FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4021.ptfa, 957 aa vs ./tmplib.26680 library 1768060 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0264+/-0.00864; mu= -4.8195+/- 0.573 mean_var=415.4969+/-101.043, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0629 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0164 ( 763 res) mbg09610 ( 763) 860 93 1.9e-19 mKIAA1019 ( 480 res) mbg02982 ( 480) 292 41 0.00046 mKIAA0324 ( 1754 res) mbg00352 (1754) 271 40 0.0039 >>mKIAA0164 ( 763 res) mbg09610 (763 aa) initn: 601 init1: 307 opt: 860 Z-score: 441.6 bits: 92.8 E(): 1.9e-19 Smith-Waterman score: 1372; 37.042% identity (39.918% ungapped) in 791 aa overlap (179-949:1-754) 150 160 170 180 190 200 mKIAA4 SRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSTKEKKSSSKDSRPSQAAG-DNQGDEA ::....::.... ...:.. . ....: mKIAA0 KRRGSQEKQTKKAEGEPQEESPLKSKSQEE 10 20 30 210 220 230 240 250 260 mKIAA4 KEQTFSGGTSQDI----KGSESSKPWPDATTYGAGSASRASVSDLS--PRERSPALKSPL ..:: :..: :.. :. :: ..: . : : : .. : . : .:. mKIAA0 PKDTFEHDPSESIDEFNKSATSGDIWPGLSAYDNSPRSPHSPSPIATPPSQSSSCSDAPM 40 50 60 70 80 90 270 280 290 300 310 320 mKIAA4 QSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSNASQMGS-SMSGGAGYQSGAHQGQFDHGSGSLSPSKK :.: .: . .: . . . :: :...:.. : .... . : . ::.: mKIAA0 LSTV---HSAKNTPSQHSHSIQHSPERSGSGSVGNGSSRYSPSQNSPIHHIPSRRSPAKT 100 110 120 130 140 330 340 350 360 370 mKIAA4 SPVGKSP--PATG-SAYGSSQKEESAASGGAAYSKRYLEEQKTENGKDKEQ-KQTNADKE ..: . : :.. .:.: .: . ::. .:.. :. . .. .: :: mKIAA0 ITPQNAPREESRGRSSFYPEGDQETAKTG--KFLKRFTDEESRVFLLDRGNIRDKEAPKE 150 160 170 180 190 200 380 390 400 410 420 430 mKIAA4 KLKEKG-GFSDADVKMKSDPFAPKTDSEKPFRGSQSPKRYKLRDDFEKKMADFHKEELDE : .::: . .: : . : :. : .... :. :.. . .:... :.: : . mKIAA0 KGSEKGRADGDWDDQEVLDYFSDKESAKQKFHDSEGDDTEET-EDYRQ----FRKSVLAD 210 220 230 240 250 260 440 450 460 470 480 490 mKIAA4 HDKDKSKGRKEPEFDDEPKFMSKVIAGASKNQEEEKSGKWESLHTGKEKQRKAEEMEDEP . :. . . .. .. ::. ::: . :...: . . :. . :: .:. : mKIAA0 QGKSFATSSHRNTEEEGPKYKSKV---SLKGNRESDGFREEKNYKLKETAYIVER----P 270 280 290 300 310 500 510 520 530 540 550 mKIAA4 FTERSR-KEERGGSKRSESGHRGFVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPPPRKTSESRDK-LGS : ... ::: :: : .. ::. : . : . . ::: .:. ..:.: . mKIAA0 STAKDKHKEEDKGSDRITVKKEVQSPEQ---VKSEKLKELFDYSPPLHKSLDAREKSIFR 320 330 340 350 360 370 560 570 580 590 600 610 mKIAA4 KGDFSSGKSSFSITREAQVNVRMDSFD-EDLARPSGLLAQERKLCRDLVHSNKKEQEFRS . . : : ... .:...: .: ::..: ...: : :::: :::::::: mKIAA0 EESPLRIKMIASDSHRPEVKLKMAPVPLDDSNRPASL-TKDRLLASTLVHSVKKEQEFRS 380 390 400 410 420 620 630 640 650 660 670 mKIAA4 IFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIVTIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKRGNEQEAAKN ::.::. :...: :: : ::::..::::::..: : ..::.::::.: ....:..... mKIAA0 IFDHIKLPQANKSTSESFIQHIVSLVHHVKEQYFKSPAVTLNERFTSY-QKATEEHSTR- 430 440 450 460 470 480 680 690 700 710 720 730 mKIAA4 KKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLTHEELKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLDIERRKKHKE .::::::::::::::..::: : .. .: :.. : . : .::: ::.::.: : mKIAA0 QKSPEIHRRIDISPSALRKHTRLAGEERGFKEEIQKGDKKLRCDSADLRHDIDRRRK--E 490 500 510 520 530 540 740 750 760 770 780 790 mKIAA4 RDLKRGKSRESVDSRDSSHSRER-STEKTEKTHKGSKKQKKHR-RARDRSRSSSSSSQSS :. .:: :. ::.:: ::.. .: : : .: : ..::. : ::.:::::::.. : mKIAA0 RSKERGDSK---GSRESSGSRKQEKTPKDYKEYKPYKDDSKHKGRERDHSRSSSSSASPS 550 560 570 580 590 600 800 810 820 830 840 850 mKIAA4 HSYKAEEYPEEAEEREESTSGFDKSRLGTKDFVGPNERGGRARGTFQFRARGRGWGRGNY : ...: : .:::: :.. ::. : . : :::: :: :::: .:: . mKIAA0 -SPSSREEKESKKEREEEF----KTHHEMKDYSGFAGVS-RPRGTF-FRIRGRGRARGVF 610 620 630 640 650 860 870 880 890 900 mKIAA4 SGNNN--NNSNNDFQKRSREEEWDPEYTPKSKKYYLHDDREGEGSDKWMGRGRGRGAFPR .:.:. ::::. :::: .:::::::::::::::.:::::. .: : : ::::::.: : mKIAA0 AGTNTGPNNSNTTFQKRPKEEEWDPEYTPKSKKYFLHDDRD-DGVDYWAKRGRGRGTFQR 660 670 680 690 700 710 910 920 930 940 950 mKIAA4 GRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSGEEGEIEDDESGTENREEKDSLQPSAE ::::: :.::..::::.:::..:. : .:::: :: ::: mKIAA0 GRGRFNFKKSGSSPKWTHDKYQGD-GIVEDDEETMENNEEKKDRRKEEKE 720 730 740 750 760 >>mKIAA1019 ( 480 res) mbg02982 (480 aa) initn: 762 init1: 199 opt: 292 Z-score: 165.2 bits: 41.0 E(): 0.00046 Smith-Waterman score: 312; 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