FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA1562.ptfa, 1135 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1767882 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9710+/-0.00522; mu= 12.4405+/- 0.350
 mean_var=131.1733+/-30.298, 0's: 0 Z-trim: 7  B-trim: 0 in 0/36
 Lambda= 0.1120

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 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
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       : :... .::.. :. ..:.. ..:. : ::.    .    .    :  : .:...  .:
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        : .  :   .. :.    :  ... .:        . . . :.  ..  :    :.:. 
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       :..... ..: : :.::   ::::... : ..:.:::.: .. :.. .. .   :.. :.
mKIAA0 EKIQDLQLLVIATDSGSPP-LSSNVSLSLFVLDQNDNAPEILYPSFPTDGSTGVELA-PR
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mKIAA1 GAESGFHVTRIRVVDRDSGANAEFSCSIVSGNEENIFIMDPRSCDIHTNVSMESIPSTEW
       .:: :. ::.. .::.::: :: .:  .....: ..: .  .. ...:  .. .  . . 
mKIAA0 SAEPGYLVTKVVAVDKDSGQNAWLSYRLLKASEPGLFSVGLHTGEVRTARALLDRDALKQ
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mKIAA1 ALSVIIQDKGSPPLHTKVLLRCMVFDYAESVT---STAMTSVSRASLDVSMIIIISLGAI
        : . .::.:.::: . : :   : .    :    :. ::     . :... ........
mKIAA0 NLVMAVQDHGQPPLSATVTLTVAVANSIPEVLADLSSIMTPEVPEDSDLTLHLVVAVAVV
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mKIAA1 -CAVLLVIMVLFATRCNREKKDTRSYNCRVAESTYQHHPKRPSRQIH-KGDITLVPTING
        :. :. ..::.: : .: .:. .  . : . .     :  ::. .   :  ... : . 
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mKIAA1 TLPIRSHHRSSPSSSPTLERGQMGSRQSHNSHQSLNSLVTISSNHVPENFSLELTHATPA
        . . :  ..:    :  . ..:   :  .: .. .::.:  . :  .. .    .: : 
mKIAA0 EVSLTSGSQTSHIIFPQPNYADMLINQ--ESCEKNDSLLTSIDFHENKDEDACAPQAPPN
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mKIAA1 VEVSQLLSMLHQGQYQPRPSFRGNKYSRSYRYALQDMDKFSLKDSGRGDSEAGDSDYDLG
       ..       . :.:   ::.  :.          :. :. .   ... :.:  .. . :.
mKIAA0 TDWR-----FSQAQ---RPGTSGS----------QNGDETGTWPNNQFDTEMLQA-MILA
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mKIAA1 RDSPIDRLLGEGFSDLFLTDGRIPAAMRLCTEECRVLGHSDQCWMPPLPSPSSDYRSNMF
         :      ..: : :    : .  . :          .. :  .  .:    :::.:..
mKIAA0 SASEA----ADGSSTLGGGAGTMGLSAR----------YGPQFTLQHVP----DYRQNVY
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mKIAA1 IPGEEFPAQPQQQHSHQGLDDDSQPAE-NGEKKKSFSTFGKDSPSDEDSGDSSTSSLLSE
       ::: .         .  :  : . ::  ::.::::                         
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mKIAA1 MSSVFQRLLPASLDTFSECNEGDRSNSLERRKGPAQGKTGGYPQGVAAWAASTHFQNPTN

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Smith-Waterman score: 1507;  36.376% identity (38.034% ungapped) in 734 aa overlap (12-734:23-735)

