140 150 160 mKIAA4 EDLTKNKERTSESRGLSRLLSSFLKRPKSQVSEEEGREVESEKEKGEGGQKEIELGNSLD .. : : . : .: . : :. : .... mKIAA0 CGPGGAEGTGPRPAGPRWGPPGPGVLVTMTTETGPDSEVKKAQEETPQQP-EAATAVT 10 20 30 40 50 170 180 190 200 210 220 mKIAA4 EDIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSIETQPAQEEHREDPDSETKEGEGIEECSGTE . .: . .:: ... . : :.. .:.::.. : :.. .:..:. : mKIAA0 TPV---TPAGHSHPETNSNEK---H-LTQQDTRPAEQSLDMD-DKDYSEADGLSE----- 60 70 80 90 100 230 240 250 260 270 280 mKIAA4 VKEDPESRAEREPEASQKPVRRHRNMHCKVSLLDDTVYECVVEKHAKGQDLLKRVCEHLN . : :.:.. : :: ... .. :.:.::: . ::: ::::..:: :. :::::: mKIAA0 -RTTP-SKAQKSP---QKIAKKFKSAICRVTLLDASEYECEVEKHGRGQVLFDLVCEHLN 110 120 130 140 150 290 300 310 320 330 340 mKIAA4 LLEEDYFGLALWDSATSKTWLDSAKEIKKQVRGVPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYY :::.:::::.. :. ..:.::: .::::::.:. ::::.:.::::::::::::::::::: mKIAA0 LLEKDYFGLTFCDADSQKNWLDPSKEIKKQIRSSPWNFAFTVKFYPPDPAQLTEDITRYY 160 170 180 190 200 210 350 360 370 380 390 400 mKIAA4 LCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDPELHGMDYVSDFKLAPNQTKELE :::::: ::..:::::::.: ::::::..:.:::::: : : .:::....:::::.::: mKIAA0 LCLQLRADIITGRLPCSFVTHALLGSYAVQAELGDYDAEEHVGNYVSELRFAPNQTRELE 220 230 240 250 260 270 410 420 430 440 450 460 mKIAA4 EKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHKAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYK :..:::::.::.:::..:...::::::::::::::::.::: ::.::.::::..:::.:. mKIAA0 ERIMELHKTYRGMTPGEAEIHFLENAKKLSMYGVDLHHAKDSEGIDIMLGVCANGLLIYR 280 290 300 310 320 330 470 480 490 500 510 520 mKIAA4 DKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEHYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHH :.:::::: :::.::::::::.:.::::::: :..:::::::::..:.::.:::::.::: mKIAA0 DRLRINRFAWPKILKISYKRSNFYIKIRPGEYEQFESTIGFKLPNHRSAKRLWKVCIEHH 340 350 360 370 380 390 530 540 550 560 570 580 mKIAA4 TFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPHFERTASKR--ASRS :::::.: . ::. ::..:::::::::::::::::::::::::: :::..::: ::: mKIAA0 TFFRLVSPEPPPKG-FLVMGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPFFERSSSKRYTMSRS 400 410 420 430 440 450 590 600 610 mKIAA4 LDGA------AAAESTDRSPR------------------------PTSAPAIAQSQVTEG :::: ...:. : .:. ::. . : : mKIAA0 LDGAEFSRPASVSENHDAGPEGDKREDDAESGGRRSEAEEGEVRTPTKIKELKPEQETTP 460 470 480 490 500 510 620 mKIAA4 ------------------------------------------------PGAPIKKTPK-E :..: . .:: mKIAA0 RHKQEFLDKPEDVLLKHQASINELKRTLKEPNSKLIHRDRDWDRERRLPSSPASPSPKGT 520 530 540 550 560 570 630 640 650 660 mKIAA4 AVKVEEKRG-----EEPAEPAEPE-PTEAWKDLDKSQEE----IKKHH------------ :. :. : :: ..: .:. : : :..::. .: .: mKIAA0 PEKASERAGLREGSEEKVKPPRPRAPESDMGDEDQDQERDAVFLKDNHLAIERKCSSITV 580 590 600 610 620 630 670 680 690 mKIAA4 ASISELK----------------KNFMESVPEPRPSEWDKRL-------STHSPFRTLNI .: : :. ..: .:.:: .. :.. . ..: . mKIAA0 SSTSSLEAEVDFTVIGDYHGGAFEDFSRSLPELDRDKSDSETEGLVFAQDLKGPSSQEDE 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 mKIAA4 NGQV---P------TGDGPPL--VKTQTVTISDTA--------NAVKSEIPTKDV----- .: . : : . : . ::..:.:.:. : ..:.. . : mKIAA0 SGGLEDSPDRGACSTPEMPQFESVKAETMTVSSLAIRKKIEPEAMLQSRVSAADSTQVDG 700 710 720 730 740 750 740 750 760 mKIAA4 ------------PIVHTETKTITYEAA-QTEDSNGDLDPG------------------VL : . ::: . :.: . .. . . . :: :: mKIAA0 GTPMVKDFMTTPPCITTETISTTMENSLKSGKGAAAMIPGPQTVATEIRSLSPIIGKDVL 760 770 780 790 800 810 770 780 790 800 810 820 mKIAA4 LTAQTITSETTSSTTTTQITKTVKGGISETRIEKRIVITGDADIDHDQVLVQAIKEAKEQ .. :.:: :..:::..:::::::.:::::::::.:::: :.:.::.:. :::::: : mKIAA0 TSTYGATAETLSTSTTTHVTKTVKGGFSETRIEKRIIITGDEDVDQDQALALAIKEAKLQ 820 830 840 850 860 870 830 840 mKIAA4 HPDMSVTKVVVHQETEISEE :::: :::.::..::. : : mKIAA0 HPDMLVTKAVVYRETDPSPEERDKKPQES 880 890 900 >>mKIAA0987 ( 851 res) mfk00358 (851 aa) initn: 1544 init1: 1108 opt: 1377 Z-score: 942.2 bits: 185.4 E(): 2.4e-47 Smith-Waterman score: 1379; 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