# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mfj20268.fasta.nr -Q ../query/mFLJ00264.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mFLJ00264, 994 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7921133 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8983+/-0.000183; mu= 15.8089+/- 0.010 mean_var=71.9252+/-14.288, 0's: 29 Z-trim: 34 B-trim: 2826 in 1/65 Lambda= 0.151229 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|47847494|dbj|BAD21419.1| mFLJ00264 protein [Mus ( 994) 6809 1495.5 0 gi|81879811|sp|Q921K8.1|F115C_MOUSE RecName: Full= ( 919) 6296 1383.5 0 gi|14250261|gb|AAH08555.1| Fam115c protein [Mus mu ( 919) 6267 1377.2 0 gi|109473418|ref|XP_001072414.1| PREDICTED: hypoth ( 973) 5617 1235.4 0 gi|109471978|ref|XP_001057103.1| PREDICTED: hypoth ( 919) 5593 1230.2 0 gi|114616552|ref|XP_519453.2| PREDICTED: hypotheti (1071) 4890 1076.8 0 gi|172049031|sp|A6NFQ2.2|F115C_HUMAN RecName: Full ( 919) 4855 1069.1 0 gi|149706719|ref|XP_001490568.1| PREDICTED: simila ( 919) 4851 1068.3 0 gi|109068737|ref|XP_001092570.1| PREDICTED: hypoth ( 919) 4845 1067.0 0 gi|189081212|sp|A6QLU7.1|F115C_BOVIN RecName: Full ( 914) 4661 1026.8 0 gi|73978730|ref|XP_539847.2| PREDICTED: hypothetic ( 917) 4605 1014.6 0 gi|27369423|gb|AAN87343.1| unknown [Homo sapiens] ( 845) 4448 980.3 0 gi|109658996|gb|AAI17234.1| Family with sequence s ( 845) 4444 979.4 0 gi|51094538|gb|EAL23793.1| hypothetical protein FL ( 845) 4443 979.2 0 gi|149065444|gb|EDM15520.1| rCG28269 [Rattus norve ( 694) 4214 929.2 0 gi|73978451|ref|XP_539846.2| PREDICTED: hypothetic ( 919) 3963 874.5 0 gi|73978453|ref|XP_848591.1| PREDICTED: hypothetic ( 921) 3963 874.5 0 gi|194210033|ref|XP_001502235.2| PREDICTED: hypoth ( 919) 3961 874.1 0 gi|205831286|sp|A5PJN5.1|F115A_BOVIN RecName: Full ( 921) 3960 873.9 0 gi|182676521|sp|Q5R8R3.2|F115A_PONAB RecName: Full ( 921) 3957 873.2 0 gi|12653653|gb|AAH00609.1| FAM115A protein [Homo s ( 919) 3944 870.4 0 gi|158256642|dbj|BAF84294.1| unnamed protein produ ( 921) 3944 870.4 0 gi|37674402|gb|AAQ96853.1| unknown [Homo sapiens] ( 919) 3943 870.2 0 gi|182628294|sp|Q9Y4C2.3|F115A_HUMAN RecName: Full ( 921) 3943 870.2 0 gi|148681525|gb|EDL13472.1| RIKEN cDNA 3321401G04, ( 953) 3837 847.1 0 gi|109471980|ref|XP_342676.3| PREDICTED: hypotheti (1017) 3833 846.2 0 gi|109473420|ref|XP_001072497.1| PREDICTED: hypoth (1024) 3833 846.2 0 gi|26343507|dbj|BAC35410.1| unnamed protein produc ( 922) 3820 843.3 0 gi|81896827|sp|Q8BNE1.1|F115A_MOUSE RecName: Full= ( 924) 3820 843.3 0 gi|21594405|gb|AAH31718.1| 3321401G04Rik protein [ ( 922) 3818 842.9 0 gi|172049033|sp|A6NGZ5.2|F139B_HUMAN Putative prot ( 806) 3745 826.9 0 gi|149574565|ref|XP_001509330.1| PREDICTED: simila ( 981) 3742 826.3 0 gi|149436138|ref|XP_001521332.1| PREDICTED: simila ( 914) 3741 826.1 0 gi|55730249|emb|CAH91847.1| hypothetical protein [ ( 841) 3630 801.8 0 gi|21748478|dbj|BAC03376.1| FLJ00264 protein [Homo ( 644) 3319 733.9 6.1e-209 gi|193806318|sp|P0C6B9.1|F115B_HUMAN Putative prot ( 736) 2962 656.0 1.9e-185 gi|169170782|ref|XP_001719056.1| PREDICTED: hypoth ( 798) 2962 656.1 2e-185 gi|21757968|dbj|BAC05220.1| unnamed protein produc ( 564) 2950 653.3 9.4e-185 gi|224043782|ref|XP_002190961.1| PREDICTED: simila ( 919) 2465 547.7 9.7e-153 gi|182676622|sp|A4IG42.1|F115_DANRE RecName: Full= ( 912) 2426 539.2 3.5e-150 gi|189528486|ref|XP_683371.3| PREDICTED: hypotheti ( 912) 2408 535.3 5.3e-149 gi|189528484|ref|XP_683284.3| PREDICTED: hypotheti ( 912) 2385 530.2 1.7e-147 gi|189528488|ref|XP_001923464.1| PREDICTED: hypoth ( 908) 2364 525.7 4.1e-146 gi|47224878|emb|CAG06448.1| unnamed protein produc ( 919) 2308 513.4 2e-142 gi|194389576|dbj|BAG61749.1| unnamed protein produ ( 497) 2193 488.1 4.5e-135 gi|148681524|gb|EDL13471.1| RIKEN cDNA 3321401G04, ( 498) 2127 473.7 9.7e-131 gi|26380345|dbj|BAC25433.1| unnamed protein produc ( 498) 2123 472.9 1.8e-130 gi|194382916|dbj|BAG59014.1| unnamed protein produ ( 815) 2103 468.7 5.3e-129 gi|119570876|gb|EAW50491.1| hypothetical protein F ( 381) 2090 465.6 2.1e-128 gi|169217930|ref|XP_947162.3| PREDICTED: similar t ( 545) 2004 446.9 1.2e-122 >>gi|47847494|dbj|BAD21419.1| mFLJ00264 protein [Mus mus (994 aa) initn: 6809 init1: 6809 opt: 6809 Z-score: 8020.2 bits: 1495.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 6809; 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