FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4139.ptfa, 1059 aa vs ./tmplib.26680 library 1767958 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2833+/-0.00435; mu= 20.3021+/- 0.292 mean_var=88.8663+/-20.553, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1361 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0778 ( 1022 res) mph00577 (1022) 5623 1115 0 mKIAA1347 ( 915 res) mtj01524 ( 915) 504 110 1.7e-24 mKIAA0703 ( 810 res) mbp06179 ( 810) 499 109 3.1e-24 mKIAA4195 ( 1061 res) mbg00956 (1061) 478 105 6.4e-23 mKIAA1825 ( 1100 res) mfj34163 (1100) 153 41 0.001 >>mKIAA0778 ( 1022 res) mph00577 (1022 aa) initn: 2911 init1: 2911 opt: 5623 Z-score: 5961.8 bits: 1114.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 5769; 85.547% identity (86.905% ungapped) in 1024 aa overlap (37-1059:14-1022) 10 20 30 40 50 60 mKIAA4 PGSALPAGSCSLLFLVSSNRTRRGARSAATMGKGVGRDKYEPAAVS-EHGDKKGKKAKKE ::.:.::. 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.: :: ... . : : :..:..: : ..:.:. ::... .:.. . . : .: mKIAA0 GKTDSP-LADGGDLSTLSNVVFMGTLVQCGKGQGVVIGTGEQSQFGEVFKMMRAEETPKT 140 150 160 170 180 190 320 330 340 350 360 370 mKIAA4 PIAEEIEHFIHLITGVAVFLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFL----IGI--IVANVPEGL :. . .... . .: .: :: :..:.. :... :: .:. :: .:::: mKIAA0 PLQKSMDKLGKQLT---IF---SFGIIGLLMLVGWVQGKPFLSMFTVGVSLAVAAIPEGL 200 210 220 230 240 250 380 390 400 410 420 430 mKIAA4 LATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQ .: : :.: . :::.: .::.: ::::: ..:::::::::: :.::.... .. mKIAA0 PIVVMVTLVLGVLRMAKKRVIVKKLPIVETLGCCNVICSDKTGTLTANEMTATQLVTSDG 260 270 280 290 300 310 440 450 460 470 480 mKIAA4 IHEADTTENQSGVSFDKTSATWFALSR--IAGLCNRAV---FQAN--QENLPILKRAVAG .: :.. :::... ... . :. : :. : .: .:. .: : : :: : mKIAA0 FH-AEV----SGVGYSGEGTVCLLPSKEVIKGFDNVSVGKLVEAGCVANNAVIRKNAVMG 320 330 340 350 360 490 500 510 520 530 540 mKIAA4 DASESALLK-CIEVCCGSVMEMREKYSKIVEIPFNSTNKYQLSIHKNPNASEPKHLLVMK . .:.::. ... ::. ...: . ::::.: .:. .... .:.. . . . :: mKIAA0 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