FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00007.ptfa, 687 aa vs ./tmplib.26680 library 1768330 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3746+/-0.00811; mu= 3.7279+/- 0.538 mean_var=333.6016+/-81.898, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 135 in 1/35 Lambda= 0.0702 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0769 ( 769 res) mbh03536 ( 769) 672 82 2.5e-16 >>mKIAA0769 ( 769 res) mbh03536 (769 aa) initn: 1364 init1: 288 opt: 672 Z-score: 385.4 bits: 81.9 E(): 2.5e-16 Smith-Waterman score: 1434; 36.521% identity (41.106% ungapped) in 753 aa overlap (1-676:7-752) 10 20 30 40 50 mFLJ00 QPPPRKVKPAQEVKLRFLEQLSILQTRQQREADLLEDIRSYSKQRAAIEREYGQ :::::::: .::.. ::.. ::...: : :::::.:..:...:::::::.: mKIAA0 CPFSIMQPPPRKVKVTQELRNIQGEQMTKLQAKHQAECDLLEDMRTFSQKKAAIEREYAQ 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 mFLJ00 ALQKLAGPFLKRE--GQRSGE-ADSRTVFGAWRCLLDATVAGGQTRLQASDRYRDLAGGT ..::::. .:::. : .. . : :... .:. .:..:. .:.:.. . :... . mKIAA0 GIQKLASQYLKRDWPGIKTDDRNDYRSMYPVWKSFLEGTMQVAQSRINICENYKNFISEP 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 mFLJ00 GR---SAKEQVLRKGTESLQQAQAEVLQSVRELSRSRKLYGQRQRVWALAQEKAADVQAR .: : ::: :.. ...: . :.:. ..:..: ...: : . ... ..::: :..:. mKIAA0 ARAVRSLKEQQLKRCVDQLTKIQTELQETVKDLVKGKKKYFETEQMAHAVREKA-DIEAK 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 mFLJ00 LNRSDHGIFHSRTSLQKLSTKLSAQSAQYSQQLRAARNEYLLNLVATNAHLAHYYQEELP : ..:.:: :::: :.::.:. .. . . :::.:::.:.:.::: .::: .: mKIAA0 ---SKLSLFQSRISLQKASVKLKARRSECNTKATHARNDYLLTLAAANAHQDRYYQTDLV 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 mFLJ00 ALLKVLVSELSEYLRDPLTLLGHTELEAAEMILEHARHGGKATSQVNWEQDVKLFLQGPG ..:.: ... ..:.: : ...::::. . : . . . .:.: . ...:::: . mKIAA0 NIMKALDGNVYDHLKDYLIAFSRTELETCQAIQNTFQFLLENSSKVVRDYNLQLFLQENA 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 mFLJ00 VFSPTPPQQFQPAGAD------QVCGLEWGA-----------------GGMAGESGLEKE :: : :::: .: :. .: . : . : .:.:: mKIAA0 VFHKPQPFQFQPCDSDTSLKAAQLVDIELSPVSALRMTIAESRQLESETGTTEEHSLNKE 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 mFLJ00 VQRWTSRAARDYKIQHHGHRVLQRLEQRRQQAPGREAPGVEQRLQEVRENIRRAQVSQVK ...:..:.::..: : .:::..:: . . .::...:.::.::.:.. ..: mKIAA0 ARKWATRVAREHKNIVHQQRVLNELECHGVALSEQSRAELEQKIDEARESIRKAEIIKLK 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 mFLJ00 GAARLALLQEAGLDVQRWLKPAMTQAQDEVEQERRLSE-ARLSQRDLSPTAEDAELSDFD . ::: ::.. :..:. ::: ::.:...:.:.:: : :. : ::: . . mKIAA0 AEARLDLLKQIGVSVDTWLKSAMNQVMEELENERWARPPAVTSNGTLHSLNADAEREEGE 420 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 mFLJ00 ECEEAGELFEEPAP-PALATRPLPCPAHVVFGYQAGREDELTITEGEWLEVIEEGDADEW : :. ..:.. . :. . : : .::..:.:.. ::::: : : :::::.:: ..: mKIAA0 EFEDNMDVFDDSSSSPSGTLRNYPLTCKVVYSYKASQPDELTIEEHEVLEVIEDGDMEDW 480 490 500 510 520 530 510 520 530 540 mFLJ00 VKARNQHGEAGFVPERYLNFPD----LSLPESCHGIDNPS----------------GGEP :::::. :..:.:::.::.:: ::. .: ..:. : .:. mKIAA0 VKARNKVGQVGYVPEKYLQFPTSNSLLSMLQSLAALDSRSHTSSNSTEAELVSGSLNGDA 540 550 560 570 580 590 550 560 570 580 590 600 mFLJ00 TAFLARALYSYTGQSEEELSFPEGALIRLLPRA-QDGVDDGFWRGEFGGHVGVFPSLLVE .. ...:::.: ::...::::::::.::.: . :: :::::.:::.:..:::::.::: mKIAA0 SVCFVKALYDYEGQTDDELSFPEGAIIRILNKENQD--DDGFWEGEFSGRIGVFPSVLVE 600 610 620 630 640 650 610 620 630 640 mFLJ00 EL-LGPPGPPELSDPEQMLPSPSPPSFSPPAPTCALDGSTA------------PALPS-- :: . : . :. :::.: . :: : :. : :: mKIAA0 ELSASENGDTPWTREIQISPSPKPHTSLPPLPLYDQPPSSPYPSPDKRSSQFFPRSPSAN 660 670 680 690 700 710 650 660 670 680 mFLJ00 DKVL--DCPG--------PLDMMVPRLRPMRPPPPPPAKAPDPGHPDPLT .. : . :: : : .:::.: ::::.. mKIAA0 ENSLHAESPGFSQASRQTP-DTSYGKLRPVRAAPPPPTQNHRRTTEKMEDVEITLV 720 730 740 750 760 687 residues in 1 query sequences 1768330 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:06:01 2006 done: Mon Mar 27 10:06:01 2006 Scan time: 0.810 Display time: 0.050 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]