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mKIAA1            PMHQMNTKMHFRFALALLMAFFSHDVLAKNLKYRIYEEQRVGSVIARLS
                             : .::... .    . :.   : : :: . :: .: :.
mKIAA1 SYCEANAEERAMETAWMCNLRQRQVLAFFVLLHVSGAGAELGPYSIEEETERGSFVANLG
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mKIAA1 EDVADVLLKLPNPSAVRFRAMPRGNSPLLVVNENTGEISIGAKIDREQLCQKNLNCSIEF
       .:..   . : . :  : : . . :.  : .: ..:.. :. :.:::.:: .   : ..:
mKIAA1 KDLG---VDLAEISNRRARIISQENKEHLQLNLQSGDLLINEKLDREELCGSIEPCVLHF
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mKIAA1 DVLTLPTEHLQLFHIEVDVLDINDNSPQFSRPVIPIEISESAAVGTRIPLDSAFDPDVGE
       .::    . :..:. :. :.:::: :: ::.  . ..: :..:.:  .::..:.: ::. 
mKIAA1 QVLM--ENPLEVFQAELRVMDINDYSPVFSEREMILRILENSALGDTFPLNNALDSDVAI
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mKIAA1 NSLHTYSLSANDYFNIEVRTRTDGAKYAELIVVKELDRELKASYELQLTASDMGVPQRSG
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mKIAA1 NNIQTYRLSSNSHFLVVTRNRSDGRKYPELVLEKELDREEEPELRLTLTALDGGAPPRSG
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mKIAA1 SSILKISISDSNDNSPAFEQPSYTIQLLENSPVGTLLLDLNATDPDEGANGRIVYSFSSH
       .. . : . : :::.: :.::.: .:. ::::.:.:.: ..:.: : :  :...:..:. 
mKIAA1 TAQVLIEVVDINDNAPKFQQPTYRVQIPENSPTGSLVLTVSANDLDSGDYGKVLYALSQP
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mKIAA1 VSPKIIETFKIDSEKGHLTLFKPVDYEITKSYEIDVQAQDLGPNSIPAHCKIIIKVVDVN
        :  : .:....   :.. : : ::.:   :::.:..: : :  .. ..: ...::::::
mKIAA1 -SEDISKTLEVNPVTGEIRLRKEVDFETIPSYEVDIKATDGG--GLSGKCTLLLKVVDVN
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mKIAA1 DNKPEISIN-LMSPGKEEVSYVFEGDPIDTFVAIVRVQDKDSGLNGEIICKLHGHGHFKL
       :: ::. .. : ::       : :..: :  ::.  :.: ::. ::..: ...    : :
mKIAA1 DNAPEVMLSALTSP-------VPENSP-DEVVAVFSVKDPDSANNGKMIASIEEDLPFLL
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mKIAA1 QKTYENNYLILTNATLDREKRSEYSLTVIAEDKGTPSLSSVRHFTVQINDINDNPPRFQR
       ... .: : ..:. .::::.: .:..:. . : ::: :.. . .:::..: ::: : :..
mKIAA1 KSSGKNFYTLVTKRALDREEREKYNITITVSDLGTPRLTTQHTITVQVSDTNDNAPAFNQ
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mKIAA1 SRYEFVISENNSPGAYITTVTATDPDLGENGHVTYTILESFVLGSSITTYVTIDPSNGAI
       . : . . :::::. .: :..::: : : :.:..:..: :     .. . ..:. .:: .
mKIAA1 TSYTLFVRENNSPAMHIGTISATDSDAGSNSHISYSLLPSHDPQLALDSLISINADNGQL
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mKIAA1 YALRIFDHEEVSQITFVVEARDGGSQKQLSSNTTVVLTIIDENDNVPVVIGPAMHNNTAE
       .::: .:.: .. . : : : : ::   :::.. : ....:.:::.: :. : :.:..: 
mKIAA1 FALRALDYEALQAFEFHVGAIDQGSPA-LSSQALVRVVVLDDNDNAPFVLYP-MQNSSAP
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mKIAA1 IS--IPKGAESGFHVTRIRVVDRDSGANAEFSCSIVSGNEENIFIMDPRSCDIHTN--VS
        .  .:..:: :. ::.. .:::::: :: .: ......: ..: .  .. ...:.  .:
mKIAA1 CTELLPRAAEPGYLVTKVVAVDRDSGQNAWLSFQLLKATEPGLFSVWAHNGEVRTTRLLS
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mKIAA1 MESIPSTEWALSVIIQDKGSPPLHTKVLLRCMVFDYAESVTSTAMTSVSRA-SLD---VS
        ...:. .  : ....:.:.::  ..: :. .: : . :     .  :.:  . :   ..
mKIAA1 ERDVPKHR--LVLLVKDNGDPPRSASVTLHVLVVD-GFSQPYLPLPEVARNPAHDEDALT
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mKIAA1 MIIIISLGAICAVLLVIMVLFA-TR-CNREKKDTRSYNCRVAESTYQHHPKRPSRQIHKG
       . ..:.:... ...:. ..::. .: : : .. . :                        
mKIAA1 LYLVIALASVSSLFLLSVLLFVGVRLCRRARSASLSGYSVPEGHIPGHLVDVRGVGTLSQ
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mKIAA1 DITLVPTINGTLPIRSHHRSSPSSSPTLERGQMGSRQSHNSHQSLNSLVTISSNHVPENF
                                                                   
