# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mfj23063.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1138.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1138, 1232 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7909486 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1258+/-0.000203; mu= 11.6398+/- 0.011 mean_var=128.4500+/-24.191, 0's: 42 Z-trim: 73 B-trim: 94 in 1/65 Lambda= 0.113164 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|148699588|gb|EDL31535.1| REX1, RNA exonuclease (1232) 8269 1362.4 0 gi|81912689|sp|Q7TT28.1|REXO1_MOUSE RecName: Full= (1213) 8137 1340.8 0 gi|148699586|gb|EDL31533.1| REX1, RNA exonuclease (1221) 8111 1336.6 0 gi|119589857|gb|EAW69451.1| REX1, RNA exonuclease (1220) 6216 1027.2 0 gi|108861882|sp|Q8N1G1.2|REXO1_HUMAN RecName: Full (1221) 6209 1026.0 0 gi|21595518|gb|AAH32244.1| REX1, RNA exonuclease 1 (1221) 6204 1025.2 0 gi|145199237|ref|NP_065746.3| transcription elonga (1221) 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