FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1095.ptfa, 1052 aa vs ./tmplib.26680 library 1767965 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9512+/-0.00641; mu= 14.9602+/- 0.425 mean_var=190.5261+/-45.298, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 152 in 1/35 Lambda= 0.0929 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA3027 ( 499 res) mbk00729 ( 499) 1122 163 8e-41 mKIAA0147 ( 1694 res) mbg04389 (1694) 234 45 0.00011 mKIAA1232 ( 950 res) mbg05359 ( 950) 222 43 0.00024 mKIAA4187 ( 562 res) mpm05138 ( 562) 213 42 0.00041 >>mKIAA3027 ( 499 res) mbk00729 (499 aa) initn: 1267 init1: 557 opt: 1122 Z-score: 825.2 bits: 163.3 E(): 8e-41 Smith-Waterman score: 1872; 60.271% identity (63.211% ungapped) in 516 aa overlap (542-1052:3-499) 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 LHMDMLEEQHHQAMQFTASVLQQKKHEEDGGTTDTATILSNQHEKDSGVGRTDESTRNDE ::::::: ::..:::::::::::: :::: mKIAA3 EEGTTDTATSSSNNQEKDSGVGRTDESLRNDE 10 20 30 580 590 600 610 620 630 mKIAA1 SSEQENNGEDATASANPLAGQRKLTCSQDTLGSGDLPFSNESFISADCTDVDYLGIPEDE :::::: :. ... : ..:.: ::::::: . : :: ...: : : . : mKIAA3 SSEQENAVEEPHSTT--LKSKRELGKSQDTLGSLEHQCS-ESCAGGECLDSDCASNQE-V 40 50 60 70 80 640 650 660 670 680 690 mKIAA1 CERFRELLELKCQVQSASPYSLYYPSSPLDAAGKSDPESVDKELELLNEELRSIELECLS :: :..::::: ... . :.::: :: .. .... ..:..::.:::::::.::::: . mKIAA3 CEGFQQLLELK--IRNHGDYDLYYSSSTIEC-NRGEQDGVEHELQLLNEELRNIELECQN 90 100 110 120 130 140 700 710 720 730 740 750 mKIAA1 IVRAHKMQQLKEQYRESWMLHHSGFRNYNTSVDVRRHELSDITELPEKSDKDSSSAYNTG :..::..:.. .:: . : :: .::::::::.::.: .:.:: : ::::::::::::::. mKIAA3 IMQAHRLQKVTDQYGDIWALHDGGFRNYNTSLDVQRGKLDDIMEHPEKSDKDSSSAYNTA 150 160 170 180 190 200 760 770 780 790 800 810 mKIAA1 ESCRSTPLTLEISPDNSLRRVAEGSSEGATANIEAYRPSPKNLLAITEDPEVSTPSYNPS :::::::::.. :::.:: :. . ... .. . . :: :. :: :. . mKIAA3 ESCRSTPLTVDRSPDSSLPRMINLTNKKNLRSMMTAHQSP---------PRQSTREYTST 210 220 230 240 250 820 830 840 850 860 mKIAA1 -AKELDPSQALEIKERRGSDGSR--SPTASPKLGNAYLPSYHHSPYKHAHIPAHAQHYQS .: : . ..: :. : ..:. . . . :: :: : :..:.:::::.:::: mKIAA3 KVKATDEGCSVESLEK-GLESSQLLDQEHTVSEHPPYLSPYHSSSYRYANIPAHARHYQS 260 270 280 290 300 310 870 880 890 900 910 920 mKIAA1 YMHLIQQKSAVEYAQSQMSLVSMCKDLNSSNSVEPRMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRL ::.::::::::::::::.:::::::. :. . ::.:::::::::::::::::::::::: mKIAA3 YMQLIQQKSAVEYAQSQLSLVSMCKE--SQRGSEPKMEWKVKIRSDGTRYITKRPVRDRL 320 330 340 350 360 370 930 940 950 960 970 980 mKIAA1 LRERALKIREERSGLTTDDDAMSEMKMGRYWSKEERKQHLVKAKEQRRRREFMMQSRLDC :.::::::.:::::.:::::.::::::::::::::::::::.::::::::::::.:::. mKIAA3 LKERALKIKEERSGMTTDDDTMSEMKMGRYWSKEERKQHLVRAKEQRRRREFMMRSRLES 380 390 400 410 420 430 990 1000 1010 1020 1030 1040 mKIAA1 LKE--QQASDDRKEMNILELSHKKMMKKRNKKIFDNWMTIQELLTHGTKSPDGTRVYNSF ::: :.... .::..:.:::::::::::::::.:::::::::.:::.::::::::.:.: mKIAA3 LKESPQSSGEGKKELSIIELSHKKMMKKRNKKILDNWMTIQELMTHGAKSPDGTRVHNAF 440 450 460 470 480 490 1050 mKIAA1 LSVTTV :::::: mKIAA3 LSVTTV >>mKIAA0147 ( 1694 res) mbg04389 (1694 aa) initn: 355 init1: 172 opt: 234 Z-score: 176.6 bits: 45.0 E(): 0.00011 Smith-Waterman score: 315; 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