FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA4181.ptfa, 591 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1768426 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1762+/-0.00391; mu= 11.0935+/- 0.262
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 Lambda= 0.1344

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mKIAA4 RYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAESLLEAGDMLE
        ::.:::.. . : ...:. ... . : .:: :...::.. . :...:..::: ....:.
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mKIAA4 FQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIRKNEDFLQL
       .:.:.:::  ::.. ::: ::::.  .... .:. ::. .  .  ..:  .  .:.:: :
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mKIAA4 PQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAMNWISYDLKKRYCYLPELLQTVRLALLPAIYLME
       : . :..:.: .::....:. :.:.:. :. :: ..:   :::::...:: :    .: .
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mKIAA4 NVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLCARPR---KTGHALFLLGGQTF
        : ...:.   .: ...:.::   .: . .    . .. .:::   . .  .. .:: . 
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mKIAA4 MCDKLYLV---DQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGSENGVSKDVWVYD
         :.: .:   :  :..      . . :.. .. ...  .:  ::  ..  .:  : .:.
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mKIAA4 TLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPASPSVSLKQVEQYDPTTN
          . :.... :   : . :.. :   .:: ::. . .         ::..:: :.: :.
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mKIAA4 KWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKL---PKVQCYDQCENRWSVPATCP
       :::.:.:.  . : :.:.  . .... ::    :: :    .:. :..    :   :.  
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       .     .:: ::...:. :: :       :  ..: . ::  .  . ..:     ::: .
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mKIAA4 KLYVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS
       .::.:::: : .  .... :::  : :.                       
mKIAA0 RLYAVGGYDGQSNLSSVEMYDPETDRWTFMAPMACHEGGVGVGCIPLLTI 
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mKIAA4 VLLHAGNRTFPCHRAVLAACSRYFEAMFSGGLKES-QDSEVNFD---NSIHPEVLELLLD
       . . . .: :  :. :::.:: ::. ... ....: :.:. ...   .... .::::::.
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mKIAA4 YAYSSRVIINEENAESLLEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTK
       ..:.. ..:.  ::..::::.. ..:. .  .:. ::::.:  .::::.: ...: ::..
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       ::...  . :. :  .  .:..:.. .:  .  .:.. :.:. :.::::....::. :  
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mKIAA4 KRYCYLPELLQTVRLALLPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVV
        :  :  ::: .::: ..   ::.. :  :::: ...  ...:.:: : ..     . . 
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mKIAA4 TSLCARPR-KTGHA--LFLLGGQTF--MCDKLYLV----DQKAKEIIPKADIP-SPRKEF
       :   .::: ..: :  . :.::. .  : ..  ..    . . ..  : :..:   :. :
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mKIAA4 SACAIGCKVYITGGRGSENGVS-KDVWVYDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYV
       :. . : ..:..::   :.::.  ::: : .: ..:. .. : : :  :.:      .:.
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mKIAA4 VGGHTAATGCLPASPSVSLKQVEQYDPTTNKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGT
       .::  .:          .. .::.::  ::.:  :::: ..: .::..    :...:::.
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mKIAA4 SVSHDKLPKVQCYDQCENRWSVPATCPQPWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFN
       . .      .: :    : ::   .     .:. :..:.. .::.::        ::   
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mKIAA4 SETYQWTKVGDVTA------KRMSCHAVASGNKLYVVGGYFGIQ--RCKTLDCYDPTLDV
       .  :.  : :.. :      .:. : ::.  .:.:..::  . .     ... :.:: ..
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       :. .  .:  ..  . :   :.. : 
mKIAA1 WTLLPHMPCPVFRHGCVVIKKYIQSG
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mKIAA4        NKMSVSVHENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHL-NLLRQQRLFTDVLL
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mKIAA4 PGLPPDPPRTSNSSQTLSSCQAMEPCSSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQL-CDVIL
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mKIAA4 HAGNRTFPCHRAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRV
        ::.: .: :: ::.. : :: :::.. ..:... :..... ..:. :  :..:::..:.
mKIAA4 VAGDRRIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEG-VEPNSLWSLIQYAYTGRL
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mKIAA4 IINEENAESLLEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWR
        ..:.: : :: .. .:..... .:: .:: :.:::.::::.  ..::. :: :....  
mKIAA4 ELKEDNIECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHN
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mKIAA4 MCLSNFQTIRKNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAMNWISYDLKKRYCYLP
       . . .:. . .:..:. :: . ...::.:....  .:. . .. ..:. .::..:   : 
mKIAA4 YTMEHFMEVIRNQEFVLLPANEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLS
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mKIAA4 ELLQTVRLALLPAIYL--MENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLCA
       .::  .:: ::   .:  ::: :   :.  . . .... ::.. .: . .   .. :  .
mKIAA4 RLLAYIRLPLLAPQFLADMENNA---LFRDDIECQKLIMEAMKYHL-LPERRPMLQSPRT
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mKIAA4 RPRK-TGHALFLLGG--QTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYIT
       .::: :  .:: .::  .:    ..   : ...   : :.. . : .:.. ..  :.:..
mKIAA4 KPRKSTVGTLFAVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYVV
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mKIAA4 GGRGSENGVSKDVWVYDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPA
       ::: . . ..  :  :.   . ::   :: . : : : : :.  .:.:::: . .     
mKIAA4 GGRDGLKTLNT-VECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWS-----
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mKIAA4 SPSVSLKQVEQYDPTTNKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQCY
            :. ::..:: . .:..:: .    :...:.  . ::.: :: . : . : .:.:.
mKIAA4 ----YLNTVERWDPQARQWNFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGS-SCLKSVECF
           470       480       490       500       510        520  

