# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mfj20071.fasta.nr -Q ../query/mKIAA4150.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA4150, 1022 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7896927 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8046+/-0.000204; mu= 6.8350+/- 0.011 mean_var=146.2715+/-29.076, 0's: 41 Z-trim: 144 B-trim: 775 in 2/64 Lambda= 0.106046 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|124378042|ref|NP_598613.2| golgi autoantigen, g (1026) 6483 1004.4 0 gi|123230367|emb|CAM15845.1| golgi autoantigen, go ( 999) 5875 911.4 0 gi|123230371|emb|CAM15849.1| golgi autoantigen, go ( 955) 5661 878.6 0 gi|148676591|gb|EDL08538.1| mCG141173, isoform CRA ( 967) 5661 878.6 0 gi|32469764|sp|Q921M4.2|GOGA2_MOUSE RecName: Full= ( 888) 5585 867.0 0 gi|149039025|gb|EDL93245.1| rCG45495, isoform CRA_ ( 998) 5549 861.5 0 gi|6226622|sp|Q62839.2|GOGA2_RAT RecName: Full=Gol ( 986) 5547 861.2 0 gi|149039026|gb|EDL93246.1| rCG45495, isoform CRA_ ( 966) 5372 834.4 0 gi|194671729|ref|XP_585636.4| PREDICTED: golgi aut (1032) 4869 757.5 7.8e-216 gi|119608169|gb|EAW87763.1| golgi autoantigen, gol (1017) 4764 741.4 5.3e-211 gi|73968151|ref|XP_537828.2| PREDICTED: similar to (1006) 4576 712.7 2.4e-202 gi|148676589|gb|EDL08536.1| mCG141173, isoform CRA (1053) 4576 712.7 2.5e-202 gi|149039024|gb|EDL93244.1| rCG45495, isoform CRA_ (1055) 4378 682.4 3.3e-193 gi|32470611|sp|Q08379.2|GOGA2_HUMAN RecName: Full= ( 990) 4315 672.7 2.5e-190 gi|220675613|emb|CAI13841.2| golgi autoantigen, go (1002) 4315 672.7 2.5e-190 gi|149738024|ref|XP_001500961.1| PREDICTED: golgi ( 991) 4097 639.4 2.7e-180 gi|109110177|ref|XP_001112219.1| PREDICTED: simila ( 984) 3988 622.7 2.8e-175 gi|15277467|gb|AAH11407.1| Golga2 protein [Mus mus ( 617) 3947 616.2 1.6e-173 gi|1587031|prf||2205312A cis-Golgi matrix protein ( 616) 3711 580.1 1.2e-162 gi|114626916|ref|XP_001155991.1| PREDICTED: Golgi ( 902) 3407 533.8 1.5e-148 gi|114626908|ref|XP_001156209.1| PREDICTED: Golgi (1030) 3407 533.8 1.7e-148 gi|224073412|ref|XP_002194331.1| PREDICTED: golgi (1067) 3291 516.1 3.8e-143 gi|118099268|ref|XP_425338.2| PREDICTED: similar t (1014) 3242 508.6 6.6e-141 gi|40225981|gb|AAH14188.2| GOLGA2 protein [Homo sa ( 678) 3177 498.5 4.9e-138 gi|119608170|gb|EAW87764.1| golgi autoantigen, gol (1008) 3165 496.8 2.3e-137 gi|109110173|ref|XP_001112179.1| PREDICTED: simila ( 844) 3090 485.2 5.8e-134 gi|114626910|ref|XP_001156160.1| PREDICTED: Golgi (1003) 2970 466.9 2.2e-128 gi|51895934|gb|AAH81001.1| MGC81213 protein [Xenop ( 968) 2939 462.2 5.8e-127 gi|109110175|ref|XP_001112003.1| PREDICTED: simila ( 705) 2765 435.4 4.7e-119 gi|306782|gb|AAA35920.1| golgin-95 ( 620) 2647 417.3 1.2e-113 gi|90084647|dbj|BAE91165.1| unnamed protein produc ( 479) 2221 352.1 4.1e-94 gi|220675614|emb|CAX14867.1| golgi autoantigen, go ( 473) 2191 347.5 9.7e-93 gi|121308972|dbj|BAF43730.1| cis-Golgi matrix prot (1028) 2176 345.5 8.3e-92 gi|114626912|ref|XP_001156104.1| PREDICTED: Golgi ( 852) 1792 286.7 3.5e-74 gi|114626914|ref|XP_001156051.1| PREDICTED: Golgi ( 646) 1716 274.9 9.1e-71 gi|123230368|emb|CAM15846.1| golgi autoantigen, go ( 250) 1582 254.0 6.8e-65 gi|119608171|gb|EAW87765.1| golgi autoantigen, gol ( 617) 1392 225.3 7.4e-56 gi|47223559|emb|CAF99168.1| unnamed protein produc ( 917) 1383 224.1 2.5e-55 gi|123230370|emb|CAM15848.1| golgi autoantigen, go ( 331) 1372 222.0 3.9e-55 gi|194033668|ref|XP_001925593.1| PREDICTED: simila ( 592) 1365 221.2 1.3e-54 gi|220673339|emb|CAX13096.1| novel protein similar ( 735) 1346 218.4 1.1e-53 gi|57997556|emb|CAI46071.1| hypothetical protein [ ( 286) 1330 215.5 3e-53 gi|30583335|gb|AAP35912.1| golgi autoantigen, golg ( 345) 1285 208.7 4.1e-51 gi|30585261|gb|AAP36903.1| Homo sapiens golgi auto ( 346) 1285 208.7 4.1e-51 gi|123230369|emb|CAM15847.1| golgi autoantigen, go ( 272) 1134 185.5 3.1e-44 gi|119598017|gb|EAW77611.1| hypothetical protein F ( 775) 1140 186.9 3.5e-44 gi|123230366|emb|CAM15844.1| golgi autoantigen, go ( 201) 1067 175.2 3e-41 gi|115721615|ref|XP_001196505.1| PREDICTED: simila (1147) 1052 173.6 5.3e-40 gi|86821637|gb|AAI03147.2| GOLGA2 protein [Bos tau ( 233) 1025 168.8 2.9e-39 gi|56126476|gb|AAV76025.1| Golgi matrix protein GM ( 194) 1010 166.4 1.3e-38 >>gi|124378042|ref|NP_598613.2| golgi autoantigen, golgi (1026 aa) initn: 6483 init1: 6483 opt: 6483 Z-score: 5365.7 bits: 1004.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 6483; 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