FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00034.ptfa, 1255 aa vs ./tmplib.26680 library 1767762 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.6751+/-0.0108; mu= -30.7289+/- 0.712 mean_var=727.9550+/-175.386, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.0475 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1542 ( 1085 res) mpg00592 (1085) 478 49 7e-06 mKIAA3013 ( 1461 res) mpm01086 (1461) 425 45 0.00011 mKIAA0324 ( 1754 res) mbg00352 (1754) 372 41 0.0015 >>mKIAA1542 ( 1085 res) mpg00592 (1085 aa) initn: 704 init1: 411 opt: 478 Z-score: 197.9 bits: 48.6 E(): 7e-06 Smith-Waterman score: 692; 25.717% identity (30.235% ungapped) in 1151 aa overlap (143-1231:39-1079) 120 130 140 150 160 170 mFLJ00 SRLDLQPGESEDMLELVAEVRIGDRDPMPLPVPSLFPRLRAWRTGKTVSPQSHASRPACS : :. .: : .: :. .. : .:. mKIAA1 LLSDFCFLAPVSLQRNSVTQSREESRLRDNPQPGALPSESA--SGGFVGDRQPNSGLSCG 10 20 30 40 50 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:.:.. mKIAA0 TGSG-TPPTAANY-PSSSRTPQAPTPANLVVGPRSAHGTAPVNIAGSRTPAGLAPTNLSS 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1255 residues in 1 query sequences 1767762 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:06:14 2006 done: Mon Mar 27 10:06:16 2006 Scan time: 1.210 Display time: 0.350 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]