FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4117.ptfa, 1192 aa vs ./tmplib.26680 library 1767825 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.6987+/-0.00956; mu= -19.5573+/- 0.633 mean_var=521.5972+/-125.602, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0562 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4062 ( 1285 res) mbg09432 (1285) 1988 177 2.2e-44 mKIAA0666 ( 1087 res) mbg21234 (1087) 982 95 6.7e-20 mFLJ00304 ( 864 res) mng15233 ( 864) 909 89 3.4e-18 mKIAA0381 ( 1032 res) mbe05005 (1032) 900 88 6.4e-18 mKIAA2014 ( 1045 res) mpm02193 (1045) 650 68 8.1e-12 mKIAA1727 ( 1159 res) mbh01547 (1159) 645 68 1.2e-11 mKIAA1902 ( 293 res) mph04215 ( 293) 334 42 0.00017 >>mKIAA4062 ( 1285 res) mbg09432 (1285 aa) initn: 2676 init1: 1628 opt: 1988 Z-score: 889.2 bits: 176.7 E(): 2.2e-44 Smith-Waterman score: 3180; 44.992% identity (52.845% ungapped) in 1218 aa 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..:::. .: mKIAA0 TEIDDTKVFKILDLEDLERTFSAYQRQQEFFVNNSKQKEADAIDDTLSSKLKVKELSVID 640 650 660 670 680 690 720 730 740 750 760 770 mKIAA4 PKIAQNLSIFLSSFRVPYEKIRTMILEVDETQ-LSESMIQNLIKHLPDEEQLKSLSQFRS . ::: .:.:: ... ..:. :: .:: . : ..:...:.: .:.. .. : . . mKIAA0 GRRAQNCNILLSRLKLSNDEIKRAILTMDEQEDLPKDMLEQLLKFVPEKSDIDLLEEHKH 700 710 720 730 740 750 780 790 800 810 820 830 mKIAA4 DYNSLCEPEQFAVVMSNVKRLRPRLSAILFKLQFEEQVNNIKPDIMAVSTACEEIKKSKG . . . . ..: :: ... . ::... :: .: :.: ..:: . :. .. ::. .:.. mKIAA0 ELDRMAKADRFLFEMSRINHYQQRLQSLYFKKKFAERVAEVKPKVEAIRSGSEEVFRSRA 760 770 780 790 800 810 840 850 860 870 880 890 mKIAA4 FSKLLELVLLMGNYMNAGSRNAQTFGFDLSSLCKLKDTKSA-DQKTTLLHFLVDVCEEKH ...:::.:: .::::: :.:. ...:: .::: :. ::::. :.. ::::.:. . :.:. mKIAA0 LKQLLEVVLAFGNYMNKGQRG-NAYGFKISSLNKIADTKSSIDKNITLLHYLITIVENKY 820 830 840 850 860 870 900 910 920 930 940 950 mKIAA4 ADILHFVDDLAHLDKASRVSVEMLEKNVKQMGRQLQQLEKNLE--TFPPPEDLHDKFVIK .:.. ..: . .:..:.. :.:... . :. .: .:: ::. :::: mKIAA0 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.: . ... . :.::.: : . mFLJ00 LQELDMNDFEEHF--KTKSQGPCLDISALKGKASQKAPTKTILIEANRAKNLAITLRKGN 440 450 460 470 480 490 740 750 760 770 780 mKIAA4 VPYEKIRTMILEVDETQLSESMIQNLIKHLPDEEQLKSLSQFRSD---YNSLCEPEQFAV . ..: : : :: .... : . :: . . . ...:... .. : : ..: . mFLJ00 LGADRICQAIETYDLQTLSLDFLELLTRFLPTDYERSLIARFEKEQRPMEELSEEDRFML 500 510 520 530 540 550 790 800 810 820 830 840 mKIAA4 VMSNVKRLRPRLSAILFKLQFEEQVNNIKPDIMAVSTACEEIKKSKGFSKLLELVLLMGN .: ..:: :.... : .: . .. . :.. :. .: ::.: . ..::.:: .:: mFLJ00 RFSRIQRLPERMNTLTFLGNFPDTAQLLMPQLNAIIAASMSIKSSDKLRQILEIVLAFGN 560 570 580 590 600 610 850 860 870 880 890 900 mKIAA4 YMNAGSRNAQTFGFDLSSLCKLKDTKSADQKTTLLHFLVDVCEEKHADILHFVDDLAHLD :::...:.: ..:: :.:: : . ::.:.: ::::.:: : ::. .. : .:: :: mFLJ00 YMNSSKRGA-AYGFRLQSLDALLEMKSTDRKQTLLHYLVKVIAEKYPQLTGFHSDLHFLD 620 630 640 650 660 670 910 920 930 940 950 960 mKIAA4 KASRVSVEMLEKNVKQMGRQLQQLEKNLETFPPPEDLHDKFVIKMSSFVISANEQYEKLS ::. ::.. . .:... : :. .... .: : .:.: :. . . ..:: mFLJ00 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:. : .:. :. ....::.:: .::.:: :.:.. ..:: ..:: : mKIAA0 QERLAEAKPKVEAILLASRELTLSQRLKQMLEVVLAIGNFMNKGQRGG-AYGFRVASLNK 740 750 760 770 780 790 870 880 890 900 910 920 mKIAA4 LKDTKSA-DQKTTLLHFLVDVCEEKHADILHFVDDLAHLDKASRVSVEMLEKNVKQMGRQ . ::::. :.. .:::.:. . :.. :::.. ..: ::..:..:.. :::.:. . : mKIAA0 IADTKSSIDRNISLLHYLIMILEKHFPDILNMPSELKHLSEAAKVNLAELEKEVSILRRG 800 810 820 830 840 850 930 940 950 960 970 980 mKIAA4 LQQLEKNLE-TFPPPEDLHDKFVIKMSSFVISANEQYEKLSTLLGSMTQLYQSVMGYYAV :. .: .:: .: .:::: ::.:. .. .. .: :. . . ... ... mKIAA0 LRAVEVELEYQRHQARDPNDKFVPVMSDFITVSSFSFSELEDQLNEARDKFAKALTHFGE 860 870 880 890 900 910 990 1000 1010 1020 1030 1040 mKIAA4 DMKKVSVEEFFNDLNNFRTSFMLALKE-NIKKREAAEKEKRARIA---KERAEKERLERQ . .:.. .:::. ...: .:. : .. . .:. : :.:::. ::. :::: .:: mKIAA0 QESKMQPDEFFGIFDTFLQAFLEARQDLEAMRRRKEEDERRARMEFMLKEQREKERWQRQ 920 930 940 950 960 970 1050 1060 1070 1080 1090 1100 mKIAA4 QEKKRLLEMKTEGDETGVMDSLLEALQSGAAFRDRRKRTPKLKDIRQSLSPMSQRPVLKV .: : : :.: .:.:. ::.:: .: : :.: :. : :: : 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