# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mfj27008.fasta.nr -Q ../query/mFLJ00034.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mFLJ00034, 1255 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7884606 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1648+/-0.000232; mu= 7.3347+/- 0.013 mean_var=248.5923+/-47.148, 0's: 31 Z-trim: 104 B-trim: 0 in 0/67 Lambda= 0.081345 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|81883604|sp|Q5U4C3.1|SFR19_MOUSE RecName: Full= (1256) 8469 1008.4 0 gi|148690840|gb|EDL22787.1| expressed sequence AI4 (1258) 8460 1007.4 0 gi|158564335|sp|Q63624.2|SFR19_RAT RecName: Full=S (1258) 8261 984.0 0 gi|1438532|gb|AAC52657.1| rA1 gi|9507017|ref|N (1173) 7585 904.7 0 gi|149055997|gb|EDM07428.1| CTD-binding SR-like rA (1022) 6655 795.4 0 gi|194675326|ref|XP_001253211.2| PREDICTED: simila (1358) 3986 482.4 8.3e-133 gi|73947956|ref|XP_541491.2| PREDICTED: similar to (1132) 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April 26, 2007]