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mKIAA4 DQCENRWSVPATCPQ--------PWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQ
       :   :.:.. :   .         :     :. :..    .  ...: : . ... .:  
mKIAA4 DPHTNKWTLCAQMSKRRGGVGVTTWNGLLYAIGGHDAPTSNLTSRLSDC-VERYDPKTDV
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mKIAA4 WTKVGDVTAKRMSCHAVASGNKLYVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIP
       :: :......: .  .   :.:::.:::: :    . .. :::  . :....        
mKIAA4 WTAVASMSVSRDAVGVCLLGDKLYAVGGYDGQTYLNIVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAG
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mKIAA4 TAFVSTWKHLPS
                   
mKIAA4 ACVVTVKI    
                   

>>mKIAA1490  ( 758 res)   mbp00060                        (758 aa)
 initn: 777 init1: 351 opt: 692  Z-score: 727.7  bits: 145.0 E(): 2.2e-35
Smith-Waterman score: 832;  29.174% identity (30.577% ungapped) in 545 aa overlap (39-573:214-743)

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mKIAA4 ENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCHRAVLAA
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        : :: :::.. . :... :..... : :..:  :...::.. . ..:.. :.:: :. .
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        :: . . .::.:..... ::. .... : :..::...:   :  ::  .:: :::   .
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       . ..  . :. .. . .... ::.. .: . .   .. :  ..::: :  .:. .::  .
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mKIAA4 TFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGSENGVSKDVWVYDT
       .     .   : ...  :  . . . : .:.. .:  :... ::: . . ..  :  :. 
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         . :.   :: . : : : . :.  .:.:::: . .          :. ::..:: ...
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       ::.:: .  . :...:.. . ::.. :: . : . : ... ::   :.::. :  : .  
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          .:.  :    . : :.  :  ::     . ... .:  :: :. ..  : .  .   
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mKIAA4 GNKLYVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS
       :..::.:::: :    .:.. :::  . :......                  
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        :  : :.::    ::.:  ::    .. .    :..:.     .:  :.:  .:.::: 
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mKIAA4 GSENGVSKD-VWVYDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPASP
        :...   : :: :..  .::...:::: ::  :.:. :   ::::.. ..         
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mKIAA4 CENRWSVPATCPQ--PWRYTAAAVL--GNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGD
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       ..  ...   .. :.:::: ::: . ..   ... :::   .:. .  .:   .  . ::
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        ....                                   
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 initn: 516 init1: 173 opt: 617  Z-score: 650.0  bits: 130.4 E(): 4.6e-31
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       . ..:. :::.. ..  : . .::.. .:..  . : : :.::...   : : .  :.. 
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       ..  .:  .   . ::.:.:.  . ::::    : . : : :: ... . :  . . :..
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mKIAA4 WISYDLKKRYCYLPELLQTVRLALLPAIYLMENV--AMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKL
       :.. .  .:  .  ..:...:. :.:   :.. :  ::  :. .. ... .::::..   
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mKIAA4 KILQNDGVVTSLCARPR---KTGHALFLLGGQ-TFMC-----DKLYLVDQKAKEIIPKAD
