FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1562.ptfa, 1135 aa vs ./tmplib.26680 library 1767882 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9710+/-0.00522; mu= 12.4405+/- 0.350 mean_var=131.1733+/-30.298, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1120 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0345 ( 962 res) mbg19517 ( 962) 1524 258 3.7e-69 mKIAA1400 ( 1098 res) mbh01141 (1098) 1420 242 4.6e-64 mKIAA1313 ( 969 res) mbh01521 ( 969) 1388 236 1.5e-62 mKIAA0327 ( 933 res) mfj34062 ( 933) 968 169 4e-42 mKIAA1621 ( 810 res) mbg08078 ( 810) 803 142 3.8e-34 mKIAA0811 ( 1654 res) mbg07446 (1654) 439 83 3.1e-16 mKIAA1775 ( 918 res) mbg01642 ( 918) 267 55 4.9e-08 >>mKIAA0345 ( 962 res) mbg19517 (962 aa) initn: 1303 init1: 678 opt: 1524 Z-score: 1334.0 bits: 258.5 E(): 3.7e-69 Smith-Waterman score: 1524; 35.497% identity (36.813% ungapped) in 755 aa overlap (12-753:29-769) 10 20 30 40 mKIAA1 PMHQMNTKMHFRFALALLMAFFSHDVLAKNLKYRIYEEQRVGS : : :. : . .. . .:.: . :: . :. mKIAA0 KYLRNFGSAREQPNIRKGLAMVFSQREDRHLLLWLLLFAAWEAGSGQLHYSVPEEAKHGT 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 mKIAA1 VIARLSEDVADVLLKLPNPSAVRFRAMPRGNSPLLVVNENTGEISIGAKIDREQLCQKNL ..:...:.. : .: : : . ::. :: :: ..: . ....::::.:: .. mKIAA0 FVGRIAQDLGLELAELV-PRLFRVASKDRGD--LLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRSA 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 mKIAA1 NCSIEFDVLTLPTEHLQLFHIEVDVLDINDNSPQFSRPVIPIEISESAAVGTRIPLDSAF .:::...:.. . ::.::.::.: ::::: : : . . : :: .:.:. :..: mKIAA0 ECSIHLEVIV--DRPLQVFHVEVEVRDINDNPPVFPVATKNLFIYESRPLGSRFSLEGAS 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 DPDVGENSLHTYSLSANDYFNIEVRTRTDGAKYAELIVVKELDRELKASYELQLTASDMG : :.: ::: .:::....::...:. . . : :.. : :.:: ..: .:: : : mKIAA0 DADIGTNSLLSYSLNSSEYFSLDVKRKDEEIKSLGLVLKKLLNREDIPEHNLLITAVDGG 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 VPQRSGSSILKISISDSNDNSPAFEQPSYTIQLLENSPVGTLLLDLNATDPDEGANGRIV :. .:.. .::.. : :::.::::. : ..: ::.: ::...:..:.: :::.: :: mKIAA0 KPELTGTTQVKITVLDVNDNAPAFEKTFYKVRLPENAPNGTVVVDVDASDLDEGVNKDIV 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 mKIAA1 YSFSSHVSPKIIETFKIDSEKGHLTLFKPVDYEITKSYEIDVQAQDLGPNSIPAHCKIII ::: . .: .:. :..: .:..:. .:.: :::.::...: : : . :: ... mKIAA0 YSFHQDMSLEILSKFHLDPISGYITVKGNIDFEETKSFEIQIEAADKGTPPMTDHCTVLV 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 mKIAA1 KVVDVNDNKPEISINLMS-PGKEEVSYVFEGDPIDTFVAIVRVQDKDSGLNGEIICKLHG ..:::::: ::. :. .: : :.:.. .: .:.. :.:.::: ::.. :.: mKIAA0 EIVDVNDNVPELVIKSLSLP-------VLENSAPSTVIALISVSDRDSGANGQVTCSLTP 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 mKIAA1 HGHFKLQKTYENNYLILTNATLDREKRSEYSLTVIAEDKGTPSLSSVRHFTVQINDINDN . ::: .:..: : .. ...:::: :.:...: :.: :.: : .. .:.. :.::: mKIAA0 QVPFKLVSTFKNYYSLVLDSVLDRETISNYNVVVTARDGGSPPLCTTASVSVEVADVNDN 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 mKIAA1 PPRFQRSRYEFVISENNSPGAYITTVTATDPDLGENGHVTYTILESFVLGSSITTYVTID : : . .: ..::: :::.: ::.: : : ::. :.:...: : ...::.. mKIAA0 APAFAQPEYTVFVKENNPPGAHIFTVSAMDADAQENALVSYSLVERRVGERLLSSYVSVH 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 mKIAA1 PSNGAIYALRIFDHEEVSQITFVVEARDGGSQKQLSSNTTVVLTIIDENDNVPVVIGPAM .: ..::. .::::. . : : :::.: :.::.:. . ..:::::.:...:: mKIAA0 AESGKVFALQPLDHEELELLQFQVSARDAGVPA-LGSNVTLQVFVLDENDNAPTLLGPHA 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 mKIAA1 HNNTAEISIPKGAESGFHVTRIRVVDRDSGANAEFSCSIVS--GNEENIFIMDPRSCDIH . ..:. . . . .: ::..:.:: ::: :: .: . : :. . : . . .: mKIAA0 GSAVSEL-VSRTVGAGHVVTKVRAVDADSGYNAWLSYELQSAAGSGRLPFRVGLYTGEIS 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 mKIAA1 TNVSMESIPSTEWALSVIIQDKGSPPLH-TKVLLRCMVFD--YAESVTSTAMTSVSR-AS :. .. . . : :...:.: : : : .:: .: . .. . : . :..: :: mKIAA0 TTRVLDETDAPRQRLLVLVKDHGEPVLTATATLLVSLVESGHTPNTPSRTLVDSAGREAS 650 660 670 680 690 700 700 710 720 730 740 750 mKIAA1 L-DVSMIIIISLGAICAVLLVIMVLF-ATRCNREKKDTRSYN----CRVAESTYQHHPKR : :... .::.. :. ..:.. ..:. : ::. . . : : .:... .: mKIAA0 LVDINVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYLALRCSTAPTEGGPGKPMLVCSSAVGTWSYSQQR 710 720 730 740 750 760 760 770 780 790 800 810 mKIAA1 PSRQIHKGDITLVPTINGTLPIRSHHRSSPSSSPTLERGQMGSRQSHNSHQSLNSLVTIS .: mKIAA0 RQRVCSGEGPPKTDLMAFSPSLTPCPVNQDKEDKLVGDIDFSIKPRQPNPDWRYSASLRA 770 780 790 800 810 820 >>mKIAA1400 ( 1098 res) mbh01141 (1098 aa) initn: 1379 init1: 682 opt: 1420 Z-score: 1242.5 bits: 241.7 E(): 4.6e-64 Smith-Waterman score: 2255; 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