FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1914.ptfa, 835 aa vs ./tmplib.26680 library 1768182 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3741+/-0.00696; mu= 1.7939+/- 0.462 mean_var=217.6937+/-51.022, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 153 in 1/35 Lambda= 0.0869 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA3018 ( 732 res) mbg08136 ( 732) 667 97 1.1e-20 mFLJ00258 ( 663 res) mej01587 ( 663) 535 80 1e-15 >>mKIAA3018 ( 732 res) mbg08136 (732 aa) initn: 1312 init1: 516 opt: 667 Z-score: 463.4 bits: 96.5 E(): 1.1e-20 Smith-Waterman score: 1398; 34.889% identity (43.022% ungapped) in 857 aa overlap (16-835:1-732) 10 20 30 40 50 60 mKIAA1 EPIAAHTVPGMERYKALEQLLTELDDFLKVLDQENLSSAAVLKKSGLSELLRLYTKSSSS :.:.:..:: ::..::.: :.:.. ::. :...: : .::.. mKIAA3 AMEELIVELRLFLELLDHEYLTSTVREKKAVLTNIL-LRLQSSKG 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 mKIAA1 DEEYIYMNKVSVNGEQNSASPDKVPEEQGPLTNGEPSQHSSAPQKSLPDLPPPKMIPERK : :. . ..: ...: .: :: ::..: : . :. mKIAA3 FE---------VKDHAQKAEANNLP---AP------------PQMPLPEIPQPWLPPDSG 50 60 70 80 130 140 150 160 170 mKIAA1 QPTVPKIESPEGYYEEAEPFDR-------SINEDGEAVSSSYESYDEDE-NSKGKAAPYQ : .: :::::::: :.. . : :..:.:::::::::.: ..::: . .: mKIAA3 PPPLPTSSLPEGYYEEAVPLSPGKAPEYITSNYDSDAMSSSYESYDEEEEDGKGKKTRHQ 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 WPSPEASIELMRDARICAFLWRKKWLGQWAKQLCVIRDTRLLCYKSSKDHSPQLDVNLRG ::: :::..:..::.::::: ::: .:::.: ::::.::.:::::::::..::... :.: mKIAA3 WPSEEASMDLVKDAKICAFLLRKKRFGQWTKLLCVIKDTKLLCYKSSKDQQPQMELPLQG 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 mKIAA1 SSVVHKEKQVRKKGHKLKITPMNADVIVLGLQSKDQAEQWLRVIQEV----SGLPSEGAS :... .. .:: :.:::: ...: .::..:.:.::::::.::.:. :: . : mKIAA3 CSITYIPRDSKKKKHELKITQQGTDPLVLAVQGKEQAEQWLKVIKEAYSDCSGPVDPECS 210 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 mKIAA1 EGNQYTPDAQRLNCQKPDIAEKYLSAAEYGI-----TINGHPEIPETKDVKKKCSA---- . . ... . .: .:. : .: :. : ::. . . : :.. .. mKIAA3 PPPSTSAPVNKAELEKKLSSERPSSDGEGGVENGVTTCNGKEQAKRKKPSKSEAKGTVSK 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 --GLKLSNLMNLGRKKSTSLEPP---ERSLETSSYLNVLVNSQWKSRWCFVRDSHLHFYQ : :......::.:: .. : :... : .::::: ::.:. ::: :.::.: ... mKIAA3 VTGKKITKIIGLGKKKPSTDEQTSSAEEDVPTCGYLNVLSNSRWRERWCRVKDSKLILHK 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 DRNRSKVAQQPLSLVGCDVLPDPSPDHLYSFRILHNGEELAKLEAKSSEEMGHWLGLLLS :: :. . : ::.:.: . : .::.:.::.:.: :::.:::.::.:.:.::. mKIAA3 DRADLKTHLVSIPLRGCEVIPGLDSKHPLTFRLLRNGQEVAVLEASSSEDMGRWIGILLA 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 ESGSKTDPEELTYDYVDAERVSCIVSAAKTSLLLMQRKFSEPNTYIDGLPSRDCQDDLYD :.::.::: : :::.:.: . ....:: .. .:.:. mKIAA3 ETGSSTDPGALHYDYIDVEMSANVIQTAKQTFCFMNRR---------------------- 450 460 470 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 DVEVSELIAVVEPAEEAAPAVDANSGSEPDRVYLDLTPVKSFLHSSSEAQAQASLPAVPH : ..: .: : :.. :. : :. : mKIAA3 -------------AVSTSP----------------------YLGSLSNGYAHPSGTAL-H 480 490 500 580 590 600 610 620 630 mKIAA1 QDDVAETLTVDPKPGTTPEEPHTESPGDPEVQQRQPEVQESSEPIEPTPRITMVKLQAEQ ::: . . . ..: . : : : :. . : :... .: . . . .::: mKIAA3 YDDVPCV-----NGSLKNKKPPASSNGVP-VKGKAPSSQQKK--VETAGGVKRTASNAEQ 510 520 530 540 550 640 650 660 670 680 690 mKIAA1 QRISFPANCPDTMASAPIAASPPVKEKLRVTSAEIKLGKNRTEAEVKRYTEEKERLERSK : ::::.::..:: ..:.: . : mKIAA3 Y----------------------------------KYGKNRVEADAKRLQSKEEELLKRK 560 570 580 700 710 720 730 740 750 mKIAA1 EEIRGHLAQLRREKRELKETLLRCTDKGVLAKLEQTLKKIDEECRMEESRRVDLELSIME : .:..:::::.:...:. .. . . . : ::. ::...:::...:..::.::: . : mKIAA3 EALRNRLAQLRKERKDLRAAIEVNAGRKTQAALEDKLKRLEEECKQREAERVSLELELTE 590 600 610 620 630 640 760 770 780 790 800 mKIAA1 VKDNLKKAEAGPVTLGTTVD--TTHLDNMSP--RPQPKAATPNPPPDST------PVNSA ::..:::: :: :::: ... . . .:: : . .: :.. ::::: mKIAA3 VKESLKKALAGGVTLGLAIEPRSGTSSPQSPVFRHRTLENSPISSCDTSDAEGPLPVNSA 650 660 670 680 690 700 810 820 830 mKIAA1 SVLK-NRPLSVMVTGKGTVLQKAKEWEKKGAS .::: ..: : .: ::::::::: :... mKIAA3 AVLKKSQPSSGSSPCRGHVLQKAKEWELKNGT 710 720 730 >>mFLJ00258 ( 663 res) mej01587 (663 aa) initn: 1277 init1: 453 opt: 535 Z-score: 374.5 bits: 80.0 E(): 1e-15 Smith-Waterman score: 1211; 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