          .:. :.  .    :   .. . :...::. .  :     :  :: : : .. . ...
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mKIAA4 IPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGSE----NGVSKDVWVYDTLHEEWSKAAPMLVARFGH
       .:. :..  . ..:  ..:.::  :.    :..:. .. ::  ...: :.: :   :   
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         : ..  : .:::..  .:        .:..:: :.: ::.::.:: : :   ..:...
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mKIAA4 SAKLKLFAFGGTSVSHDKLPK-VQCYDQCENRWSV--PATCPQPWRYTAAAVLGNQIFIM
          . ..  :: . .     : . :::.  . :    : :  . :.   .  ::..:. .
mFLJ00 YKDF-VYISGGHDYQIGPYRKNLLCYDHRTDVWEERRPMTTARGWHSMCS--LGDSIYSI
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mKIAA4 GGDTE-------FSACSAYKFNSETYQWTKVGDVT-AKRMSCHAVASGNKLYVVGGYF--
       ::. .       :.. ..  .. .  :::.:. .  :.  :  :: .: ..:..:::   
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mKIAA4 GIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS                
       .    .... ::   . :.    .: ..                              
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                                  . :: :.: .:.:. .:.::::..: . .  ::
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       ::. :::.:: ::.::: .::.::....:.. : .   .:.... :::.. . .:. ..:
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       .: :.. .:. .:. . : :.: :...  ::. .: ..:  .: .: . . ::   .: .
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       . ..: :.:: .:.....:::..:..: :. : :.:: :. :. ..:  ::  .:. .:.
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         :  .    . :  . .  . ::  .:.   .   :...    .:       :    .:
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       . ...   :.    :  . .:...     : ::.   .:  .. .    .::.::    .
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       ..... ::               : .:. .. :   .::: .:   . .  .  .:..::
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        ... : :      . . ::.::   ..::::.::  . . .:.: ..  ....      
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          :  . ::    . :   :       ...::..:..:: .::               .
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mKIAA4 EFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAKRMS--C-HAVASGNKLYVVGGYFGI-QRCKTLDC
       . :. ..  .. .  .:  .... :::.:  : .::. .:.: :      . .: : .  
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mKIAA4 -YDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS                           
        ::  :: :.                                                  
mKIAA1 QYDLELDRWSLRQHISERVLWDLGRDFRCTVGKLYPSCLEESPWKPPTYLFSPDGTEEFE
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mKIAA4 RAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAESL
       ..:::. :  :.:::..::.: :  ::   ..:::.:.: :...::.. . ..:. .  .
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mKIAA4 LEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIR
       .... : .....  ::..:: ..: :.: .:.  ...   ::.:.. . ..   .:  . 
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       :.:.:..: . ... :.: ..:... :  :... ..:..::  .:  :.  ::..::   
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       :   .:. ..   :..  . . :. . . .. .: . .   .:   :  : :.:. ..  
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        . .        ... :: : :.  :: : . .  :. ... ::  :: :. .  .: . 
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mKIAA0 DQQNCTC
              




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Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]