FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1148.ptfa, 1589 aa vs ./tmplib.26680 library 1767428 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1171+/-0.00921; mu= -8.6233+/- 0.610 mean_var=527.8417+/-127.728, 0's: 0 Z-trim: 20 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0558 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1728 ( 1313 res) mbg03474 (1313) 3494 297 1.3e-80 mFLJ00246 ( 1454 res) mpm02140 (1454) 416 50 5.7e-06 mKIAA1223 ( 600 res) mfj51380 ( 600) 400 48 8e-06 mKIAA1250 ( 1693 res) mbg07525 (1693) 356 45 0.00018 mKIAA1306 ( 1347 res) mbg04314 (1347) 314 41 0.0016 mKIAA1334 ( 992 res) mpm09174 ( 992) 304 40 0.0023 mKIAA0379 ( 377 res) mtj01105 ( 377) 288 39 0.0031 mKIAA1977 ( 649 res) mph01546 ( 649) 294 39 0.0031 mKIAA0946 ( 465 res) mbx00001 ( 465) 290 39 0.0032 mKIAA1785 ( 617 res) mph01357 ( 617) 279 38 0.007 mFLJ00040 ( 638 res) mpm09196 ( 638) 274 38 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:.: :: . : ... : : :.. mKIAA1 LSGPAEAGAAAVEKSSNHLPPTPRTTSRESSLSGRARHISSSQELLGDGP-PGPGSPMSR 590 600 610 620 630 640 1200 1210 1220 1230 1240 1250 mKIAA1 PQQGLR---LQPAKA-QIVRSNQPSSAVHSSTVIPT-GAYGQVAHSMASKYQSSQGDMGV :. : . :. . :::.. . .:. ..: :. : :: : ::.. : . mKIAA1 SQEYLLDEGMAPGTPPKEVRSSRHGHSVKRASVPPVPGKPRQVLPSGASHFTPPQTPTKA 650 660 670 680 690 700 1260 1270 1280 1290 1300 1310 mKIAA1 SQ-SRLVYQGSIGGIVGDGRPVQHVQASLSAGAICQHGGLTKEDLPQRPSSAYRGGMRYS . : . : : .. .:. .. . .. ..::: :. .:: mKIAA1 QPGSPQALGGPHGPATAKVKPTPQLLPPTDRP-------MSPRSLPQSPT--HRGFAYVL 710 720 730 740 750 1320 1330 1340 1350 1360 1370 mKIAA1 QTPQIGRSQSASYYPVCHSKLDLERSSSQLGSPDVSHLIRRPISVNPNEIKPHPPTPRPL : :. . :. : : . : : : .: :. mKIAA1 PQPVEGEVGPPAPGPA---------------PPPVPAAV--PTLCLPPETDVEPGRPKKR 760 770 780 790 1380 1390 1400 1410 1420 mKIAA1 LHSQSVGLRFSPSSNSISSTSNLTPTFR-PSSSIQQ-------MEIPLKPAYDRSCDELS :: . :.. :.. :.:. : ...:. .. : . . .. mKIAA1 AHSLN---RYAASDSEPERDELLVPAAAGPYATVQRRVGRSHSVRAPAGTDKNVNRSQSF 800 810 820 830 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:: :. :. . .: ::. :. :.: .. .. : .:. :: : mKIAA0 QHGAKCLLRDSRGRTPIHLSAACGHIGVLGALLQSATSVDANPAVV--DNHGYT-ALHWA 40 50 60 70 80 590 600 610 620 630 640 mKIAA1 ASMGYTEIVSYLLDLPEKDEEEVERAQINSFDSLWGETALTAAAGRGKLDVCRLLLEQGA :. : :: :.: .. . :.:. : .... : ... . : :: mKIAA0 CYNGHETCVELLL---EQDV--FQKIDGNAFSPL-HCAVINDNEGAAEMLIDSL----GA 90 100 110 120 130 650 660 670 680 690 700 mKIAA1 AVAQP-NRRGAVPLFSTVRQGHWQIVDLLLTHGADVNMADKQGRTPLMMAASEGHLGTVD .... . .: .:: ... : . ..:::...:.:: ::. :.::::::: .:. .::. mKIAA0 SIVNATDSKGRTPLHAAAFTDHVECLQLLLSQNAQVNSADSTGKTPLMMAAENGQTNTVE 140 150 160 170 180 190 710 720 730 740 750 mKIAA1 FLLAQG-ASIALMDKEGLTALSWACLKGH----LSVVRSLVDNG--AATDHADKNGRTPL .:.... :...:.:: ::: :: ::: : ......: . ::. : . ::: mKIAA0 MLVSSASADLTLQDKSKNTALHLACGKGHETSALLILEKITDRNLINATNAALQ---TPL 200 210 220 230 240 250 760 770 780 790 800 810 mKIAA1 DLAAFYGDAEVVQFLVDHGAMIEHVDYSGMRPLDRAVGCRNTSVVVTLLKKGAKIGCQTL .:: : . ::: :. .:: . :: .:. : :..: .. :. : : : . mKIAA0 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