FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA2011.ptfa, 771 aa vs ./tmplib.26680 library 1768246 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1550+/-0.00778; mu= -13.3546+/- 0.514 mean_var=363.4791+/-89.900, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0673 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0942 ( 276 res) mbg08976 ( 276) 920 103 4.4e-23 mKIAA4240 ( 416 res) mia02001 ( 416) 386 51 2.4e-07 mKIAA4241 ( 453 res) mfj17221 ( 453) 378 51 4.4e-07 mFLJ00017 ( 408 res) msh09230 ( 408) 322 45 1.8e-05 mKIAA1110 ( 911 res) mbg05269 ( 911) 318 45 4.2e-05 mKIAA0763 ( 530 res) mbp04234 ( 530) 302 43 8.2e-05 mKIAA0248 ( 1803 res) mbg12530 (1803) 281 42 0.00085 >>mKIAA0942 ( 276 res) mbg08976 (276 aa) initn: 947 init1: 794 opt: 920 Z-score: 506.7 bits: 103.0 E(): 4.4e-23 Smith-Waterman score: 920; 59.471% identity (61.927% ungapped) in 227 aa overlap (444-665:1-223) 420 430 440 450 460 470 mKIAA2 HNIGKRMTCGDFIGNLEGLNDGGDFPRELLKALYSSIKNEKLQWAIDEEELRRSLSELAD ::::.:::::::.::.:.:: ..: :: .: mKIAA0 KALYNSIKNEKLEWAVDDEEKKKSPSEGTD 10 20 30 480 490 500 510 520 mKIAA2 P-----NPKVIKRVSGGSGSSSSPFLDLTPEPGAAVYKHGALVRKVHADPDCRKTPRGKR .::.:.:. ::...::::. .:.::::: : :.::.::: : .::::::: mKIAA0 EKANGTHPKTISRI----GSTTNPFLDIPHDPNAAVYKSGFLARKIHADMDGKKTPRGKR 40 50 60 70 80 530 540 550 560 570 580 mKIAA2 GWKSFHGILKGMILYLQKEEYQPGKALSEAELKNAISIHHALATRASDYSKRPHVFYLRT :::.:...::: .:::::.::.: :.::. .::::.:.:::::..:.:: :.:.:: :.: mKIAA0 GWKTFYAVLKGTVLYLQKDEYKPEKSLSDEDLKNAVSVHHALASKATDYEKKPNVFKLKT 90 100 110 120 130 140 590 600 610 620 630 640 mKIAA2 ADWRVFLFQAPSLEQMQSWITRINVVAAMFSAPPFPAAVSSQKKFSRPLLPSAATRLSQE :::::.:::. : :.::.::..:: :::.:::::::::..:::::::::::...:.:::. mKIAA0 ADWRVLLFQTQSPEEMQGWINKINCVAAVFSAPPFPAAIGSQKKFSRPLLPATTTKLSQK 150 160 170 180 190 200 650 660 670 680 690 700 mKIAA2 EQVRTHEAKLKAMASELREHRAAHLGKKARGKEADEQRQKEAYLEFEKSRYGTYAALLRV . . . . :: ..:: mKIAA0 TRYEIYVSVLKEGGKELLTTDGNEPVGLKKSHSSPSLNPDASPVTAKVKRNVSERKDHRP 210 220 230 240 250 260 >>mKIAA4240 ( 416 res) mia02001 (416 aa) initn: 419 init1: 386 opt: 386 Z-score: 224.2 bits: 51.4 E(): 2.4e-07 Smith-Waterman score: 386; 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