FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
../query/mKIAA4139.ptfa, 1059 aa
vs ./tmplib.26680 library
1767958 residues in 2168 sequences
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::.:.::. : :::.. :.: ::: .::
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...:::::::.::::::::::: ::: .:::.::: :: .:::::::::::::::::::
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:::::::::.::::::::::::::.::::.::::.::::::::::::::.::::::::..
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::::::::::::::::::::.::.::::::::: :::::::::::::::. :::::::::
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::::::::: :::::: ::::::.::::::::::::::.::::: :.:::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::.:::..::: : :: ::::::::::::::.:.:::. . :: .::
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::::::::::::. :::: .::.. :..:::::::::::::::. . : .:.:::::
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::::::::::.::..::: :::.:..:::::::.:::::::::::::.: ::. .::.::
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.::::..:::...::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::.::.::: :::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::::::::::
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mKIAA4 LLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
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:::::::::::::::: :::::::::::: .:::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::: .::::: :::: .::.::::::.:::::::.::::::::::.:::::
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mKIAA0 -----NLLIFIYDEVRKLILRRYPGGWVEKETYY
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.:...:. .::. ::. ..... :
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120 130 140 150 160 170
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: : . : : :. :. . . ::: .:.. .: . :: ...
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180 190 200 210 220 230
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... :...: .. :: .: : .: ....:: . .:.:. :.:.: :: : ..
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110 120 130 140 150 160
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:::.:::::.. : .::.::::::. : .. .:. . .. : .: ::::..:
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:. :: : . ... :: .:::: .::: :.: . ::..: .::.: ::
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280 290 300 310 320 330
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::: ..::::::::::.:.:::.:. .. .: :..: :: : : : . :
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:.::: :: .:: ::.. : .. : .:.::. . . : . ... :
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400 410 420 430 440
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. .: ::.: .:.. .:.. . ..:. . :::: :... :.. .:. : ..
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450 460 470 480 490 500
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.: .:. ..:. : :::.. . :: . .: :.::...::
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510 520 530 540
630 640 650 660 670 680
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:::..: .:: ..:... :.::: :: :::. .:. :. ...:
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550 560 570 580 590
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mKIAA4 QVNPRDAKACVVHGSDLKDMTSEELDDILRYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVA
: .. : ..:..:. :: :.::..:. :... :..::.::
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mKIAA4 VTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIVGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLK
.:::::::. ::: :::::::: .:.:: :.::::::.::.: .:....:::. :..:.:
mKIAA1 MTGDGVNDAVALKAADIGVAMGQTGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIK
640 650 660 670 680 690
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mKIAA4 KSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMK
. . . :...: .: . . . :.: ::... :: :.. : :: ::. : ...:...
mKIAA1 NFVRFQLSTSIAALTLISLATLMNFPNPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDKDVIR
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. ::: : . :... .... ..: .. : .:... : .: . :
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: : .. . : : :. :. . . .::
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150 160 170 180 190 200
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.... :. ..: ....:......: .. :: .: : .: . ..:
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: . .:.:. . :.:.: ::.: .. :::::::.:. .. ::.::.::: ::
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.: :: ... . : : :..:..: : ..:.:. ::... .:.. . . : .:
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:. . .... . .: .: :: :..:.. :... :: .:. :: .::::
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.: : :.: . :::.: .::.: ::::: ..:::::::::: :.::.... ..
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.: :.. :::... ... . :. : :. : .: .:. .: : : :: :
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. .:.::. ... ::. ...: . ::::.: .:. .... .:.. . . . ::
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370 380 390 400 410 420
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:: :... .:: : :: . :. :. ..:.:: :::.. . ::
mKIAA0 GAFEEVIHHCSMYNNGGIPLPLTPQQKSYCQQEEKKMGSLGLRVLALA-------SGPE-
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mKIAA4 FQFDTDDVNFPVDNLCFVGLISMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIA
. : :.::...::::::.: .:: .:..: ::::: :: ::.
mKIAA0 -----------LGRLTFLGLVGIIDPPRAGVKEAVQVLSESGVSVKMVTGDALETALAIG
480 490 500 510 520
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. .:. :: .. .... :.:.. ... : .
mKIAA0 RTIGLC---NEKLKAMSGEE----------------VEGTEQGALAA-------RVRQVS
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730 740 750 760 770 780
mKIAA4 VFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIVGSDVSKQAADM
:: ::::..:. :... :..:::::.:::::::: :::.::::.::: .:.::::.::.:
mKIAA0 VFFRTSPKHKVKIIKALQESGAIVAMTGDGVNDSVALKSADIGIAMGQTGTDVSKEAANM
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::.::.:..:...::::. :: :.:. . . :...: .. . . . :.: ::... ::
mKIAA0 ILVDDDFSAIMSAVEEGKGIFYNIKNFVRFQLSTSIAALSLITLSTVCNLPSPLNAMQIL
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mKIAA4 CIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGG-FF
... : :: ::. : .. : ..: ::. : ..:. :: . . ..: .:: .:
mKIAA0 WVNIIMDGPPAQSLGVEPVDRDALRRPPRSVG-DTILNRALILRVLMSAAVI--IGGTLF
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mKIAA4 TYFVILAENGFLPFHLLGIRETWDDRWVNDVEDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIV
.. . ::
mKIAA0 IFWREIPANGTSTPRTTTMAFTCFVFFDLFNALSCRSQTKLIFEIGFFRNRMFLYSVLGS
740 750 760 770 780 790
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: ...:. ..:.. : ::. .. ..
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10 20 30 40 50
110 120 130 140 150 160
mKIAA4 RDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSM-LLWIGAILCF-LAYGIRSATEEEPPNDDLY
: : : : : ... . : . . .: ..: . : ::. : : .
mKIAA4 RWGSNEL-PAEEGKTLLELVIEQFEDLLVRILLLAACISFVLAW----FEEGEETITAFV
60 70 80 90 100
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