FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA4239.ptfa, 1059 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1767958 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.6550+/-0.0105; mu= -13.6343+/- 0.697
 mean_var=682.4579+/-163.673, 0's: 0 Z-trim: 18  B-trim: 0 in 0/36
 Lambda= 0.0491

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The best scores are:                                       opt bits E(2168)
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        .. : . :.  .    . .: .  .:...:  .. .   .   :. :.: .   :.:. 
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       :  : :.   .: .   : :. : .   :  ...   :: . . .: : .   : . .: 
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          . .. . .    :  :  .. . .. ::. .:. :: .:. .. . . .:  . : .
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       :   . .    :   .::   :.:    :  : ... .: . :...  .  : :. .  .
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         :   : :. :  :    ..  . :.    :...:: .. .:..   :  : .  :  :
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       : : .:.: .: ..  .:.:.: .... . ..::...   :.:...::.: . ..::: .
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       . .:.:.. ..:.  . . : :.. :::. ..   ::: :.: .:: : .: ::.:: : 
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       : :   .  :. .   :. .: .. :  .:     :::         ::. : :    .:
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       :   . : ..: . .:  :    :     :....: . :   .: . .    ::     :
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        .: :      . .  .. ...: .:.   . . :   :.:     ::  .::   :.  
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        :   ::.. .: . :   : :  : .:  .  :    :. .  :          ::  :
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       :: . ::  .   : :..:            .:  :..  ::        .::.     .
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        ...::    ... :           ... :: :.   :::.   :.   : . .. :. 
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           :.... ::.:::..:::::. :. :.  : .   : ::......  :    .. .:
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       .  .  ::..   ::  .:  ::.:. .  .  :...::.      .. .. .. .::: 
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mKIAA4 VELVNTWTERSTQFKVIIHEVQKEEACGNLTLQHHMLEPVQRIPRYELLLKDYLLKLPHG
       . :.      : .. . ..: ..    :. ...:.::. :::. .:..:: ::: .:   
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       : .  ..:..: ::. .....: .... : ..::...   . :. :...: .:..::: .
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mKIAA4 LKLSAKNGTTQDRYLILFNDRLLYCVPRLRLLGQKFSVRARIDVDGMELKESSNLNMPRT
       ... .:  . . :.:.:.:: :::  :.      :. ... . : .:....    ..: .
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mKIAA4 FLVSGKQRSLELQARTEEEKKDWVQAINSTLLKHEQTLETFKLLNSTNRDDEDTPPNSPN
       . .   .  : :.: .  :. .:   .. .: .  .:     . .:..  ..       .
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       ..::.: :: .   .. ::: :   : :.: :::::.:::..:: .::. .  :   .::
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         .::  :.  :   .: .:::    :                       . :  : ...
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       ...    . :::  :.:.: ..:   ..: . :.: :.:.  .   ::: : : .:  :.
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       .:.::.:: ..: .     .   ::.. ...  .: :. :  .  .::: ..        
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mKIAA4 FCPGPTLSEDKEMEETPVAASGATAEPPEASQTRDKT

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       . .  ....  . :. .:::: .:   :..::   ::  .. : .   ..:... :.   
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       . .: :: .: ..:    ::: .. . :.  .. ..   .:     .. :. ..: :.::
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       : :  ....   ::. .:..::.::  :. :.: ..::.. :.::  . :. :.: :.  
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                  :.::... ::...         :.. ..   . .  ..:.. .  .:.:
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        :::. :..:    :.....  :..::                                 
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       ....:. :. ::  : . : .  :    :  .... ..:.   . .:.  :..:::::::
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       ::::.:: : . :.  ::     :::.... .:   ...  . .. ::  ..:.  :  .
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        : ::. .: ......  .....: .:  .:: :.::.: :. :.   :  :.       
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Smith-Waterman score: 339;  27.324% identity (30.124% ungapped) in 355 aa overlap (441-781:145-480)

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mFLJ00 EDKEAWFPASFVRLRVNQEELPENCSSSHGEEQDEDTSKARH------KHPESQ----QQ
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          .. .:...::..:..  :: :  .:   ... :.... : .  .  ::.:: .:: :
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       ...::  .:::.. .:  .  .::. . .    . .:.:: .:   : ::: :    . .
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        . ..:   :   ::.: . :. .    . : :  ::.. ..:::. :.. :.. ..: .
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       :.: ..::. .:. :   : :  . .  ..:.:.: .:: .  .       :..  .: :
mFLJ00 QQRIFFLFDHQLVSCKKDL-LRRDMLYYKGRMDMDEVELVDVEDGRDKDWSLSLRNAFKL
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mKIAA4 VSGKQRSLEL-QARTEEEKKDWVQAINSTLLKHEQTLETFKLLNSTNRDDEDTPPNSPNV
       ::     ..:  :: .:.:  :.::                                   
mFLJ00 VSKATDEVHLFCARKQEDKARWLQAYADERRRVQEDQQMGMEIPENQKKLAMLNAQKAGH
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>>mKIAA4037  ( 919 res)   mfj00669                        (919 aa)
 initn: 207 init1: 131 opt: 335  Z-score: 150.4  bits: 39.3 E(): 0.0031
Smith-Waterman score: 341;  22.996% identity (24.661% ungapped) in 474 aa overlap (454-921:451-898)

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mKIAA4 ADPHRPGSQEVDSDLEEEEEEEEEEKEREIPVPPMERQESVELTVQQKVFHIANELLQTE
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