mKIAA1 SYQYDVCLMGDSSGTSEFNFLKPVFPSSLDQCSGKEIEENSSLHNSFGFHH         
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>>mKIAA0811  ( 1654 res)   mbg07446                       (1654 aa)
 initn: 383 init1: 209 opt: 439  Z-score: 383.8  bits: 83.4 E(): 3.1e-16
Smith-Waterman score: 691;  27.436% identity (29.660% ungapped) in 667 aa overlap (28-687:213-836)

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mKIAA1    PMHQMNTKMHFRFALALLMAFFSHDVLAKNLKYRIYEEQRVGSVIARLSEDVADVLL
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mKIAA0 FDHGQTIQLSSQALVEVSITDENDNPPRFASEDYRGSVVENNEPGELVATLKTLDADISE
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mKIAA1 KLPNPSAVRFRAMPRGNSPLLVVNENTGEISIGAKIDREQLCQKNLNCSI---EFDVLTL
       .  . .    .. : :.  .  :...  .:.    .:::.. .  :  .    .:.. ..
mKIAA0 QNRQVTCYITEGDPLGQFSISQVGDEW-RITSRKTLDREHIAKYLLRITASDGKFQA-SV
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mKIAA1 PTEHLQLFHIEVDVLDINDNSPQFSRPVIPIEISESAAVGTRIPLDSAFDPDVGENSLHT
       :        .:: :::::::::: :. .   .. :... :  :   ::.: :.  :.  :
mKIAA0 P--------VEVFVLDINDNSPQCSQLLYTGKVREDVTPGHFILKVSAIDVDMDTNAQIT
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mKIAA1 YSLSANDYFNIEVRTRTDGAKYAELIVVKELDRELKASYELQLTASDMGVPQRSGSSILK
       ::: .    ....  .:     .:: ... :::: :  :.:   :.: :   .: .. . 
mKIAA0 YSLHGPGAQEFKLDPHT-----GELTTLSVLDRERKDVYNLVAKATDGG--GQSCQAEVT
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mKIAA1 ISISDSNDNSPAFEQPSYTIQLLENSPVGTLLLDLNATDPDEGANGRIVYSFSSHVSPKI
       . : : :::.: :     .. ...:. : : .  . : :::.:.:...:::... .. . 
mKIAA0 LHIEDVNDNAPRFFPSHCAVAVFDNTTVKTPVAVVFARDPDQGVNAQVVYSLTDSADGQ-
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mKIAA1 IETFKIDSEKGHLTLFKPVDYEITKSYEIDVQAQDLG-PNSIPAHCKIIIKVVDVNDNKP
          :.::. .: . : ::.. . ... :. :.:.::: :  . .   . ...: ..:  :
mKIAA0 ---FSIDATSGVIRLEKPLQVRSSSAVELTVRASDLGTPIPLSTLGTVTVSIVGLEDYLP
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mKIAA1 EISINLMSPGKEEVSYVFEGDPIDTFVA-IVRVQDKDSGLNGEIICKLHGHGHFKLQKTY
        : .:     .:. . : :   ::  :  .. .    :  .:  :   . .:.:.:.   
mKIAA0 -IFLN-----SEHSTQVPEDALIDMEVLYLATLTRPGSEKTGYHITGGNEQGKFRLDA--
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mKIAA1 ENNYLILTNATLDREKRSEYSLTVIAEDKGTPSLSSVRHFTVQINDINDNPPRFQRSRYE
        .. .. .:..:: :   .: :..    :.. :::.:  ......:.:.. ::: .. : 
mKIAA0 -HTGILYVNGSLDFETNPKYFLSIECSRKSSSSLSDVTTIVINVTDVNEHHPRFTHDLYT
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mKIAA1 FVISENNSPGAYITTVTATDPDLGENGHVTYTILESFVLGSSITTYVTIDPSNGAIYALR
         . ::   :  : ::.:.: :   :. .::... .  ::     . ::::..: . . .
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